logo

Genes within 1Mb (chr6:132056834:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 1.37e-03 0.345 0.106 0.088 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 -344641 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0385 0.159 0.088 B L1
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 1.03e-02 0.153 0.059 0.088 B L1
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0836 0.119 0.088 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000283 0.113 0.088 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0539 0.0681 0.088 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 5.94e-01 0.0754 0.141 0.088 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 4.16e-01 -0.117 0.143 0.088 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -75054 sc-eQTL 3.37e-01 0.0903 0.0939 0.088 B L1
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 6.06e-01 -0.073 0.141 0.088 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 4.80e-03 0.323 0.113 0.088 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 2.18e-01 0.113 0.0912 0.088 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 8.38e-01 0.0204 0.0999 0.088 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 2.76e-01 -0.074 0.0678 0.088 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 8.82e-02 -0.209 0.122 0.088 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 3.12e-01 -0.139 0.137 0.088 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 5.81e-01 0.0636 0.115 0.088 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 6.25e-01 0.0555 0.113 0.088 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 7.05e-01 0.051 0.134 0.088 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 7.95e-01 -0.012 0.0459 0.088 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 3.78e-01 -0.114 0.129 0.088 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 5.70e-02 -0.264 0.138 0.088 CD8T L1
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 5.37e-01 0.0758 0.123 0.086 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 2.22e-01 0.132 0.108 0.086 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -677931 sc-eQTL 6.27e-02 -0.249 0.133 0.086 DC L1
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 7.37e-02 -0.281 0.156 0.086 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -657221 sc-eQTL 8.08e-02 -0.253 0.144 0.086 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 9.54e-01 0.00899 0.155 0.086 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0151 0.087 0.086 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 1.56e-01 0.22 0.154 0.086 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 2.83e-01 -0.148 0.137 0.086 DC L1
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00825 0.132 0.088 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 5.41e-02 0.151 0.0778 0.088 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -677931 sc-eQTL 4.51e-01 -0.102 0.135 0.088 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 9.04e-01 0.0155 0.128 0.088 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -657221 sc-eQTL 8.20e-01 -0.033 0.145 0.088 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 2.82e-01 0.11 0.102 0.088 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 2.26e-01 0.0742 0.0611 0.088 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0937 0.127 0.088 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0246 0.121 0.088 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 5.98e-05 0.482 0.118 0.088 NK L1
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 4.91e-01 -0.077 0.112 0.088 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 4.21e-01 -0.122 0.152 0.088 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 6.22e-01 -0.031 0.0629 0.088 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0592 0.134 0.088 NK L1
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 4.32e-01 0.104 0.133 0.088 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 4.84e-01 0.0841 0.12 0.088 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 1.51e-01 -0.215 0.149 0.088 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 1.18e-01 -0.227 0.144 0.088 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0134 0.0576 0.088 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0287 0.131 0.088 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 6.76e-01 0.0661 0.158 0.088 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 2.64e-01 -0.158 0.141 0.092 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344641 sc-eQTL 3.96e-01 0.136 0.16 0.092 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 1.09e-01 0.241 0.149 0.092 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 1.23e-01 0.257 0.166 0.092 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 1.53e-01 -0.229 0.159 0.092 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0171 0.0858 0.092 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 7.25e-01 0.0586 0.166 0.092 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 7.86e-01 -0.041 0.15 0.092 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75054 sc-eQTL 7.53e-01 0.0452 0.143 0.092 B_Activated L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 3.84e-01 0.135 0.154 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344641 sc-eQTL 4.72e-01 -0.108 0.15 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 6.11e-02 0.183 0.0972 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 8.24e-01 0.0333 0.149 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 2.86e-01 -0.157 0.147 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0741 0.0902 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 8.82e-01 0.0225 0.151 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 1.02e-01 -0.266 0.162 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75054 sc-eQTL 2.27e-02 -0.314 0.137 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 1.04e-02 0.359 0.139 0.088 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344641 sc-eQTL 4.50e-01 0.111 0.146 0.088 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 2.99e-01 0.119 0.114 0.088 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0451 0.148 0.088 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00914 0.15 0.088 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 1.26e-01 -0.11 0.0719 0.088 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 5.39e-02 -0.296 0.152 0.088 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0165 0.151 0.088 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75054 sc-eQTL 1.05e-01 0.227 0.14 0.088 B_Memory L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 3.84e-04 0.426 0.118 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344641 sc-eQTL 2.15e-01 -0.205 0.165 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 3.47e-04 0.255 0.0701 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0841 0.129 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 4.66e-01 0.102 0.14 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 6.35e-01 -0.038 0.0799 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 2.30e-01 0.194 0.161 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 6.61e-01 0.0678 0.154 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75054 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0577 0.102 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 4.89e-03 0.384 0.135 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344641 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00574 0.156 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 2.87e-01 0.0905 0.0848 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0646 0.157 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 7.84e-01 0.0429 0.156 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0815 0.0824 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 9.27e-01 0.0152 0.165 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 1.99e-01 -0.202 0.157 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75054 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0219 0.109 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 5.72e-01 0.0758 0.134 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 7.85e-01 0.0451 0.165 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 8.38e-01 0.0352 0.172 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 7.45e-01 0.0542 0.167 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0538 0.077 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 2.43e-01 -0.192 0.164 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 5.81e-01 0.0858 0.155 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0364 0.147 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 1.67e-02 0.296 0.123 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 3.21e-01 0.105 0.106 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0142 0.115 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0394 0.0748 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 1.35e-01 -0.207 0.138 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 7.75e-02 -0.254 0.143 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 6.34e-01 0.0724 0.152 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 8.80e-02 0.236 0.138 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0137 0.117 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0497 0.137 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0677 0.0707 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 9.06e-01 0.016 0.135 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 7.86e-01 0.0447 0.164 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 3.02e-01 -0.165 0.16 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 2.68e-01 0.178 0.16 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0581 0.148 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 4.20e-01 0.124 0.154 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 6.48e-01 0.0289 0.0631 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 1.65e-01 -0.225 0.162 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 4.72e-01 -0.113 0.157 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0617 0.134 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 2.66e-01 0.152 0.137 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 5.49e-01 0.0911 0.152 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 5.92e-01 0.0436 0.0813 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 4.64e-01 -0.112 0.153 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0978 0.157 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0163 0.16 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 3.31e-01 -0.125 0.129 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 9.78e-01 0.00379 0.138 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 8.72e-01 0.0128 0.0792 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0409 0.146 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 1.68e-01 -0.219 0.158 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 8.91e-01 0.0218 0.159 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0102 0.16 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 1.93e-01 -0.206 0.158 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 4.05e-01 0.0642 0.077 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 5.34e-01 0.107 0.172 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 3.51e-03 -0.489 0.165 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 9.73e-01 0.00582 0.172 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 4.78e-01 0.118 0.166 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 8.54e-02 0.294 0.17 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 7.36e-02 0.165 0.0915 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 3.41e-01 -0.161 0.168 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0363 0.174 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 5.40e-01 0.0931 0.152 0.089 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 5.31e-01 0.0992 0.158 0.089 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 2.71e-01 -0.182 0.165 0.089 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 4.16e-01 -0.131 0.161 0.089 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00229 0.0791 0.089 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 7.77e-01 0.0463 0.163 0.089 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 2.94e-01 0.174 0.165 0.089 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 4.69e-02 0.31 0.155 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 5.33e-01 -0.103 0.166 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00261 0.159 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 5.81e-01 0.049 0.0886 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0274 0.161 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 2.09e-02 0.294 0.126 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0703 0.131 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 6.62e-01 -0.07 0.16 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0291 0.0634 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0408 0.139 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 8.04e-02 0.273 0.155 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 6.27e-01 -0.077 0.158 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 7.48e-01 -0.051 0.158 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 1.67e-01 -0.102 0.0735 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 9.92e-01 0.00161 0.164 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 2.44e-04 0.512 0.137 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 5.56e-01 0.0864 0.146 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0308 0.159 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0483 0.0863 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0052 0.148 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 2.24e-01 0.227 0.186 0.104 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 -344641 sc-eQTL 2.14e-01 -0.193 0.155 0.104 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 3.45e-01 -0.123 0.129 0.104 PB L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 4.82e-01 -0.124 0.176 0.104 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 9.70e-01 0.00605 0.159 0.104 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 2.44e-01 0.105 0.0896 0.104 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 8.83e-01 0.0253 0.172 0.104 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 5.21e-01 -0.109 0.169 0.104 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -75054 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0261 0.111 0.104 PB L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 4.66e-01 -0.1 0.137 0.089 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 7.90e-01 0.0378 0.142 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 6.97e-01 -0.062 0.159 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 5.07e-01 -0.101 0.152 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 4.67e-01 0.0419 0.0574 0.089 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0141 0.137 0.089 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0738 0.149 0.089 Pro_T L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00959 0.151 0.088 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 5.85e-02 0.286 0.15 0.088 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 9.10e-01 0.0176 0.156 0.088 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 3.73e-01 0.114 0.127 0.088 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0287 0.0564 0.088 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 3.09e-03 -0.394 0.132 0.088 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 4.88e-01 -0.111 0.159 0.088 Treg L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 1.83e-01 0.182 0.136 0.085 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 5.50e-01 0.0814 0.136 0.085 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -677931 sc-eQTL 4.27e-02 -0.272 0.134 0.085 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 1.05e-02 -0.446 0.172 0.085 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -657221 sc-eQTL 3.64e-01 -0.144 0.158 0.085 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0563 0.155 0.085 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 6.68e-01 0.0328 0.0763 0.085 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 2.56e-02 0.378 0.168 0.085 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 5.43e-03 -0.417 0.148 0.085 cDC L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 3.65e-01 -0.132 0.146 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 2.33e-01 0.122 0.102 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -677931 sc-eQTL 3.67e-01 -0.131 0.145 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 5.92e-01 0.0768 0.143 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -657221 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0218 0.146 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 5.28e-01 0.0739 0.117 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 3.66e-01 0.0588 0.0648 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 2.09e-01 -0.175 0.139 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0139 0.125 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 7.82e-01 0.0423 0.152 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 3.13e-01 0.113 0.111 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -677931 sc-eQTL 6.48e-01 0.0637 0.139 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0866 0.151 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -657221 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00282 0.151 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 8.42e-01 0.0198 0.0991 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 9.79e-01 0.00188 0.0714 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0537 0.148 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00496 0.132 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 9.66e-01 0.00752 0.177 0.085 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 3.25e-01 0.183 0.185 0.085 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 8.71e-01 0.0323 0.199 0.085 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 9.00e-01 0.0259 0.205 0.085 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 6.92e-01 0.031 0.0782 0.085 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 2.21e-01 0.254 0.207 0.085 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 1.99e-01 0.259 0.201 0.085 gdT L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 4.76e-01 -0.11 0.154 0.087 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 1.87e-01 0.198 0.149 0.087 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -677931 sc-eQTL 4.89e-01 -0.105 0.151 0.087 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 6.10e-01 -0.085 0.166 0.087 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -657221 sc-eQTL 9.22e-01 0.0147 0.15 0.087 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 2.10e-01 0.191 0.152 0.087 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 7.17e-01 0.024 0.0662 0.087 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 2.01e-01 -0.207 0.162 0.087 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 2.52e-01 -0.185 0.161 0.087 intMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 6.13e-01 0.0739 0.146 0.088 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 2.09e-01 0.14 0.111 0.088 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -677931 sc-eQTL 9.24e-03 -0.406 0.154 0.088 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 5.51e-01 0.0949 0.159 0.088 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -657221 sc-eQTL 8.68e-01 0.0259 0.156 0.088 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 4.85e-01 0.105 0.15 0.088 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 8.09e-03 0.197 0.0738 0.088 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 5.75e-02 0.292 0.153 0.088 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 2.19e-01 -0.163 0.132 0.088 ncMono L2
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0751 0.174 0.09 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 6.34e-01 0.0599 0.125 0.09 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -677931 sc-eQTL 2.74e-01 -0.138 0.126 0.09 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 8.99e-01 0.0223 0.176 0.09 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -657221 sc-eQTL 2.17e-03 -0.389 0.125 0.09 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 7.38e-01 0.0514 0.153 0.09 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 9.17e-01 0.0109 0.105 0.09 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 3.54e-01 -0.133 0.143 0.09 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 2.40e-01 0.183 0.155 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 2.18e-01 0.168 0.136 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -344641 sc-eQTL 3.02e-01 0.159 0.154 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 8.55e-03 0.228 0.086 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 1.98e-01 0.172 0.133 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0898 0.138 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0651 0.0787 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 4.16e-01 -0.111 0.136 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 3.72e-01 -0.129 0.144 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -75054 sc-eQTL 5.65e-01 0.0803 0.139 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 5.81e-05 0.453 0.11 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -344641 sc-eQTL 3.03e-01 -0.17 0.164 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 2.49e-03 0.203 0.0662 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0548 0.127 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 5.50e-01 0.0785 0.131 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0492 0.0794 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 3.81e-01 0.14 0.16 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0547 0.15 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -75054 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0364 0.0952 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 7.81e-01 -0.039 0.14 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 8.72e-02 0.147 0.0855 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -677931 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0764 0.14 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 7.35e-01 0.0457 0.135 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -657221 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0441 0.146 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 3.08e-01 0.0986 0.0965 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 4.05e-01 0.0553 0.0662 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0817 0.132 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0138 0.118 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079819 EPB41L2 993512 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0449 0.148 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 8.10e-02 0.183 0.104 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -677931 sc-eQTL 2.48e-03 -0.463 0.151 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 4.95e-01 -0.103 0.15 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -657221 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0343 0.153 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 2.62e-01 0.162 0.144 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 3.22e-01 0.0606 0.0611 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0869 0.154 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -756505 sc-eQTL 1.32e-01 -0.223 0.148 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -456364 sc-eQTL 1.11e-04 0.464 0.118 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 428592 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0552 0.118 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -706625 sc-eQTL 3.19e-01 -0.154 0.154 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -757735 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0259 0.063 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 921367 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0475 0.131 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -456364 eQTL 6.4e-08 0.147 0.027 0.0 0.0 0.0908
ENSG00000112299 VNN1 -657221 eQTL 0.0309 0.0808 0.0374 0.0 0.0 0.0908
ENSG00000118520 ARG1 483690 eQTL 0.028 -0.0697 0.0317 0.0 0.0 0.0908
ENSG00000118523 CCN2 105462 pQTL 1.54e-13 -0.268 0.0359 0.0 0.0 0.0907

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -456364 8.43e-07 4.97e-07 1.29e-07 3.48e-07 1.05e-07 2.01e-07 5.31e-07 1.65e-07 5.02e-07 2.57e-07 6.88e-07 3.73e-07 7.19e-07 1.17e-07 2.15e-07 2.69e-07 3.63e-07 4.11e-07 2.17e-07 1.51e-07 2.17e-07 3.95e-07 3.77e-07 1.73e-07 7.01e-07 2.56e-07 2.94e-07 2.68e-07 3.99e-07 5.36e-07 2.83e-07 5.62e-08 4.49e-08 1.56e-07 3.05e-07 1.28e-07 8.28e-08 9.71e-08 6.38e-08 3.05e-08 8.61e-08 4.55e-07 3.55e-08 1.93e-08 1.29e-07 1.29e-08 1.18e-07 1.22e-08 5.96e-08
ENSG00000146409 \N -756505 2.95e-07 1.33e-07 6.04e-08 2.01e-07 1.03e-07 8.21e-08 1.9e-07 5.82e-08 1.59e-07 8.53e-08 1.62e-07 1.2e-07 1.87e-07 7.95e-08 5.82e-08 8.08e-08 4.31e-08 1.72e-07 7.18e-08 4.95e-08 1.22e-07 1.47e-07 1.62e-07 3.07e-08 1.72e-07 1.39e-07 1.17e-07 1.06e-07 1.34e-07 1.06e-07 1.06e-07 3.39e-08 3.13e-08 9.78e-08 3.4e-08 2.74e-08 5.51e-08 8.51e-08 6.76e-08 3.67e-08 5.54e-08 1.46e-07 5.27e-08 1.22e-08 3.41e-08 1.68e-08 8.74e-08 1.92e-09 4.83e-08
ENSG00000154269 \N 428392 9.14e-07 6.09e-07 1.46e-07 3.96e-07 1.07e-07 2.42e-07 5.8e-07 2.07e-07 6.27e-07 2.88e-07 8.58e-07 4.31e-07 9.1e-07 1.52e-07 2.77e-07 3.36e-07 4.87e-07 4.33e-07 2.57e-07 1.78e-07 2.61e-07 4.99e-07 4.13e-07 2.27e-07 8.62e-07 2.64e-07 3.68e-07 2.73e-07 4.76e-07 6.42e-07 3.49e-07 6.37e-08 5.86e-08 1.77e-07 3.31e-07 1.52e-07 1.23e-07 1.02e-07 6.66e-08 2.77e-08 1.22e-07 5.87e-07 4.59e-08 1.04e-08 1.6e-07 1.46e-08 1.1e-07 2.35e-08 6.04e-08