Genes within 1Mb (chr12:98644771:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.22e-09 0.456 0.0729 0.126 B L1
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0492 0.0677 0.126 B L1
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0678 0.0909 0.126 B L1
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 1.22e-01 0.143 0.0922 0.126 B L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 7.94e-01 0.0223 0.0853 0.126 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.89e-24 0.889 0.0769 0.126 CD4T L1
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0341 0.0785 0.126 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0409 0.076 0.126 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 5.03e-04 0.365 0.103 0.126 CD4T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 7.93e-02 0.136 0.0772 0.126 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 3.46e-15 0.58 0.0683 0.126 CD8T L1
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 7.55e-02 -0.128 0.0719 0.126 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0435 0.0876 0.126 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 2.35e-02 0.266 0.117 0.126 CD8T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 4.72e-01 0.0614 0.0852 0.126 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 5.48e-05 0.319 0.0773 0.133 DC L1
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 6.90e-01 0.0434 0.109 0.133 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 4.04e-01 0.0754 0.0901 0.133 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 3.91e-02 0.246 0.118 0.133 DC L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 1.46e-01 0.151 0.103 0.133 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 3.91e-02 0.14 0.0676 0.126 Mono L1
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 2.26e-01 -0.1 0.0823 0.126 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 1.39e-02 -0.156 0.063 0.126 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 1.09e-01 0.137 0.0848 0.126 Mono L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 7.91e-01 0.0233 0.0878 0.126 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.17e-08 0.58 0.0996 0.127 NK L1
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 4.80e-01 0.0641 0.0906 0.127 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0458 0.0945 0.127 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 2.18e-02 0.225 0.0973 0.127 NK L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 3.58e-01 0.0871 0.0945 0.127 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.26e-07 0.455 0.0851 0.126 Other_T L1
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 5.04e-01 0.0359 0.0536 0.126 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 3.38e-01 -0.105 0.109 0.126 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 1.06e-01 0.152 0.0939 0.126 Other_T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 3.25e-01 0.0756 0.0767 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 3.50e-01 0.126 0.135 0.138 B_Activated L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 9.09e-01 0.0144 0.125 0.138 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 4.11e-01 -0.115 0.139 0.138 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 3.22e-01 -0.139 0.14 0.138 B_Activated L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 1.39e-01 0.183 0.123 0.138 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.35e-04 0.406 0.108 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 9.08e-01 0.0105 0.0913 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 5.27e-01 0.0744 0.117 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 2.46e-01 0.136 0.117 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 6.97e-01 0.0413 0.106 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 1.83e-05 0.467 0.106 0.127 B_Memory L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0126 0.112 0.127 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 2.56e-02 -0.286 0.127 0.127 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0288 0.128 0.127 B_Memory L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 5.36e-01 0.0748 0.121 0.127 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 6.35e-05 0.383 0.0939 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0138 0.0759 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 3.44e-01 -0.108 0.114 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 4.31e-01 0.0951 0.12 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 4.94e-02 0.211 0.107 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 1.38e-03 0.381 0.118 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 4.35e-01 0.0795 0.102 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 5.49e-01 0.0706 0.118 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 3.68e-01 0.104 0.115 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0606 0.111 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 1.25e-06 0.564 0.113 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 6.67e-02 0.209 0.114 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0466 0.123 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00517 0.121 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 1.55e-01 0.18 0.126 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.04e-21 0.824 0.0775 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 7.11e-01 0.0322 0.0867 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 9.81e-01 0.00222 0.0916 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 1.67e-03 0.323 0.101 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 5.55e-02 0.174 0.0904 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 1.24e-14 0.676 0.0815 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0549 0.085 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 2.60e-01 -0.119 0.105 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 4.75e-03 0.336 0.118 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 3.46e-01 0.0859 0.091 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 3.31e-08 0.605 0.105 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 9.24e-02 -0.18 0.106 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 5.39e-01 0.0749 0.122 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 1.03e-01 0.217 0.132 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 2.96e-01 0.12 0.114 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 6.37e-05 0.436 0.107 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 1.29e-01 -0.157 0.103 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 2.49e-01 -0.133 0.115 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 2.70e-02 0.272 0.122 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 4.47e-01 0.0868 0.114 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 6.50e-17 0.801 0.088 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0467 0.0988 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 1.41e-01 0.179 0.121 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 1.49e-02 0.304 0.124 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 6.11e-01 0.0529 0.104 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 6.73e-07 0.624 0.121 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 6.63e-01 0.0472 0.108 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0147 0.123 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0134 0.125 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 7.57e-01 0.039 0.126 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 4.66e-07 0.549 0.105 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0715 0.115 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 3.31e-01 0.128 0.132 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 7.75e-01 0.0376 0.131 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 2.74e-01 0.134 0.122 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 9.21e-08 0.63 0.114 0.128 MAIT L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0474 0.116 0.128 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0397 0.115 0.128 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 4.52e-01 0.0892 0.118 0.128 MAIT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 7.99e-01 0.0311 0.122 0.128 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.24e-05 0.479 0.11 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 1.59e-02 0.283 0.116 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 1.74e-02 -0.31 0.129 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 7.84e-01 0.0334 0.122 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 6.59e-01 0.0583 0.132 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 3.95e-07 0.563 0.108 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00331 0.0998 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00155 0.105 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 6.29e-03 0.297 0.108 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 2.92e-01 0.117 0.111 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 6.46e-02 0.223 0.12 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0105 0.127 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0255 0.126 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 5.40e-01 0.0782 0.128 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 6.66e-01 0.0518 0.12 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 4.85e-06 0.537 0.114 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 8.31e-01 0.0222 0.104 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0486 0.114 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 2.72e-01 0.134 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 6.86e-01 0.0478 0.118 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 9.84e-01 0.00198 0.101 0.111 PB L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 4.15e-01 -0.155 0.19 0.111 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 2.10e-01 -0.222 0.176 0.111 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 6.08e-01 0.0684 0.133 0.111 PB L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 4.36e-01 -0.138 0.176 0.111 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 4.24e-01 0.0642 0.0801 0.126 Pro_T L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 3.73e-01 0.0591 0.0662 0.126 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 2.44e-01 -0.154 0.132 0.126 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 4.41e-01 0.0717 0.0929 0.126 Pro_T L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 9.56e-02 0.171 0.102 0.126 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 6.97e-05 0.469 0.116 0.126 Treg L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0328 0.104 0.126 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 9.88e-02 -0.212 0.128 0.126 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 6.48e-01 0.0568 0.124 0.126 Treg L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 3.44e-01 0.106 0.112 0.126 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.95e-04 0.349 0.0945 0.134 cDC L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 8.46e-01 0.0238 0.122 0.134 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 1.31e-01 0.146 0.0965 0.134 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 4.33e-01 0.098 0.125 0.134 cDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 7.96e-01 0.0318 0.123 0.134 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 1.48e-02 0.155 0.063 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0892 0.0898 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0225 0.0689 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 6.63e-02 0.171 0.0927 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 7.38e-01 0.0339 0.101 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.07e-01 0.0937 0.074 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 8.26e-02 -0.171 0.0983 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 1.03e-02 -0.226 0.0871 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 2.68e-01 0.12 0.108 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 5.48e-01 0.0636 0.106 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 1.61e-04 0.493 0.127 0.139 gdT L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 1.77e-01 0.191 0.141 0.139 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0246 0.152 0.139 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 4.77e-01 0.106 0.148 0.139 gdT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 1.43e-01 0.209 0.142 0.139 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 6.49e-02 0.171 0.0923 0.124 intMono L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 8.64e-01 0.0184 0.108 0.124 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 2.25e-02 -0.238 0.103 0.124 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0976 0.115 0.124 intMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 4.87e-01 0.0912 0.131 0.124 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.05e-01 0.127 0.0999 0.131 ncMono L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 9.73e-01 0.00259 0.077 0.131 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 4.64e-01 -0.07 0.0954 0.131 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 5.08e-01 0.076 0.115 0.131 ncMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 6.61e-01 0.0443 0.101 0.131 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.00e-02 0.235 0.0999 0.138 pDC L2
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 5.66e-01 0.0749 0.13 0.138 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0129 0.121 0.138 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 4.68e-01 0.0998 0.137 0.138 pDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 6.87e-01 0.0455 0.113 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 7.18e-07 0.535 0.105 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 5.03e-01 -0.056 0.0835 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 3.48e-01 -0.105 0.112 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 3.24e-01 0.118 0.119 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 7.88e-01 0.0253 0.0941 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 1.78e-05 0.403 0.0917 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 8.64e-01 0.0133 0.0775 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0448 0.109 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 1.78e-01 0.149 0.11 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 3.73e-01 0.0873 0.0978 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 1.76e-01 0.088 0.0648 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 1.79e-01 -0.12 0.0888 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 1.09e-01 -0.112 0.0695 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 3.42e-02 0.186 0.0871 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 8.19e-01 0.0211 0.0918 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 3.42e-02 0.183 0.0857 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 6.93e-01 0.0234 0.059 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 4.69e-02 -0.161 0.0804 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0265 0.106 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 2.82e-01 0.0982 0.091 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 sc-eQTL 2.49e-08 0.578 0.0998 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO 129259 sc-eQTL 8.68e-01 0.0156 0.0937 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -370 sc-eQTL 8.97e-01 0.0124 0.0955 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -342 sc-eQTL 7.94e-03 0.269 0.1 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 128349 sc-eQTL 5.08e-01 0.0638 0.0962 0.127 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 eQTL 3.75e-27 0.173 0.0156 0.0 0.0 0.162
ENSG00000120868 APAF1 -370 eQTL 2.96e-12 -0.092 0.013 0.0 0.0 0.162
ENSG00000166130 IKBIP -342 eQTL 0.0418 -0.0363 0.0178 0.0 0.0 0.162
ENSG00000227825 SLC9A7P1 187626 eQTL 0.00231 -0.0837 0.0274 0.0 0.0 0.162
ENSG00000245017 LINC02453 140916 eQTL 9.77e-05 -0.207 0.053 0.0 0.0 0.162


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075415 SLC25A3 51180 1.41e-05 4.74e-05 5.15e-06 1.03e-05 2.38e-06 5.43e-06 1.76e-05 2.18e-06 1.07e-05 6e-06 2.11e-05 1.01e-05 2.93e-05 9.29e-06 5.23e-06 6.97e-06 8.2e-06 1.12e-05 3.14e-06 2.92e-06 6.27e-06 1.31e-05 1.67e-05 4.69e-06 1.83e-05 4.36e-06 7.13e-06 5.32e-06 1.51e-05 7.71e-06 1.21e-05 1.19e-06 7.68e-07 3.28e-06 6.68e-06 3.3e-06 1.84e-06 1.87e-06 2.25e-06 2.82e-06 7.1e-07 2.02e-05 2.98e-06 1.81e-07 1.36e-06 3.13e-06 1.74e-06 7.89e-07 1.02e-06
ENSG00000120802 \N 129259 8.56e-06 2.87e-05 2.46e-06 6.69e-06 1.75e-06 2.7e-06 9.61e-06 1.16e-06 6.04e-06 4.28e-06 1.23e-05 6.62e-06 1.46e-05 5.15e-06 3.18e-06 3.9e-06 4.44e-06 4.76e-06 1.58e-06 1.15e-06 3.46e-06 7.65e-06 7.14e-06 2.76e-06 8.91e-06 2.1e-06 3.58e-06 3.27e-06 7.05e-06 3.87e-06 5.93e-06 1.03e-06 7.94e-07 2.18e-06 3.75e-06 2.13e-06 1.11e-06 4.39e-07 1.37e-06 1.69e-06 2.08e-07 1.16e-05 2.15e-06 2.68e-08 7.04e-07 2.08e-06 1.14e-06 7.14e-07 5.64e-07
ENSG00000120868 APAF1 -370 0.000208 0.000218 2.5e-05 5.55e-05 2.43e-05 7.02e-05 0.000182 2.28e-05 0.000176 7.33e-05 0.00021 8.18e-05 0.000274 6.88e-05 2.72e-05 0.000126 7.71e-05 0.00012 3.71e-05 3.33e-05 7.22e-05 0.000192 0.00018 3.88e-05 0.0002 4.42e-05 8.48e-05 5.98e-05 0.000166 8.08e-05 9.51e-05 5.77e-06 9.09e-06 2.88e-05 3.09e-05 2.19e-05 7.41e-06 1.11e-05 1.67e-05 7.57e-06 3.02e-06 0.00024 2.08e-05 8.26e-07 1.34e-05 2.1e-05 1.73e-05 8.75e-06 6.3e-06
ENSG00000166130 IKBIP -342 0.000212 0.000233 2.66e-05 5.85e-05 2.56e-05 7.34e-05 0.000192 2.35e-05 0.000184 7.52e-05 0.000226 8.48e-05 0.000285 7.17e-05 2.81e-05 0.000131 8.02e-05 0.000127 3.83e-05 3.68e-05 7.56e-05 0.000199 0.000188 4.18e-05 0.00021 4.6e-05 9.07e-05 6.33e-05 0.000172 8.68e-05 0.000103 6.16e-06 9.78e-06 3.17e-05 3.24e-05 2.4e-05 7.77e-06 1.15e-05 1.71e-05 8e-06 3.31e-06 0.000254 2.18e-05 9.41e-07 1.42e-05 2.24e-05 1.79e-05 9.11e-06 6.57e-06
ENSG00000227825 SLC9A7P1 187626 6.15e-06 1.54e-05 1.67e-06 5.06e-06 1.06e-06 1.55e-06 7.48e-06 1.01e-06 5.05e-06 3.1e-06 8.97e-06 4.77e-06 1.12e-05 3.54e-06 2.2e-06 2.68e-06 3.71e-06 3.99e-06 1.29e-06 9.54e-07 2.87e-06 4.83e-06 5.11e-06 1.81e-06 6.5e-06 1.62e-06 2.45e-06 2.09e-06 4.47e-06 2.55e-06 4.24e-06 7.35e-07 5.81e-07 1.65e-06 2.47e-06 1.54e-06 1.02e-06 4.75e-07 9.49e-07 9.42e-07 1.67e-07 8.09e-06 1.48e-06 1.21e-08 7.73e-07 1.75e-06 7.44e-07 6.85e-07 3.9e-07
ENSG00000245017 LINC02453 140916 7.8e-06 2.58e-05 2.57e-06 6.5e-06 1.59e-06 2.48e-06 9.53e-06 1.16e-06 5.23e-06 4.42e-06 1.12e-05 6.09e-06 1.34e-05 4.65e-06 2.98e-06 4.04e-06 4.16e-06 3.94e-06 1.43e-06 1.16e-06 3.13e-06 7.74e-06 6.93e-06 2.28e-06 9.11e-06 2.01e-06 3.16e-06 3.1e-06 6.71e-06 3.61e-06 5.48e-06 1.07e-06 7.35e-07 1.96e-06 3.56e-06 2.07e-06 1.02e-06 4.58e-07 1.26e-06 1.45e-06 2.4e-07 1.03e-05 1.76e-06 1.95e-08 7.07e-07 1.79e-06 1.09e-06 6.35e-07 6.21e-07