logo

Genes within 1Mb (chr12:97680426:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0745 0.0997 0.085 B L1
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 3.41e-01 -0.081 0.085 0.085 B L1
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 6.69e-03 0.308 0.112 0.085 B L1
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 5.09e-02 -0.278 0.142 0.085 B L1
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 8.29e-01 0.0252 0.117 0.085 B L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 2.90e-01 0.113 0.107 0.085 B L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0584 0.125 0.085 CD4T L1
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 5.48e-01 -0.06 0.0998 0.085 CD4T L1
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 8.20e-01 0.022 0.0967 0.085 CD4T L1
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0839 0.109 0.085 CD4T L1
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 8.68e-01 0.0225 0.135 0.085 CD4T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 8.70e-02 -0.169 0.0982 0.085 CD4T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0472 0.102 0.085 CD8T L1
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 5.38e-01 0.0578 0.0936 0.085 CD8T L1
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 5.91e-01 0.061 0.113 0.085 CD8T L1
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 3.12e-01 -0.125 0.124 0.085 CD8T L1
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 7.90e-02 -0.268 0.152 0.085 CD8T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 3.69e-01 0.0991 0.11 0.085 CD8T L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 1.38e-01 -0.15 0.101 0.086 DC L1
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0976 0.137 0.086 DC L1
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 3.22e-01 -0.113 0.114 0.086 DC L1
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 8.46e-02 -0.265 0.153 0.086 DC L1
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 1.92e-01 0.197 0.15 0.086 DC L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 5.93e-01 0.07 0.131 0.086 DC L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0306 0.0849 0.085 Mono L1
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0789 0.103 0.085 Mono L1
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 3.27e-01 0.0778 0.0793 0.085 Mono L1
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 1.71e-01 0.198 0.144 0.085 Mono L1
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0173 0.106 0.085 Mono L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0755 0.109 0.085 Mono L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0943 0.135 0.086 NK L1
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 9.10e-01 -0.013 0.114 0.086 NK L1
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 9.20e-01 -0.012 0.119 0.086 NK L1
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 2.22e-01 0.158 0.129 0.086 NK L1
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0395 0.124 0.086 NK L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 8.04e-01 0.0297 0.119 0.086 NK L1
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0779 0.113 0.085 Other_T L1
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 5.00e-01 0.0454 0.0672 0.085 Other_T L1
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0521 0.137 0.085 Other_T L1
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 9.19e-01 -0.015 0.148 0.085 Other_T L1
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0617 0.118 0.085 Other_T L1
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 9.98e-01 0.00029 0.0962 0.085 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0671 0.168 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0494 0.156 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 5.69e-01 0.0989 0.173 0.089 B_Activated L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 1.59e-01 0.234 0.165 0.089 B_Activated L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0471 0.174 0.089 B_Activated L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0623 0.154 0.089 B_Activated L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0294 0.141 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 7.46e-01 0.0373 0.115 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 1.91e-01 0.193 0.147 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 4.93e-01 0.11 0.16 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 6.99e-01 0.0573 0.148 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0713 0.134 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 8.42e-02 -0.238 0.137 0.086 B_Memory L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000795 0.14 0.086 B_Memory L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 1.74e-02 0.379 0.158 0.086 B_Memory L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0741 0.162 0.086 B_Memory L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 2.37e-01 0.188 0.158 0.086 B_Memory L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0472 0.15 0.086 B_Memory L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 5.12e-02 -0.236 0.121 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 2.37e-01 -0.112 0.0943 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 1.88e-01 0.187 0.142 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 5.04e-02 -0.305 0.155 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0595 0.15 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 4.93e-01 0.0921 0.134 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 7.13e-01 0.0564 0.153 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0901 0.129 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 2.07e-01 0.189 0.149 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 5.31e-01 -0.106 0.169 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 6.68e-01 0.0631 0.147 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 4.40e-01 0.109 0.141 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 9.06e-01 0.0187 0.159 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 2.01e-01 -0.194 0.152 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 3.40e-01 0.155 0.162 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 8.57e-01 0.0317 0.176 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 2.15e-01 0.199 0.16 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 8.62e-01 0.0293 0.168 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0888 0.123 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0496 0.111 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 4.85e-01 0.082 0.117 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 1.90e-01 -0.157 0.119 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 6.13e-01 0.0674 0.133 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 1.64e-01 -0.163 0.117 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 3.71e-01 -0.107 0.119 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00428 0.108 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 6.79e-01 0.0556 0.134 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 9.54e-01 0.00796 0.137 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0681 0.153 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0503 0.116 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0836 0.143 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 3.78e-01 0.119 0.135 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 3.00e-01 0.159 0.153 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 1.72e-01 -0.217 0.158 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 8.79e-01 0.0255 0.168 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 2.81e-01 -0.156 0.144 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 4.85e-01 -0.097 0.139 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 2.69e-01 0.143 0.129 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 3.67e-01 0.131 0.145 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0655 0.144 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 1.77e-01 -0.209 0.154 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 1.36e-01 0.213 0.142 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0656 0.134 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 3.98e-01 -0.108 0.127 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0852 0.157 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 3.93e-01 -0.122 0.142 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 1.98e-01 -0.209 0.162 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00259 0.134 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 2.22e-01 -0.209 0.171 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 1.54e-02 -0.345 0.141 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 4.24e-02 0.33 0.162 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 6.98e-01 0.0639 0.164 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 5.32e-01 -0.104 0.166 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 2.17e-01 -0.206 0.166 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 7.45e-01 0.0458 0.141 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 8.95e-01 0.019 0.144 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0554 0.165 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0824 0.167 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 9.58e-01 0.00875 0.165 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 9.33e-01 -0.013 0.154 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 9.53e-01 0.00936 0.157 0.084 MAIT L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 2.56e-01 0.17 0.15 0.084 MAIT L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 1.57e-01 -0.209 0.147 0.084 MAIT L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 6.14e-01 0.0812 0.161 0.084 MAIT L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0359 0.153 0.084 MAIT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0262 0.157 0.084 MAIT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 6.24e-01 0.0688 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 4.75e-03 0.401 0.14 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 9.54e-01 0.00929 0.159 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 4.06e-02 0.324 0.157 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 2.12e-01 -0.184 0.147 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 8.38e-02 0.277 0.159 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 4.82e-01 -0.101 0.144 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0939 0.125 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 8.73e-01 0.0211 0.132 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 4.54e-01 0.109 0.145 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0478 0.138 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 5.88e-01 0.0757 0.14 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 6.82e-01 0.0615 0.15 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 3.37e-01 -0.151 0.157 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 6.60e-01 0.0688 0.156 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0589 0.152 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 8.69e-01 0.026 0.158 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 7.73e-01 0.0428 0.148 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 9.62e-01 0.00711 0.149 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0347 0.129 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 4.55e-01 -0.106 0.141 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 2.55e-01 0.172 0.151 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 6.11e-01 0.0769 0.151 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0047 0.146 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 6.75e-02 -0.19 0.103 0.1 PB L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 8.79e-01 0.0302 0.197 0.1 PB L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 4.01e-01 0.154 0.183 0.1 PB L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 1.42e-01 0.299 0.202 0.1 PB L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 2.23e-01 -0.168 0.137 0.1 PB L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0881 0.183 0.1 PB L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 8.30e-01 0.0215 0.0999 0.087 Pro_T L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 1.52e-01 0.118 0.0822 0.087 Pro_T L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 1.65e-01 -0.229 0.164 0.087 Pro_T L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 9.06e-01 0.0175 0.148 0.087 Pro_T L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 4.93e-02 -0.227 0.115 0.087 Pro_T L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 3.60e-01 0.117 0.127 0.087 Pro_T L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0683 0.152 0.085 Treg L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0438 0.133 0.085 Treg L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 1.40e-01 -0.241 0.163 0.085 Treg L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 4.17e-02 0.335 0.163 0.085 Treg L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0878 0.158 0.085 Treg L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0598 0.142 0.085 Treg L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 3.80e-01 -0.107 0.122 0.09 cDC L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0754 0.152 0.09 cDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 1.30e-01 -0.182 0.12 0.09 cDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 9.47e-01 0.011 0.164 0.09 cDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 6.38e-01 0.0731 0.155 0.09 cDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0549 0.153 0.09 cDC L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0421 0.0795 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0583 0.112 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 2.82e-01 0.0922 0.0855 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0478 0.154 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 4.21e-01 0.0937 0.116 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 1.91e-01 -0.165 0.126 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0692 0.0919 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 2.70e-01 -0.135 0.122 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 2.31e-01 0.131 0.109 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 1.82e-01 0.222 0.165 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0663 0.134 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0964 0.131 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 1.97e-01 -0.229 0.177 0.076 gdT L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 4.75e-01 -0.135 0.188 0.076 gdT L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 7.85e-01 0.0551 0.202 0.076 gdT L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0047 0.2 0.076 gdT L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 3.13e-01 0.199 0.197 0.076 gdT L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0827 0.19 0.076 gdT L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 2.68e-01 0.123 0.111 0.084 intMono L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 4.46e-01 0.0982 0.129 0.084 intMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 8.85e-01 0.0182 0.125 0.084 intMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 6.77e-02 0.282 0.154 0.084 intMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0458 0.138 0.084 intMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 2.46e-01 0.182 0.156 0.084 intMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 3.96e-01 0.109 0.128 0.084 ncMono L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00103 0.0986 0.084 ncMono L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 3.09e-01 -0.124 0.122 0.084 ncMono L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 1.89e-02 0.331 0.14 0.084 ncMono L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 6.40e-01 0.069 0.147 0.084 ncMono L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 1.77e-01 0.174 0.129 0.084 ncMono L2
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 1.13e-01 -0.206 0.129 0.088 pDC L2
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 2.22e-01 -0.204 0.166 0.088 pDC L2
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 4.15e-01 0.126 0.154 0.088 pDC L2
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 6.43e-02 -0.315 0.169 0.088 pDC L2
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 2.86e-01 0.188 0.176 0.088 pDC L2
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 9.08e-01 0.0168 0.144 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0786 0.14 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000355 0.106 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 2.75e-02 0.311 0.14 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 3.27e-01 0.156 0.159 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 3.18e-01 0.15 0.15 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0912 0.119 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 1.80e-01 -0.162 0.12 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0909 0.0973 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 4.50e-02 0.273 0.135 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 2.16e-02 -0.354 0.153 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 8.39e-01 0.0283 0.139 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 2.88e-01 0.131 0.123 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0544 0.0805 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0846 0.11 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 2.59e-01 0.0977 0.0863 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 4.74e-01 0.112 0.157 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0219 0.109 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 2.40e-01 -0.134 0.113 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 5.27e-01 0.0696 0.11 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 9.07e-01 0.00876 0.0749 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0253 0.103 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 4.03e-03 0.408 0.14 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 7.21e-01 0.0482 0.135 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 3.08e-02 0.249 0.114 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 sc-eQTL 7.73e-01 -0.039 0.135 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120802 TMPO -835086 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0761 0.118 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120868 APAF1 -964715 sc-eQTL 9.90e-01 0.00153 0.12 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139350 NEDD1 773203 sc-eQTL 3.09e-01 0.134 0.131 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166130 IKBIP -964687 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0287 0.128 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257167 TMPO-AS1 -835996 sc-eQTL 9.75e-01 0.00388 0.121 0.086 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075415 SLC25A3 -913165 eQTL 0.0105 -0.0582 0.0227 0.00105 0.0 0.0765
ENSG00000166130 IKBIP -964687 eQTL 0.0343 -0.0521 0.0246 0.00213 0.0 0.0765
ENSG00000245017 LINC02453 -823429 eQTL 0.0246 0.165 0.0734 0.0 0.0 0.0765

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139350 \N 773203 3.02e-07 1.5e-07 6.28e-08 2.07e-07 1.01e-07 8.37e-08 1.99e-07 5.68e-08 1.59e-07 9.35e-08 1.63e-07 1.23e-07 2.05e-07 8e-08 5.36e-08 8.71e-08 4.35e-08 1.72e-07 7.16e-08 5.48e-08 1.18e-07 1.47e-07 1.62e-07 3.42e-08 1.98e-07 1.31e-07 1.2e-07 1.12e-07 1.31e-07 1.05e-07 1.06e-07 4.23e-08 3.56e-08 9.78e-08 3.57e-08 2.68e-08 4.28e-08 7.61e-08 6.28e-08 5.24e-08 6e-08 1.52e-07 3.99e-08 1.1e-08 3.55e-08 8.31e-09 7.97e-08 2.16e-09 4.94e-08
ENSG00000245017 LINC02453 -823429 2.91e-07 1.33e-07 6.04e-08 2.01e-07 9.82e-08 8.21e-08 1.81e-07 5.62e-08 1.5e-07 7.6e-08 1.67e-07 1.19e-07 1.79e-07 7.95e-08 5.94e-08 7.89e-08 4.18e-08 1.56e-07 7.12e-08 5.2e-08 1.22e-07 1.39e-07 1.58e-07 3.07e-08 1.72e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.05e-07 1.08e-07 3.84e-08 3.21e-08 8.89e-08 3.02e-08 2.68e-08 5.42e-08 8.2e-08 6.76e-08 4.08e-08 5.48e-08 1.46e-07 4.7e-08 7.51e-09 2.64e-08 1.71e-08 8.61e-08 2.05e-09 4.83e-08