logo

Genes within 1Mb (chr12:94857930:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 2.02e-02 0.183 0.0781 0.263 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 3.00e-01 0.0964 0.0927 0.263 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 6.81e-01 0.0287 0.0696 0.263 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 1.67e-01 -0.121 0.0875 0.263 B L1
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00779 0.0802 0.263 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0274 0.0527 0.263 B L1
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 8.57e-01 0.012 0.0665 0.263 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 7.30e-01 0.0277 0.0804 0.263 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0218 0.0383 0.263 B L1
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0383 0.066 0.263 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 4.31e-01 0.0452 0.0573 0.263 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 2.35e-01 0.0758 0.0636 0.263 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 4.66e-01 0.0636 0.0871 0.263 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 5.46e-01 0.0339 0.0561 0.263 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 1.14e-01 0.0927 0.0584 0.263 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 5.22e-04 0.211 0.0599 0.263 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0347 0.0786 0.263 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 7.92e-01 0.014 0.0528 0.263 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 7.03e-01 0.0256 0.0672 0.263 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0291 0.0856 0.263 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 7.88e-01 0.0206 0.0766 0.263 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 7.81e-02 0.128 0.0723 0.263 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00308 0.068 0.263 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 1.80e-01 0.0745 0.0554 0.263 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 3.09e-01 -0.096 0.094 0.261 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 3.16e-01 0.1 0.0997 0.261 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 5.15e-01 0.0644 0.0988 0.261 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 9.70e-01 0.00359 0.0958 0.261 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00662 0.0894 0.261 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 9.21e-01 0.00793 0.0796 0.261 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00618 0.0886 0.261 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 4.76e-03 0.209 0.0732 0.261 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 2.31e-01 -0.103 0.086 0.263 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 1.54e-02 0.162 0.0661 0.263 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0302 0.0687 0.263 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 1.81e-01 0.109 0.0815 0.263 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0629 0.0554 0.263 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 9.08e-02 -0.139 0.0816 0.263 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 1.00e-01 0.12 0.0727 0.263 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 2.75e-05 0.216 0.0504 0.263 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0486 0.0865 0.264 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 8.52e-01 0.0152 0.0816 0.264 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 1.56e-01 0.0971 0.0681 0.264 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0963 0.0808 0.264 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00897 0.0668 0.264 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 2.09e-01 0.0952 0.0756 0.264 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 2.35e-03 0.169 0.0548 0.264 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0577 0.0974 0.263 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 5.96e-01 0.0441 0.083 0.263 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -933222 sc-eQTL 3.28e-01 0.0719 0.0733 0.263 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 8.05e-01 0.0187 0.0758 0.263 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 4.13e-01 0.0775 0.0945 0.263 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0356 0.0768 0.263 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 7.37e-01 0.0291 0.0864 0.263 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 6.11e-02 0.0898 0.0477 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 9.55e-01 0.00598 0.105 0.276 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0629 0.0895 0.276 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0249 0.11 0.276 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 6.79e-01 0.0436 0.105 0.276 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0257 0.0802 0.276 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0124 0.0847 0.276 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 6.01e-02 0.197 0.104 0.276 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 2.20e-01 0.091 0.0739 0.276 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0235 0.0929 0.276 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 2.80e-01 0.104 0.0956 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 2.04e-01 0.123 0.0966 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0552 0.0884 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0646 0.0969 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 4.41e-01 0.0765 0.0992 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0057 0.0816 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 8.26e-01 0.0199 0.0904 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0466 0.0887 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0982 0.0731 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 2.91e-01 0.106 0.1 0.263 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0135 0.102 0.263 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0166 0.0973 0.263 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 5.24e-03 -0.29 0.103 0.263 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 2.55e-01 0.106 0.093 0.263 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 4.57e-01 0.0587 0.0787 0.263 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 8.38e-01 0.0188 0.0919 0.263 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 3.43e-01 0.088 0.0926 0.263 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0207 0.0746 0.263 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 2.30e-01 0.114 0.0942 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 9.12e-01 0.0106 0.0956 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 9.10e-03 0.208 0.0791 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 5.26e-01 0.0622 0.098 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0467 0.0967 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 7.88e-01 0.0219 0.0812 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0594 0.0838 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 9.75e-01 0.00294 0.0919 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0603 0.0534 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0847 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 1.81e-04 0.343 0.0901 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0804 0.094 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0858 0.103 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 5.31e-01 0.059 0.0941 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 7.42e-02 -0.155 0.0865 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 4.51e-01 0.0693 0.0919 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 8.09e-01 0.0186 0.0771 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0272 0.0758 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00491 0.1 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0027 0.105 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 1.10e-01 0.168 0.104 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0083 0.0834 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 1.44e-01 0.137 0.0932 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 6.64e-01 0.0417 0.0957 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 1.35e-01 0.129 0.0858 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0266 0.0751 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 4.66e-01 0.0475 0.065 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 2.57e-01 0.09 0.0792 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 7.46e-01 0.0297 0.0915 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00435 0.0623 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 5.64e-01 0.0389 0.0673 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 1.97e-03 0.177 0.0566 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0179 0.0786 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 9.04e-01 0.00889 0.0737 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 4.53e-01 0.0645 0.0857 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 6.79e-01 0.0413 0.0998 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 5.67e-01 0.042 0.0734 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 1.31e-01 0.118 0.0779 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 2.27e-03 0.204 0.066 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 4.15e-01 0.0833 0.102 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 3.77e-01 0.0801 0.0904 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0273 0.0951 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 2.24e-01 0.116 0.0953 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 9.07e-02 0.138 0.0811 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 7.90e-01 0.0244 0.0917 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 1.02e-02 0.212 0.0816 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 9.03e-01 0.011 0.0904 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 5.35e-01 0.0495 0.0796 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 1.04e-01 -0.147 0.0899 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 6.90e-01 0.0399 0.1 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 5.59e-01 0.0561 0.0958 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 2.59e-02 0.181 0.0808 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 1.18e-01 0.141 0.0896 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 2.73e-01 0.0777 0.0707 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 5.33e-02 -0.177 0.0911 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 8.55e-02 0.123 0.0713 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 2.28e-01 0.1 0.0829 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0899 0.0921 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 5.50e-01 0.0499 0.0833 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 7.84e-01 0.0232 0.0843 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 4.76e-01 -0.058 0.0812 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 4.64e-01 0.0493 0.0673 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 4.39e-01 0.0784 0.101 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 7.17e-01 0.0283 0.0781 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 4.77e-01 0.0731 0.103 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0721 0.103 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 3.91e-01 0.0796 0.0926 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 4.97e-01 0.0665 0.0977 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 2.09e-01 0.126 0.1 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 8.21e-01 0.0183 0.0808 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00358 0.103 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 2.66e-01 0.0981 0.0879 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 3.80e-02 0.206 0.0985 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 8.33e-01 0.0221 0.105 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 8.64e-01 0.0149 0.0869 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0699 0.0988 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 7.74e-01 0.0293 0.102 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 2.95e-01 0.0912 0.087 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0977 0.102 0.264 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 4.55e-01 0.065 0.0868 0.264 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -933222 sc-eQTL 5.31e-01 0.0497 0.0792 0.264 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 2.25e-01 0.121 0.0995 0.264 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000398 0.0968 0.264 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 1.03e-01 -0.139 0.0846 0.264 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0452 0.0975 0.264 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 8.82e-02 0.145 0.0847 0.264 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 1.50e-01 -0.149 0.103 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 8.02e-01 0.025 0.0994 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 7.58e-01 0.0315 0.102 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 2.37e-01 -0.127 0.107 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 5.19e-01 0.0567 0.0878 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00572 0.089 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 1.91e-01 0.111 0.0849 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0105 0.0971 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 4.84e-01 0.0592 0.0845 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 1.50e-01 0.126 0.0872 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0282 0.0893 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 8.96e-01 0.0103 0.0784 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 4.55e-02 0.181 0.0898 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 1.70e-03 0.196 0.0618 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 6.62e-01 0.0466 0.107 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 1.56e-01 0.134 0.094 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0723 0.0992 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 7.70e-01 0.0306 0.105 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00933 0.0856 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 7.19e-02 -0.176 0.0975 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 2.60e-01 0.0997 0.0882 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0417 0.0903 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0622 0.0926 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 4.26e-01 0.0731 0.0916 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 9.23e-01 0.00923 0.095 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0874 0.082 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0259 0.0944 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 6.75e-02 0.12 0.0653 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 1.21e-01 0.195 0.125 0.263 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0512 0.113 0.263 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 1.10e-01 -0.201 0.124 0.263 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0594 0.119 0.263 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 2.53e-01 -0.129 0.112 0.263 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 3.49e-01 -0.109 0.116 0.263 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0447 0.121 0.263 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 2.59e-01 0.113 0.1 0.263 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 5.99e-01 0.0373 0.0706 0.263 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 1.45e-01 -0.137 0.0938 0.263 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 7.50e-01 0.0268 0.084 0.263 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -933222 sc-eQTL 5.16e-01 0.0445 0.0685 0.263 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 9.73e-01 0.00274 0.0809 0.263 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 1.47e-01 0.141 0.0971 0.263 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 5.31e-01 0.0599 0.0954 0.263 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0822 0.0944 0.263 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0631 0.0589 0.263 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0453 0.0971 0.263 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0943 0.0914 0.263 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 6.37e-01 0.0458 0.097 0.263 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 9.52e-01 0.00528 0.0868 0.263 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0513 0.0894 0.263 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 6.59e-01 0.0423 0.0957 0.263 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 8.39e-02 0.127 0.0729 0.263 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 5.30e-02 -0.186 0.0954 0.261 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0279 0.104 0.261 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 4.06e-01 0.0878 0.105 0.261 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 9.27e-01 0.00934 0.102 0.261 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00525 0.0908 0.261 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 2.30e-01 0.102 0.0848 0.261 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0374 0.0977 0.261 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 1.04e-02 0.212 0.0817 0.261 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0729 0.0952 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 1.87e-02 0.175 0.074 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0156 0.0823 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 9.04e-02 0.147 0.0861 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0635 0.066 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 6.53e-02 -0.166 0.0893 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 5.80e-02 0.145 0.0762 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 8.46e-04 0.18 0.0531 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 7.37e-01 0.0325 0.0967 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 2.15e-01 0.105 0.0844 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 6.92e-01 0.0371 0.0934 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 3.10e-01 0.0935 0.0919 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 1.19e-01 -0.107 0.0687 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 5.95e-01 0.052 0.0976 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 8.19e-01 0.0205 0.0894 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 1.92e-04 0.234 0.0615 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 1.34e-01 0.183 0.121 0.261 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 6.09e-01 0.0479 0.0935 0.261 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -933222 sc-eQTL 1.14e-02 0.233 0.0908 0.261 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 8.86e-02 -0.197 0.115 0.261 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 2.53e-01 0.142 0.124 0.261 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 1.90e-01 0.154 0.117 0.261 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 2.20e-01 0.141 0.115 0.261 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0412 0.1 0.261 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 9.79e-01 0.0028 0.104 0.267 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 8.60e-01 0.0178 0.101 0.267 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0589 0.106 0.267 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0694 0.0986 0.267 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 1.35e-01 -0.127 0.0845 0.267 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 1.35e-01 -0.153 0.102 0.267 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 1.57e-01 0.13 0.0915 0.267 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 1.08e-03 0.212 0.0639 0.267 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 7.32e-01 0.0333 0.0969 0.265 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 6.91e-01 0.0372 0.0935 0.265 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0259 0.102 0.265 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 8.94e-01 0.0135 0.101 0.265 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 1.00e-01 0.106 0.064 0.265 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0144 0.101 0.265 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 3.77e-01 0.0845 0.0955 0.265 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 3.25e-01 0.0837 0.0849 0.265 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 2.66e-01 0.119 0.106 0.277 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 2.08e-01 0.131 0.103 0.277 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 3.64e-01 0.0989 0.109 0.277 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 4.75e-01 0.0769 0.107 0.277 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 7.30e-01 0.0358 0.103 0.277 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 1.01e-01 -0.182 0.11 0.277 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 2.47e-01 0.108 0.0932 0.277 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 2.77e-01 0.1 0.092 0.277 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 9.25e-02 0.16 0.0945 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 6.31e-01 0.0483 0.1 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0238 0.0886 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 1.38e-02 -0.249 0.1 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 7.19e-01 0.034 0.0943 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00394 0.0608 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 3.75e-01 0.0753 0.0847 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 5.94e-01 0.0451 0.0844 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0688 0.0581 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 7.11e-01 0.0332 0.0894 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 9.88e-02 0.149 0.0902 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 4.93e-02 0.146 0.074 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0267 0.0971 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -693546 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00996 0.0862 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 4.23e-01 -0.059 0.0735 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0359 0.0767 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 5.17e-01 0.0613 0.0946 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0477 0.0522 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0883 0.0871 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 5.64e-03 0.19 0.0679 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00837 0.0746 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 4.74e-02 0.16 0.0805 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0854 0.061 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 2.03e-01 -0.106 0.0832 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 6.45e-02 0.139 0.0748 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 5.67e-05 0.205 0.0498 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0415 0.0989 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 5.24e-01 0.0586 0.0917 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0859 0.0905 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0221 0.101 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 5.60e-01 0.0342 0.0585 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 1.88e-01 -0.128 0.0969 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -359552 sc-eQTL 3.69e-02 0.173 0.0822 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 2.05e-02 0.153 0.0654 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -359816 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0207 0.0898 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 207373 sc-eQTL 5.33e-01 0.0522 0.0837 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -615590 sc-eQTL 1.24e-01 0.11 0.0713 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -215698 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00764 0.0813 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 709353 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0312 0.0713 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 397942 sc-eQTL 2.34e-01 0.0954 0.0799 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 sc-eQTL 1.89e-03 0.181 0.0575 0.263 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -359816 eQTL 0.0367 0.0343 0.0164 0.0 0.0 0.234
ENSG00000111142 METAP2 -615590 pQTL 0.0207 -0.0324 0.014 0.0 0.0 0.238
ENSG00000180263 FGD6 -359552 eQTL 3.11e-07 0.114 0.022 0.0272 0.024 0.234
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 eQTL 6.68e-14 0.152 0.02 0.0 0.0 0.234
ENSG00000278916 CEP83-DT 397927 eQTL 0.0268 0.0902 0.0407 0.0011 0.0 0.234

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000180263 FGD6 -359552 1.28e-06 9.52e-07 1.76e-07 1.14e-06 1.4e-07 4.79e-07 1.22e-06 2.28e-07 1.2e-06 4.03e-07 1.35e-06 5.73e-07 2.16e-06 2.63e-07 5.65e-07 6.57e-07 6.37e-07 5.53e-07 5.31e-07 6.2e-07 2.89e-07 1.08e-06 6.33e-07 3.12e-07 1.93e-06 2.37e-07 6.81e-07 5.29e-07 8.47e-07 9.57e-07 5.23e-07 6.15e-08 1.27e-07 4.04e-07 6.24e-07 2.78e-07 3.64e-07 1.58e-07 2.19e-07 9.61e-09 1.92e-07 1.51e-06 5.45e-08 2.68e-08 1.92e-07 1.12e-07 1.8e-07 8.48e-08 9.32e-08
ENSG00000184752 NDUFA12 -145818 5.29e-06 7.69e-06 7.79e-07 3.67e-06 1.08e-06 1.54e-06 6.53e-06 1.04e-06 5.03e-06 2.81e-06 6.45e-06 3.52e-06 9.9e-06 2.19e-06 1.06e-06 3.79e-06 1.92e-06 3.36e-06 1.45e-06 1.09e-06 2.85e-06 5.38e-06 4.58e-06 1.65e-06 8.19e-06 1.32e-06 2.32e-06 1.81e-06 4.58e-06 4.12e-06 2.85e-06 5.09e-07 7.75e-07 1.58e-06 2.07e-06 8.52e-07 8.96e-07 4.89e-07 8.94e-07 4.28e-07 1.51e-07 7.76e-06 3.83e-07 1.93e-07 3.45e-07 1.13e-06 7.92e-07 3.18e-07 3.41e-07
ENSG00000236349 \N 309689 1.39e-06 1.36e-06 3.08e-07 1.27e-06 2.98e-07 6.36e-07 1.46e-06 3.26e-07 1.66e-06 5.9e-07 1.89e-06 6.45e-07 2.58e-06 4.89e-07 4.48e-07 9.27e-07 8.01e-07 6.58e-07 8.83e-07 6.19e-07 5.66e-07 1.69e-06 8.59e-07 5.6e-07 2.22e-06 3.91e-07 9.45e-07 7.19e-07 1.35e-06 1.29e-06 6.68e-07 2.53e-07 2.14e-07 6.76e-07 6.12e-07 4.34e-07 5.58e-07 2.38e-07 5.01e-07 2.46e-07 2.98e-07 1.64e-06 1.39e-07 6.53e-08 1.64e-07 3.19e-07 2.41e-07 1.15e-07 1.63e-07