logo

Genes within 1Mb (chr12:94852035:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 3.29e-02 0.167 0.0778 0.267 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 2.36e-01 0.11 0.0922 0.267 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 7.46e-01 0.0224 0.0692 0.267 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 1.21e-01 -0.135 0.087 0.267 B L1
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0153 0.0798 0.267 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0172 0.0524 0.267 B L1
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 7.41e-01 0.0219 0.0662 0.267 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 6.50e-01 0.0364 0.08 0.267 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0193 0.0381 0.267 B L1
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0539 0.0654 0.267 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 4.16e-01 0.0463 0.0568 0.267 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 1.77e-01 0.0855 0.0631 0.267 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 4.78e-01 0.0615 0.0864 0.267 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 5.40e-01 0.0341 0.0556 0.267 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 1.06e-01 0.0942 0.058 0.267 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 4.23e-04 0.213 0.0594 0.267 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0338 0.0778 0.267 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 7.65e-01 0.0156 0.0523 0.267 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 9.32e-01 0.00568 0.0666 0.267 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0545 0.0847 0.267 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 7.51e-01 0.0241 0.0758 0.267 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 5.66e-02 0.137 0.0715 0.267 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0245 0.0673 0.267 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 2.03e-01 0.0702 0.0549 0.267 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 2.06e-01 -0.118 0.0933 0.266 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 3.96e-01 0.0843 0.099 0.266 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 4.79e-01 0.0696 0.0981 0.266 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00951 0.0952 0.266 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 9.34e-01 0.00737 0.0888 0.266 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 8.88e-01 0.0112 0.0791 0.266 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 8.67e-01 0.0147 0.088 0.266 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 3.15e-03 0.217 0.0725 0.266 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0969 0.0853 0.267 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 1.73e-02 0.157 0.0656 0.267 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0329 0.0681 0.267 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 2.36e-01 0.0961 0.081 0.267 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0569 0.055 0.267 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 8.66e-02 -0.139 0.0809 0.267 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 9.15e-02 0.122 0.0721 0.267 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 2.42e-05 0.216 0.05 0.267 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0433 0.0857 0.268 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 5.67e-01 0.0463 0.0808 0.268 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 1.48e-01 0.098 0.0675 0.268 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 1.93e-01 -0.105 0.0801 0.268 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0189 0.0662 0.268 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 2.58e-01 0.0851 0.0751 0.268 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 1.02e-03 0.18 0.0541 0.268 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0546 0.0965 0.267 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 5.82e-01 0.0453 0.0822 0.267 Other_T L1
ENSG00000074527 NTN4 -939117 sc-eQTL 4.38e-01 0.0565 0.0726 0.267 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 8.36e-01 0.0155 0.0751 0.267 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 6.18e-01 0.0467 0.0937 0.267 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0343 0.076 0.267 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 8.60e-01 0.0151 0.0856 0.267 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 6.71e-02 0.087 0.0473 0.267 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 9.61e-01 0.00509 0.104 0.281 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0258 0.0889 0.281 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0161 0.109 0.281 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 6.43e-01 0.0484 0.104 0.281 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0164 0.0795 0.281 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00736 0.084 0.281 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 7.64e-02 0.185 0.104 0.281 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 1.70e-01 0.101 0.0733 0.281 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0358 0.0921 0.281 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 3.04e-01 0.0978 0.0949 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 1.88e-01 0.126 0.0958 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0412 0.0877 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 4.12e-01 -0.079 0.0961 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 6.60e-01 0.0433 0.0985 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00285 0.081 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0092 0.0897 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0537 0.088 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 1.62e-01 -0.102 0.0725 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 4.17e-01 0.0811 0.0998 0.267 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0331 0.101 0.267 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0384 0.0969 0.267 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 4.14e-03 -0.296 0.102 0.267 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 2.69e-01 0.103 0.0926 0.267 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 5.18e-01 0.0507 0.0784 0.267 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 6.58e-01 0.0405 0.0915 0.267 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 4.13e-01 0.0757 0.0922 0.267 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0221 0.0743 0.267 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 2.64e-01 0.105 0.0935 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 7.76e-01 0.027 0.0948 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 9.80e-03 0.205 0.0785 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 6.58e-01 0.0431 0.0973 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0521 0.0959 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 7.10e-01 0.03 0.0806 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 6.40e-01 -0.039 0.0832 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 9.11e-01 0.0102 0.0912 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0505 0.053 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 2.33e-01 -0.121 0.101 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 1.64e-04 0.343 0.0893 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0949 0.0932 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0636 0.102 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 5.03e-01 0.0626 0.0933 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 1.13e-01 -0.137 0.0859 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 4.33e-01 0.0715 0.0911 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 7.07e-01 0.0288 0.0765 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0194 0.0752 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00165 0.0995 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0214 0.104 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 9.87e-02 0.172 0.104 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 9.12e-01 0.00918 0.0828 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 1.00e-01 0.152 0.0923 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 5.51e-01 0.0567 0.095 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 1.26e-01 0.131 0.0851 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 6.98e-01 -0.029 0.0745 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 4.16e-01 0.0526 0.0645 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 2.00e-01 0.101 0.0785 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 7.46e-01 0.0294 0.0908 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 9.24e-01 0.0059 0.0618 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 6.33e-01 0.032 0.0668 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 2.24e-03 0.174 0.0562 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0499 0.078 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 9.83e-01 0.00152 0.0731 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 3.82e-01 0.0745 0.085 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 6.61e-01 0.0435 0.099 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 5.95e-01 0.0387 0.0728 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 1.38e-01 0.115 0.0773 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 1.77e-03 0.207 0.0654 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 5.86e-01 0.0551 0.101 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 3.19e-01 0.0894 0.0895 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0561 0.0941 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 3.10e-01 0.0962 0.0945 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 1.47e-01 0.117 0.0804 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 8.02e-01 0.0228 0.0908 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 2.03e-02 0.189 0.081 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0131 0.09 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 5.48e-01 0.0477 0.0793 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 5.33e-02 -0.173 0.0892 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 7.64e-01 0.03 0.0996 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 5.74e-01 0.0537 0.0954 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 1.31e-02 0.201 0.0802 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 1.68e-01 0.123 0.0893 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 3.08e-01 0.072 0.0704 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 1.11e-01 -0.145 0.0907 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 7.28e-02 0.128 0.0707 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 3.92e-01 0.0707 0.0824 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0904 0.0914 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 6.12e-01 0.042 0.0827 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 6.06e-01 0.0432 0.0836 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0625 0.0806 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 5.88e-01 0.0362 0.0668 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 4.78e-01 0.0713 0.1 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 7.81e-01 0.0216 0.0774 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 4.94e-01 0.0697 0.102 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0911 0.102 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 4.20e-01 0.0741 0.0918 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 5.04e-01 0.0648 0.0968 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 2.13e-01 0.124 0.0991 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 8.09e-01 0.0193 0.08 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 9.57e-01 0.00557 0.103 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 2.41e-01 0.103 0.088 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 4.70e-02 0.197 0.0987 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 7.89e-01 0.0281 0.105 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 7.26e-01 0.0305 0.087 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0728 0.099 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 8.60e-01 0.018 0.102 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 2.58e-01 0.0987 0.0871 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0746 0.102 0.268 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 4.28e-01 0.0683 0.0861 0.268 MAIT L2
ENSG00000074527 NTN4 -939117 sc-eQTL 6.29e-01 0.0381 0.0786 0.268 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 2.54e-01 0.113 0.0987 0.268 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0317 0.096 0.268 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 1.54e-01 -0.12 0.0841 0.268 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0668 0.0966 0.268 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 8.07e-02 0.147 0.084 0.268 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 2.29e-01 -0.125 0.103 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 7.22e-01 0.0354 0.0992 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 7.83e-01 0.0281 0.102 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0975 0.107 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 5.50e-01 0.0525 0.0877 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 8.78e-01 0.0136 0.0888 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 1.64e-01 0.118 0.0847 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0104 0.0967 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 2.78e-01 0.0914 0.084 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 1.20e-01 0.135 0.0868 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0222 0.0889 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00531 0.0781 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 5.24e-02 0.175 0.0895 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 6.39e-04 0.212 0.0613 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 6.94e-01 0.0416 0.106 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 1.00e-01 0.154 0.0932 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0474 0.0986 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 7.62e-01 0.0316 0.104 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00745 0.085 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 6.47e-02 -0.18 0.0967 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 2.68e-01 0.0972 0.0876 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0202 0.0896 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0817 0.0918 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 7.00e-01 0.0352 0.091 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0317 0.0942 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0961 0.0812 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0392 0.0936 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 3.91e-02 0.134 0.0646 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 9.19e-02 0.208 0.123 0.27 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0486 0.112 0.27 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 1.35e-01 -0.185 0.123 0.27 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0712 0.118 0.27 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 2.00e-01 -0.142 0.11 0.27 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0996 0.114 0.27 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 8.41e-01 -0.024 0.119 0.27 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 1.82e-01 0.132 0.0983 0.27 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 6.08e-01 0.0358 0.0696 0.27 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 1.38e-01 -0.139 0.0931 0.267 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 7.10e-01 0.031 0.0834 0.267 Pro_T L2
ENSG00000074527 NTN4 -939117 sc-eQTL 5.15e-01 0.0443 0.068 0.267 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00244 0.0804 0.267 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 1.87e-01 0.128 0.0965 0.267 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 6.11e-01 0.0483 0.0948 0.267 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0834 0.0937 0.267 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0703 0.0585 0.267 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0508 0.0963 0.267 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0737 0.0908 0.267 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 6.89e-01 0.0386 0.0962 0.267 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 9.80e-01 0.00217 0.0862 0.267 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0477 0.0887 0.267 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 4.64e-01 0.0696 0.0949 0.267 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 5.80e-02 0.138 0.0722 0.267 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 3.00e-02 -0.207 0.0947 0.266 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0448 0.103 0.266 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 4.34e-01 0.0823 0.105 0.266 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00783 0.101 0.266 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 9.39e-01 0.00693 0.0903 0.266 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 2.10e-01 0.106 0.0843 0.266 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0302 0.0972 0.266 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 7.27e-03 0.22 0.0811 0.266 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0665 0.0946 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 2.03e-02 0.172 0.0735 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0204 0.0817 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 1.13e-01 0.136 0.0856 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0553 0.0655 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 5.63e-02 -0.17 0.0887 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 5.50e-02 0.146 0.0757 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 6.18e-04 0.183 0.0527 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 7.33e-01 0.0328 0.096 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 2.31e-01 0.101 0.0838 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 6.65e-01 0.0403 0.0928 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 3.48e-01 0.0858 0.0912 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 1.11e-01 -0.109 0.0681 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 6.28e-01 0.047 0.0969 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 7.58e-01 0.0274 0.0887 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 1.61e-04 0.235 0.061 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 1.34e-01 0.183 0.121 0.261 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 6.09e-01 0.0479 0.0935 0.261 gdT L2
ENSG00000074527 NTN4 -939117 sc-eQTL 1.14e-02 0.233 0.0908 0.261 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 8.86e-02 -0.197 0.115 0.261 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 2.53e-01 0.142 0.124 0.261 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 1.90e-01 0.154 0.117 0.261 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 2.20e-01 0.141 0.115 0.261 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0412 0.1 0.261 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 9.59e-01 0.00534 0.103 0.271 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 8.77e-01 0.0154 0.0997 0.271 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0615 0.105 0.271 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0972 0.0975 0.271 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 2.03e-01 -0.107 0.0838 0.271 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 1.58e-01 -0.143 0.101 0.271 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 2.03e-01 0.116 0.0906 0.271 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 1.20e-03 0.208 0.0633 0.271 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 6.38e-01 0.0452 0.0959 0.269 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 6.48e-01 0.0424 0.0926 0.269 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0169 0.101 0.269 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 8.11e-01 0.024 0.1 0.269 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 1.02e-01 0.104 0.0634 0.269 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 8.34e-01 0.021 0.0997 0.269 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 3.39e-01 0.0907 0.0945 0.269 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 3.73e-01 0.0751 0.0841 0.269 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 2.62e-01 0.119 0.105 0.28 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 2.72e-01 0.113 0.103 0.28 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 3.13e-01 0.109 0.108 0.28 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 5.00e-01 0.0722 0.107 0.28 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 6.58e-01 0.0455 0.103 0.28 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 7.46e-02 -0.196 0.109 0.28 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 1.40e-01 0.137 0.0923 0.28 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 2.58e-01 0.104 0.0912 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 1.41e-01 0.139 0.0939 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 5.44e-01 0.0605 0.0996 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0179 0.088 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 7.10e-03 -0.27 0.0993 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 8.67e-01 0.0157 0.0936 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00642 0.0603 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 4.24e-01 0.0674 0.0841 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 6.57e-01 0.0373 0.0837 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0714 0.0576 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 9.00e-01 0.0112 0.0889 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 6.70e-02 0.165 0.0895 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 5.94e-02 0.139 0.0736 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0333 0.0965 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -699441 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00929 0.0856 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0409 0.0731 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0217 0.0763 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 4.38e-01 0.073 0.094 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0396 0.0519 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0834 0.0865 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 6.60e-03 0.185 0.0675 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0104 0.0741 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 6.25e-02 0.15 0.08 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0826 0.0606 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 1.73e-01 -0.113 0.0826 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 5.89e-02 0.141 0.0743 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 4.84e-05 0.205 0.0495 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0316 0.0982 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 5.45e-01 0.0552 0.091 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0799 0.0898 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0453 0.101 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 4.75e-01 0.0416 0.058 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 2.82e-01 -0.104 0.0963 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -365447 sc-eQTL 4.15e-02 0.167 0.0816 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 2.41e-02 0.147 0.0649 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -365711 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0175 0.0891 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 201478 sc-eQTL 3.14e-01 0.0838 0.083 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -621485 sc-eQTL 1.23e-01 0.11 0.0708 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -221593 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0227 0.0807 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 703458 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0389 0.0707 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 392047 sc-eQTL 3.07e-01 0.0813 0.0794 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 sc-eQTL 7.76e-04 0.194 0.0569 0.267 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -365711 eQTL 0.0476 0.0323 0.0163 0.0 0.0 0.238
ENSG00000111142 METAP2 -621485 pQTL 0.0313 -0.0301 0.014 0.0 0.0 0.242
ENSG00000180263 FGD6 -365447 eQTL 4.18e-07 0.112 0.0219 0.0219 0.0188 0.238
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 eQTL 1.01e-13 0.15 0.0199 0.0 0.0 0.238
ENSG00000278916 CEP83-DT 392032 eQTL 0.0216 0.093 0.0404 0.00123 0.0 0.238

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074527 \N -939117 2.61e-07 1.1e-07 3.62e-08 1.79e-07 8.92e-08 9.57e-08 1.41e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.62e-07 7.88e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.55e-08 7.89e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.2e-08 1.04e-07 1.3e-07 1.3e-07 4.26e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.12e-07 8.7e-08 9.88e-08 1.1e-07 9.58e-08 3.89e-08 3.26e-08 8.68e-08 8.93e-08 3.96e-08 4.89e-08 9.62e-08 7.63e-08 3.05e-08 4.46e-08 1.36e-07 4.33e-08 1.53e-08 5.87e-08 1.69e-08 1.25e-07 3.8e-09 4.73e-08
ENSG00000180263 FGD6 -365447 8.43e-07 4.93e-07 9.49e-08 3.57e-07 1.07e-07 1.71e-07 5.01e-07 9.26e-08 3.03e-07 1.89e-07 4.3e-07 3.11e-07 6e-07 1.1e-07 1.71e-07 1.61e-07 2.34e-07 3.12e-07 1.62e-07 1.32e-07 1.91e-07 2.86e-07 3.03e-07 1.23e-07 5.53e-07 2.13e-07 2.24e-07 1.95e-07 2.66e-07 4.1e-07 2e-07 6.49e-08 4.74e-08 1.21e-07 3.04e-07 8.32e-08 1.06e-07 7.64e-08 5.28e-08 7.65e-08 5.38e-08 3.55e-07 4.24e-08 1.99e-08 1.15e-07 1.75e-08 9.83e-08 2.48e-08 5.35e-08
ENSG00000184752 NDUFA12 -151713 2.7e-06 2.34e-06 2.88e-07 1.49e-06 4.41e-07 7.89e-07 1.53e-06 3.9e-07 1.6e-06 7.2e-07 1.93e-06 1.48e-06 3.49e-06 1.15e-06 5.5e-07 1.16e-06 9.55e-07 1.44e-06 6.7e-07 8.75e-07 6.7e-07 2.15e-06 1.87e-06 9.74e-07 2.86e-06 1.05e-06 1.18e-06 1.12e-06 1.69e-06 1.8e-06 1.08e-06 3.03e-07 4.74e-07 8.98e-07 9.46e-07 7.45e-07 7.35e-07 3.81e-07 6.4e-07 2.26e-07 3.56e-07 2.94e-06 4.14e-07 1.65e-07 3.56e-07 3.36e-07 3.68e-07 2.3e-07 2.59e-07