logo

Genes within 1Mb (chr12:94727262:AG:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 2.67e-01 0.0892 0.0801 0.284 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0651 0.0943 0.284 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 1.83e-01 0.094 0.0704 0.284 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00285 0.0893 0.284 B L1
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 9.08e-01 0.00947 0.0815 0.284 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0568 0.0534 0.284 B L1
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00503 0.0676 0.284 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 1.06e-01 0.132 0.0812 0.284 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000331 0.039 0.284 B L1
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 3.80e-01 0.0588 0.0669 0.284 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 6.69e-01 0.0249 0.0581 0.284 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 5.99e-01 0.0341 0.0647 0.284 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 8.08e-01 0.0215 0.0884 0.284 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0438 0.0568 0.284 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0557 0.0595 0.284 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 7.49e-01 0.02 0.0625 0.284 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 2.40e-01 0.0939 0.0797 0.284 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00544 0.0538 0.284 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 1.49e-01 0.0987 0.0681 0.284 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0698 0.0869 0.284 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 9.11e-03 -0.202 0.0767 0.284 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 9.74e-01 0.0024 0.0741 0.284 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0426 0.0691 0.284 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0102 0.0566 0.284 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 1.57e-01 0.135 0.0948 0.282 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0182 0.101 0.282 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 5.98e-02 -0.188 0.0991 0.282 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000142 0.0969 0.282 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 8.17e-01 -0.021 0.0904 0.282 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 2.68e-01 0.0892 0.0802 0.282 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 8.81e-01 0.0134 0.0896 0.282 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0993 0.0751 0.282 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0975 0.0881 0.284 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 9.37e-01 0.00547 0.0687 0.284 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 8.08e-01 0.0171 0.0704 0.284 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 9.15e-01 0.00893 0.0839 0.284 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0433 0.0569 0.284 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 4.16e-01 0.0685 0.0841 0.284 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 6.10e-01 0.0383 0.0749 0.284 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 7.28e-01 0.0188 0.0539 0.284 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 6.21e-01 0.0435 0.0878 0.285 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 1.11e-01 -0.132 0.0824 0.285 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 2.26e-01 0.0842 0.0693 0.285 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0445 0.0823 0.285 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 6.05e-01 0.0351 0.0678 0.285 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 8.75e-01 0.0121 0.0771 0.285 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0414 0.0568 0.285 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 4.18e-01 0.0779 0.096 0.284 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0477 0.0818 0.284 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 7.04e-02 0.135 0.0741 0.284 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 1.22e-02 0.232 0.0918 0.284 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 9.72e-01 0.00264 0.0757 0.284 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0209 0.0851 0.284 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 8.51e-01 0.00894 0.0474 0.284 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 8.59e-01 0.0199 0.112 0.27 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 6.10e-01 0.0487 0.0954 0.27 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0316 0.117 0.27 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 5.98e-01 0.059 0.112 0.27 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0954 0.085 0.27 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 4.27e-01 0.0717 0.09 0.27 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 2.07e-01 0.141 0.112 0.27 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 8.55e-01 0.0145 0.0791 0.27 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 2.58e-01 0.112 0.0985 0.27 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 2.76e-01 0.107 0.0981 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 7.40e-01 0.033 0.0995 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 9.09e-01 0.0104 0.0908 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 3.13e-01 -0.1 0.0993 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 5.69e-01 0.0581 0.102 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 1.97e-01 0.108 0.0834 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 6.96e-01 0.0363 0.0928 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 9.70e-01 0.00342 0.0911 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00993 0.0754 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 8.51e-01 0.0194 0.103 0.282 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0563 0.105 0.282 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 7.92e-01 0.0265 0.1 0.282 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 1.09e-01 0.173 0.107 0.282 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0545 0.0961 0.282 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0349 0.0813 0.282 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0621 0.0948 0.282 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 4.60e-02 0.19 0.0948 0.282 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 1.84e-01 -0.102 0.0767 0.282 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 9.84e-02 0.158 0.095 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 2.96e-01 -0.101 0.0964 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00489 0.0813 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 7.06e-02 -0.179 0.0984 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 8.75e-01 0.0154 0.0978 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00974 0.0821 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 4.02e-01 0.0711 0.0847 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 4.35e-01 0.0726 0.0928 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0251 0.0541 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0442 0.105 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00673 0.0962 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 6.93e-04 0.326 0.0946 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0121 0.106 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0397 0.0972 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 1.20e-01 -0.14 0.0895 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 5.96e-01 0.0504 0.0949 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 4.39e-02 -0.16 0.0789 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 4.07e-01 0.065 0.0782 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0794 0.101 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 8.04e-01 0.0262 0.106 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 8.69e-01 0.0175 0.106 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 4.29e-01 0.0666 0.084 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 3.71e-01 0.0846 0.0944 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0813 0.0965 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 6.76e-01 0.0364 0.087 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 8.78e-01 0.0117 0.0758 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 9.35e-01 0.00539 0.0656 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 6.37e-01 0.0379 0.08 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 7.02e-01 0.0354 0.0922 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 6.46e-01 0.0289 0.0628 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0409 0.0679 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 3.86e-01 0.0506 0.0582 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 2.38e-01 0.0951 0.0804 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 5.61e-01 0.044 0.0755 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0231 0.088 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 9.56e-01 0.00567 0.102 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0657 0.0752 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0384 0.0802 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 7.75e-01 0.0198 0.0692 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 1.25e-01 0.157 0.102 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 5.79e-01 0.0504 0.0908 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 7.50e-01 0.0305 0.0955 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 1.39e-01 -0.142 0.0955 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0941 0.0817 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0774 0.0918 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0932 0.0829 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0488 0.0909 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 8.44e-01 0.0158 0.0802 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 1.06e-01 0.147 0.0905 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0399 0.101 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0454 0.0964 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0222 0.0823 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 6.41e-01 0.0423 0.0906 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0146 0.0713 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 6.57e-01 0.0415 0.0935 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0679 0.0729 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 1.13e-01 0.134 0.0841 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0534 0.0938 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 1.30e-02 -0.209 0.0835 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 4.70e-01 -0.062 0.0857 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00588 0.0827 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0322 0.0685 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 3.87e-01 0.089 0.103 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0874 0.0791 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 3.44e-01 0.0987 0.104 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0203 0.105 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0401 0.0941 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0428 0.0993 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 3.22e-01 -0.101 0.102 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0434 0.082 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0916 0.105 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 2.84e-01 0.0965 0.0897 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 8.54e-01 0.0187 0.102 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000121 0.107 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0583 0.0886 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 3.09e-01 0.103 0.101 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 3.09e-01 -0.106 0.104 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 4.37e-01 0.0692 0.0889 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 9.82e-01 0.00232 0.101 0.286 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00432 0.0858 0.286 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 7.18e-01 0.0356 0.0985 0.286 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 1.10e-01 0.152 0.0949 0.286 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0433 0.084 0.286 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00633 0.0962 0.286 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 2.10e-01 -0.105 0.0838 0.286 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 2.05e-03 0.311 0.0995 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 2.64e-01 -0.109 0.0973 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0529 0.1 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 1.57e-01 -0.149 0.105 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 4.01e-01 0.0725 0.0861 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0613 0.0873 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0588 0.0836 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 3.09e-01 0.101 0.099 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0445 0.0864 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 5.27e-02 0.173 0.0888 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0296 0.0913 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0882 0.0799 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 6.93e-01 0.0367 0.0926 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0476 0.0646 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 2.35e-01 -0.132 0.111 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0497 0.0983 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 9.43e-01 0.00735 0.103 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0352 0.109 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0407 0.0891 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 2.37e-01 -0.121 0.102 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 8.78e-01 0.0141 0.0921 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 6.00e-01 -0.048 0.0914 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0358 0.0938 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 9.07e-01 0.0108 0.0928 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 4.14e-01 0.0785 0.0959 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 2.35e-01 0.0987 0.0829 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 3.84e-01 0.0831 0.0953 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0575 0.0665 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0143 0.129 0.263 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0758 0.116 0.263 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0558 0.129 0.263 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0145 0.123 0.263 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 2.95e-01 -0.121 0.115 0.263 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 5.82e-01 0.0657 0.119 0.263 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 7.91e-02 -0.217 0.122 0.263 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 2.52e-01 -0.118 0.103 0.263 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 7.31e-01 0.0249 0.0724 0.263 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 4.82e-01 0.0677 0.0962 0.285 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0831 0.0856 0.285 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 1.18e-03 0.265 0.0806 0.285 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0304 0.0997 0.285 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 1.83e-01 0.13 0.0972 0.285 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 8.99e-01 0.0123 0.0967 0.285 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 2.34e-01 0.0719 0.0602 0.285 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 4.62e-01 0.0725 0.0984 0.284 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0378 0.093 0.284 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 3.13e-02 0.211 0.0973 0.284 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 5.73e-01 0.0498 0.088 0.284 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 1.62e-01 -0.127 0.0903 0.284 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 6.73e-01 0.041 0.0971 0.284 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 9.74e-01 0.00242 0.0745 0.284 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 6.83e-01 0.0401 0.0979 0.276 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 9.80e-01 0.00269 0.106 0.276 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 5.70e-02 -0.204 0.106 0.276 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 6.06e-01 0.0534 0.103 0.276 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0333 0.0921 0.276 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 1.21e-01 0.134 0.0859 0.276 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000472 0.0993 0.276 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 5.70e-02 -0.16 0.0836 0.276 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0734 0.098 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0174 0.0772 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 5.13e-01 0.0555 0.0847 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 7.67e-01 0.0265 0.0893 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0612 0.0679 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 4.98e-01 0.0628 0.0926 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 9.22e-01 0.00773 0.0791 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 3.46e-01 0.053 0.0561 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 3.62e-01 0.0921 0.101 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 4.95e-01 0.0603 0.0883 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0485 0.0975 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 7.14e-01 0.0352 0.096 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00285 0.072 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 1.07e-01 0.164 0.101 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 3.14e-01 0.094 0.093 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0552 0.0662 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0453 0.125 0.282 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 2.14e-01 -0.119 0.0949 0.282 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 1.74e-01 -0.161 0.118 0.282 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 1.96e-01 0.163 0.126 0.282 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 3.00e-01 -0.125 0.12 0.282 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 7.90e-01 0.0314 0.117 0.282 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0143 0.102 0.282 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 8.32e-01 0.0224 0.106 0.284 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 2.39e-01 0.121 0.102 0.284 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 7.96e-02 -0.188 0.107 0.284 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00843 0.1 0.284 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 8.80e-01 0.0131 0.0864 0.284 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0354 0.104 0.284 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 1.01e-01 -0.153 0.0928 0.284 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 5.13e-01 0.0437 0.0666 0.284 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 3.59e-02 -0.204 0.0965 0.287 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 5.18e-01 0.0609 0.0941 0.287 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 1.90e-02 0.239 0.101 0.287 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 8.21e-01 0.0231 0.102 0.287 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00556 0.0649 0.287 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 1.27e-01 -0.155 0.101 0.287 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0578 0.0963 0.287 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0836 0.0855 0.287 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 8.57e-01 0.0192 0.107 0.302 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0241 0.104 0.302 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0453 0.109 0.302 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0165 0.107 0.302 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 9.23e-02 -0.173 0.102 0.302 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 5.49e-01 0.0667 0.111 0.302 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0646 0.0933 0.302 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 9.76e-01 0.0028 0.0922 0.302 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 3.89e-01 0.0856 0.0992 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0337 0.105 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00128 0.0926 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 7.29e-01 0.0369 0.106 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0112 0.0985 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 5.71e-01 0.036 0.0634 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 9.24e-01 0.00849 0.0886 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 7.05e-02 0.159 0.0874 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0217 0.0608 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 4.29e-01 0.0724 0.0914 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 2.63e-01 -0.104 0.0925 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 6.89e-02 0.138 0.0757 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 1.14e-01 -0.157 0.0987 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -824214 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0321 0.0881 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 3.39e-01 -0.072 0.0751 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 5.78e-01 0.0436 0.0784 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0133 0.0968 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 9.63e-01 0.00249 0.0535 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0697 0.0906 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0269 0.0718 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 9.94e-01 0.000632 0.0776 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 7.44e-01 0.0276 0.0844 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0279 0.0637 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 9.16e-02 0.146 0.0862 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 4.16e-01 0.0638 0.0783 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 7.11e-01 0.02 0.0538 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 1.26e-01 -0.156 0.101 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 7.64e-02 0.167 0.0937 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 6.44e-01 0.0431 0.0932 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0371 0.104 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 5.18e-01 0.039 0.0602 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0913 0.0999 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -490220 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0974 0.0852 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0234 0.0681 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -490484 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0274 0.0911 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 76705 sc-eQTL 2.08e-01 -0.107 0.0847 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -746258 sc-eQTL 1.77e-01 0.0982 0.0724 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -346366 sc-eQTL 8.32e-01 0.0175 0.0825 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00451 0.0723 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 267274 sc-eQTL 5.30e-01 0.0511 0.0813 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -276486 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0375 0.0597 0.287 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 76705 eQTL 0.049 0.0279 0.0142 0.0 0.0 0.29
ENSG00000136040 PLXNC1 578685 eQTL 0.0387 0.0185 0.00892 0.0 0.0 0.29
ENSG00000173588 CEP83 267274 eQTL 0.025 0.0606 0.027 0.00105 0.0 0.29
ENSG00000258357 AC023161.2 205393 eQTL 0.0444 0.0692 0.0344 0.0 0.0 0.29

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 TMCC3 76705 4.35e-05 2.7e-05 6.49e-06 1.33e-05 2.41e-06 8.57e-06 2.46e-05 2.18e-06 1.73e-05 8.28e-06 2.11e-05 7.45e-06 3.17e-05 9.95e-06 5.38e-06 1.01e-05 1.47e-05 1.52e-05 4.73e-06 3.57e-06 8.57e-06 1.81e-05 2.43e-05 4.96e-06 3.13e-05 5.34e-06 8.02e-06 6.83e-06 2.33e-05 1.93e-05 1.24e-05 1.08e-06 1.12e-06 4.2e-06 8.6e-06 4.06e-06 2.04e-06 2.61e-06 2.01e-06 9.35e-07 9.78e-07 4e-05 2.76e-06 3.59e-07 1.95e-06 2.83e-06 2.13e-06 7.99e-07 4.9e-07
ENSG00000184752 \N -276486 5.61e-06 6.75e-06 1.3e-06 3.09e-06 5.62e-07 1.56e-06 3.49e-06 3.78e-07 3.25e-06 1.7e-06 4.17e-06 1.29e-06 6.49e-06 1.96e-06 1.03e-06 2.42e-06 2.96e-06 2.37e-06 1.44e-06 9.53e-07 2.63e-06 4.63e-06 4.78e-06 1.42e-06 4.97e-06 1.96e-06 1.58e-06 1.71e-06 4.48e-06 4.61e-06 1.96e-06 2.42e-07 3.79e-07 1.34e-06 1.45e-06 8.84e-07 9.73e-07 4.9e-07 1.35e-06 1.86e-07 3.03e-07 5.54e-06 4.43e-07 1.81e-07 3.49e-07 3.94e-07 2.37e-07 8.89e-08 1.7e-07
ENSG00000258357 AC023161.2 205393 1.05e-05 9.76e-06 2.41e-06 4.57e-06 1.64e-06 3.9e-06 8.88e-06 1.03e-06 4.68e-06 3.39e-06 8.76e-06 3.34e-06 1.02e-05 3.85e-06 1.52e-06 4.56e-06 4.79e-06 3.67e-06 2.25e-06 1.92e-06 3.2e-06 7.74e-06 8.65e-06 1.47e-06 9.12e-06 3.19e-06 2.86e-06 1.78e-06 7.44e-06 7.87e-06 3.37e-06 4.52e-07 7.1e-07 1.96e-06 1.96e-06 1.63e-06 1.71e-06 5.45e-07 9.13e-07 3.47e-07 3.2e-07 9.56e-06 7.19e-07 1.7e-07 5.77e-07 8.44e-07 8.27e-07 2.25e-07 1.98e-07