logo

Genes within 1Mb (chr12:94702042:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 3.56e-01 0.0768 0.0829 0.237 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 5.39e-01 0.0601 0.0976 0.237 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0568 0.073 0.237 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 3.97e-01 0.0782 0.0922 0.237 B L1
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0574 0.0842 0.237 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 8.53e-01 0.0103 0.0554 0.237 B L1
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0433 0.0698 0.237 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00229 0.0845 0.237 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 3.97e-03 -0.115 0.0395 0.237 B L1
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0109 0.0685 0.237 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0812 0.0592 0.237 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00919 0.0662 0.237 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 4.87e-02 -0.178 0.0897 0.237 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0151 0.0582 0.237 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0516 0.0609 0.237 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0426 0.0639 0.237 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 4.15e-01 -0.067 0.082 0.237 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 3.18e-06 -0.251 0.0524 0.237 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 8.43e-02 -0.121 0.0698 0.237 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 9.33e-03 -0.231 0.088 0.237 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 7.99e-03 -0.211 0.0787 0.237 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 1.79e-01 -0.102 0.0758 0.237 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0128 0.0711 0.237 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0216 0.0581 0.237 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0674 0.0973 0.243 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0993 0.103 0.243 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 3.54e-01 0.0948 0.102 0.243 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 5.70e-02 -0.188 0.0982 0.243 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 7.55e-01 0.0289 0.0924 0.243 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 3.97e-01 0.0697 0.0822 0.243 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 9.77e-01 0.00259 0.0916 0.243 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 7.55e-01 0.0241 0.0771 0.243 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 7.45e-02 0.16 0.0892 0.237 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000387 0.0699 0.237 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0122 0.0716 0.237 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0428 0.0853 0.237 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0207 0.0579 0.237 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 8.52e-01 -0.016 0.0856 0.237 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0324 0.0762 0.237 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 4.24e-01 0.0438 0.0547 0.237 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 5.29e-01 0.0575 0.0913 0.238 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 1.91e-02 -0.201 0.085 0.238 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0666 0.0721 0.238 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 8.56e-01 0.0156 0.0856 0.238 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0709 0.0704 0.238 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 2.89e-02 -0.174 0.0793 0.238 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0573 0.059 0.238 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 8.30e-01 0.0216 0.101 0.237 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 4.67e-04 -0.296 0.0832 0.237 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 7.44e-01 0.0255 0.0782 0.237 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0278 0.0976 0.237 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 1.71e-01 0.108 0.0789 0.237 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0977 0.0889 0.237 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 1.12e-01 -0.0787 0.0493 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0619 0.114 0.23 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 8.78e-02 -0.166 0.0969 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 1.15e-01 0.188 0.119 0.23 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 9.22e-01 0.0113 0.115 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 2.79e-02 0.191 0.0861 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 1.61e-01 0.129 0.0918 0.23 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 5.78e-01 -0.064 0.115 0.23 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0753 0.0807 0.23 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 2.97e-01 -0.105 0.101 0.23 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0322 0.0991 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 9.23e-01 0.00972 0.1 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 7.51e-01 -0.029 0.0915 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 9.56e-01 0.00549 0.1 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 4.15e-01 0.0837 0.103 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 1.60e-01 -0.119 0.084 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 1.11e-01 -0.149 0.093 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 2.07e-01 -0.116 0.0915 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 3.82e-02 -0.157 0.0752 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 9.53e-01 0.00625 0.105 0.237 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 8.54e-01 0.0197 0.107 0.237 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 1.51e-01 -0.147 0.102 0.237 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 6.69e-01 0.047 0.11 0.237 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 6.70e-02 -0.179 0.0972 0.237 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 8.64e-01 0.0142 0.0828 0.237 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 5.51e-01 0.0577 0.0965 0.237 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 6.39e-01 0.0457 0.0974 0.237 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 8.61e-02 -0.134 0.0779 0.237 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 8.98e-01 0.0126 0.0985 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 4.09e-02 0.203 0.0986 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 6.68e-01 0.0359 0.0837 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0414 0.102 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 8.51e-02 -0.173 0.1 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 5.44e-01 0.0514 0.0846 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0372 0.0874 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 5.31e-01 0.06 0.0957 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0675 0.0556 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 2.04e-01 0.137 0.107 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 5.97e-01 0.0522 0.0984 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 1.60e-01 -0.14 0.0991 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 3.90e-01 0.0938 0.109 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0522 0.0995 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 6.52e-01 0.0416 0.0921 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 3.07e-01 0.0993 0.097 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 6.93e-01 0.0323 0.0816 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0604 0.0801 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0804 0.106 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 6.99e-01 0.043 0.111 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 8.04e-01 0.0276 0.111 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 6.78e-02 -0.161 0.0875 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 3.42e-01 0.0942 0.099 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0506 0.101 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0279 0.0913 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 3.65e-01 0.0705 0.0777 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0831 0.0671 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0614 0.0822 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 1.98e-02 -0.22 0.0935 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0341 0.0645 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 9.47e-02 -0.116 0.0693 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0571 0.0598 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0376 0.0827 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 9.56e-02 -0.129 0.077 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 5.07e-01 -0.06 0.0902 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 4.49e-01 0.0796 0.105 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 3.34e-01 0.0747 0.0771 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 4.88e-01 0.0572 0.0823 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00999 0.071 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0781 0.106 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 7.22e-01 0.0334 0.0937 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 1.07e-01 0.158 0.0979 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 7.85e-01 0.027 0.099 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 7.75e-01 0.0242 0.0845 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 8.75e-01 -0.015 0.0949 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0479 0.0857 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0463 0.0939 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 6.76e-05 -0.324 0.0798 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00699 0.094 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0527 0.104 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 2.35e-03 -0.3 0.0975 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0526 0.0849 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0505 0.0936 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0299 0.0737 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0399 0.0959 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 1.71e-01 -0.103 0.0746 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 2.20e-01 -0.106 0.0865 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 2.68e-02 -0.212 0.0952 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 1.54e-01 -0.124 0.0865 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 2.63e-01 0.0985 0.0877 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 6.30e-01 0.0409 0.0848 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0271 0.0703 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 3.15e-01 -0.106 0.105 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 2.32e-02 -0.183 0.0801 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 7.59e-01 0.0328 0.107 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 7.31e-02 -0.192 0.107 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 5.12e-01 0.0633 0.0964 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 1.23e-01 -0.157 0.101 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0733 0.104 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 1.08e-01 -0.135 0.0834 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 4.94e-01 0.0729 0.106 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 7.99e-04 -0.303 0.0889 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000109 0.103 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 6.91e-01 0.0432 0.109 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0507 0.0902 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 6.13e-03 -0.279 0.101 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 5.45e-01 0.0642 0.106 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0534 0.0905 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00633 0.103 0.24 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 2.09e-03 -0.267 0.0856 0.24 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 4.43e-01 0.0772 0.1 0.24 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 3.69e-01 0.0876 0.0974 0.24 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 1.06e-01 0.139 0.0853 0.24 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 7.61e-02 -0.174 0.0976 0.24 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 7.23e-02 -0.154 0.0853 0.24 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 5.79e-01 0.0597 0.108 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 3.31e-01 -0.1 0.103 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 8.21e-01 -0.024 0.106 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 2.04e-01 0.141 0.111 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0259 0.0911 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 2.25e-02 -0.21 0.0911 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 9.87e-01 0.00147 0.0885 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0282 0.103 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0939 0.0892 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 5.48e-01 0.0557 0.0926 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0897 0.0942 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 5.56e-02 -0.158 0.0822 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0501 0.0958 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0512 0.0668 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 3.12e-02 0.245 0.113 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 4.52e-03 -0.284 0.099 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0801 0.106 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 6.58e-01 0.0497 0.112 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 6.91e-01 0.0364 0.0916 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 7.98e-01 0.027 0.105 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0707 0.0945 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 3.99e-01 0.0796 0.0941 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 2.34e-03 -0.291 0.0946 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 2.73e-02 -0.21 0.0946 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 8.80e-01 0.015 0.0991 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 5.65e-01 0.0494 0.0857 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0861 0.0983 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0299 0.0686 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 1.90e-01 0.172 0.13 0.215 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 7.18e-01 0.0427 0.118 0.215 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 7.37e-01 0.044 0.131 0.215 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 9.05e-01 0.0148 0.124 0.215 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 4.02e-01 0.0982 0.117 0.215 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0792 0.121 0.215 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 1.75e-01 -0.17 0.125 0.215 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 7.75e-01 0.03 0.104 0.215 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 9.24e-02 -0.123 0.0725 0.215 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 7.59e-01 0.0307 0.0998 0.239 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0854 0.0888 0.239 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 5.83e-01 0.0471 0.0857 0.239 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 7.53e-01 0.0325 0.103 0.239 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 8.90e-01 0.014 0.101 0.239 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 6.17e-01 0.0502 0.1 0.239 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0695 0.0624 0.239 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 5.05e-01 0.0678 0.102 0.237 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0278 0.096 0.237 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00245 0.102 0.237 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 9.03e-01 0.0111 0.091 0.237 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0239 0.0937 0.237 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 8.85e-01 0.0145 0.1 0.237 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00357 0.0769 0.237 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 3.18e-01 -0.1 0.1 0.241 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0644 0.108 0.241 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 2.65e-02 0.243 0.109 0.241 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 2.34e-01 -0.126 0.106 0.241 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00436 0.0946 0.241 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 4.32e-01 0.0698 0.0886 0.241 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 4.81e-01 0.0718 0.102 0.241 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 4.26e-01 0.0691 0.0866 0.241 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 5.80e-02 0.188 0.0988 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 3.82e-01 0.0685 0.0782 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 4.42e-01 0.0662 0.0859 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 2.48e-01 -0.105 0.0903 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0789 0.0689 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 8.64e-01 0.0161 0.0941 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0366 0.0803 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 2.41e-01 0.0668 0.0568 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 8.47e-01 0.0196 0.102 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00821 0.0891 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0737 0.0982 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 9.48e-01 0.00637 0.0969 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00863 0.0726 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 2.12e-01 -0.128 0.102 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0914 0.0938 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 3.29e-01 0.0653 0.0667 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 2.40e-01 0.146 0.123 0.252 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 7.50e-03 -0.251 0.0925 0.252 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 2.56e-01 0.134 0.117 0.252 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0647 0.126 0.252 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 5.66e-01 0.0687 0.119 0.252 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 8.56e-01 0.0212 0.117 0.252 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 6.16e-01 0.051 0.101 0.252 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 7.03e-01 0.0415 0.109 0.238 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0042 0.105 0.238 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0541 0.111 0.238 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 3.57e-01 0.0952 0.103 0.238 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0257 0.0889 0.238 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 5.55e-01 0.0634 0.107 0.238 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 1.02e-01 -0.157 0.0956 0.238 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 5.39e-01 0.0422 0.0686 0.238 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 4.33e-01 0.0782 0.0994 0.242 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0964 0.0959 0.242 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0769 0.104 0.242 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 5.39e-01 0.0639 0.104 0.242 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 2.40e-01 0.0777 0.066 0.242 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0997 0.103 0.242 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 6.98e-01 0.0382 0.0983 0.242 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0849 0.0872 0.242 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 6.03e-01 0.0557 0.107 0.246 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 9.87e-01 0.00171 0.104 0.246 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 6.67e-01 -0.047 0.109 0.246 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0734 0.108 0.246 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 1.25e-01 -0.159 0.103 0.246 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 2.16e-01 -0.138 0.111 0.246 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0871 0.0936 0.246 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 7.76e-01 0.0264 0.0925 0.246 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0522 0.1 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0337 0.106 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0311 0.0933 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 3.54e-01 0.0994 0.107 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 7.64e-01 0.0298 0.0992 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00675 0.064 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 4.81e-01 -0.063 0.0892 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0434 0.0888 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 3.28e-03 -0.179 0.0601 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 4.44e-01 0.072 0.094 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 1.09e-01 0.153 0.0949 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 9.78e-01 0.00212 0.0785 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 9.98e-01 0.000236 0.102 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -849434 sc-eQTL 7.49e-02 -0.161 0.09 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 6.52e-01 0.0349 0.0774 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 7.12e-01 0.0298 0.0807 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 6.70e-01 0.0425 0.0996 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 9.22e-02 -0.0925 0.0547 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 8.78e-02 0.156 0.091 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 7.03e-01 0.0277 0.0726 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 9.53e-01 0.0046 0.0784 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0416 0.0852 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0745 0.0642 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0331 0.0877 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0447 0.0791 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 1.39e-01 0.0804 0.0541 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 3.17e-01 0.104 0.103 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0764 0.0959 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0727 0.0947 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 6.82e-01 0.0435 0.106 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 7.23e-01 0.0218 0.0612 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 7.46e-01 -0.033 0.102 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -515440 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0749 0.0867 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 8.81e-01 0.0104 0.0693 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -515704 sc-eQTL 6.49e-01 0.043 0.0944 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 51485 sc-eQTL 2.25e-02 -0.2 0.087 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -771478 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0397 0.0754 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -371586 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0581 0.0854 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 553465 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0633 0.0748 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 242054 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0949 0.0841 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -301706 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0639 0.0618 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -515704 eQTL 0.00753 -0.0448 0.0167 0.00296 0.0 0.252
ENSG00000057704 TMCC3 51485 eQTL 3.95e-07 -0.0781 0.0153 0.0 0.0 0.252
ENSG00000136014 USP44 -849434 eQTL 0.0481 0.066 0.0334 0.0 0.0 0.252
ENSG00000258357 AC023161.2 180173 eQTL 0.0375 -0.0782 0.0375 0.0 0.0 0.252
ENSG00000258365 AC073655.2 419198 eQTL 0.0176 0.0937 0.0394 0.0 0.0 0.252

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 TMCC3 51485 8.08e-06 9.91e-06 9.7e-07 5.52e-06 1.82e-06 3.86e-06 9.57e-06 1.36e-06 6.53e-06 4.19e-06 1.06e-05 4.77e-06 1.36e-05 3.88e-06 1.54e-06 4.71e-06 3.78e-06 4e-06 2.29e-06 2.4e-06 3.46e-06 7.51e-06 6.57e-06 2.32e-06 1.27e-05 2.35e-06 3.93e-06 2.73e-06 7.67e-06 7.84e-06 4.69e-06 5.11e-07 8.1e-07 2.82e-06 3.81e-06 2.09e-06 1.47e-06 1.08e-06 1.64e-06 1.03e-06 8.36e-07 1.03e-05 1.28e-06 1.59e-07 7.49e-07 9.38e-07 1.04e-06 7.08e-07 5.44e-07
ENSG00000136014 USP44 -849434 2.61e-07 1.16e-07 3.69e-08 1.89e-07 8.92e-08 9.87e-08 1.38e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.59e-07 7.75e-08 1.33e-07 6.38e-08 5.53e-08 7.89e-08 4.48e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.2e-08 1.04e-07 1.28e-07 1.26e-07 4.16e-08 1.31e-07 1.19e-07 1.12e-07 9.15e-08 1.02e-07 1.12e-07 9.58e-08 3.7e-08 3.28e-08 8.68e-08 7.51e-08 3.95e-08 5.59e-08 9.25e-08 6.54e-08 3.82e-08 5e-08 1.31e-07 4.1e-08 1.2e-08 5.75e-08 1.66e-08 1.26e-07 3.92e-09 4.79e-08
ENSG00000236349 \N 153801 2.63e-06 3.17e-06 2.79e-07 2.02e-06 4.65e-07 7.88e-07 1.55e-06 5.6e-07 1.74e-06 7.2e-07 2.35e-06 1.29e-06 3.5e-06 1.47e-06 4.4e-07 1.06e-06 1.04e-06 1.34e-06 5.32e-07 8.15e-07 6.41e-07 1.94e-06 1.76e-06 1.02e-06 3.4e-06 9.49e-07 1.15e-06 1.34e-06 1.78e-06 1.85e-06 1.71e-06 2.65e-07 3.61e-07 1.24e-06 1.63e-06 8.31e-07 7.94e-07 4.57e-07 1.12e-06 3.99e-07 1.83e-07 3.26e-06 4.14e-07 1.91e-07 3.14e-07 3.19e-07 2.74e-07 2.1e-07 2.41e-07