Genes within 1Mb (chr12:89528311:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0269 0.0766 0.085 B L1
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 9.54e-01 0.00602 0.104 0.085 B L1
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 1.96e-01 0.138 0.107 0.085 B L1
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 7.58e-01 0.0344 0.111 0.085 B L1
ENSG00000258216 AC009522.1 -183737 sc-eQTL 7.88e-01 0.0323 0.12 0.085 B L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 1.15e-01 0.213 0.134 0.085 B L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0297 0.101 0.085 B L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0282 0.0765 0.085 CD4T L1
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0652 0.115 0.085 CD4T L1
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 8.52e-01 0.0186 0.0997 0.085 CD4T L1
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 1.65e-01 -0.153 0.11 0.085 CD4T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0423 0.126 0.085 CD4T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 2.29e-01 -0.141 0.117 0.085 CD4T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0969 0.0905 0.085 CD8T L1
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 1.16e-01 0.168 0.106 0.085 CD8T L1
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 4.83e-01 0.0807 0.115 0.085 CD8T L1
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 5.71e-01 0.0673 0.119 0.085 CD8T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 3.21e-02 0.286 0.133 0.085 CD8T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 1.66e-02 -0.28 0.116 0.085 CD8T L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0282 0.108 0.077 DC L1
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0718 0.0976 0.077 DC L1
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 5.26e-02 0.3 0.154 0.077 DC L1
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0579 0.151 0.077 DC L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 8.82e-01 0.0206 0.138 0.077 DC L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 9.21e-01 0.0103 0.103 0.077 DC L1
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0314 0.126 0.077 DC L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 9.08e-03 0.148 0.0563 0.085 Mono L1
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 1.57e-01 -0.137 0.0967 0.085 Mono L1
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 7.35e-01 -0.044 0.13 0.085 Mono L1
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 9.11e-01 0.0131 0.116 0.085 Mono L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0614 0.0993 0.085 Mono L1
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 1.93e-03 -0.304 0.0966 0.085 Mono L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 1.79e-01 -0.133 0.099 0.086 NK L1
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 8.76e-02 -0.16 0.0933 0.086 NK L1
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0318 0.119 0.086 NK L1
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 1.51e-01 0.178 0.123 0.086 NK L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 5.23e-01 -0.089 0.139 0.086 NK L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 2.65e-01 -0.151 0.135 0.086 NK L1
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 9.53e-01 -0.007 0.119 0.086 NK L1
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0982 0.12 0.085 Other_T L1
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 8.58e-01 -0.024 0.134 0.085 Other_T L1
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0484 0.12 0.085 Other_T L1
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 4.87e-01 -0.104 0.149 0.085 Other_T L1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 6.81e-02 -0.252 0.137 0.085 Other_T L1
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 1.32e-01 -0.202 0.134 0.085 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 3.86e-01 -0.119 0.137 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0767 0.134 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 9.43e-01 0.0112 0.156 0.094 B_Activated L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 9.03e-01 0.0169 0.139 0.094 B_Activated L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -183737 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0202 0.147 0.094 B_Activated L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 7.43e-01 0.0392 0.12 0.094 B_Activated L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 5.89e-01 0.0877 0.162 0.094 B_Activated L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00971 0.128 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0842 0.137 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 2.50e-01 -0.166 0.144 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 1.68e-01 -0.187 0.136 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -183737 sc-eQTL 5.11e-02 0.253 0.129 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 3.21e-01 0.15 0.151 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0471 0.117 0.086 B_Intermediate L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 5.33e-01 -0.066 0.106 0.084 B_Memory L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0268 0.136 0.084 B_Memory L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 3.60e-01 0.13 0.142 0.084 B_Memory L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 9.34e-01 0.0124 0.15 0.084 B_Memory L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -183737 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0316 0.15 0.084 B_Memory L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 2.04e-01 0.179 0.141 0.084 B_Memory L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 4.84e-01 0.0876 0.125 0.084 B_Memory L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0329 0.0937 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 6.71e-01 0.0483 0.114 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 4.78e-02 0.239 0.12 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 8.16e-01 0.0285 0.122 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -183737 sc-eQTL 9.02e-01 0.0158 0.128 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 2.51e-01 0.154 0.134 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0362 0.109 0.085 B_Naive1 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 8.39e-01 -0.022 0.108 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 9.54e-01 0.00788 0.135 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 3.59e-01 0.127 0.138 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 3.32e-01 0.138 0.142 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -183737 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0391 0.145 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 3.27e-01 0.141 0.143 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 6.17e-01 -0.068 0.136 0.086 B_Naive2 L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 1.35e-01 -0.211 0.14 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 9.57e-01 0.00741 0.138 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 3.53e-01 0.14 0.15 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 3.04e-01 -0.137 0.133 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 2.22e-01 -0.166 0.136 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 8.88e-01 0.0219 0.155 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0292 0.0837 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00605 0.128 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 2.12e-01 -0.145 0.116 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 9.71e-01 0.00449 0.124 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000488 0.129 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 2.24e-01 -0.135 0.111 0.085 CD4_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0837 0.0906 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0199 0.121 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 2.36e-01 0.159 0.134 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 7.56e-03 -0.339 0.126 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 4.27e-01 -0.119 0.149 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 8.82e-02 -0.219 0.128 0.085 CD4_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 1.00e+00 -1.07e-05 0.113 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 9.23e-01 0.0126 0.131 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 4.12e-01 0.125 0.152 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 3.37e-01 -0.128 0.133 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 4.47e-01 -0.11 0.145 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 3.72e-01 -0.124 0.139 0.085 CD4_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 1.15e-02 -0.282 0.111 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 1.88e-01 0.179 0.135 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 3.43e-01 0.13 0.136 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 9.29e-01 0.0122 0.137 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 9.86e-02 0.227 0.137 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 2.22e-03 -0.413 0.133 0.085 CD8_CTL L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 9.49e-01 0.00752 0.117 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 4.10e-01 0.104 0.126 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 4.77e-01 0.0986 0.138 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 1.50e-01 0.199 0.138 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 5.25e-02 0.273 0.14 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 2.66e-02 -0.26 0.117 0.085 CD8_Naive L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 3.93e-01 0.107 0.125 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 4.32e-01 -0.114 0.145 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 3.67e-01 -0.137 0.152 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0739 0.134 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 3.93e-01 0.114 0.133 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 2.77e-01 -0.156 0.143 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 2.82e-01 -0.162 0.15 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 7.71e-01 -0.043 0.147 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 7.26e-01 0.0527 0.15 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 8.08e-01 0.0334 0.137 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 8.23e-01 0.0291 0.13 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 1.95e-01 -0.195 0.15 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 2.74e-01 -0.135 0.123 0.084 MAIT L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 1.47e-01 0.197 0.136 0.084 MAIT L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0799 0.142 0.084 MAIT L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 6.88e-01 -0.056 0.139 0.084 MAIT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 3.90e-01 -0.12 0.139 0.084 MAIT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 8.63e-02 -0.233 0.135 0.084 MAIT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0273 0.125 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0767 0.132 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 7.80e-03 0.381 0.142 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0535 0.149 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0998 0.14 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0335 0.144 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 7.46e-02 0.232 0.13 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0766 0.111 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 1.30e-01 -0.156 0.103 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0953 0.129 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 9.53e-01 0.00748 0.128 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 3.91e-01 -0.128 0.149 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 4.52e-01 -0.106 0.141 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0277 0.126 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0423 0.137 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 4.47e-01 -0.108 0.141 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 5.49e-01 0.0957 0.16 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 6.75e-01 0.0592 0.141 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 4.10e-01 -0.113 0.137 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 4.14e-01 -0.128 0.156 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 4.59e-01 0.0899 0.121 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 8.81e-02 -0.202 0.118 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 1.51e-01 -0.164 0.114 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 5.80e-01 -0.076 0.137 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 2.00e-01 0.178 0.139 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 5.23e-01 0.0875 0.137 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 1.41e-01 -0.21 0.142 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0815 0.132 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 9.68e-02 -0.253 0.151 0.085 PB L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 6.65e-01 0.0813 0.187 0.085 PB L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 5.14e-01 -0.137 0.209 0.085 PB L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 5.60e-01 -0.122 0.209 0.085 PB L2
ENSG00000258216 AC009522.1 -183737 sc-eQTL 3.29e-01 -0.185 0.189 0.085 PB L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 1.39e-01 0.269 0.181 0.085 PB L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 3.66e-01 -0.17 0.187 0.085 PB L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 8.94e-02 -0.23 0.135 0.087 Pro_T L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0184 0.132 0.087 Pro_T L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 9.90e-01 0.00173 0.144 0.087 Pro_T L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 9.29e-01 0.0122 0.136 0.087 Pro_T L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0175 0.12 0.087 Pro_T L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 6.09e-01 0.074 0.144 0.087 Pro_T L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 5.10e-01 0.0819 0.124 0.085 Treg L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 1.06e-01 -0.222 0.137 0.085 Treg L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 9.57e-01 0.00843 0.156 0.085 Treg L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00107 0.145 0.085 Treg L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0559 0.137 0.085 Treg L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 3.92e-01 -0.114 0.133 0.085 Treg L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 8.84e-01 0.0168 0.115 0.071 cDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 1.32e-01 -0.169 0.112 0.071 cDC L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 7.73e-01 0.0494 0.171 0.071 cDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 4.49e-01 -0.12 0.158 0.071 cDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0323 0.13 0.071 cDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 6.90e-01 0.0508 0.127 0.071 cDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 4.51e-01 -0.105 0.139 0.071 cDC L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 9.86e-03 0.17 0.0654 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0684 0.102 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 2.69e-01 -0.151 0.136 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0463 0.125 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0247 0.12 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 4.80e-02 -0.209 0.105 0.085 cMono_IL1B L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 5.04e-03 0.214 0.0755 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 9.43e-02 -0.19 0.113 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 3.84e-01 0.129 0.148 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 8.02e-01 0.0343 0.136 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 6.33e-01 0.0469 0.098 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 3.02e-02 -0.24 0.11 0.085 cMono_S100A L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 7.34e-01 0.0553 0.162 0.082 gdT L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 1.38e-01 -0.241 0.162 0.082 gdT L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 7.12e-01 0.0649 0.176 0.082 gdT L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 4.68e-01 0.122 0.168 0.082 gdT L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 6.66e-01 -0.067 0.155 0.082 gdT L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 9.69e-02 -0.297 0.178 0.082 gdT L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 2.40e-01 0.107 0.0905 0.082 intMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 1.46e-01 -0.151 0.103 0.082 intMono L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 3.19e-01 0.155 0.155 0.082 intMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 2.19e-01 -0.174 0.141 0.082 intMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0884 0.129 0.082 intMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 1.87e-02 -0.302 0.127 0.082 intMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0302 0.0814 0.081 ncMono L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 7.01e-02 -0.209 0.115 0.081 ncMono L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0379 0.145 0.081 ncMono L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 3.21e-01 0.151 0.152 0.081 ncMono L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 6.49e-01 0.0549 0.12 0.081 ncMono L2
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 1.33e-02 -0.324 0.129 0.081 ncMono L2
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 5.51e-01 0.0761 0.127 0.073 pDC L2
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0302 0.131 0.073 pDC L2
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 1.60e-02 0.436 0.179 0.073 pDC L2
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 8.21e-01 0.0369 0.163 0.073 pDC L2
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 6.38e-01 0.0689 0.146 0.073 pDC L2
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 1.95e-01 -0.137 0.105 0.073 pDC L2
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 2.87e-01 -0.138 0.13 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0442 0.0974 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0525 0.138 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0319 0.134 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 3.57e-01 -0.122 0.132 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -183737 sc-eQTL 5.02e-01 0.0901 0.134 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 1.14e-01 0.238 0.15 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 9.45e-01 0.00723 0.104 0.085 B_Memory LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0554 0.086 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 5.99e-01 0.0564 0.107 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 5.77e-02 0.212 0.111 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 4.18e-01 0.0963 0.119 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000258216 AC009522.1 -183737 sc-eQTL 7.41e-01 0.0427 0.129 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 1.23e-01 0.21 0.136 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0373 0.103 0.085 B_Naive LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 2.76e-03 0.183 0.0603 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 2.53e-01 -0.114 0.0999 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0448 0.129 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 8.68e-01 0.0198 0.119 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0369 0.0959 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 4.07e-03 -0.281 0.0967 0.085 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 2.88e-01 0.0797 0.0747 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 2.11e-01 -0.119 0.0948 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 4.35e-01 0.114 0.145 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 5.76e-01 0.079 0.141 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 9.05e-01 0.0148 0.124 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 5.84e-03 -0.33 0.119 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 sc-eQTL 1.89e-01 -0.128 0.0975 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139318 DUSP6 175810 sc-eQTL 9.81e-02 -0.157 0.0945 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000139323 POC1B 2264 sc-eQTL 3.01e-01 -0.128 0.123 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000257594 GALNT4 3515 sc-eQTL 1.49e-01 0.178 0.123 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000270344 POC1B-AS1 3717 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0291 0.141 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000271614 ATP2B1-AS1 -180648 sc-eQTL 2.43e-01 -0.158 0.135 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000274021 AC024909.1 177296 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0487 0.119 0.086 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000070961 ATP2B1 -180989 eQTL 0.0314 -0.0506 0.0235 0.0 0.0 0.1
ENSG00000258302 AC025034.1 -32818 eQTL 0.0169 -0.0771 0.0322 0.00173 0.0 0.1
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2657 eQTL 0.00345 -0.131 0.0448 0.0 0.0 0.1


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000139318 \N 175810 3.54e-06 9.45e-07 3.35e-07 6.97e-07 9.8e-08 4.23e-07 6.72e-07 6.2e-08 3.66e-07 1.46e-07 1.04e-06 5.22e-07 1.22e-06 2.06e-07 1.07e-07 1.61e-07 7.39e-07 4.72e-07 1.56e-07 8.69e-08 2.17e-07 5.66e-07 5.82e-07 1.15e-07 1.35e-06 2.36e-07 1.74e-07 1.7e-07 5.03e-07 1.25e-06 2.43e-07 3.52e-08 4.97e-08 3.66e-07 5.9e-07 8.32e-08 4.28e-08 6.98e-08 6.42e-08 3.77e-08 4.64e-08 2.41e-06 5.51e-08 1.76e-08 3.83e-08 3.41e-08 7.13e-08 4.41e-09 4.85e-08
ENSG00000139323 \N 2264 0.00025 0.000228 4.11e-05 6.58e-05 3.36e-05 9.37e-05 0.000242 2.69e-05 0.000197 8.27e-05 0.000243 0.000109 0.000267 9.76e-05 4.12e-05 0.000159 0.000101 0.000144 4.96e-05 3.94e-05 0.000104 0.000229 0.000213 4.87e-05 0.000206 7.02e-05 0.000113 7.45e-05 0.000182 0.00012 0.000126 8.82e-06 1.56e-05 3.72e-05 4.4e-05 2.59e-05 1.06e-05 1.46e-05 2.18e-05 1.11e-05 4.68e-06 0.000265 3.12e-05 1.27e-06 1.98e-05 2.53e-05 2.08e-05 1.04e-05 8.81e-06
ENSG00000270344 POC1B-AS1 2657 0.000222 0.000201 3.74e-05 5.71e-05 2.94e-05 8.42e-05 0.000219 2.35e-05 0.000171 7.3e-05 0.000219 9.53e-05 0.000236 8.35e-05 3.66e-05 0.00014 9.28e-05 0.000125 4.31e-05 3.38e-05 9.13e-05 0.000199 0.000189 4.4e-05 0.000182 5.91e-05 9.99e-05 6.58e-05 0.000163 0.000111 0.000113 7.57e-06 1.39e-05 3.22e-05 3.99e-05 2.4e-05 9.21e-06 1.35e-05 1.9e-05 1.01e-05 4.32e-06 0.000235 2.79e-05 1.18e-06 1.63e-05 2.1e-05 1.78e-05 9.39e-06 7.81e-06
ENSG00000274021 \N 177296 3.59e-06 9.37e-07 3.27e-07 6.75e-07 9.87e-08 4.08e-07 6.51e-07 5.84e-08 3.62e-07 1.46e-07 1.03e-06 5.08e-07 1.2e-06 1.98e-07 9.33e-08 1.63e-07 7.22e-07 4.52e-07 1.51e-07 8e-08 2.09e-07 5.83e-07 5.81e-07 1.06e-07 1.28e-06 2.33e-07 1.74e-07 1.68e-07 4.9e-07 1.24e-06 2.31e-07 3.52e-08 4.86e-08 3.58e-07 5.93e-07 7.57e-08 4.41e-08 7.68e-08 6.76e-08 3.77e-08 4.39e-08 2.32e-06 4.71e-08 1.73e-08 3.84e-08 3.87e-08 7.26e-08 4.5e-09 4.85e-08