logo

Genes within 1Mb (chr12:106619007:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0172 0.102 0.075 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 4.44e-01 -0.114 0.148 0.075 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 1.04e-01 0.192 0.117 0.075 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 6.80e-01 0.0675 0.163 0.075 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 9.25e-01 0.00721 0.0768 0.075 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 6.67e-01 0.0495 0.115 0.075 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0343 0.0922 0.075 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 1.40e-01 -0.101 0.0685 0.075 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0786 0.109 0.075 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 9.00e-01 0.0136 0.108 0.075 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 5.06e-01 0.0883 0.132 0.075 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 4.30e-02 -0.189 0.0927 0.075 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 3.17e-01 0.105 0.105 0.075 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 8.30e-01 0.0194 0.0899 0.075 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 9.51e-01 0.00584 0.0953 0.075 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 4.15e-01 -0.124 0.151 0.075 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 1.04e-01 -0.14 0.0859 0.075 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 3.94e-01 -0.109 0.128 0.075 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0571 0.129 0.075 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0446 0.134 0.075 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0397 0.0846 0.075 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 3.61e-01 0.101 0.11 0.075 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0169 0.0713 0.075 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0582 0.075 0.075 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 2.00e-01 0.206 0.161 0.075 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 9.00e-01 0.0175 0.139 0.077 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 5.93e-02 -0.279 0.147 0.077 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 1.01e-01 -0.252 0.153 0.077 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 5.22e-01 0.0915 0.143 0.077 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 1.17e-01 -0.16 0.102 0.077 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0198 0.143 0.077 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 3.89e-01 0.116 0.135 0.077 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0729 0.154 0.077 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 4.12e-01 0.0874 0.106 0.075 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0478 0.128 0.075 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 1.35e-01 0.183 0.122 0.075 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 7.47e-01 0.0296 0.0916 0.075 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 8.65e-01 0.0201 0.118 0.075 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 3.97e-01 0.0902 0.106 0.075 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 5.01e-01 0.0523 0.0776 0.075 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 7.62e-01 0.0421 0.139 0.075 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 478974 sc-eQTL 2.60e-01 -0.154 0.137 0.075 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 6.49e-01 -0.059 0.13 0.075 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 8.63e-01 -0.023 0.133 0.075 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0803 0.124 0.075 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 4.63e-01 0.0987 0.134 0.075 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 8.20e-01 0.0243 0.106 0.075 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0558 0.113 0.075 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 2.61e-01 0.182 0.161 0.075 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 9.23e-01 0.00824 0.0848 0.075 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 7.46e-01 0.0516 0.159 0.075 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 1.94e-01 0.145 0.111 0.075 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 7.97e-01 0.0344 0.133 0.075 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 9.59e-01 0.00516 0.0996 0.075 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 2.40e-01 -0.164 0.139 0.075 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 1.87e-01 -0.132 0.0997 0.075 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 7.37e-01 0.0411 0.122 0.075 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0731 0.15 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 3.47e-01 0.156 0.166 0.074 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 4.40e-01 -0.126 0.163 0.074 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0338 0.166 0.074 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 9.06e-01 0.0153 0.129 0.074 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0385 0.155 0.074 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 5.68e-01 0.0992 0.173 0.074 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0395 0.173 0.074 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0871 0.151 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 8.92e-01 0.0227 0.167 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 3.93e-01 0.127 0.148 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 2.11e-01 -0.199 0.159 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0528 0.124 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 8.23e-02 0.274 0.157 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 4.21e-01 -0.116 0.143 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0293 0.159 0.075 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 8.50e-02 -0.289 0.167 0.075 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0289 0.158 0.075 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 4.72e-01 -0.103 0.143 0.075 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 6.61e-01 0.0623 0.142 0.075 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0463 0.161 0.075 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 9.27e-01 -0.013 0.141 0.075 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 6.81e-01 0.0555 0.135 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0315 0.151 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 1.15e-01 0.233 0.147 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 4.28e-01 0.129 0.162 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0163 0.114 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 5.56e-01 0.0947 0.16 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 3.11e-01 -0.113 0.112 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0884 0.163 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 6.45e-01 0.0757 0.164 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 8.32e-01 0.0309 0.146 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0568 0.166 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 5.21e-01 0.0914 0.142 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 8.84e-01 0.0241 0.165 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 9.34e-01 0.0101 0.121 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00758 0.127 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 1.11e-01 0.246 0.153 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0566 0.163 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 2.41e-01 0.182 0.155 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 5.35e-01 0.0792 0.127 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0455 0.165 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 6.01e-04 0.438 0.126 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 9.46e-01 0.0109 0.161 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000249 0.138 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0652 0.08 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 3.24e-01 -0.12 0.122 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 6.26e-01 0.0563 0.115 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 7.22e-01 0.0545 0.153 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 1.03e-01 -0.17 0.104 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 9.09e-01 0.0129 0.112 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00346 0.1 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 4.45e-01 0.0801 0.105 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 5.23e-01 -0.101 0.158 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 3.88e-03 -0.288 0.0985 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 7.27e-01 0.0484 0.138 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 8.08e-01 0.0352 0.144 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 4.82e-01 0.117 0.166 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 1.94e-01 -0.132 0.101 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 4.88e-01 0.096 0.138 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0491 0.112 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 1.48e-01 -0.161 0.111 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 4.40e-01 0.129 0.167 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0418 0.134 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0879 0.168 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 4.96e-02 -0.3 0.152 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0628 0.164 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0357 0.132 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 2.09e-01 0.19 0.151 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 1.72e-01 0.156 0.114 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00208 0.132 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 9.13e-02 -0.267 0.158 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 1.67e-01 -0.142 0.102 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 2.67e-02 -0.341 0.153 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 5.73e-02 -0.275 0.144 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 1.57e-01 -0.227 0.16 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 5.25e-02 -0.266 0.136 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 1.06e-01 0.214 0.132 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 4.70e-01 -0.103 0.143 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 8.93e-01 0.0198 0.148 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0118 0.164 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 2.17e-01 -0.144 0.116 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 6.73e-01 0.0599 0.142 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 5.87e-01 -0.082 0.151 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 8.83e-01 0.0229 0.155 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 6.75e-01 0.053 0.126 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 1.00e+00 -2.2e-05 0.135 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 8.89e-01 0.0147 0.105 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 6.11e-01 0.0575 0.113 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 8.54e-01 0.0294 0.159 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 3.52e-01 -0.128 0.137 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 8.09e-01 0.0396 0.163 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0197 0.157 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 2.90e-01 0.167 0.157 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 3.30e-02 -0.303 0.141 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 2.15e-01 0.202 0.162 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 7.76e-01 0.0391 0.137 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 1.95e-02 -0.319 0.136 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 2.34e-01 0.177 0.148 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 5.07e-01 -0.102 0.153 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 1.78e-01 0.234 0.173 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 2.32e-02 0.375 0.164 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 5.16e-01 0.113 0.174 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 5.92e-01 0.0857 0.16 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 9.89e-02 -0.288 0.173 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 9.33e-01 0.0135 0.16 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0875 0.166 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 3.81e-04 0.538 0.149 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0461 0.125 0.076 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 4.73e-01 0.114 0.158 0.076 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0234 0.14 0.076 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 4.87e-01 0.107 0.153 0.076 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 9.40e-01 0.0106 0.142 0.076 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 1.41e-01 -0.244 0.165 0.076 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 1.99e-01 -0.162 0.126 0.076 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 7.18e-01 0.0522 0.144 0.076 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0848 0.155 0.076 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 4.15e-01 0.101 0.124 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 5.17e-01 -0.102 0.157 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 478974 sc-eQTL 3.71e-01 -0.123 0.137 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 6.29e-01 0.0825 0.171 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 2.96e-01 -0.167 0.159 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 3.06e-01 -0.132 0.128 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 5.64e-01 0.0921 0.159 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 9.96e-01 0.000653 0.141 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 9.73e-01 0.00555 0.164 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 5.65e-02 0.299 0.156 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 8.15e-01 0.0222 0.0949 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 7.73e-01 0.0411 0.142 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 478974 sc-eQTL 2.21e-01 -0.17 0.139 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0682 0.142 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0632 0.141 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 8.27e-01 0.0313 0.143 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 6.34e-01 0.0703 0.147 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 4.14e-01 0.0968 0.118 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00478 0.125 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 3.55e-01 0.152 0.164 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 2.63e-01 -0.167 0.149 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 8.17e-01 0.0418 0.181 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 478974 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0055 0.176 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 6.37e-01 0.0876 0.185 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 8.90e-01 0.0259 0.188 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 7.89e-02 -0.285 0.162 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 3.58e-01 -0.172 0.186 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0925 0.16 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 7.03e-01 -0.07 0.183 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 1.82e-01 -0.229 0.171 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 4.73e-01 0.0826 0.115 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 6.48e-01 0.0754 0.165 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 478974 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0123 0.152 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 4.14e-01 -0.128 0.156 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 9.43e-01 0.0114 0.16 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 1.80e-01 -0.202 0.15 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 1.77e-01 0.222 0.163 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 8.70e-01 0.0196 0.12 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 4.55e-01 -0.101 0.135 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 5.91e-01 0.09 0.167 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 4.23e-01 -0.138 0.171 0.078 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0805 0.185 0.078 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 9.00e-01 0.0208 0.165 0.078 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 8.16e-02 -0.269 0.153 0.078 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 8.10e-01 -0.025 0.104 0.078 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0448 0.133 0.078 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 1.72e-01 0.236 0.172 0.078 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 7.85e-01 0.0315 0.116 0.074 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 8.23e-01 0.0373 0.167 0.074 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 4.89e-01 0.109 0.157 0.074 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 2.12e-01 -0.196 0.157 0.074 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 8.27e-02 -0.151 0.0866 0.074 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0711 0.146 0.074 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 3.40e-01 -0.14 0.146 0.074 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 7.22e-01 0.0479 0.135 0.074 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0285 0.139 0.074 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0119 0.135 0.075 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0658 0.16 0.075 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 8.33e-01 0.0324 0.153 0.075 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 3.76e-02 -0.343 0.164 0.075 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 4.67e-01 0.0862 0.118 0.075 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 3.11e-02 0.329 0.152 0.075 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 7.89e-01 0.0298 0.111 0.075 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 6.75e-01 0.0535 0.128 0.075 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 3.51e-01 -0.14 0.15 0.075 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 4.78e-01 -0.11 0.155 0.08 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 2.90e-01 -0.158 0.148 0.08 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 1.15e-02 -0.394 0.155 0.08 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 6.69e-01 0.0579 0.135 0.08 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 4.87e-01 -0.077 0.11 0.08 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0773 0.145 0.08 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 7.26e-01 0.0479 0.136 0.08 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0779 0.165 0.08 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 7.80e-01 0.038 0.136 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0135 0.153 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0876 0.139 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 5.15e-01 0.0685 0.105 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 5.64e-01 0.0725 0.126 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 1.61e-01 0.176 0.125 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 3.88e-01 0.137 0.159 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 3.11e-01 -0.161 0.158 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 1.73e-01 0.2 0.146 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 5.47e-01 0.0699 0.116 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0898 0.146 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0589 0.136 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 6.34e-01 0.0901 0.189 0.076 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 1.44e-01 -0.289 0.197 0.076 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 1.47e-01 0.291 0.2 0.076 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 2.47e-02 0.482 0.212 0.076 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 9.43e-01 0.0136 0.189 0.076 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 9.62e-02 -0.327 0.195 0.076 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 8.19e-01 0.0402 0.175 0.076 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 3.62e-01 -0.187 0.205 0.076 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 9.94e-01 0.00138 0.196 0.076 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 5.03e-01 -0.104 0.156 0.073 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0133 0.152 0.073 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 1.93e-01 0.193 0.148 0.073 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0648 0.154 0.073 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 7.99e-01 0.0363 0.142 0.073 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 5.84e-01 0.0949 0.173 0.073 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 9.28e-01 0.00993 0.11 0.075 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 7.85e-01 0.0386 0.142 0.075 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 8.07e-03 0.362 0.135 0.075 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 4.36e-01 0.114 0.146 0.075 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 4.94e-01 0.0968 0.141 0.075 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0708 0.144 0.075 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 7.53e-01 0.0478 0.152 0.088 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 6.14e-02 -0.309 0.164 0.088 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0182 0.16 0.088 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 5.59e-01 0.0876 0.15 0.088 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 1.17e-01 -0.166 0.105 0.088 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 7.71e-01 0.0494 0.169 0.088 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 3.33e-01 0.128 0.131 0.088 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 2.57e-01 -0.181 0.159 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 3.90e-01 -0.124 0.144 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 3.95e-01 -0.141 0.166 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 4.16e-01 0.116 0.143 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 4.02e-01 -0.135 0.161 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0357 0.112 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 2.19e-01 0.194 0.157 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0948 0.136 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 8.77e-01 0.019 0.123 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 6.00e-01 0.0808 0.154 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 1.27e-01 0.23 0.15 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 4.96e-01 0.112 0.165 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0292 0.115 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 5.64e-01 0.0897 0.155 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 2.19e-01 -0.123 0.0997 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 4.75e-01 0.0938 0.131 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 5.54e-01 -0.086 0.145 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 6.44e-01 0.0622 0.134 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 6.78e-01 0.042 0.101 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00158 0.122 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 2.18e-01 0.132 0.107 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0408 0.113 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0206 0.137 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 9.09e-03 0.338 0.129 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 6.29e-01 0.0654 0.135 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 3.57e-01 0.121 0.131 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0572 0.14 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -474542 sc-eQTL 8.23e-01 0.0177 0.079 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 261259 sc-eQTL 6.62e-01 0.0628 0.143 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 478974 sc-eQTL 3.81e-01 -0.121 0.138 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -155614 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00038 0.132 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -368153 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0422 0.137 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 314728 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0602 0.131 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -336712 sc-eQTL 4.40e-01 0.107 0.139 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00625 0.103 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 sc-eQTL 9.08e-01 -0.013 0.112 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -336490 sc-eQTL 3.11e-01 0.164 0.162 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000151136 BTBD11 -699414 eQTL 0.00127 0.167 0.0517 0.0 0.0 0.053
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 eQTL 0.0344 0.0674 0.0318 0.00111 0.0 0.053

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000013503 \N 261259 1.19e-06 1.18e-06 2.63e-07 1.2e-06 3.47e-07 6.02e-07 1.55e-06 3.57e-07 1.49e-06 5.19e-07 1.87e-06 7.43e-07 2.25e-06 2.74e-07 5.65e-07 8.79e-07 8.94e-07 7.02e-07 8.21e-07 6.26e-07 7.68e-07 1.7e-06 8.94e-07 6.35e-07 2.25e-06 4.27e-07 9.62e-07 8.04e-07 1.38e-06 1.32e-06 6.97e-07 3.07e-07 2.15e-07 7.03e-07 5.31e-07 4.62e-07 5.22e-07 2.54e-07 3.89e-07 2.5e-07 2.87e-07 1.63e-06 9.6e-08 1.3e-07 2.11e-07 1.25e-07 2.7e-07 3.68e-08 1.36e-07
ENSG00000120832 \N -368153 1.05e-06 8.23e-07 1.59e-07 3.71e-07 1.11e-07 3.22e-07 6.87e-07 2e-07 6.71e-07 3.1e-07 1.07e-06 5.22e-07 1.05e-06 1.98e-07 3.56e-07 3.41e-07 5.63e-07 4.39e-07 2.87e-07 3.06e-07 2.43e-07 5.34e-07 4.69e-07 2.7e-07 1.42e-06 2.57e-07 4.7e-07 3.95e-07 5.42e-07 7.63e-07 3.66e-07 3.8e-08 4.77e-08 1.77e-07 3.16e-07 1.58e-07 1.31e-07 1.18e-07 7.41e-08 1.57e-08 1.44e-07 8.79e-07 5.09e-08 1.29e-08 2.03e-07 2.71e-08 1.43e-07 5.73e-08 6.32e-08
ENSG00000166046 TCP11L2 317078 1.24e-06 9.07e-07 3.06e-07 5.51e-07 2.28e-07 4.51e-07 1.08e-06 2.88e-07 1.14e-06 3.82e-07 1.33e-06 5.76e-07 1.54e-06 2.61e-07 4.33e-07 5.7e-07 7.72e-07 5.53e-07 4.24e-07 6.07e-07 3.6e-07 9.64e-07 7.63e-07 4.55e-07 1.92e-06 2.44e-07 6.19e-07 5.63e-07 8.81e-07 9.73e-07 4.59e-07 1.56e-07 1.35e-07 3.28e-07 4.25e-07 3e-07 2.94e-07 1.47e-07 1.49e-07 9.81e-09 2.75e-07 1.43e-06 6.53e-08 4.2e-08 1.61e-07 7.16e-08 1.87e-07 8.66e-08 8e-08