logo

Genes within 1Mb (chr12:106603711:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 1.22e-01 0.162 0.104 0.079 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0503 0.152 0.079 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 4.32e-01 0.0952 0.121 0.079 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 7.28e-01 0.0582 0.167 0.079 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0646 0.0786 0.079 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0566 0.118 0.079 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 2.80e-01 0.102 0.0943 0.079 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0327 0.0691 0.079 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 1.58e-01 0.155 0.11 0.079 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 3.79e-01 0.0955 0.108 0.079 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 8.21e-03 -0.35 0.131 0.079 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 2.90e-01 0.0996 0.0938 0.079 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 2.80e-01 -0.114 0.105 0.079 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00651 0.0903 0.079 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 2.25e-01 0.116 0.0954 0.079 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 4.51e-01 0.115 0.152 0.079 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 9.11e-01 0.0101 0.0902 0.079 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 4.95e-01 0.0913 0.134 0.079 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 3.85e-01 0.117 0.134 0.079 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 6.40e-02 -0.258 0.138 0.079 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 5.16e-01 0.0574 0.0883 0.079 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 6.15e-01 -0.058 0.115 0.079 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0867 0.0742 0.079 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 4.94e-02 0.154 0.0777 0.079 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 5.53e-01 0.1 0.168 0.079 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 9.20e-01 0.0144 0.143 0.081 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0571 0.153 0.081 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 8.38e-01 0.0325 0.158 0.081 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 5.22e-04 -0.503 0.143 0.081 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 3.80e-01 0.0924 0.105 0.081 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 6.46e-02 -0.27 0.145 0.081 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 7.89e-02 0.243 0.138 0.081 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 2.63e-01 -0.177 0.158 0.081 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 4.63e-01 0.0822 0.112 0.079 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 4.49e-01 -0.102 0.134 0.079 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 4.54e-01 0.0967 0.129 0.079 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 9.04e-01 0.0117 0.0964 0.079 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 7.89e-02 0.217 0.123 0.079 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 5.58e-01 0.0655 0.112 0.079 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 3.38e-01 0.077 0.0802 0.079 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 7.58e-01 0.0444 0.144 0.079 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 463678 sc-eQTL 1.51e-02 -0.343 0.14 0.079 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 3.29e-01 -0.131 0.134 0.079 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 6.24e-01 0.0678 0.138 0.079 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 5.07e-01 0.0856 0.129 0.079 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0134 0.139 0.079 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 7.02e-02 -0.199 0.109 0.079 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 7.24e-01 0.0415 0.117 0.079 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0306 0.168 0.079 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 2.53e-01 0.1 0.0874 0.079 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 8.78e-01 0.0252 0.164 0.079 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0339 0.115 0.079 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 9.39e-01 0.0106 0.138 0.079 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 8.33e-01 0.0218 0.103 0.079 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 6.62e-01 0.0629 0.144 0.079 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0732 0.103 0.079 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 2.69e-01 -0.139 0.126 0.079 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 9.54e-01 0.00898 0.156 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 9.11e-01 0.0185 0.166 0.084 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 4.09e-01 -0.135 0.163 0.084 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 1.52e-02 0.4 0.163 0.084 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0371 0.129 0.084 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 7.23e-01 0.0552 0.155 0.084 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 6.75e-01 0.0727 0.173 0.084 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 6.80e-01 0.0713 0.173 0.084 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0273 0.156 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 3.41e-01 0.164 0.172 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0433 0.153 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 8.19e-01 0.0376 0.164 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 5.73e-01 0.0718 0.127 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 6.13e-01 0.0826 0.163 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 2.07e-01 0.187 0.147 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 3.13e-01 0.164 0.162 0.08 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0134 0.171 0.08 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 5.56e-01 0.0951 0.161 0.08 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 7.18e-01 0.0525 0.145 0.08 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 9.81e-01 0.00341 0.145 0.08 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 6.09e-01 0.0842 0.164 0.08 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 1.85e-01 0.191 0.144 0.08 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 7.68e-02 0.247 0.139 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 9.60e-01 0.00784 0.157 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 1.96e-01 0.198 0.153 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 8.28e-01 0.0366 0.168 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 9.19e-01 0.012 0.118 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 1.65e-01 -0.231 0.166 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 7.13e-01 0.0428 0.116 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00775 0.165 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00854 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 8.64e-01 0.0255 0.148 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 9.15e-01 -0.018 0.169 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 3.13e-01 -0.146 0.144 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 6.15e-01 0.0846 0.168 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0251 0.123 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 2.25e-01 0.16 0.131 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 6.83e-01 0.0655 0.16 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0527 0.169 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 1.94e-01 -0.21 0.161 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0052 0.132 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000922 0.171 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 7.29e-01 0.0467 0.134 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 6.80e-01 -0.069 0.167 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0829 0.144 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0127 0.0816 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 5.63e-02 0.236 0.123 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 2.32e-01 0.14 0.117 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 3.18e-01 -0.156 0.156 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 6.25e-01 0.0522 0.106 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0626 0.114 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 4.58e-01 0.0759 0.102 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 9.38e-01 0.00829 0.107 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 1.61e-01 0.226 0.16 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 2.57e-01 -0.115 0.101 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 4.22e-01 -0.112 0.139 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 5.95e-01 0.0777 0.146 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 1.12e-01 -0.267 0.167 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 8.03e-01 0.0256 0.103 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0795 0.14 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 3.25e-01 -0.112 0.113 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 2.47e-01 0.131 0.113 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 5.34e-01 -0.105 0.169 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 2.02e-01 -0.175 0.137 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 5.50e-01 0.103 0.172 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0436 0.157 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 1.42e-01 -0.247 0.167 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 1.87e-01 0.178 0.134 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0104 0.155 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 8.21e-02 -0.204 0.117 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 6.52e-01 0.0611 0.135 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 6.99e-01 0.063 0.163 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0544 0.106 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 8.64e-01 0.0275 0.16 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 8.27e-01 0.0329 0.151 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 2.83e-01 -0.179 0.166 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 8.17e-01 -0.033 0.143 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0847 0.137 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 2.03e-01 -0.188 0.147 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 3.18e-01 0.153 0.153 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 5.57e-01 0.0997 0.17 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0231 0.12 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 9.20e-02 0.245 0.145 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 7.05e-01 0.0588 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 1.34e-01 -0.238 0.158 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 2.21e-01 0.159 0.13 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 2.63e-01 0.155 0.138 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 2.74e-02 -0.237 0.107 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 1.20e-01 0.18 0.115 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 3.00e-01 0.17 0.163 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 2.81e-01 -0.155 0.144 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 6.01e-01 0.0896 0.171 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 7.43e-01 -0.054 0.164 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 2.98e-01 -0.172 0.165 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 8.44e-01 0.0295 0.149 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 1.31e-01 0.257 0.17 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 2.57e-01 0.163 0.143 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 2.52e-01 0.165 0.144 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 5.11e-01 -0.103 0.156 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0219 0.152 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00678 0.172 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 1.11e-01 0.262 0.164 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0826 0.173 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 9.67e-01 0.00661 0.158 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 9.06e-01 0.0205 0.173 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 4.28e-01 0.126 0.159 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 6.57e-01 0.0734 0.165 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 2.81e-01 0.164 0.152 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 1.49e-01 0.184 0.127 0.078 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00403 0.161 0.078 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 2.30e-01 0.172 0.142 0.078 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 6.85e-01 0.0635 0.156 0.078 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 6.72e-01 0.0612 0.144 0.078 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 8.55e-01 -0.031 0.169 0.078 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 4.16e-01 0.105 0.129 0.078 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 1.93e-03 -0.452 0.144 0.078 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 2.50e-01 0.182 0.158 0.078 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 1.98e-02 -0.291 0.124 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 2.16e-02 0.363 0.157 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 463678 sc-eQTL 2.71e-02 0.305 0.137 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 3.90e-01 0.148 0.172 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0909 0.161 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 5.58e-01 0.0761 0.13 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 2.86e-01 0.172 0.16 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 1.91e-01 0.185 0.141 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 8.03e-02 0.289 0.164 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0771 0.159 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0214 0.0966 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 2.04e-01 -0.184 0.144 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 463678 sc-eQTL 2.10e-03 -0.431 0.139 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00899 0.145 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0829 0.144 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 6.81e-01 0.0599 0.145 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 8.73e-01 0.024 0.15 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 8.55e-02 -0.207 0.12 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0648 0.128 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0934 0.168 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00746 0.137 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 8.79e-02 -0.281 0.164 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 463678 sc-eQTL 4.01e-02 -0.329 0.159 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 8.04e-01 -0.042 0.169 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 5.26e-01 0.109 0.171 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00998 0.149 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 6.00e-01 0.0894 0.17 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 1.16e-01 -0.229 0.145 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 4.29e-01 0.133 0.167 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0333 0.157 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 4.22e-01 0.0902 0.112 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 4.38e-02 0.324 0.16 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 463678 sc-eQTL 5.47e-02 -0.285 0.148 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 8.68e-02 -0.261 0.152 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 4.97e-01 0.106 0.156 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 7.93e-01 0.0387 0.147 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0281 0.16 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 6.43e-02 -0.217 0.116 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 9.15e-01 0.014 0.132 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 2.81e-01 0.176 0.163 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 5.60e-01 -0.128 0.219 0.063 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0972 0.236 0.063 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 4.93e-01 -0.145 0.211 0.063 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 5.99e-01 0.104 0.198 0.063 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 4.83e-01 0.0931 0.132 0.063 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0936 0.169 0.063 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 2.65e-01 -0.247 0.22 0.063 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0534 0.114 0.08 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 6.43e-01 0.0765 0.165 0.08 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 4.74e-01 0.111 0.155 0.08 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 7.40e-02 0.277 0.154 0.08 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0473 0.0862 0.08 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 5.56e-01 0.0849 0.144 0.08 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 2.82e-01 0.156 0.144 0.08 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 3.13e-02 0.285 0.131 0.08 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 9.02e-01 0.017 0.138 0.08 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0456 0.139 0.079 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0156 0.165 0.079 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 3.14e-01 -0.158 0.157 0.079 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0267 0.17 0.079 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 1.39e-01 -0.18 0.121 0.079 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 9.12e-01 0.0175 0.158 0.079 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00483 0.114 0.079 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 3.14e-01 0.132 0.131 0.079 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 6.02e-01 0.0807 0.155 0.079 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 8.33e-01 0.0335 0.158 0.083 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 3.41e-01 -0.145 0.152 0.083 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0295 0.161 0.083 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 3.98e-01 -0.117 0.138 0.083 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 8.92e-01 0.0154 0.113 0.083 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0812 0.148 0.083 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 3.82e-02 0.288 0.138 0.083 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 6.74e-01 0.0712 0.169 0.083 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0165 0.14 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0573 0.159 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 8.65e-01 0.0244 0.144 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 5.96e-01 0.0576 0.109 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 2.32e-02 0.294 0.128 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0712 0.13 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 9.98e-02 0.27 0.163 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 8.93e-01 0.022 0.164 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 3.82e-01 0.133 0.151 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 8.55e-01 0.022 0.12 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 8.27e-01 0.0331 0.151 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 6.39e-01 0.066 0.14 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 2.40e-01 -0.205 0.174 0.094 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0298 0.183 0.094 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 2.61e-01 -0.209 0.185 0.094 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 3.24e-01 -0.197 0.199 0.094 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 1.43e-01 0.255 0.173 0.094 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 3.56e-01 0.168 0.182 0.094 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 1.67e-01 -0.223 0.16 0.094 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 3.59e-01 0.174 0.189 0.094 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 6.42e-02 -0.334 0.179 0.094 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 4.56e-01 0.12 0.16 0.082 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 9.94e-01 0.00112 0.156 0.082 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 8.04e-01 0.0378 0.152 0.082 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0333 0.159 0.082 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 6.65e-01 0.0636 0.147 0.082 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 4.70e-01 -0.129 0.178 0.082 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0771 0.113 0.081 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0537 0.146 0.081 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 5.83e-01 -0.078 0.142 0.081 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 4.96e-01 0.103 0.151 0.081 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 9.49e-01 0.00939 0.146 0.081 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 6.59e-02 0.272 0.147 0.081 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 4.33e-01 -0.125 0.159 0.085 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 7.43e-01 0.0571 0.174 0.085 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 8.03e-01 0.0419 0.168 0.085 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 3.73e-03 -0.45 0.153 0.085 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 2.65e-01 0.124 0.111 0.085 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 5.58e-02 -0.339 0.176 0.085 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 8.17e-01 -0.032 0.138 0.085 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0733 0.167 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 3.67e-01 0.134 0.148 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0152 0.171 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 6.12e-01 0.0746 0.147 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 8.91e-01 0.0229 0.166 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 3.86e-01 0.1 0.115 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 2.21e-01 0.199 0.162 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 2.54e-02 0.312 0.138 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 2.15e-01 0.157 0.126 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0277 0.159 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 1.12e-01 0.247 0.155 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 7.09e-01 0.0635 0.17 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0112 0.118 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 3.87e-01 -0.139 0.16 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 5.19e-01 0.0667 0.103 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 4.00e-01 0.116 0.137 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0459 0.152 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 3.28e-01 0.138 0.14 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 7.13e-01 0.039 0.106 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 1.15e-01 0.2 0.127 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 8.69e-01 0.0185 0.112 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 8.61e-01 0.0201 0.115 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00188 0.139 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00745 0.133 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0533 0.137 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 6.96e-01 0.0519 0.133 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 2.47e-01 0.165 0.142 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -489838 sc-eQTL 2.00e-01 0.105 0.0813 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 245963 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0426 0.148 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 463678 sc-eQTL 9.70e-03 -0.366 0.14 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -170910 sc-eQTL 3.31e-01 -0.133 0.136 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 sc-eQTL 4.70e-01 0.102 0.142 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 299432 sc-eQTL 6.31e-01 0.0651 0.135 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -352008 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0579 0.143 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 sc-eQTL 1.09e-02 -0.269 0.105 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 301782 sc-eQTL 9.90e-01 0.00149 0.116 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -351786 sc-eQTL 7.55e-01 0.0523 0.167 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000008405 CRY1 -489838 eQTL 0.00471 -0.0728 0.0257 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 eQTL 0.00374 -0.118 0.0405 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000151136 BTBD11 -714710 eQTL 0.213 0.0511 0.041 0.00155 0.0 0.0903

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000008405 CRY1 -489838 5.59e-07 4e-07 8.83e-08 3.66e-07 9.45e-08 2.09e-07 4.93e-07 1.37e-07 2.75e-07 2.14e-07 4.3e-07 3.21e-07 5.39e-07 1.1e-07 1.51e-07 1.75e-07 1.69e-07 3.3e-07 1.89e-07 1.51e-07 1.97e-07 2.96e-07 3.03e-07 1.34e-07 5.15e-07 2.32e-07 2.22e-07 2.18e-07 2.76e-07 4.3e-07 1.95e-07 5.71e-08 4.42e-08 1.37e-07 3.01e-07 1.02e-07 1.09e-07 1.06e-07 4.55e-08 3.09e-08 8.15e-08 3.43e-07 1.67e-08 1.99e-08 1.1e-07 1.22e-08 1.1e-07 3.17e-08 6.26e-08
ENSG00000120832 MTERF2 -383449 1.01e-06 8.47e-07 1.6e-07 3.4e-07 1.19e-07 3.2e-07 7.1e-07 2.65e-07 6.71e-07 3.05e-07 1.07e-06 5.48e-07 1.05e-06 2.14e-07 3.61e-07 3.57e-07 5.63e-07 4.16e-07 3.64e-07 3.96e-07 2.72e-07 5.49e-07 4.96e-07 3.59e-07 1.35e-06 2.44e-07 4.71e-07 4.23e-07 5.78e-07 8.47e-07 3.81e-07 4.91e-08 1.31e-07 2.33e-07 3.4e-07 2.91e-07 2.59e-07 1.54e-07 1.14e-07 9.55e-09 1.67e-07 7.7e-07 5.98e-08 1.27e-08 1.91e-07 5.94e-08 1.73e-07 7.69e-08 8.38e-08