logo

Genes within 1Mb (chr12:106432011:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 3.10e-02 -0.241 0.111 0.058 B L1
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 7.17e-01 -0.059 0.163 0.058 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 9.01e-01 0.0161 0.129 0.058 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 3.61e-01 -0.163 0.179 0.058 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0869 0.0839 0.058 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 1.25e-01 0.193 0.125 0.058 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0497 0.101 0.058 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00675 0.0744 0.058 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 8.84e-03 -0.308 0.117 0.058 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0104 0.117 0.058 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 8.89e-01 0.02 0.143 0.058 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 1.28e-02 -0.25 0.0998 0.058 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0312 0.113 0.058 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 6.18e-01 0.0485 0.0972 0.058 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 2.29e-04 0.374 0.0997 0.058 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0292 0.164 0.058 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 5.49e-01 0.0572 0.0952 0.058 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 9.79e-01 0.00381 0.141 0.058 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0912 0.142 0.058 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 3.84e-01 -0.128 0.147 0.058 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 9.65e-01 0.00413 0.0933 0.058 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 3.57e-01 0.112 0.121 0.058 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 4.25e-01 0.0628 0.0785 0.058 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 2.97e-01 0.0863 0.0826 0.058 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 4.24e-01 -0.142 0.177 0.058 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0427 0.154 0.059 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 7.44e-01 0.0537 0.164 0.059 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0428 0.17 0.059 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 3.90e-01 0.136 0.157 0.059 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0657 0.113 0.059 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0835 0.157 0.059 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 2.69e-01 -0.165 0.149 0.059 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0668 0.17 0.059 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 2.93e-01 -0.124 0.118 0.058 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 3.96e-02 -0.291 0.14 0.058 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 2.71e-01 0.15 0.136 0.058 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 2.83e-01 -0.109 0.101 0.058 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 4.14e-01 -0.107 0.13 0.058 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 7.09e-01 0.0441 0.118 0.058 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0129 0.0883 0.058 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 3.19e-01 -0.158 0.158 0.058 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 291978 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0225 0.156 0.058 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 3.57e-02 -0.308 0.146 0.058 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0289 0.152 0.058 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 2.37e-01 0.167 0.141 0.058 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 5.25e-01 0.0973 0.153 0.058 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 3.34e-01 0.117 0.121 0.058 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 3.62e-03 0.372 0.126 0.058 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 5.53e-02 0.352 0.183 0.058 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 8.76e-01 0.0145 0.093 0.058 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 5.57e-01 -0.102 0.174 0.058 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 5.72e-02 -0.232 0.121 0.058 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 9.37e-02 0.244 0.145 0.058 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 5.42e-01 0.0666 0.109 0.058 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0712 0.152 0.058 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 9.31e-01 0.00945 0.11 0.058 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 1.56e-01 0.19 0.133 0.058 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 4.03e-01 0.138 0.165 0.058 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 6.20e-01 0.097 0.196 0.051 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0317 0.192 0.051 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 9.30e-01 0.0171 0.195 0.051 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 5.66e-02 -0.288 0.15 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 1.70e-01 -0.251 0.182 0.051 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 6.94e-01 0.0803 0.204 0.051 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 1.87e-01 -0.269 0.203 0.051 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 3.54e-01 -0.16 0.173 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0887 0.191 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 7.88e-01 0.0456 0.17 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 4.67e-01 -0.132 0.182 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 4.71e-01 -0.102 0.141 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 3.00e-01 0.188 0.18 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 1.59e-01 -0.231 0.163 0.058 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0781 0.174 0.056 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0899 0.184 0.056 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 1.70e-01 -0.238 0.173 0.056 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 3.15e-01 0.157 0.156 0.056 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 4.68e-01 -0.113 0.155 0.056 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 4.88e-01 0.123 0.176 0.056 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 3.14e-01 -0.156 0.155 0.056 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 2.41e-02 -0.344 0.151 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 4.21e-01 0.138 0.172 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 3.36e-01 0.162 0.168 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 1.67e-02 -0.439 0.182 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 3.24e-01 0.128 0.129 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 2.43e-01 0.213 0.182 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 5.20e-01 0.0818 0.127 0.058 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 7.60e-01 0.056 0.183 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 5.03e-01 -0.124 0.184 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 5.27e-01 -0.104 0.164 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 4.48e-01 0.142 0.186 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 1.06e-01 -0.258 0.159 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 4.74e-01 0.133 0.186 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 8.85e-01 0.0198 0.137 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0829 0.145 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 7.94e-01 0.046 0.176 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 7.17e-01 0.0672 0.185 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 5.34e-02 0.341 0.175 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 5.88e-01 0.0788 0.145 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 9.49e-02 -0.313 0.187 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00109 0.148 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0254 0.183 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 3.23e-02 0.336 0.156 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 8.35e-01 0.0183 0.0876 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 4.01e-02 -0.272 0.132 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0178 0.126 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 9.21e-01 0.0167 0.167 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 6.88e-03 -0.307 0.112 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0789 0.123 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 5.36e-01 0.0679 0.11 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 5.43e-05 0.454 0.11 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0415 0.173 0.058 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0838 0.11 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 2.03e-01 -0.192 0.15 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 4.93e-01 0.108 0.158 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 5.73e-01 -0.102 0.182 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 2.05e-01 -0.14 0.111 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00356 0.151 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 1.02e-01 -0.2 0.122 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 3.10e-02 0.262 0.121 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0147 0.183 0.058 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 3.82e-01 0.133 0.151 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0795 0.19 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 9.17e-01 0.018 0.174 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 6.66e-01 0.0803 0.186 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 2.19e-01 -0.183 0.148 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 8.69e-01 0.0282 0.171 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 5.44e-02 0.249 0.129 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 3.76e-01 0.132 0.149 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0559 0.179 0.058 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 1.07e-01 0.183 0.113 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00692 0.171 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 7.21e-01 0.0574 0.16 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0236 0.177 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 2.08e-01 0.191 0.151 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 5.74e-01 0.0824 0.146 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00723 0.158 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 1.70e-01 0.224 0.162 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 8.42e-01 0.0362 0.181 0.058 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 2.21e-01 0.159 0.129 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0907 0.158 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0334 0.168 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 2.65e-01 -0.192 0.172 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0239 0.141 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0815 0.15 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 2.69e-01 0.129 0.116 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 5.08e-01 0.0832 0.125 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 9.64e-02 -0.294 0.176 0.058 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 5.52e-02 0.296 0.153 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 3.63e-01 0.168 0.184 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 4.48e-02 -0.354 0.175 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0841 0.178 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 9.04e-01 0.0194 0.161 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00292 0.184 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 1.94e-01 0.2 0.154 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 8.51e-01 0.0292 0.155 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 4.40e-01 0.13 0.168 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0976 0.165 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 2.01e-01 0.239 0.187 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 5.55e-01 0.106 0.179 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 5.47e-01 -0.113 0.188 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 3.40e-01 -0.164 0.172 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00388 0.188 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 3.09e-01 -0.176 0.172 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 9.22e-01 0.0176 0.179 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 3.19e-01 -0.165 0.165 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 9.43e-02 -0.232 0.138 0.058 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 2.98e-01 -0.183 0.175 0.058 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 6.61e-02 -0.285 0.154 0.058 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 5.75e-01 0.0955 0.17 0.058 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0379 0.157 0.058 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 3.93e-01 -0.157 0.184 0.058 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 1.28e-01 -0.213 0.14 0.058 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 3.73e-01 0.143 0.16 0.058 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 4.92e-01 -0.119 0.172 0.058 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 6.31e-01 0.0658 0.137 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 5.31e-01 -0.109 0.173 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 291978 sc-eQTL 1.36e-01 -0.225 0.15 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0274 0.188 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 2.14e-01 -0.219 0.175 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 3.87e-01 0.123 0.142 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 1.06e-01 0.283 0.175 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 4.56e-01 -0.116 0.155 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 4.29e-01 0.143 0.181 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 8.53e-01 0.032 0.173 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0944 0.106 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 2.90e-01 -0.169 0.159 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 291978 sc-eQTL 6.58e-01 0.069 0.156 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 1.42e-01 -0.234 0.159 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 7.75e-01 0.0453 0.158 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 5.48e-01 0.0962 0.16 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 2.93e-01 0.174 0.165 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 2.21e-01 0.162 0.132 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 9.13e-03 0.363 0.138 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 2.65e-02 0.407 0.182 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 3.63e-01 0.137 0.15 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 8.61e-01 0.0318 0.182 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 291978 sc-eQTL 9.39e-01 0.0135 0.177 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 4.66e-01 -0.136 0.186 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 9.38e-01 0.0147 0.188 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 7.91e-01 0.0434 0.163 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 1.80e-01 -0.251 0.187 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 6.75e-02 0.293 0.159 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 1.19e-01 0.287 0.183 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 9.42e-02 -0.288 0.171 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 6.28e-01 0.0605 0.125 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 6.89e-02 -0.324 0.177 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 291978 sc-eQTL 6.23e-01 0.0813 0.165 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 7.34e-02 -0.303 0.168 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0835 0.173 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 5.46e-01 0.0988 0.163 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0808 0.178 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 9.59e-01 0.00665 0.13 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 1.56e-01 0.207 0.146 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 2.06e-01 0.229 0.181 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0155 0.227 0.059 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0914 0.245 0.059 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0208 0.218 0.059 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 4.85e-02 0.403 0.202 0.059 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 2.59e-01 -0.155 0.137 0.059 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000359 0.176 0.059 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00759 0.229 0.059 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 5.41e-01 0.0754 0.123 0.059 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0649 0.178 0.059 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0688 0.168 0.059 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 4.86e-01 -0.117 0.168 0.059 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00945 0.0931 0.059 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 4.39e-02 -0.312 0.154 0.059 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0762 0.156 0.059 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0792 0.144 0.059 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 4.27e-02 0.3 0.147 0.059 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 9.37e-01 0.0121 0.153 0.058 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0943 0.181 0.058 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 1.62e-01 0.242 0.172 0.058 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0675 0.187 0.058 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 8.63e-01 0.0231 0.134 0.058 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 1.16e-01 -0.273 0.173 0.058 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 3.27e-01 -0.123 0.126 0.058 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 2.27e-01 0.174 0.144 0.058 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0498 0.17 0.058 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 1.47e-01 -0.25 0.172 0.056 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 2.22e-01 0.203 0.166 0.056 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 6.49e-01 -0.08 0.176 0.056 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 3.27e-01 0.148 0.151 0.056 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0265 0.124 0.056 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 4.52e-01 0.122 0.162 0.056 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0712 0.152 0.056 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 8.56e-01 0.0334 0.184 0.056 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 6.33e-01 0.0708 0.148 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 1.00e-01 -0.274 0.166 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 2.29e-01 0.182 0.151 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 1.58e-01 -0.161 0.114 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0489 0.137 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 4.63e-01 0.1 0.137 0.058 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 5.15e-01 -0.112 0.172 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 1.16e-01 -0.27 0.171 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 5.56e-01 0.0936 0.159 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0688 0.126 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 2.91e-01 -0.167 0.158 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0218 0.147 0.058 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 8.60e-02 0.313 0.181 0.061 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0268 0.192 0.061 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 6.64e-01 0.0845 0.194 0.061 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0408 0.209 0.061 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 3.79e-01 -0.161 0.182 0.061 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0914 0.191 0.061 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 3.10e-01 0.172 0.168 0.061 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0179 0.199 0.061 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 2.86e-01 0.202 0.189 0.061 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 4.65e-01 0.122 0.167 0.06 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 3.45e-01 -0.154 0.162 0.06 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 8.90e-01 0.0219 0.159 0.06 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 4.58e-02 -0.33 0.164 0.06 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00821 0.153 0.06 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 8.36e-01 0.0386 0.186 0.06 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 1.09e-02 -0.305 0.119 0.061 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 5.85e-01 0.0848 0.155 0.061 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 4.15e-01 0.123 0.15 0.061 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0939 0.161 0.061 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 3.10e-01 -0.157 0.154 0.061 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 2.90e-01 0.167 0.157 0.061 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 2.82e-01 0.186 0.172 0.056 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0309 0.188 0.056 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 5.21e-01 0.117 0.181 0.056 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 5.34e-01 -0.106 0.17 0.056 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 3.47e-01 -0.114 0.12 0.056 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0947 0.192 0.056 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0463 0.15 0.056 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 5.81e-01 -0.1 0.181 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 1.57e-01 -0.227 0.16 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 6.08e-01 -0.095 0.185 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00209 0.159 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0538 0.18 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0949 0.125 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 1.37e-01 0.261 0.175 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 2.08e-02 -0.348 0.15 0.058 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 1.67e-01 -0.193 0.14 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0456 0.176 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 8.78e-01 0.0264 0.172 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 1.12e-01 -0.298 0.187 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0272 0.131 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 3.77e-01 0.157 0.177 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0156 0.114 0.058 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 8.56e-01 0.026 0.144 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 5.75e-02 -0.301 0.158 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 2.45e-01 0.171 0.147 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 2.43e-01 -0.129 0.11 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0603 0.133 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 9.49e-01 0.00748 0.118 0.058 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 7.26e-02 -0.22 0.122 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0765 0.15 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 3.82e-01 0.125 0.142 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 2.01e-01 -0.188 0.147 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 4.12e-01 -0.117 0.142 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 3.38e-01 0.147 0.153 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -661538 sc-eQTL 9.88e-01 0.00139 0.0897 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B 74263 sc-eQTL 2.77e-01 -0.177 0.162 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 291978 sc-eQTL 8.32e-01 0.0333 0.157 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -342610 sc-eQTL 4.89e-02 -0.295 0.149 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -555149 sc-eQTL 8.56e-01 0.0282 0.156 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 127732 sc-eQTL 4.74e-01 0.107 0.149 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -523708 sc-eQTL 5.89e-01 0.0854 0.158 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -886410 sc-eQTL 4.26e-01 0.0929 0.117 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 sc-eQTL 3.70e-03 0.366 0.125 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -523486 sc-eQTL 6.49e-02 0.339 0.183 0.056 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B 74263 eQTL 4.35e-04 -0.212 0.0601 0.0 0.0 0.0466
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 eQTL 1.22e-06 0.158 0.0324 0.0 0.0 0.0466

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 130082 4.24e-06 4.89e-06 9.35e-07 2.64e-06 1.52e-06 1.19e-06 4.17e-06 1.07e-06 5.16e-06 2.47e-06 5.18e-06 3.54e-06 7.07e-06 2.33e-06 1.49e-06 3.89e-06 2.06e-06 3.19e-06 1.57e-06 1.19e-06 3.04e-06 4.74e-06 3.8e-06 1.4e-06 6.39e-06 1.95e-06 2.39e-06 1.57e-06 4.48e-06 4.02e-06 2.7e-06 4.37e-07 5.38e-07 1.52e-06 2.18e-06 1.16e-06 1.06e-06 4.56e-07 9.26e-07 5.21e-07 7.24e-07 5.74e-06 3.82e-07 1.51e-07 6.22e-07 1.32e-06 9.75e-07 5.21e-07 4.68e-07
ENSG00000258355 \N 185055 2.13e-06 2.64e-06 3.66e-07 1.83e-06 7.73e-07 8.24e-07 2.03e-06 8.04e-07 2.25e-06 1.18e-06 2.52e-06 1.49e-06 3.64e-06 1.4e-06 9.19e-07 2.08e-06 1.17e-06 2.24e-06 1.51e-06 1.39e-06 1.37e-06 3.09e-06 2.46e-06 1.17e-06 3.97e-06 1.03e-06 1.51e-06 1.66e-06 2.61e-06 1.85e-06 1.81e-06 4.15e-07 6.64e-07 1.25e-06 1.35e-06 8.94e-07 9.08e-07 3.93e-07 1.13e-06 3.46e-07 2.79e-07 3.38e-06 5.37e-07 1.8e-07 3.63e-07 3.6e-07 8.61e-07 2e-07 1.78e-07
ENSG00000260329 \N -523486 5.59e-07 3.55e-07 1.03e-07 3.56e-07 1.05e-07 1.54e-07 4.42e-07 9.69e-08 3.51e-07 2.12e-07 4.39e-07 3.27e-07 5.39e-07 1.07e-07 1.9e-07 2.14e-07 1.35e-07 3.3e-07 1.89e-07 1.39e-07 1.87e-07 2.96e-07 2.81e-07 1.21e-07 6.18e-07 2.42e-07 2.52e-07 2.63e-07 2.84e-07 3.15e-07 2.11e-07 7.41e-08 5.19e-08 1.19e-07 2.55e-07 7.68e-08 1.13e-07 8.33e-08 4.11e-08 2.53e-08 1.18e-07 4.02e-07 1.96e-08 1.07e-08 1.48e-07 1.22e-08 7.89e-08 1.15e-08 5.13e-08