Genes within 1Mb (chr12:106335163:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 1.32e-02 -0.273 0.109 0.06 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 6.86e-01 -0.065 0.16 0.06 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 9.70e-01 0.00473 0.128 0.06 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 3.32e-01 -0.171 0.176 0.06 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0662 0.0828 0.06 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 2.18e-01 0.153 0.124 0.06 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0885 0.0994 0.06 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 9.33e-01 0.00616 0.0734 0.06 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 5.57e-03 -0.321 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0302 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 9.76e-01 0.00418 0.141 0.06 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 1.09e-02 -0.253 0.0983 0.06 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0491 0.112 0.06 CD4T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 6.58e-01 0.0425 0.0958 0.06 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 2.23e-04 0.369 0.0983 0.06 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0266 0.162 0.06 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 5.86e-01 0.0511 0.0936 0.06 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0253 0.139 0.06 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 3.40e-01 -0.133 0.139 0.06 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0871 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0171 0.0918 0.06 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 3.65e-01 0.108 0.119 0.06 CD8T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 4.60e-01 0.0572 0.0772 0.06 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 3.12e-01 0.0823 0.0812 0.06 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 5.47e-01 -0.105 0.175 0.06 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0481 0.151 0.061 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 9.19e-01 0.0165 0.162 0.061 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 6.15e-01 -0.084 0.167 0.061 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 3.49e-01 0.146 0.155 0.061 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0533 0.111 0.061 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0731 0.155 0.061 DC L1
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 3.31e-01 -0.143 0.146 0.061 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 4.94e-01 -0.114 0.167 0.061 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0886 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 5.14e-02 -0.272 0.139 0.06 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 1.63e-01 0.187 0.134 0.06 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 2.59e-01 -0.113 0.1 0.06 Mono L1
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0933 0.129 0.06 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 6.86e-01 0.0471 0.116 0.06 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 9.59e-01 0.00449 0.0869 0.06 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 3.73e-01 -0.139 0.155 0.06 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 195130 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00496 0.153 0.06 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 2.80e-02 -0.317 0.143 0.06 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0428 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 2.76e-01 0.152 0.139 0.06 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 6.07e-01 0.0774 0.15 0.06 NK L1
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 3.12e-01 0.12 0.119 0.06 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 2.37e-03 0.382 0.124 0.06 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 5.63e-02 0.345 0.18 0.06 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 5.84e-01 0.0502 0.0917 0.06 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0635 0.172 0.06 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 8.60e-02 -0.206 0.12 0.06 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 1.31e-01 0.217 0.143 0.06 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 5.09e-01 0.0713 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0755 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 7.82e-01 0.0299 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 2.13e-01 0.164 0.132 0.06 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 3.98e-01 0.138 0.163 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 5.86e-01 0.104 0.192 0.054 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0444 0.189 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000992 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 4.75e-02 -0.294 0.147 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 1.82e-01 -0.239 0.178 0.054 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 5.24e-01 0.128 0.2 0.054 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 1.06e-01 -0.322 0.198 0.054 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 2.18e-01 -0.209 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0732 0.188 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 8.19e-01 0.0382 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 4.23e-01 -0.144 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0835 0.139 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 2.85e-01 0.19 0.178 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 1.01e-01 -0.265 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 5.46e-01 -0.104 0.172 0.058 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0904 0.181 0.058 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 1.79e-01 -0.229 0.17 0.058 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 4.04e-01 0.129 0.154 0.058 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0706 0.153 0.058 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 6.36e-01 0.0824 0.174 0.058 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 3.02e-01 -0.158 0.152 0.058 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 1.15e-02 -0.378 0.148 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 4.56e-01 0.126 0.169 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 4.89e-01 0.114 0.165 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 3.19e-02 -0.388 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 4.73e-01 0.0916 0.127 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 4.82e-01 0.126 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 8.96e-01 0.0164 0.125 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 6.83e-01 0.0739 0.181 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 4.48e-01 -0.138 0.182 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0789 0.162 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 5.11e-01 0.121 0.184 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 2.17e-01 -0.195 0.158 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 4.77e-01 0.131 0.183 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 9.00e-01 -0.017 0.135 0.058 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0736 0.142 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 9.30e-01 0.0151 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 7.76e-01 0.0519 0.182 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 7.07e-02 0.314 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 6.67e-01 0.0614 0.143 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 1.23e-01 -0.285 0.184 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 6.84e-01 0.0591 0.145 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 8.65e-01 0.0306 0.18 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 3.74e-02 0.321 0.153 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 7.46e-01 0.028 0.0864 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 3.18e-02 -0.281 0.13 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 7.23e-01 -0.044 0.124 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 8.83e-01 0.0244 0.165 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 4.60e-03 -0.317 0.111 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0979 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 5.77e-01 0.0604 0.108 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 7.59e-05 0.439 0.109 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0382 0.17 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0698 0.108 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 1.76e-01 -0.201 0.148 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 3.97e-01 0.132 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 3.73e-01 -0.16 0.179 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 2.64e-01 -0.122 0.109 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0153 0.149 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 1.47e-01 -0.175 0.12 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 3.36e-02 0.255 0.119 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00903 0.18 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 3.41e-01 0.142 0.149 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0993 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0139 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 8.05e-01 0.0453 0.183 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 1.99e-01 -0.188 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 8.48e-01 0.0323 0.168 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 1.03e-01 0.208 0.127 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 1.82e-01 0.196 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0137 0.177 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 1.33e-01 0.168 0.112 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00638 0.169 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 8.50e-01 0.0302 0.159 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0298 0.176 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 2.22e-01 0.184 0.15 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 5.12e-01 0.0952 0.145 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 7.77e-01 0.0443 0.156 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 1.02e-01 0.264 0.161 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 8.85e-01 0.0259 0.179 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 2.10e-01 0.16 0.127 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 4.87e-01 -0.108 0.155 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0636 0.165 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 3.91e-01 -0.145 0.169 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0477 0.138 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0795 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 3.05e-01 0.118 0.115 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 5.74e-01 0.0696 0.123 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 1.45e-01 -0.254 0.173 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 4.41e-02 0.306 0.151 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 2.27e-01 0.219 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 5.26e-02 -0.337 0.173 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0667 0.175 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 8.21e-01 0.0359 0.158 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0122 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 2.61e-01 0.171 0.152 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 9.86e-01 0.00259 0.153 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 4.07e-01 0.137 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 5.11e-01 -0.107 0.162 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 3.53e-01 0.171 0.184 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 8.05e-01 0.0434 0.176 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0431 0.184 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 4.63e-01 -0.124 0.169 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 9.56e-01 0.0103 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 4.48e-01 -0.129 0.17 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 8.45e-01 0.0345 0.176 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 2.82e-01 -0.175 0.162 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 1.44e-01 -0.2 0.137 0.061 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 3.64e-01 -0.157 0.173 0.061 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 8.06e-02 -0.267 0.152 0.061 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 7.39e-01 0.056 0.168 0.061 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0124 0.155 0.061 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 3.50e-01 -0.17 0.181 0.061 MAIT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 1.25e-01 -0.212 0.137 0.061 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 4.58e-01 0.117 0.158 0.061 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 4.84e-01 -0.119 0.17 0.061 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 5.03e-01 0.0905 0.135 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 5.47e-01 -0.103 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 195130 sc-eQTL 1.88e-01 -0.196 0.149 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0408 0.185 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 2.19e-01 -0.213 0.173 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 4.99e-01 0.0945 0.14 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 1.06e-01 0.279 0.172 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 4.35e-01 -0.119 0.153 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 3.22e-01 0.177 0.178 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 8.71e-01 0.0277 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 5.40e-01 -0.064 0.104 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 4.49e-01 -0.119 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 195130 sc-eQTL 5.56e-01 0.0903 0.153 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 1.16e-01 -0.246 0.156 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 7.17e-01 0.0566 0.156 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 6.67e-01 0.0677 0.157 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 4.22e-01 0.13 0.162 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 2.17e-01 0.161 0.13 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 1.02e-02 0.352 0.136 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 4.29e-02 0.366 0.18 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 3.46e-01 0.139 0.147 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 6.14e-01 0.09 0.178 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 195130 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0271 0.174 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0816 0.183 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0229 0.185 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 7.91e-01 0.0426 0.161 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 1.22e-01 -0.285 0.183 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 3.51e-02 0.331 0.156 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 1.59e-01 0.254 0.18 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 1.53e-01 -0.242 0.169 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 6.73e-01 0.0518 0.122 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 4.76e-02 -0.347 0.174 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 195130 sc-eQTL 5.92e-01 0.087 0.162 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 6.00e-02 -0.312 0.165 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0929 0.17 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 4.99e-01 0.109 0.161 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0611 0.175 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 9.15e-01 0.0136 0.128 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 1.28e-01 0.219 0.143 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 1.70e-01 0.245 0.178 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 7.39e-01 0.0737 0.221 0.063 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 5.65e-01 -0.137 0.237 0.063 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 4.32e-01 0.167 0.212 0.063 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 1.15e-01 0.314 0.198 0.063 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 3.91e-01 -0.115 0.133 0.063 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0284 0.171 0.063 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0171 0.223 0.063 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 6.01e-01 0.0639 0.122 0.061 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0177 0.176 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0511 0.166 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 4.67e-01 -0.121 0.166 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0179 0.0921 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 6.62e-02 -0.282 0.153 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0203 0.154 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0702 0.142 0.061 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 3.09e-02 0.316 0.145 0.061 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 7.77e-01 0.0427 0.151 0.06 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 5.19e-01 -0.116 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 1.84e-01 0.226 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 5.36e-01 -0.115 0.185 0.06 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 7.03e-01 0.0504 0.132 0.06 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 1.51e-01 -0.245 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 3.08e-01 -0.127 0.124 0.06 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 2.06e-01 0.18 0.142 0.06 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0601 0.168 0.06 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 1.61e-01 -0.238 0.169 0.059 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 2.98e-01 0.171 0.163 0.059 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 5.44e-01 -0.105 0.173 0.059 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 4.51e-01 0.112 0.149 0.059 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0247 0.122 0.059 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 5.41e-01 0.0975 0.159 0.059 cDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0457 0.15 0.059 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00624 0.181 0.059 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 4.67e-01 0.106 0.146 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 1.67e-01 -0.228 0.164 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 1.48e-01 0.216 0.149 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 9.90e-02 -0.186 0.112 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0459 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 5.64e-01 0.078 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0541 0.171 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 8.43e-02 -0.293 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 4.07e-01 0.13 0.157 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0791 0.124 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 3.05e-01 -0.16 0.156 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 9.04e-01 0.0176 0.146 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 2.69e-02 0.393 0.176 0.064 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0718 0.187 0.064 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 6.60e-01 0.0838 0.19 0.064 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 7.99e-01 -0.052 0.204 0.064 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 2.36e-01 -0.211 0.178 0.064 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 3.45e-01 -0.176 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 2.33e-01 0.197 0.165 0.064 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0722 0.194 0.064 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 3.45e-01 0.175 0.185 0.064 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 3.59e-01 0.152 0.165 0.062 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 3.35e-01 -0.155 0.16 0.062 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00868 0.157 0.062 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 5.62e-02 -0.312 0.162 0.062 intMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 8.23e-01 0.0338 0.151 0.062 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 6.43e-01 0.0851 0.184 0.062 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 1.39e-02 -0.29 0.117 0.063 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 5.65e-01 0.0881 0.153 0.063 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 3.47e-01 0.139 0.148 0.063 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0676 0.158 0.063 ncMono L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 5.05e-01 -0.102 0.152 0.063 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 3.29e-01 0.152 0.155 0.063 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 3.50e-01 0.159 0.169 0.059 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0629 0.185 0.059 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 5.86e-01 0.0975 0.179 0.059 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0425 0.167 0.059 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0786 0.119 0.059 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0702 0.189 0.059 pDC L2
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0744 0.147 0.059 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 5.13e-01 -0.117 0.178 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 8.37e-02 -0.272 0.157 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0852 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00822 0.156 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 6.51e-01 -0.08 0.177 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0701 0.123 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 1.49e-01 0.249 0.172 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 1.28e-02 -0.368 0.147 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 1.15e-01 -0.217 0.137 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0604 0.173 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 9.40e-01 0.0127 0.169 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 1.33e-01 -0.277 0.184 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0189 0.129 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 5.64e-01 0.101 0.174 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0672 0.112 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 6.45e-01 0.0654 0.142 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 8.99e-02 -0.265 0.156 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 1.36e-01 0.216 0.145 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 1.66e-01 -0.151 0.109 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0634 0.131 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 8.96e-01 0.0151 0.116 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 9.15e-02 -0.204 0.12 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0678 0.148 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 3.32e-01 0.136 0.14 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 2.70e-01 -0.161 0.145 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0617 0.141 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 3.44e-01 0.143 0.151 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -758386 sc-eQTL 8.57e-01 0.0159 0.0881 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -22585 sc-eQTL 3.35e-01 -0.154 0.16 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 195130 sc-eQTL 7.71e-01 0.0449 0.154 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -439458 sc-eQTL 4.09e-02 -0.3 0.146 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -651997 sc-eQTL 9.25e-01 0.0145 0.153 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 30884 sc-eQTL 4.76e-01 0.104 0.146 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -620556 sc-eQTL 6.82e-01 0.0636 0.155 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151136 BTBD11 -983258 sc-eQTL 3.78e-01 0.101 0.114 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 sc-eQTL 3.10e-03 0.367 0.123 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -620334 sc-eQTL 6.21e-02 0.336 0.179 0.058 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B -22585 eQTL 3.30e-04 -0.218 0.0605 0.0 0.0 0.0461
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 eQTL 6.31e-07 0.164 0.0326 0.0 0.0 0.0461


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 TCP11L2 33234 2.13e-05 2.43e-05 4.32e-06 1.28e-05 3.92e-06 9.84e-06 2.91e-05 3.72e-06 2.19e-05 1.17e-05 2.99e-05 1.08e-05 3.72e-05 9.56e-06 5.53e-06 1.35e-05 1.12e-05 1.87e-05 6.26e-06 5.26e-06 1.12e-05 2.37e-05 2.24e-05 6.73e-06 3.39e-05 6.17e-06 1.04e-05 9.46e-06 2.23e-05 1.83e-05 1.53e-05 1.62e-06 2.23e-06 5.67e-06 9.3e-06 4.56e-06 2.68e-06 2.96e-06 3.6e-06 2.85e-06 1.67e-06 2.92e-05 2.8e-06 3.6e-07 2.12e-06 3.29e-06 3.59e-06 1.42e-06 1.46e-06
ENSG00000258355 \N 88207 9e-06 9.99e-06 1.36e-06 5.03e-06 2.44e-06 4.15e-06 1.04e-05 1.99e-06 9.63e-06 5.16e-06 1.24e-05 5.28e-06 1.46e-05 3.81e-06 2.52e-06 6.67e-06 4.1e-06 7.17e-06 2.55e-06 2.88e-06 5.14e-06 9.61e-06 7.47e-06 3.25e-06 1.48e-05 3.81e-06 5.26e-06 4.45e-06 9.22e-06 7.86e-06 5.69e-06 1.11e-06 1.29e-06 2.94e-06 4.6e-06 2.66e-06 1.74e-06 1.91e-06 1.62e-06 9.71e-07 9.79e-07 1.28e-05 1.49e-06 1.47e-07 7.7e-07 1.73e-06 1.47e-06 7.16e-07 4.83e-07
ENSG00000260329 \N -620334 6.09e-07 3.12e-07 6.99e-08 2.49e-07 1.11e-07 1.44e-07 3.44e-07 6.72e-08 2.53e-07 1.28e-07 3.21e-07 2.09e-07 4.05e-07 8.85e-08 9.33e-08 1.49e-07 8.74e-08 2.83e-07 8e-08 8.69e-08 1.39e-07 2.24e-07 2.04e-07 3.41e-08 4.54e-07 2.01e-07 1.72e-07 1.85e-07 1.76e-07 1.81e-07 1.76e-07 6.87e-08 4.86e-08 9.9e-08 1.27e-07 5.14e-08 6.87e-08 6.11e-08 5.78e-08 7.78e-08 4.83e-08 2.72e-07 2.62e-08 1.9e-08 8.45e-08 8.24e-09 9.12e-08 2.99e-09 4.66e-08