logo

Genes within 1Mb (chr12:106315999:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0944 0.0618 0.267 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 9.87e-01 0.00143 0.0901 0.267 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0303 0.0717 0.267 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 2.63e-01 -0.111 0.0989 0.267 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0612 0.0464 0.267 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 9.04e-02 -0.118 0.0692 0.267 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 1.10e-02 -0.141 0.0551 0.267 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0124 0.0407 0.267 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 2.34e-03 -0.196 0.0635 0.267 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0323 0.0639 0.267 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0867 0.0783 0.267 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 3.35e-07 -0.275 0.0521 0.267 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 5.56e-02 -0.118 0.0616 0.267 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 3.86e-08 0.3 0.0525 0.267 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0315 0.0898 0.267 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 9.99e-01 8.4e-05 0.0527 0.267 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 7.30e-01 0.027 0.0781 0.267 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 2.74e-01 -0.086 0.0784 0.267 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 8.40e-01 0.0164 0.0815 0.267 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0616 0.0515 0.267 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 5.36e-01 0.0416 0.0672 0.267 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 5.96e-01 0.0243 0.0458 0.267 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0557 0.0983 0.267 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 7.40e-01 0.0282 0.0848 0.266 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00333 0.0905 0.266 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 2.49e-01 -0.108 0.0933 0.266 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 9.95e-01 0.000539 0.087 0.266 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0742 0.062 0.266 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0767 0.0866 0.266 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0488 0.0934 0.266 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0151 0.0646 0.267 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 1.19e-01 0.121 0.0771 0.267 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 5.46e-01 0.045 0.0744 0.267 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 5.67e-03 -0.153 0.0546 0.267 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 3.61e-01 0.059 0.0644 0.267 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00418 0.0474 0.268 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00441 0.0849 0.268 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 175966 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0301 0.0836 0.268 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 3.65e-02 -0.165 0.0783 0.268 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 6.82e-01 0.0334 0.0814 0.268 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 6.55e-02 -0.14 0.0754 0.268 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0344 0.082 0.268 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 1.11e-03 0.223 0.0675 0.268 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0531 0.0988 0.268 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 8.22e-01 0.0116 0.0513 0.267 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 5.96e-01 -0.051 0.0961 0.267 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0327 0.0674 0.267 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 6.37e-01 0.0381 0.0805 0.267 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 7.01e-01 0.0232 0.0602 0.267 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0918 0.0839 0.267 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 6.91e-04 0.248 0.0719 0.267 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 2.91e-01 0.096 0.0908 0.267 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00584 0.103 0.247 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 6.93e-01 0.04 0.101 0.247 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 8.16e-01 0.024 0.103 0.247 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 1.65e-01 -0.111 0.0795 0.247 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0162 0.0963 0.247 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 6.39e-01 0.0505 0.107 0.247 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0411 0.107 0.247 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 1.20e-01 -0.149 0.0956 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0443 0.106 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 5.08e-01 0.0624 0.0942 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 6.49e-03 -0.273 0.0994 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 4.38e-01 -0.061 0.0785 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 2.25e-01 -0.122 0.1 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 1.13e-01 -0.145 0.0908 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 3.05e-01 0.1 0.0974 0.265 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 6.23e-02 -0.192 0.102 0.265 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 5.67e-02 -0.184 0.0961 0.265 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 5.30e-01 -0.055 0.0874 0.265 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 1.59e-01 -0.122 0.0866 0.265 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0531 0.0988 0.265 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 1.32e-01 -0.13 0.0862 0.265 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0351 0.083 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 3.30e-01 0.0909 0.093 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 9.42e-01 0.00667 0.0911 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 4.96e-01 -0.068 0.0998 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 7.37e-02 -0.125 0.0697 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 2.42e-01 -0.116 0.0986 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 7.27e-02 -0.123 0.0684 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 9.47e-01 0.00674 0.101 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0746 0.101 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 1.84e-01 -0.12 0.0897 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 3.10e-01 0.104 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 1.36e-01 -0.131 0.0874 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0387 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 1.33e-01 -0.112 0.0746 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0629 0.0784 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 6.98e-01 0.0371 0.0954 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 7.83e-01 0.0277 0.1 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 1.03e-01 0.156 0.0953 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 5.85e-01 -0.043 0.0787 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0954 0.102 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 7.45e-02 0.177 0.0987 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 3.38e-01 0.082 0.0853 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 3.97e-01 0.0403 0.0474 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 1.11e-01 -0.115 0.0718 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0227 0.0683 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0562 0.0907 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 4.49e-06 -0.278 0.059 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0778 0.0663 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 6.62e-08 0.324 0.0579 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0173 0.0938 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 9.42e-01 0.00437 0.0602 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 2.13e-01 -0.103 0.0826 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00323 0.0866 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 2.28e-02 -0.226 0.0985 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 6.07e-03 -0.166 0.0598 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 4.88e-03 -0.231 0.0813 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 2.06e-04 0.245 0.0649 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 7.28e-01 -0.035 0.1 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 4.85e-01 0.0587 0.0839 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 3.34e-02 -0.223 0.104 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 8.33e-01 0.0203 0.0962 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 1.72e-01 -0.14 0.102 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 2.53e-03 -0.247 0.0808 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 5.41e-01 0.058 0.0947 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 2.89e-03 0.244 0.0809 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 4.13e-01 0.0815 0.0993 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 4.52e-01 0.0465 0.0617 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 6.96e-02 0.168 0.0923 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0596 0.0873 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0777 0.0965 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 6.36e-01 0.0392 0.0828 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 1.76e-02 0.188 0.0787 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 6.61e-03 0.24 0.0873 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0615 0.0985 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 3.65e-01 0.0649 0.0715 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 8.81e-02 -0.148 0.0864 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 7.61e-01 0.0282 0.0926 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 6.62e-01 0.0416 0.095 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 1.74e-01 -0.105 0.0772 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 4.85e-02 -0.162 0.0818 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0566 0.0691 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0105 0.0977 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 5.02e-02 0.17 0.0864 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 9.42e-01 0.00759 0.104 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 2.40e-01 -0.117 0.0993 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 8.77e-01 0.0155 0.1 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 5.65e-01 0.0521 0.0905 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 1.86e-01 -0.137 0.103 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0311 0.0873 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 6.44e-01 0.0438 0.0945 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 9.19e-01 0.00935 0.0919 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 3.31e-01 -0.101 0.104 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0468 0.0995 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 5.42e-01 0.0637 0.104 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0427 0.0958 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 4.46e-01 0.08 0.105 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 7.77e-01 0.0284 0.0998 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 2.43e-02 -0.207 0.091 0.267 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0299 0.0753 0.266 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0638 0.0948 0.266 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 4.46e-02 -0.169 0.0835 0.266 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 4.55e-01 0.0689 0.092 0.266 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0701 0.085 0.266 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 9.53e-02 -0.166 0.099 0.266 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 2.52e-03 0.26 0.0849 0.266 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0201 0.0933 0.266 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 5.20e-01 0.0486 0.0754 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 6.32e-01 0.0458 0.0954 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 175966 sc-eQTL 1.92e-01 -0.109 0.083 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 3.12e-01 -0.105 0.103 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 5.70e-02 -0.184 0.0962 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0374 0.0781 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 1.90e-01 0.127 0.0964 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 4.28e-02 0.201 0.0987 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 1.82e-01 -0.127 0.0951 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0904 0.0571 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0125 0.0863 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 175966 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0148 0.0843 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 1.22e-01 -0.133 0.0859 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 4.02e-01 0.0719 0.0856 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 2.08e-01 -0.109 0.0863 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 5.76e-01 -0.05 0.0894 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 5.01e-02 0.148 0.0752 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0252 0.0999 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 4.28e-01 0.0641 0.0808 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0828 0.0977 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 175966 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0858 0.0952 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 6.88e-01 0.0403 0.1 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 5.28e-01 0.0641 0.101 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0519 0.088 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0508 0.101 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 3.67e-02 0.206 0.0981 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 8.86e-01 0.0134 0.0929 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 6.23e-01 0.0328 0.0668 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 5.04e-01 -0.064 0.0957 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 175966 sc-eQTL 3.09e-01 0.09 0.0883 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 1.72e-01 -0.124 0.0904 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0266 0.0927 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 8.60e-02 -0.15 0.087 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0884 0.0951 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 3.95e-02 0.161 0.0776 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0417 0.0972 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0143 0.113 0.278 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 2.80e-01 0.131 0.121 0.278 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 1.59e-01 0.153 0.108 0.278 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0293 0.102 0.278 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0778 0.0679 0.278 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 9.37e-01 0.00689 0.0873 0.278 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 7.59e-02 0.201 0.112 0.278 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0374 0.0675 0.27 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 9.07e-01 0.0114 0.0976 0.27 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 2.17e-01 0.113 0.0916 0.27 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 5.58e-01 -0.054 0.0921 0.27 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 4.57e-01 0.038 0.051 0.27 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0497 0.0851 0.27 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 7.98e-02 0.138 0.0781 0.27 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 5.17e-01 0.0528 0.0813 0.27 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 1.37e-01 -0.124 0.0831 0.267 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0869 0.099 0.267 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 7.36e-02 0.169 0.0938 0.267 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0176 0.102 0.267 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 1.76e-02 -0.173 0.0723 0.267 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 9.20e-03 -0.245 0.0934 0.267 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 3.58e-03 0.228 0.0774 0.267 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0967 0.0929 0.267 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 9.29e-01 0.00852 0.0958 0.266 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 5.18e-01 0.0597 0.0921 0.266 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0984 0.0971 0.266 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 9.46e-01 0.00572 0.0838 0.266 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0341 0.0685 0.266 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0446 0.0897 0.266 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 7.43e-01 0.0335 0.102 0.266 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 5.80e-01 0.0448 0.0808 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 1.10e-01 0.146 0.0908 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 3.73e-01 0.0738 0.0827 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 7.61e-04 -0.208 0.0609 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 1.30e-01 0.113 0.0743 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 6.93e-01 0.037 0.0935 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 2.06e-01 -0.118 0.0929 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 4.02e-02 0.176 0.0854 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 4.38e-03 -0.193 0.0669 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0245 0.0799 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 2.25e-01 0.129 0.106 0.279 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 1.09e-01 -0.178 0.111 0.279 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 6.07e-01 0.0584 0.113 0.279 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 2.84e-01 -0.13 0.121 0.279 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0691 0.106 0.279 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 1.96e-01 -0.143 0.11 0.279 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 5.04e-01 0.0773 0.116 0.279 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 2.42e-01 0.129 0.11 0.279 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 7.61e-01 0.0287 0.0943 0.273 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0804 0.0914 0.273 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 1.44e-01 -0.131 0.089 0.273 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 2.09e-01 -0.117 0.093 0.273 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 6.84e-01 0.0426 0.105 0.273 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0882 0.0662 0.271 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 4.61e-02 0.17 0.0848 0.271 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0572 0.083 0.271 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0865 0.0884 0.271 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 1.30e-01 0.132 0.0866 0.271 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 8.08e-01 0.0256 0.105 0.263 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 2.14e-01 -0.142 0.114 0.263 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 9.02e-01 0.0136 0.111 0.263 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 5.97e-01 -0.055 0.104 0.263 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0558 0.0735 0.263 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00339 0.117 0.263 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0775 0.11 0.263 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 2.24e-01 -0.107 0.0877 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0662 0.101 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 9.98e-01 0.00023 0.0872 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 2.17e-02 -0.225 0.0975 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 1.13e-01 -0.108 0.0682 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0298 0.0963 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 1.01e-02 -0.212 0.0818 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0237 0.0756 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 9.01e-01 0.0118 0.0948 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0865 0.0926 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0154 0.101 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 5.62e-02 -0.134 0.07 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 2.03e-01 -0.122 0.0953 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 2.39e-02 -0.138 0.0609 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 4.25e-01 0.0621 0.0777 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 4.16e-01 0.07 0.0859 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 1.71e-01 0.109 0.0794 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 6.99e-04 -0.201 0.0583 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 2.86e-01 0.068 0.0635 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0342 0.0679 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 1.37e-01 0.123 0.0823 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0697 0.0786 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 2.02e-01 -0.104 0.0813 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 4.49e-01 0.0641 0.0844 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -777550 sc-eQTL 8.38e-01 -0.00985 0.0481 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -41749 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0355 0.0873 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 175966 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0312 0.084 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -458622 sc-eQTL 4.81e-02 -0.159 0.0798 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 sc-eQTL 4.40e-01 0.0645 0.0834 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 11720 sc-eQTL 8.29e-02 -0.138 0.0793 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -639720 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0584 0.0845 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 sc-eQTL 2.52e-03 0.204 0.0668 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -639498 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0681 0.0986 0.267 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B -41749 eQTL 1.96e-06 -0.146 0.0306 0.0705 0.0593 0.248
ENSG00000074590 NUAK1 175966 eQTL 0.00095 -0.113 0.034 0.00584 0.0 0.248
ENSG00000120832 MTERF2 -671161 eQTL 0.0228 -0.0617 0.0271 0.0017 0.0 0.248
ENSG00000136026 CKAP4 11720 eQTL 0.000149 -0.0449 0.0118 0.00186 0.0 0.248
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 eQTL 6.64e-56 0.248 0.0147 0.037 0.0428 0.248

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000013503 POLR3B -41749 1.24e-05 1.48e-05 2.43e-06 8.26e-06 2.41e-06 6.03e-06 1.87e-05 2.45e-06 1.41e-05 6.72e-06 1.8e-05 6.86e-06 2.31e-05 5.15e-06 4.37e-06 8.68e-06 7.74e-06 1.19e-05 3.54e-06 3.25e-06 6.87e-06 1.28e-05 1.33e-05 4.01e-06 2.35e-05 5.05e-06 7.12e-06 5.64e-06 1.48e-05 1.22e-05 1.03e-05 1.06e-06 1.29e-06 3.69e-06 6.01e-06 2.85e-06 1.77e-06 2.3e-06 2.22e-06 1.26e-06 9.48e-07 1.73e-05 2.34e-06 2.09e-07 9.58e-07 2.15e-06 1.99e-06 7.25e-07 6.07e-07
ENSG00000074590 NUAK1 175966 3.55e-06 3.77e-06 5.11e-07 1.89e-06 4.67e-07 7.11e-07 2.45e-06 8.37e-07 2.37e-06 1.15e-06 3.09e-06 1.67e-06 4.18e-06 1.34e-06 9.02e-07 1.75e-06 1.55e-06 2.17e-06 1.46e-06 1.33e-06 1.21e-06 3.09e-06 2.69e-06 1.06e-06 4.36e-06 1.03e-06 1.38e-06 1.84e-06 2.68e-06 2.46e-06 1.91e-06 2.21e-07 5.69e-07 1.28e-06 1.65e-06 9.27e-07 8.32e-07 4.39e-07 1.11e-06 3.76e-07 3.16e-07 4.04e-06 5.74e-07 1.96e-07 3.29e-07 3.1e-07 5.64e-07 2.25e-07 1.41e-07
ENSG00000136026 CKAP4 11720 3.17e-05 3.07e-05 5.92e-06 1.49e-05 5.42e-06 1.32e-05 4.17e-05 4.37e-06 2.89e-05 1.45e-05 3.59e-05 1.59e-05 4.46e-05 1.28e-05 6.68e-06 1.72e-05 1.56e-05 2.37e-05 7.47e-06 6.43e-06 1.4e-05 3.03e-05 2.94e-05 8.51e-06 4.09e-05 7.55e-06 1.27e-05 1.19e-05 3.01e-05 2.35e-05 1.87e-05 1.62e-06 2.42e-06 6.71e-06 1.11e-05 5.45e-06 2.84e-06 3.19e-06 4.35e-06 3.19e-06 1.72e-06 3.54e-05 3.38e-06 3.6e-07 2.26e-06 3.59e-06 3.97e-06 1.5e-06 1.53e-06
ENSG00000166046 TCP11L2 14070 2.89e-05 2.95e-05 5.66e-06 1.44e-05 5.1e-06 1.27e-05 3.93e-05 4.18e-06 2.72e-05 1.38e-05 3.44e-05 1.48e-05 4.26e-05 1.22e-05 6.27e-06 1.59e-05 1.48e-05 2.26e-05 7.36e-06 5.95e-06 1.34e-05 2.86e-05 2.82e-05 8.06e-06 3.87e-05 7.23e-06 1.18e-05 1.14e-05 2.85e-05 2.23e-05 1.78e-05 1.63e-06 2.38e-06 6.48e-06 1.05e-05 5.17e-06 2.73e-06 3.18e-06 4.24e-06 3.11e-06 1.7e-06 3.4e-05 3.21e-06 3.57e-07 2.19e-06 3.41e-06 3.75e-06 1.49e-06 1.56e-06
ENSG00000260329 \N -639498 3.21e-07 1.83e-07 6.45e-08 2.26e-07 9.82e-08 8.63e-08 2.4e-07 5.62e-08 1.71e-07 8.53e-08 1.76e-07 1.31e-07 2.38e-07 8.55e-08 6.93e-08 9.01e-08 4.31e-08 2.15e-07 7.11e-08 6.16e-08 1.18e-07 1.56e-07 1.68e-07 3.59e-08 2.48e-07 1.43e-07 1.2e-07 1.36e-07 1.32e-07 1.05e-07 1.26e-07 3.84e-08 4.37e-08 9.81e-08 5.16e-08 3.18e-08 4.28e-08 9.17e-08 6.35e-08 5.96e-08 6.28e-08 1.59e-07 3.35e-08 1.55e-08 3.3e-08 6.53e-09 8.61e-08 2.05e-09 4.83e-08