logo

Genes within 1Mb (chr12:106266828:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 4.28e-02 0.159 0.0781 0.139 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0543 0.114 0.139 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 4.98e-01 0.0617 0.0908 0.139 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 8.07e-01 0.0307 0.126 0.139 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 3.80e-02 -0.122 0.0585 0.139 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0313 0.0884 0.139 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0697 0.0708 0.139 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 9.89e-01 0.000739 0.0527 0.139 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 4.19e-01 0.0679 0.0838 0.139 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 9.18e-01 0.00852 0.0827 0.139 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 2.19e-01 0.125 0.101 0.139 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 7.90e-01 0.0191 0.0717 0.139 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 7.46e-01 -0.026 0.0803 0.139 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 5.52e-01 0.0434 0.0729 0.139 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 1.00e-01 -0.19 0.115 0.139 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0166 0.0672 0.139 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000715 0.0997 0.139 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 8.56e-01 0.0182 0.1 0.139 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 1.27e-01 -0.158 0.103 0.139 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0137 0.0659 0.139 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0249 0.0858 0.139 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 8.72e-01 0.00946 0.0584 0.139 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 1.04e-02 -0.319 0.124 0.139 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 1.45e-01 0.159 0.108 0.144 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 3.41e-01 -0.111 0.116 0.144 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0826 0.12 0.144 DC L1
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 1.85e-01 -0.148 0.111 0.144 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00619 0.08 0.144 DC L1
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 9.51e-01 0.0069 0.112 0.144 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0129 0.12 0.144 DC L1
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0046 0.081 0.139 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 4.63e-02 -0.193 0.0964 0.139 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 4.79e-01 0.0662 0.0934 0.139 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 8.91e-02 -0.118 0.0693 0.139 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0676 0.0809 0.139 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 1.44e-01 0.0891 0.0607 0.137 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0377 0.109 0.137 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 126795 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0139 0.108 0.137 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 6.13e-01 0.0516 0.102 0.137 NK L1
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 7.28e-01 0.0365 0.105 0.137 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0458 0.0978 0.137 NK L1
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 8.31e-01 0.0225 0.106 0.137 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0888 0.0889 0.137 NK L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 3.53e-01 -0.118 0.127 0.137 NK L1
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 9.89e-03 0.167 0.064 0.139 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 3.51e-01 0.114 0.122 0.139 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 7.70e-01 -0.025 0.0854 0.139 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 9.10e-02 0.172 0.101 0.139 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0039 0.0763 0.139 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00159 0.107 0.139 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 1.12e-01 -0.148 0.093 0.139 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 8.82e-02 0.196 0.115 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 1.26e-01 0.204 0.133 0.128 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0422 0.131 0.128 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 1.84e-01 0.177 0.133 0.128 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 1.61e-01 0.145 0.103 0.128 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 3.74e-01 0.111 0.125 0.128 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 1.99e-01 0.179 0.139 0.128 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0805 0.139 0.128 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 5.82e-01 0.0655 0.119 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 8.73e-01 -0.021 0.131 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 1.18e-01 0.182 0.116 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 7.56e-01 0.039 0.125 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 3.36e-01 0.0935 0.097 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0468 0.124 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 1.81e-01 -0.151 0.112 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 8.31e-01 0.0271 0.127 0.14 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0427 0.134 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0277 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 1.13e-01 0.18 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 8.60e-01 -0.02 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 7.11e-01 0.0476 0.128 0.14 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0552 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 1.91e-01 0.14 0.107 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 6.72e-01 0.0511 0.12 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 1.31e-01 0.177 0.117 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 2.11e-01 -0.161 0.129 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 1.37e-01 0.135 0.0903 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0528 0.128 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 2.50e-01 -0.102 0.0888 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 7.51e-01 0.0409 0.129 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 9.14e-01 0.0141 0.13 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 1.15e-01 -0.181 0.115 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 7.39e-01 0.0438 0.131 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 1.45e-03 -0.355 0.11 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 4.77e-01 0.0929 0.131 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 6.63e-01 0.042 0.096 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 3.95e-02 0.21 0.102 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 2.81e-01 0.134 0.124 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 5.41e-01 0.0803 0.131 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 3.38e-01 0.12 0.125 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 8.83e-01 0.0152 0.103 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 5.83e-01 0.0733 0.133 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 2.00e-01 -0.166 0.129 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 8.67e-01 0.0187 0.112 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 1.94e-01 0.0792 0.0607 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 1.73e-01 0.126 0.0923 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0406 0.0877 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 1.46e-01 0.169 0.116 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 7.25e-01 0.0281 0.0796 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0699 0.0852 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 3.99e-01 0.0672 0.0796 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 3.44e-01 -0.114 0.12 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 1.92e-01 -0.1 0.0764 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0835 0.105 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 1.09e-01 0.176 0.11 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0548 0.127 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 8.44e-02 -0.133 0.077 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 9.75e-01 0.00326 0.106 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00258 0.0853 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 1.61e-01 -0.179 0.127 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 4.71e-02 0.208 0.104 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 9.80e-01 0.00332 0.132 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0354 0.121 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 2.27e-01 0.156 0.128 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 8.33e-01 0.0218 0.103 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 6.47e-01 0.0544 0.119 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 1.07e-01 -0.167 0.103 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 9.34e-01 0.0104 0.125 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 2.84e-01 0.0841 0.0784 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 1.30e-01 -0.179 0.118 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0141 0.111 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0223 0.123 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0931 0.105 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00693 0.101 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 9.48e-01 0.00738 0.113 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 1.38e-01 -0.186 0.125 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 4.82e-01 0.0631 0.0896 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 6.69e-01 0.0467 0.109 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 9.84e-01 0.00233 0.116 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 6.88e-01 0.0479 0.119 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0821 0.0969 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0654 0.103 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 5.85e-01 0.0474 0.0867 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 6.66e-02 -0.224 0.121 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0219 0.107 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 6.15e-01 0.064 0.127 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 4.12e-01 -0.1 0.122 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 1.32e-02 -0.301 0.12 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0165 0.111 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 2.61e-01 0.142 0.126 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 1.63e-01 -0.149 0.106 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 3.15e-01 -0.116 0.115 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 8.63e-01 0.0203 0.118 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 4.99e-03 0.371 0.131 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 1.57e-02 0.306 0.126 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 2.00e-02 -0.309 0.132 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0752 0.123 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 7.90e-01 0.0359 0.134 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0389 0.128 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0261 0.118 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 3.29e-01 0.0931 0.0953 0.139 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 5.16e-01 0.0781 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00591 0.107 0.139 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 4.23e-02 0.236 0.116 0.139 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 9.77e-01 0.00314 0.108 0.139 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00805 0.126 0.139 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 2.21e-01 -0.135 0.11 0.139 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0101 0.118 0.139 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 9.12e-02 0.164 0.0965 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 1.39e-01 -0.181 0.122 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 126795 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0463 0.107 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 8.05e-01 0.0329 0.133 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 1.48e-01 -0.18 0.124 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0258 0.101 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 8.51e-02 0.214 0.124 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0653 0.128 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0265 0.123 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 1.89e-01 0.0971 0.0736 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0377 0.111 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 126795 sc-eQTL 3.92e-01 0.0928 0.108 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 6.85e-01 -0.045 0.111 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 7.30e-01 0.0381 0.11 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0901 0.111 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0378 0.115 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0657 0.0975 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 6.35e-01 0.061 0.128 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 6.99e-01 -0.04 0.103 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 2.04e-01 0.159 0.125 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 126795 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0396 0.122 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 1.44e-02 0.312 0.126 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0583 0.13 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 5.28e-01 0.0711 0.112 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 6.58e-01 0.0573 0.129 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 3.21e-01 -0.126 0.126 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 1.98e-01 -0.153 0.118 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 1.53e-01 0.124 0.0863 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0131 0.124 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 126795 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0621 0.115 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0241 0.118 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 3.07e-01 0.123 0.12 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0658 0.114 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 9.04e-01 0.015 0.124 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 8.31e-01 0.0217 0.102 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 7.95e-02 -0.221 0.125 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 8.27e-01 0.0332 0.151 0.13 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 7.19e-01 0.0586 0.163 0.13 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0942 0.145 0.13 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0471 0.137 0.13 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 7.75e-01 0.0262 0.0913 0.13 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 7.39e-01 -0.039 0.117 0.13 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0874 0.152 0.13 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 5.82e-01 0.0482 0.0873 0.141 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 2.07e-01 0.159 0.126 0.141 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 3.19e-01 0.118 0.119 0.141 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0263 0.119 0.141 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 1.49e-02 -0.16 0.0651 0.141 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 1.88e-01 -0.145 0.11 0.141 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0424 0.102 0.141 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 1.02e-02 0.269 0.104 0.141 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0345 0.106 0.139 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 4.21e-01 -0.101 0.125 0.139 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 6.82e-04 0.4 0.116 0.139 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 6.13e-01 0.0654 0.129 0.139 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 8.38e-01 0.019 0.0925 0.139 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0435 0.12 0.139 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 2.02e-01 0.127 0.0993 0.139 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 1.89e-02 -0.275 0.116 0.139 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 3.55e-01 0.117 0.126 0.137 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 3.69e-01 -0.109 0.121 0.137 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0748 0.128 0.137 cDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 2.68e-01 0.122 0.11 0.137 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0294 0.0902 0.137 cDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 8.69e-01 0.0195 0.118 0.137 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 7.38e-02 0.24 0.133 0.137 cDC L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 9.48e-01 0.00678 0.103 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0516 0.117 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 7.37e-01 0.0356 0.106 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 2.40e-01 -0.094 0.0797 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0656 0.0953 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 2.98e-01 0.125 0.12 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 5.96e-03 -0.327 0.118 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 3.50e-01 0.104 0.111 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0948 0.0873 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0593 0.103 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 1.88e-01 0.196 0.148 0.133 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 4.99e-01 0.106 0.156 0.133 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 2.37e-01 0.187 0.158 0.133 gdT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0729 0.17 0.133 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 8.21e-03 0.389 0.145 0.133 gdT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 6.57e-01 0.069 0.155 0.133 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 8.61e-01 0.0284 0.162 0.133 gdT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 2.99e-01 0.16 0.154 0.133 gdT L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 5.02e-01 0.0794 0.118 0.14 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 6.58e-01 0.0509 0.115 0.14 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0646 0.112 0.14 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 2.36e-01 -0.139 0.117 0.14 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 7.86e-03 -0.346 0.129 0.14 intMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 2.30e-01 -0.102 0.0846 0.143 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0749 0.109 0.143 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 7.73e-01 0.0307 0.106 0.143 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 6.81e-01 0.0466 0.113 0.143 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 5.92e-01 0.0597 0.111 0.143 ncMono L2
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0493 0.138 0.119 pDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 2.78e-01 -0.163 0.15 0.119 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 4.08e-01 -0.12 0.145 0.119 pDC L2
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0755 0.136 0.119 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 4.76e-01 0.0689 0.0963 0.119 pDC L2
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0721 0.154 0.119 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 9.71e-01 0.00529 0.145 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 2.98e-01 0.118 0.113 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 7.01e-01 -0.05 0.13 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 1.53e-01 0.16 0.111 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 2.91e-02 0.275 0.125 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 6.01e-01 0.0461 0.088 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 9.59e-01 0.00634 0.124 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 2.36e-01 -0.126 0.106 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 2.71e-01 0.107 0.0969 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 3.98e-01 0.103 0.121 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 9.74e-01 0.00382 0.119 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0828 0.13 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 7.43e-01 0.0298 0.0906 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 8.81e-01 0.0184 0.123 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0239 0.0791 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 7.48e-01 0.032 0.0995 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 1.04e-01 -0.179 0.109 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 3.64e-01 0.0926 0.102 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 1.68e-01 -0.105 0.0763 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0591 0.0814 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 2.15e-01 -0.107 0.0858 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 7.60e-01 -0.032 0.105 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0439 0.0998 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0654 0.103 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 4.28e-01 -0.085 0.107 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -826721 sc-eQTL 1.54e-01 0.0883 0.0617 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -90920 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0258 0.113 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 126795 sc-eQTL 8.53e-01 0.0201 0.108 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -507793 sc-eQTL 8.07e-01 0.0253 0.104 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 sc-eQTL 4.40e-01 0.0831 0.108 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0792 0.103 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00177 0.109 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -35101 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0667 0.0879 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000260329 AC007541.1 -688669 sc-eQTL 3.42e-01 -0.121 0.127 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 eQTL 0.00598 -0.0869 0.0315 0.0 0.0 0.17
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 pQTL 0.0143 -0.0435 0.0177 0.0 0.0 0.168
ENSG00000136026 CKAP4 -37451 eQTL 0.0475 0.0274 0.0138 0.0 0.0 0.17
ENSG00000151135 TMEM263 -688891 eQTL 0.00194 -0.0495 0.0159 0.0 0.0 0.17

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111785 \N -507793 3.62e-07 1.27e-07 3.72e-08 1.89e-07 8.83e-08 9.76e-08 1.61e-07 5.2e-08 1.44e-07 4.74e-08 1.54e-07 8.36e-08 1.47e-07 6.76e-08 6.12e-08 7.3e-08 3.98e-08 1.33e-07 5.97e-08 4.04e-08 1.04e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.23e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.57e-08 1.09e-07 1.1e-07 9.64e-08 4.03e-08 3.66e-08 8.34e-08 6.67e-08 3.97e-08 5.05e-08 9.44e-08 6.55e-08 3.54e-08 3.92e-08 1.46e-07 5.12e-08 1.43e-08 4.7e-08 1.83e-08 1.24e-07 3.95e-09 4.94e-08
ENSG00000120832 MTERF2 -720332 2.74e-07 1.1e-07 3.31e-08 1.78e-07 9.65e-08 9.57e-08 1.41e-07 5.49e-08 1.42e-07 4.38e-08 1.6e-07 8.03e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.55e-08 7.89e-08 4.94e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.05e-07 1.28e-07 1.3e-07 4.54e-08 1.31e-07 1.13e-07 1.12e-07 8.7e-08 9.88e-08 1.11e-07 9.58e-08 3.95e-08 2.92e-08 8.21e-08 9.07e-08 4.02e-08 4.63e-08 8.91e-08 8.3e-08 3.12e-08 3.91e-08 1.31e-07 4.33e-08 1.32e-08 7.26e-08 1.72e-08 1.27e-07 4.33e-09 4.91e-08
ENSG00000166046 \N -35101 1.03e-05 9.5e-06 8.44e-07 4.49e-06 1.75e-06 3.65e-06 9.75e-06 1.26e-06 6.04e-06 4.12e-06 1.03e-05 3.52e-06 1.15e-05 3.41e-06 1.52e-06 5.69e-06 3.84e-06 6.21e-06 2.02e-06 1.54e-06 3.25e-06 7.65e-06 6.69e-06 1.91e-06 1.29e-05 2.19e-06 4.19e-06 1.75e-06 7.59e-06 7.87e-06 4.24e-06 4.34e-07 5.55e-07 2.34e-06 2.89e-06 1.11e-06 9.46e-07 4.24e-07 1.37e-06 5.93e-07 4.42e-07 1.23e-05 1.14e-06 1.68e-07 7.7e-07 1.05e-06 1.01e-06 5.06e-07 5.83e-07