Genes within 1Mb (chr12:105192969:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 2.37e-01 0.106 0.089 0.135 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0322 0.0569 0.135 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 1.82e-02 -0.213 0.0895 0.135 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 9.34e-03 -0.283 0.108 0.135 B L1
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 9.09e-01 0.00969 0.0849 0.135 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 3.54e-01 0.0963 0.104 0.135 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0615 0.078 0.135 B L1
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 3.91e-01 -0.107 0.124 0.135 B L1
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 8.78e-02 0.144 0.0842 0.135 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0429 0.0835 0.135 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 2.06e-05 -0.483 0.111 0.135 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 3.09e-01 -0.078 0.0765 0.135 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0293 0.0933 0.135 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0976 0.0644 0.135 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 7.12e-01 0.0374 0.101 0.135 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 1.33e-01 0.144 0.0955 0.135 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 2.12e-01 -0.134 0.107 0.135 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 1.14e-02 -0.244 0.0956 0.135 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0703 0.0608 0.135 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0223 0.106 0.135 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0432 0.0425 0.135 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0855 0.12 0.135 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 4.37e-01 0.0953 0.122 0.14 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 6.15e-03 0.268 0.0969 0.14 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 2.40e-01 0.0985 0.0835 0.14 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00976 0.0749 0.14 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 1.45e-01 0.152 0.104 0.14 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 2.69e-01 0.128 0.115 0.14 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 7.89e-02 -0.088 0.0498 0.14 DC L1
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 1.61e-01 0.166 0.118 0.14 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 6.44e-01 0.0535 0.116 0.135 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 2.09e-06 0.263 0.0539 0.135 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 7.26e-03 -0.266 0.0981 0.135 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 6.35e-01 0.0408 0.0858 0.135 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 9.69e-01 0.00378 0.0985 0.135 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 8.02e-01 0.0277 0.111 0.135 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -947064 sc-eQTL 1.10e-01 -0.174 0.109 0.135 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 4.84e-01 0.0687 0.0979 0.135 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 6.02e-01 0.0534 0.102 0.135 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 1.21e-01 -0.195 0.125 0.135 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 3.10e-01 0.097 0.0953 0.135 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 6.45e-01 0.0535 0.116 0.135 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 2.30e-01 0.0889 0.0739 0.135 NK L1
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 7.30e-01 0.0441 0.128 0.135 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 2.20e-01 0.129 0.105 0.135 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 4.36e-01 -0.108 0.138 0.135 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 2.10e-01 -0.122 0.0968 0.135 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0475 0.102 0.135 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 1.48e-01 0.146 0.1 0.135 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 7.44e-01 0.0264 0.0808 0.135 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 5.06e-01 0.0819 0.123 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 8.35e-01 0.0289 0.139 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 4.44e-01 -0.101 0.132 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0171 0.0985 0.138 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 9.30e-01 0.0121 0.137 0.138 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 6.57e-01 0.0591 0.133 0.138 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 9.48e-02 0.235 0.14 0.138 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 2.01e-02 0.307 0.131 0.138 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 4.86e-01 0.0925 0.132 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 2.47e-02 0.261 0.115 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0635 0.101 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 2.94e-01 -0.116 0.111 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 1.44e-03 -0.405 0.125 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 5.18e-02 -0.204 0.104 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0463 0.13 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0506 0.119 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 5.20e-01 0.0779 0.121 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 9.99e-01 0.000128 0.12 0.136 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 1.61e-01 -0.139 0.0987 0.136 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 3.67e-01 -0.105 0.116 0.136 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0679 0.134 0.136 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 9.21e-01 0.0114 0.115 0.136 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 5.73e-01 0.0692 0.122 0.136 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 5.62e-01 0.0591 0.102 0.136 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 2.43e-01 0.148 0.126 0.136 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 2.96e-01 -0.109 0.105 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0409 0.0942 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 1.40e-01 -0.161 0.108 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 4.11e-02 -0.276 0.134 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 3.37e-01 0.102 0.106 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 3.73e-01 0.118 0.132 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 1.40e-02 -0.294 0.119 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 2.06e-01 -0.168 0.133 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 1.28e-01 0.163 0.107 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 5.44e-01 -0.059 0.0972 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 9.71e-01 0.00372 0.102 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 4.79e-01 0.0978 0.138 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0817 0.0994 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 7.68e-01 0.0377 0.128 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 2.82e-02 -0.26 0.118 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 5.31e-01 0.086 0.137 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 6.36e-01 0.0623 0.131 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0919 0.126 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 2.33e-01 -0.151 0.126 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 3.01e-01 0.117 0.113 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 6.55e-01 0.0607 0.136 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0683 0.0763 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 3.52e-01 -0.126 0.135 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 8.63e-02 0.15 0.0872 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 5.98e-01 0.0456 0.0865 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 1.82e-05 -0.53 0.121 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 1.12e-01 -0.126 0.0792 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0676 0.102 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 1.75e-01 -0.153 0.112 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0303 0.102 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 5.88e-02 0.197 0.103 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0393 0.107 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 5.25e-02 -0.256 0.132 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0459 0.0982 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 7.26e-01 -0.04 0.114 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0443 0.0873 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 4.19e-01 0.0953 0.118 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 9.12e-01 0.0127 0.116 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0715 0.131 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 1.64e-01 -0.176 0.126 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 2.75e-01 -0.124 0.113 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 6.61e-01 0.0527 0.12 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000261 0.0849 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 5.42e-01 0.0772 0.126 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 7.94e-02 0.181 0.103 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0605 0.115 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 6.43e-01 0.0628 0.135 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 4.77e-01 0.0712 0.1 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0649 0.129 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 6.43e-01 0.0403 0.0868 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 2.39e-01 -0.153 0.13 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 2.34e-01 0.124 0.104 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 5.25e-01 -0.072 0.113 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 2.12e-02 -0.279 0.12 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 9.57e-03 -0.208 0.0796 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 1.34e-01 -0.188 0.125 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 2.68e-01 -0.108 0.0968 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0487 0.127 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 9.05e-01 0.0162 0.136 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 2.14e-01 -0.17 0.136 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0935 0.146 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 4.34e-02 -0.192 0.0942 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 3.58e-01 0.13 0.141 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0869 0.129 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 5.71e-02 -0.262 0.137 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0305 0.14 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 3.25e-01 -0.142 0.144 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 2.44e-01 -0.164 0.141 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 4.21e-01 0.111 0.137 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 1.56e-01 0.195 0.137 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 1.59e-01 -0.152 0.107 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 2.74e-01 -0.151 0.138 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 5.76e-01 0.0673 0.12 0.134 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0627 0.141 0.134 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 7.88e-03 -0.335 0.125 0.134 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 1.51e-01 -0.162 0.112 0.134 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 2.97e-01 0.137 0.131 0.134 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 3.64e-01 0.0865 0.095 0.134 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 1.23e-01 0.207 0.134 0.134 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -947064 sc-eQTL 8.05e-02 -0.192 0.109 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 4.13e-01 0.101 0.123 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 4.75e-02 -0.251 0.126 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0852 0.137 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00607 0.113 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 6.37e-01 0.0627 0.133 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 2.43e-01 0.139 0.119 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 7.15e-01 0.048 0.131 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -947064 sc-eQTL 6.73e-02 -0.201 0.109 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 9.12e-01 0.0113 0.102 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 4.89e-01 0.077 0.111 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 4.53e-01 -0.1 0.134 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 4.64e-01 0.0758 0.103 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 2.45e-01 0.135 0.116 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00444 0.0805 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0376 0.132 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -947064 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0728 0.129 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 2.06e-01 0.165 0.13 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 4.03e-01 -0.113 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0354 0.136 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0545 0.119 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0481 0.146 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 5.16e-01 0.0637 0.098 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 2.84e-01 0.142 0.132 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -947064 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0639 0.117 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 6.13e-01 0.062 0.122 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 8.22e-01 0.0266 0.119 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 1.64e-01 -0.182 0.13 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 3.81e-01 0.0939 0.107 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00497 0.124 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 4.12e-01 0.0714 0.0869 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 6.88e-01 0.0524 0.13 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0872 0.171 0.13 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0715 0.145 0.13 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 5.05e-01 0.103 0.155 0.13 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0672 0.153 0.13 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 3.81e-01 0.121 0.137 0.13 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0579 0.138 0.13 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 3.12e-03 0.311 0.103 0.13 PB L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 3.65e-01 -0.151 0.167 0.13 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 1.81e-01 -0.172 0.128 0.137 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 7.52e-01 0.0452 0.143 0.137 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 5.81e-01 0.0604 0.109 0.137 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0539 0.124 0.137 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 2.90e-02 0.231 0.105 0.137 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 9.54e-01 0.00525 0.0914 0.137 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0697 0.138 0.137 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0545 0.114 0.135 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 1.18e-01 -0.198 0.126 0.135 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 3.82e-01 -0.112 0.128 0.135 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 5.62e-01 0.0527 0.0907 0.135 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 6.99e-01 0.0506 0.131 0.135 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 1.78e-01 -0.111 0.0824 0.135 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 5.93e-01 0.0704 0.131 0.135 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00333 0.13 0.139 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 3.81e-03 0.332 0.113 0.139 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 2.87e-01 0.108 0.101 0.139 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 9.67e-02 0.149 0.0891 0.139 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 1.02e-02 0.306 0.118 0.139 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 2.49e-02 0.284 0.126 0.139 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 6.92e-01 0.0385 0.0972 0.139 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 1.74e-01 0.16 0.117 0.139 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 5.38e-01 0.0772 0.125 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 8.43e-07 0.31 0.061 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 1.12e-01 -0.167 0.105 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 1.51e-01 0.137 0.095 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 4.73e-01 0.0762 0.106 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0562 0.117 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 9.03e-01 0.0167 0.137 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 9.72e-03 0.245 0.094 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 2.74e-01 -0.125 0.114 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0518 0.104 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 3.43e-01 -0.112 0.118 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0161 0.117 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 4.28e-01 0.115 0.145 0.127 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 3.32e-01 0.167 0.171 0.127 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 6.62e-01 0.075 0.171 0.127 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 5.76e-01 0.0791 0.141 0.127 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0703 0.168 0.127 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 3.46e-01 -0.128 0.135 0.127 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 5.41e-01 0.102 0.166 0.127 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 9.98e-01 0.000292 0.135 0.131 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 3.30e-01 0.111 0.114 0.131 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 3.45e-01 -0.131 0.138 0.131 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0973 0.125 0.131 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 8.62e-01 0.0233 0.135 0.131 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 7.51e-01 0.0379 0.12 0.131 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 9.25e-01 -0.011 0.117 0.14 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 3.42e-01 0.0753 0.079 0.14 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 1.79e-01 -0.171 0.126 0.14 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 4.23e-01 0.0782 0.0974 0.14 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0184 0.121 0.14 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 1.38e-01 0.182 0.122 0.14 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 3.19e-01 0.14 0.14 0.138 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 6.90e-01 0.053 0.133 0.138 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 5.27e-01 0.0654 0.103 0.138 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 2.00e-01 -0.116 0.0897 0.138 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 3.29e-01 0.125 0.128 0.138 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 2.84e-01 -0.15 0.14 0.138 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0806 0.0866 0.138 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 7.93e-01 0.0302 0.115 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 4.01e-02 0.229 0.111 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 9.66e-02 -0.132 0.0794 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 1.56e-01 -0.164 0.115 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 8.33e-03 -0.318 0.119 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 1.91e-01 -0.136 0.104 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 8.37e-01 0.0244 0.119 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0162 0.11 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 1.27e-01 0.195 0.127 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 8.50e-01 0.0178 0.0942 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00719 0.0804 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 sc-eQTL 1.53e-01 -0.14 0.0979 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 2.13e-01 -0.167 0.133 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 9.34e-01 0.00794 0.0951 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 4.75e-01 0.0907 0.127 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 1.64e-03 -0.352 0.11 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 3.00e-01 -0.136 0.131 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 5.15e-01 0.081 0.124 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 7.01e-06 0.267 0.0579 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 3.11e-02 -0.213 0.0982 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 2.22e-01 0.108 0.0886 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 8.74e-01 0.016 0.101 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0779 0.113 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0319 0.12 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 1.21e-01 0.11 0.0705 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 7.65e-02 -0.228 0.128 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00741 0.105 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 4.15e-01 0.0962 0.118 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 2.47e-01 0.146 0.126 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -947064 sc-eQTL 1.53e-01 -0.157 0.109 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -43234 sc-eQTL 5.82e-01 0.0538 0.0975 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 85645 sc-eQTL 4.32e-01 0.0839 0.107 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 206653 sc-eQTL 1.20e-01 -0.2 0.128 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 737674 sc-eQTL 3.11e-01 0.0987 0.0971 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 977190 sc-eQTL 5.49e-01 0.0701 0.117 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -42321 sc-eQTL 4.33e-01 0.0586 0.0746 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 889230 sc-eQTL 6.88e-01 0.0515 0.128 0.136 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 -43234 pQTL 5.13e-08 0.0816 0.0149 0.0 0.0 0.112
ENSG00000136044 APPL2 -43234 eQTL 0.000347 0.103 0.0286 0.0 0.0 0.113
ENSG00000136051 WASHC4 85645 eQTL 4.99e-06 0.067 0.0146 0.0 0.0 0.113
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 eQTL 3.67e-19 0.483 0.0529 0.0 0.0 0.113
ENSG00000151131 C12orf45 206653 eQTL 0.00605 -0.0684 0.0248 0.0 0.0 0.113
ENSG00000171310 CHST11 737674 eQTL 0.000539 0.0779 0.0224 0.0 0.0 0.113
ENSG00000279176 AC079316.2 640896 eQTL 0.00305 0.115 0.0386 0.00133 0.0 0.113


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136051 WASHC4 85645 1.1e-05 2.06e-05 2.41e-06 1.38e-05 2.48e-06 4.37e-06 1.5e-05 3.33e-06 1.92e-05 6.93e-06 2.38e-05 1.2e-05 4.65e-05 1.56e-05 3.66e-06 9.28e-06 7.73e-06 1.11e-05 2.64e-06 3.14e-06 6.35e-06 1.24e-05 9.61e-06 4.28e-06 2.94e-05 4.12e-06 7.15e-06 8.16e-06 1.3e-05 8.95e-06 2.25e-05 1.17e-06 1.27e-06 6.16e-06 1.04e-05 3.17e-06 1.81e-06 2e-06 3.33e-06 3.56e-06 1.75e-06 1.59e-05 1.8e-06 1.89e-07 9.99e-07 2.34e-06 1.38e-06 7.04e-07 6.22e-07
ENSG00000136052 SLC41A2 234225 4.11e-06 7.87e-06 7.43e-07 3.29e-06 4.85e-07 8.24e-07 2.46e-06 9.98e-07 5.13e-06 1.9e-06 6.19e-06 3.62e-06 7.05e-06 3.97e-06 9.21e-07 2.67e-06 1.97e-06 2.11e-06 6.47e-07 6.46e-07 1.12e-06 3.51e-06 2.46e-06 1.42e-06 5.59e-06 1.2e-06 1.38e-06 1.85e-06 2.64e-06 1.63e-06 3.88e-06 4.56e-07 2.79e-07 1.72e-06 2.06e-06 9.72e-07 8.9e-07 4.21e-07 1.21e-06 4.88e-07 3.2e-07 3.42e-06 5.79e-07 2e-08 3.01e-07 3.93e-07 2.37e-07 2.3e-07 9.59e-08
ENSG00000171310 CHST11 737674 3.02e-07 4.78e-07 5.14e-08 2.41e-07 9.25e-08 8.45e-08 1.81e-07 5.85e-08 1.66e-07 7.6e-08 2.98e-07 2.09e-07 2.05e-07 1.17e-07 5.91e-08 7.89e-08 4.18e-08 1.51e-07 5.75e-08 4.03e-08 1.26e-07 1.26e-07 1.58e-07 2.91e-08 2.09e-07 1.14e-07 1.07e-07 1.04e-07 1.23e-07 1.1e-07 1.59e-07 3.92e-08 3.09e-08 8.72e-08 1.27e-07 3.49e-08 5.51e-08 9.36e-08 6.78e-08 3.92e-08 4.68e-08 1.46e-07 5.27e-08 1.76e-08 4.25e-08 1.19e-08 1.26e-07 3.86e-09 4.77e-08