Genes within 1Mb (chr12:105148394:CTG:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 7.11e-02 -0.135 0.0742 0.239 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0248 0.0476 0.239 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 4.90e-01 0.0525 0.0758 0.239 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 3.84e-01 0.08 0.0916 0.239 B L1
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0745 0.0709 0.239 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0557 0.0868 0.239 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 9.75e-01 0.00205 0.0654 0.239 B L1
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 5.31e-02 -0.2 0.103 0.239 B L1
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 1.51e-01 0.101 0.0703 0.239 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 1.90e-02 0.162 0.0687 0.239 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 8.76e-01 -0.015 0.0963 0.239 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 6.96e-01 -0.025 0.0638 0.239 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0842 0.0775 0.239 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 1.35e-01 0.0805 0.0536 0.239 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0185 0.0843 0.239 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0575 0.0802 0.239 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 4.40e-04 0.311 0.087 0.239 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0581 0.081 0.239 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0449 0.0509 0.239 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0432 0.0886 0.239 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 2.72e-01 0.0391 0.0355 0.239 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 2.97e-01 0.105 0.1 0.239 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 1.69e-01 -0.139 0.101 0.239 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 2.09e-01 -0.103 0.0815 0.239 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0266 0.0694 0.239 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 8.16e-01 0.0145 0.0621 0.239 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00757 0.0868 0.239 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0322 0.0957 0.239 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 6.66e-02 -0.0761 0.0412 0.239 DC L1
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0285 0.0981 0.239 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 1.83e-01 -0.129 0.0966 0.239 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 7.87e-04 -0.158 0.0464 0.239 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 8.64e-01 0.0144 0.0838 0.239 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 9.64e-01 0.00323 0.072 0.239 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 9.40e-01 0.00627 0.0826 0.239 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 1.25e-01 -0.142 0.0924 0.239 Mono L1
ENSG00000074590 NUAK1 -991639 sc-eQTL 6.88e-01 0.0372 0.0927 0.238 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0411 0.0831 0.238 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 3.60e-01 0.0795 0.0865 0.238 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 2.22e-02 -0.242 0.105 0.238 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 3.12e-01 -0.082 0.0809 0.238 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00726 0.0983 0.238 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 3.22e-01 0.0622 0.0627 0.238 NK L1
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 7.70e-01 0.0317 0.108 0.238 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 2.13e-02 -0.2 0.086 0.239 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0206 0.114 0.239 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0818 0.0803 0.239 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 9.61e-01 0.00412 0.0847 0.239 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0949 0.0834 0.239 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 6.85e-01 0.0272 0.0669 0.239 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 4.28e-01 0.0809 0.102 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0259 0.117 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0769 0.111 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0129 0.0834 0.235 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 6.95e-01 0.0455 0.116 0.235 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0295 0.113 0.235 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 3.28e-01 0.117 0.119 0.235 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 9.19e-01 0.0114 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0941 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00598 0.0971 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0495 0.0839 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 1.47e-01 0.133 0.0918 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 1.76e-02 0.252 0.105 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 8.78e-01 0.0134 0.0873 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 3.18e-01 -0.108 0.108 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0532 0.0991 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 1.53e-02 -0.242 0.0991 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 3.13e-01 0.104 0.103 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 1.51e-01 0.122 0.0846 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 5.93e-01 0.0534 0.0997 0.241 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 1.92e-01 0.15 0.115 0.241 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 1.13e-01 -0.156 0.0979 0.241 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0374 0.105 0.241 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0338 0.0873 0.241 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 3.83e-02 -0.225 0.108 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0719 0.0859 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 6.67e-01 0.0333 0.0773 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000463 0.0895 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 2.69e-01 -0.123 0.111 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0838 0.0871 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 2.39e-01 -0.127 0.108 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 9.61e-02 0.164 0.0983 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0115 0.109 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 8.34e-02 -0.159 0.0914 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0338 0.0832 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0254 0.0873 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0195 0.118 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0327 0.0852 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 1.67e-01 -0.151 0.109 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 2.18e-01 0.126 0.102 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0208 0.117 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 3.28e-01 0.105 0.107 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 5.00e-02 0.2 0.101 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 4.26e-01 0.082 0.103 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 9.15e-01 0.00984 0.0921 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 6.65e-01 -0.048 0.11 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 1.69e-01 0.0855 0.0619 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 8.10e-02 0.191 0.109 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 7.79e-01 0.0205 0.073 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 8.42e-01 0.0143 0.072 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0322 0.105 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 8.72e-01 0.0107 0.0663 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 1.29e-01 -0.129 0.0849 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 7.44e-01 0.0306 0.0936 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00679 0.0849 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 6.16e-02 0.161 0.0859 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 8.26e-04 0.295 0.0869 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0169 0.11 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00742 0.0816 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0698 0.0947 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 9.03e-04 0.238 0.0707 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 9.04e-01 0.0118 0.0978 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 1.78e-01 0.13 0.0963 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 7.08e-01 0.041 0.109 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 8.83e-01 0.0157 0.106 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 8.84e-01 0.0139 0.0949 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 1.03e-01 -0.164 0.0999 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 5.38e-02 0.136 0.0703 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00822 0.106 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0345 0.0863 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 1.92e-01 0.125 0.0953 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 1.31e-01 -0.17 0.112 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 9.86e-02 -0.138 0.0829 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0358 0.107 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 5.02e-01 0.0487 0.0723 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 1.58e-01 0.153 0.108 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0296 0.0861 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 3.07e-04 0.332 0.0905 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 8.27e-01 0.0219 0.1 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 2.39e-01 0.0785 0.0664 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 6.37e-01 -0.049 0.104 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 5.41e-01 -0.049 0.08 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 6.76e-01 0.0438 0.105 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0227 0.107 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 9.83e-02 0.178 0.107 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 7.85e-01 0.0315 0.115 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0381 0.0752 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 6.15e-01 0.0562 0.111 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 3.60e-01 0.0931 0.101 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 7.77e-01 0.0309 0.109 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 7.50e-01 0.0354 0.111 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 2.70e-01 0.127 0.114 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 1.32e-01 -0.169 0.111 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 7.83e-01 0.03 0.109 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 9.38e-01 0.0085 0.109 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0299 0.0855 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00551 0.11 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 2.24e-01 -0.124 0.101 0.24 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 5.83e-01 0.0658 0.12 0.24 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0432 0.108 0.24 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 2.48e-01 0.111 0.0955 0.24 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 7.61e-01 0.0339 0.111 0.24 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0281 0.0807 0.24 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 7.15e-02 0.205 0.113 0.24 MAIT L2
ENSG00000074590 NUAK1 -991639 sc-eQTL 7.01e-01 -0.035 0.091 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0264 0.102 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 2.50e-01 0.121 0.105 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 2.35e-02 -0.256 0.112 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 6.11e-01 0.0475 0.0933 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 7.36e-01 -0.037 0.11 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 8.55e-01 -0.018 0.0984 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 2.63e-01 0.121 0.108 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -991639 sc-eQTL 6.22e-01 0.0459 0.093 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 8.07e-01 0.021 0.0858 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 8.28e-02 0.162 0.0932 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 5.29e-02 -0.218 0.112 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0131 0.0871 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0453 0.0983 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 6.65e-02 0.124 0.0674 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 9.45e-01 0.00766 0.112 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -991639 sc-eQTL 5.27e-01 0.066 0.104 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 3.18e-01 -0.106 0.106 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 2.88e-02 0.239 0.108 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 3.33e-01 -0.107 0.11 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00788 0.0967 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 3.79e-01 -0.104 0.118 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 5.82e-01 0.0437 0.0793 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 8.54e-01 0.0197 0.107 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -991639 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00112 0.0982 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 6.03e-02 -0.193 0.102 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 3.07e-01 -0.102 0.0993 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0817 0.11 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 7.90e-02 -0.158 0.0892 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 7.27e-01 0.0364 0.104 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 5.66e-01 0.042 0.073 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0897 0.109 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 4.56e-02 0.297 0.147 0.23 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 2.08e-01 -0.16 0.127 0.23 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 5.57e-01 0.0799 0.136 0.23 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 1.95e-01 -0.173 0.133 0.23 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0439 0.121 0.23 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 6.13e-01 0.0614 0.121 0.23 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 7.33e-01 0.0321 0.0938 0.23 PB L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0588 0.147 0.23 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0215 0.108 0.239 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 2.46e-01 -0.14 0.12 0.239 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 1.38e-01 -0.136 0.0915 0.239 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0316 0.104 0.239 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 3.09e-03 -0.262 0.0874 0.239 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 1.31e-01 0.116 0.0764 0.239 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0581 0.116 0.239 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0564 0.0949 0.239 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 1.83e-04 0.389 0.102 0.239 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0364 0.106 0.239 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 8.78e-02 -0.128 0.0749 0.239 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 3.90e-01 0.0933 0.108 0.239 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 2.54e-01 0.0783 0.0685 0.239 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 5.10e-01 0.0721 0.109 0.239 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 5.93e-03 -0.291 0.104 0.241 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 3.48e-02 -0.2 0.0941 0.241 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 7.61e-01 0.0253 0.083 0.241 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 1.52e-01 0.106 0.0734 0.241 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0665 0.0987 0.241 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 2.48e-01 -0.121 0.104 0.241 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0532 0.0798 0.241 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0062 0.0969 0.241 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 2.14e-01 -0.131 0.105 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 2.55e-06 -0.25 0.0516 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 2.79e-01 -0.096 0.0884 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 5.68e-01 -0.046 0.0803 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 3.73e-01 0.0796 0.0891 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0513 0.0982 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0254 0.114 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0684 0.0791 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 1.00e-01 0.155 0.0941 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 8.74e-01 0.0137 0.0864 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0291 0.0983 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 7.53e-02 -0.173 0.0965 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 3.21e-02 -0.249 0.115 0.248 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00137 0.138 0.248 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 1.19e-01 -0.214 0.136 0.248 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 1.80e-01 -0.152 0.113 0.248 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0286 0.135 0.248 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 6.16e-01 0.0546 0.109 0.248 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 7.91e-01 0.0354 0.133 0.248 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0258 0.11 0.24 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0612 0.0932 0.24 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0649 0.113 0.24 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 1.92e-01 0.133 0.102 0.24 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0375 0.11 0.24 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00331 0.0976 0.24 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 2.00e-01 -0.129 0.1 0.238 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0357 0.0678 0.238 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 6.96e-01 0.0426 0.109 0.238 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 5.97e-03 -0.228 0.082 0.238 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0419 0.103 0.238 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0899 0.105 0.238 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 6.11e-01 0.0583 0.114 0.246 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 2.00e-01 -0.139 0.108 0.246 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 5.27e-02 -0.163 0.0835 0.246 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 2.22e-01 -0.09 0.0734 0.246 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0285 0.105 0.246 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 5.39e-01 0.0705 0.114 0.246 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0448 0.0709 0.246 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 6.98e-01 0.0365 0.0939 0.246 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 8.59e-01 0.0165 0.0929 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00345 0.0664 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 4.65e-01 0.0704 0.0962 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 1.51e-03 0.316 0.0984 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 1.78e-01 -0.116 0.0861 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0707 0.0984 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0235 0.0912 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 3.36e-03 -0.309 0.104 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0999 0.0788 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0253 0.0675 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 189650 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0321 0.0826 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0489 0.112 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0831 0.0796 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 3.33e-01 -0.103 0.106 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 2.11e-02 0.218 0.0938 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0355 0.11 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 2.81e-01 -0.112 0.104 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 8.26e-05 -0.197 0.049 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 8.25e-01 0.0184 0.083 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 5.54e-01 -0.044 0.0742 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 8.24e-01 0.0189 0.0845 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 3.29e-01 -0.092 0.0941 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 1.66e-01 -0.142 0.102 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 3.92e-01 -0.052 0.0607 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0572 0.11 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 6.24e-01 -0.044 0.0896 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0352 0.101 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0881 0.108 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -991639 sc-eQTL 6.19e-01 0.0463 0.0931 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -87809 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0768 0.0827 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 41070 sc-eQTL 3.09e-01 0.0923 0.0904 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 162078 sc-eQTL 1.12e-01 -0.173 0.109 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 693099 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0964 0.0824 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 932615 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0102 0.0993 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 sc-eQTL 2.45e-01 0.0736 0.0632 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 844655 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0285 0.109 0.237 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136010 ALDH1L2 40751 eQTL 1.94e-06 0.149 0.031 0.0 0.00121 0.246
ENSG00000136044 APPL2 -87809 pQTL 3.49e-12 -0.0805 0.0115 0.0 0.0 0.248
ENSG00000136044 APPL2 -87809 eQTL 6.4e-05 -0.0886 0.0221 0.0 0.0 0.246
ENSG00000136051 WASHC4 41070 eQTL 7.37e-05 -0.045 0.0113 0.0 0.0 0.246
ENSG00000151131 C12orf45 162078 eQTL 0.00672 0.0521 0.0192 0.0 0.0 0.246
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 eQTL 4.2e-10 -0.129 0.0204 0.00419 0.00374 0.246


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136010 ALDH1L2 40751 4.82e-06 6.73e-06 5.84e-07 3.51e-06 1.63e-06 2.1e-06 4.25e-06 6.72e-07 5.06e-06 1.83e-06 7.68e-06 2.51e-06 7.83e-06 1.94e-06 1.37e-06 1.66e-06 3.59e-06 2.9e-06 1.42e-06 1.04e-06 1.4e-06 4.19e-06 4.62e-06 1.01e-06 7.3e-06 1.95e-06 1.56e-06 1.44e-06 4.23e-06 5.42e-06 2.85e-06 2.84e-07 7.75e-07 1.74e-06 2.69e-06 1.17e-06 9.22e-07 4.71e-07 8.29e-07 3.63e-07 2.87e-07 8.54e-06 1.43e-06 1.47e-07 2.73e-07 1.1e-06 8e-07 4.26e-07 1.54e-07
ENSG00000136051 WASHC4 41070 4.81e-06 6.47e-06 6.07e-07 3.5e-06 1.66e-06 2.02e-06 4.31e-06 6.83e-07 5.13e-06 1.69e-06 7.42e-06 2.48e-06 7.74e-06 1.99e-06 1.35e-06 1.7e-06 3.34e-06 2.87e-06 1.44e-06 1e-06 1.39e-06 4.2e-06 4.6e-06 1.08e-06 7.15e-06 1.93e-06 1.57e-06 1.44e-06 4.19e-06 5.45e-06 2.83e-06 2.83e-07 7.75e-07 1.64e-06 2.6e-06 1.17e-06 9.23e-07 4.72e-07 8.31e-07 3.63e-07 3.02e-07 8.29e-06 1.42e-06 1.47e-07 3.14e-07 1.12e-06 8.41e-07 4.25e-07 1.53e-07
ENSG00000235162 C12orf75 -86896 8.63e-07 7.46e-07 7.16e-08 3.22e-07 1.1e-07 3.39e-07 5.2e-07 5.82e-08 3.94e-07 1.46e-07 9.46e-07 3.84e-07 9.65e-07 1.59e-07 1.5e-07 9.6e-08 7.66e-07 3.44e-07 9.71e-08 6.16e-08 1.33e-07 2.45e-07 3.81e-07 3.17e-08 8.33e-07 2.74e-07 1.57e-07 1.48e-07 3e-07 7.39e-07 2.73e-07 3.64e-08 5.41e-08 1.67e-07 3.98e-07 5.23e-08 4.07e-08 1.16e-07 6.33e-08 8.09e-08 5.53e-08 5.52e-07 5.62e-08 1.49e-07 4.91e-08 1.25e-08 1.2e-07 0.0 5.02e-08