Genes within 1Mb (chr12:105086238:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0329 0.104 0.147 B L1
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 3.98e-01 0.0744 0.088 0.147 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0517 0.0561 0.147 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 4.34e-02 -0.18 0.0886 0.147 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 5.76e-03 -0.296 0.106 0.147 B L1
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 5.29e-01 0.0527 0.0837 0.147 B L1
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 2.21e-01 0.125 0.102 0.147 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0713 0.0769 0.147 B L1
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 3.30e-01 -0.119 0.122 0.147 B L1
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0489 0.0849 0.147 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 2.62e-01 0.0935 0.0832 0.147 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0883 0.0821 0.147 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 4.72e-05 -0.455 0.109 0.147 CD4T L1
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0781 0.0753 0.147 CD4T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 8.05e-01 0.0228 0.0919 0.147 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 1.07e-01 -0.102 0.0633 0.147 CD4T L1
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 8.75e-01 0.0156 0.0996 0.147 CD4T L1
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0935 0.102 0.147 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 8.06e-02 0.166 0.0943 0.147 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 5.24e-02 -0.205 0.105 0.147 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 9.35e-03 -0.248 0.0945 0.147 CD8T L1
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0929 0.06 0.147 CD8T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 9.88e-01 0.00152 0.105 0.147 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0324 0.0421 0.147 CD8T L1
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 2.56e-01 -0.135 0.118 0.147 CD8T L1
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 1.32e-01 0.177 0.117 0.153 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 7.84e-01 0.033 0.12 0.153 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 3.42e-02 0.204 0.0958 0.153 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 2.13e-01 0.102 0.0819 0.153 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00375 0.0735 0.153 DC L1
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 8.26e-02 0.178 0.102 0.153 DC L1
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 1.02e-01 0.185 0.113 0.153 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0689 0.049 0.153 DC L1
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 6.90e-02 0.211 0.115 0.153 DC L1
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00524 0.11 0.147 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 7.34e-01 0.0388 0.114 0.147 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 1.46e-04 0.21 0.0542 0.147 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 6.00e-03 -0.268 0.0967 0.147 Mono L1
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 2.97e-01 0.0883 0.0844 0.147 Mono L1
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00645 0.0972 0.147 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 4.09e-01 0.0903 0.109 0.147 Mono L1
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 6.98e-02 -0.189 0.104 0.148 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 9.83e-01 0.00206 0.0974 0.148 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 5.34e-01 0.0633 0.102 0.148 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 1.79e-01 -0.168 0.124 0.148 NK L1
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 1.95e-01 0.123 0.0946 0.148 NK L1
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 4.80e-01 0.0814 0.115 0.148 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 5.52e-01 0.0439 0.0736 0.148 NK L1
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0376 0.127 0.148 NK L1
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 3.51e-01 -0.1 0.107 0.147 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 2.97e-01 0.107 0.102 0.147 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0509 0.135 0.147 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0875 0.0948 0.147 Other_T L1
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000781 0.0998 0.147 Other_T L1
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 2.17e-01 0.122 0.0983 0.147 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 5.53e-01 0.0469 0.0789 0.147 Other_T L1
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 9.38e-01 0.00931 0.12 0.147 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 3.61e-01 0.128 0.139 0.151 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 6.15e-01 0.0683 0.136 0.151 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0879 0.129 0.151 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0415 0.0964 0.151 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 7.06e-01 0.0506 0.134 0.151 B_Activated L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 3.69e-01 0.117 0.13 0.151 B_Activated L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 8.21e-02 0.239 0.137 0.151 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 5.56e-02 0.248 0.129 0.151 B_Activated L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 4.17e-01 0.106 0.13 0.151 B_Activated L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0192 0.13 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 4.67e-02 0.226 0.113 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0875 0.0985 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 2.36e-01 -0.129 0.108 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 9.70e-03 -0.322 0.123 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 2.14e-01 -0.127 0.102 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0786 0.127 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0241 0.117 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 6.56e-01 0.0527 0.118 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 4.66e-01 0.0933 0.128 0.149 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 6.58e-01 0.0522 0.118 0.149 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0724 0.0971 0.149 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 2.21e-01 -0.139 0.114 0.149 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0844 0.132 0.149 B_Memory L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 6.60e-01 0.0495 0.112 0.149 B_Memory L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 8.37e-01 0.0248 0.12 0.149 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 4.31e-01 0.0787 0.0997 0.149 B_Memory L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 2.11e-01 0.156 0.124 0.149 B_Memory L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 4.22e-02 -0.253 0.124 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 2.49e-01 -0.119 0.102 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 4.56e-01 -0.069 0.0923 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0845 0.107 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 7.48e-03 -0.353 0.131 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 1.91e-01 0.136 0.104 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 4.59e-01 0.0958 0.129 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 2.07e-02 -0.272 0.117 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 2.21e-01 -0.16 0.13 0.147 B_Naive1 L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 6.51e-02 0.233 0.126 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 3.12e-01 0.106 0.105 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0829 0.095 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 7.17e-01 0.0363 0.0999 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 8.16e-01 0.0315 0.135 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0774 0.0973 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 5.50e-01 0.0747 0.125 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 2.51e-02 -0.26 0.115 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 7.10e-01 0.05 0.134 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 9.30e-01 0.0115 0.13 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 5.92e-01 0.0686 0.128 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 3.02e-01 -0.127 0.122 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 1.45e-01 -0.18 0.123 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.11 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 4.54e-01 0.0991 0.132 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0506 0.0744 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 3.17e-01 -0.132 0.131 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 6.77e-02 -0.166 0.0903 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 2.87e-01 0.0918 0.086 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00489 0.085 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 1.10e-05 -0.534 0.119 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 1.95e-01 -0.101 0.078 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0074 0.101 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 2.52e-01 -0.127 0.11 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0468 0.1 0.147 CD4_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 2.75e-01 0.124 0.114 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 7.54e-02 0.182 0.102 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0604 0.106 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 1.86e-01 -0.173 0.13 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0714 0.0965 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0304 0.112 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0688 0.0858 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 6.74e-01 0.0488 0.116 0.147 CD4_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 1.77e-01 0.166 0.122 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00595 0.115 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 3.83e-01 -0.113 0.129 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 3.09e-01 -0.128 0.125 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 2.81e-01 -0.121 0.112 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 4.25e-01 0.095 0.119 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 8.00e-01 0.0213 0.084 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 8.07e-01 0.0306 0.125 0.147 CD4_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0241 0.121 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 2.92e-02 0.222 0.101 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 2.84e-01 -0.121 0.113 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 4.09e-01 0.11 0.133 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 7.37e-01 0.0333 0.0988 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0237 0.127 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 5.47e-01 0.0516 0.0856 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 2.82e-01 -0.138 0.128 0.147 CD8_CTL L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 1.37e-01 -0.174 0.117 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 2.21e-01 0.125 0.102 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 1.17e-01 -0.173 0.11 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 2.96e-02 -0.258 0.118 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 7.63e-03 -0.21 0.0778 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 9.06e-02 -0.208 0.122 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 2.09e-01 -0.119 0.0947 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0854 0.124 0.147 CD8_Naive L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0675 0.134 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 6.67e-01 0.0572 0.133 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 1.36e-01 -0.199 0.133 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 8.91e-02 -0.242 0.142 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 3.44e-02 -0.196 0.0921 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 6.64e-01 0.06 0.138 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 3.95e-01 -0.107 0.126 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 2.28e-02 -0.307 0.134 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0283 0.127 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0312 0.136 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 1.94e-01 -0.183 0.14 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 1.56e-01 -0.195 0.137 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 4.09e-01 0.111 0.134 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 2.76e-01 0.146 0.134 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 2.29e-01 -0.126 0.105 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 3.21e-01 -0.134 0.135 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 7.96e-01 -0.031 0.12 0.147 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 7.46e-01 0.0379 0.117 0.147 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0181 0.138 0.147 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 4.46e-03 -0.348 0.121 0.147 MAIT L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 2.54e-01 -0.126 0.11 0.147 MAIT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 7.04e-01 0.0487 0.128 0.147 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 3.48e-01 0.087 0.0924 0.147 MAIT L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 3.13e-01 0.132 0.131 0.147 MAIT L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 1.43e-01 -0.188 0.128 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 3.74e-01 0.107 0.121 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 4.63e-02 -0.248 0.124 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0945 0.135 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0521 0.111 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 6.43e-01 0.0605 0.13 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 4.88e-01 0.0812 0.117 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0445 0.129 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 1.20e-01 -0.173 0.111 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00156 0.101 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 8.68e-01 0.0183 0.11 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0505 0.132 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 4.01e-01 0.0859 0.102 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 9.76e-02 0.191 0.115 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0331 0.0797 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 3.53e-01 -0.122 0.131 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 1.72e-01 -0.191 0.14 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 1.21e-01 0.202 0.129 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 2.83e-01 -0.145 0.134 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0619 0.135 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0581 0.119 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 9.16e-01 0.0154 0.145 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 9.29e-01 0.00866 0.0974 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 1.98e-01 0.169 0.131 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 3.53e-01 0.104 0.111 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0502 0.121 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 6.52e-01 0.0529 0.117 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 2.16e-01 -0.16 0.129 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 1.23e-01 0.163 0.105 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0134 0.123 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 8.49e-01 0.0164 0.086 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 9.60e-01 0.00645 0.129 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 1.22e-01 -0.237 0.152 0.141 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 4.94e-01 -0.114 0.166 0.141 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0644 0.142 0.141 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000515 0.151 0.141 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0889 0.149 0.141 PB L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 3.29e-01 0.131 0.134 0.141 PB L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 1.00e+00 8.33e-05 0.135 0.141 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 3.81e-03 0.297 0.1 0.141 PB L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0991 0.163 0.141 PB L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 8.21e-01 0.029 0.128 0.15 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 1.39e-01 -0.185 0.125 0.15 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 9.82e-01 0.00319 0.139 0.15 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 7.96e-01 0.0275 0.106 0.15 Pro_T L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0161 0.12 0.15 Pro_T L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 5.54e-02 0.197 0.102 0.15 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 5.54e-01 0.0527 0.0888 0.15 Pro_T L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 4.56e-01 -0.1 0.134 0.15 Pro_T L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 3.93e-01 -0.101 0.118 0.147 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0627 0.111 0.147 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 6.53e-02 -0.228 0.123 0.147 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 2.87e-01 -0.133 0.124 0.147 Treg L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 6.04e-01 0.0459 0.0884 0.147 Treg L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0393 0.127 0.147 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 1.78e-01 -0.109 0.0802 0.147 Treg L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 4.18e-01 0.104 0.128 0.147 Treg L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 1.54e-01 0.188 0.131 0.149 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0343 0.128 0.149 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 1.02e-02 0.291 0.112 0.149 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 3.45e-01 0.0942 0.0994 0.149 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 1.13e-01 0.14 0.088 0.149 cDC L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 8.33e-03 0.31 0.116 0.149 cDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 4.46e-03 0.354 0.123 0.149 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 6.13e-01 0.0486 0.0959 0.149 cDC L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 7.74e-02 0.205 0.115 0.149 cDC L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 2.77e-01 -0.135 0.124 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 5.51e-01 0.0735 0.123 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 5.01e-06 0.283 0.0605 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 1.27e-01 -0.158 0.103 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 7.25e-02 0.168 0.0932 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 7.82e-01 0.0289 0.104 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 9.15e-01 0.0123 0.115 0.147 cMono_IL1B L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 5.01e-01 -0.081 0.12 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0313 0.135 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 1.27e-01 0.143 0.0933 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 2.48e-01 -0.13 0.112 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 9.83e-01 0.0022 0.102 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 3.56e-01 -0.108 0.116 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 7.63e-01 0.0347 0.115 0.147 cMono_S100A L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 3.12e-01 -0.15 0.148 0.142 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 2.40e-01 0.169 0.144 0.142 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 2.12e-01 0.212 0.169 0.142 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 5.07e-01 0.113 0.169 0.142 gdT L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 8.31e-01 0.0299 0.14 0.142 gdT L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 9.20e-01 0.0168 0.166 0.142 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 4.05e-01 -0.112 0.134 0.142 gdT L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 4.18e-01 0.133 0.164 0.142 gdT L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 1.69e-01 0.19 0.137 0.144 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0246 0.134 0.144 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 2.34e-01 0.135 0.113 0.144 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0515 0.137 0.144 intMono L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 2.53e-01 -0.141 0.123 0.144 intMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 9.09e-01 0.0153 0.133 0.144 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0713 0.118 0.144 intMono L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0716 0.122 0.149 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00657 0.116 0.149 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 6.43e-01 0.0362 0.078 0.149 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 4.37e-02 -0.252 0.124 0.149 ncMono L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 7.72e-02 0.169 0.0953 0.149 ncMono L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 6.45e-01 0.0549 0.119 0.149 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 2.43e-01 0.141 0.121 0.149 ncMono L2
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 5.29e-01 0.0925 0.147 0.144 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 4.78e-01 0.0975 0.137 0.144 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 9.74e-01 0.00427 0.13 0.144 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 4.32e-01 0.0797 0.101 0.144 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0923 0.088 0.144 pDC L2
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 1.39e-01 0.185 0.125 0.144 pDC L2
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 2.96e-01 -0.143 0.137 0.144 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 2.54e-01 -0.097 0.0847 0.144 pDC L2
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 5.58e-01 0.066 0.112 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00654 0.116 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 2.16e-02 0.25 0.108 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 1.47e-01 -0.113 0.0779 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 1.08e-01 -0.182 0.113 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 2.93e-02 -0.258 0.117 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0594 0.102 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0251 0.116 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0112 0.108 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 1.98e-01 0.161 0.125 0.147 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00856 0.117 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0148 0.093 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 5.71e-01 -0.045 0.0793 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0849 0.097 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 4.58e-02 -0.263 0.131 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 6.61e-01 0.0412 0.0939 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 4.50e-01 0.0947 0.125 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 2.25e-03 -0.338 0.109 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 3.20e-01 -0.129 0.129 0.147 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 2.60e-01 -0.132 0.117 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 5.90e-01 0.066 0.122 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 4.89e-04 0.206 0.058 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 3.27e-02 -0.208 0.0965 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 8.21e-02 0.152 0.0867 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00852 0.0994 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00984 0.111 0.147 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 3.12e-01 0.119 0.118 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0721 0.118 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 1.77e-01 0.0942 0.0696 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 1.55e-01 -0.181 0.127 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 8.49e-01 0.0197 0.103 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 2.64e-01 0.13 0.116 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 7.67e-01 0.0368 0.124 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120837 NFYB 947997 sc-eQTL 1.26e-01 -0.158 0.103 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 -149965 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0018 0.097 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 sc-eQTL 4.03e-01 0.0888 0.106 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 99922 sc-eQTL 1.81e-01 -0.171 0.127 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000171310 CHST11 630943 sc-eQTL 1.68e-01 0.133 0.0963 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198431 TXNRD1 870459 sc-eQTL 3.51e-01 0.108 0.116 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 -149052 sc-eQTL 8.17e-01 0.0172 0.0742 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000255150 EID3 782499 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0299 0.127 0.149 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 -149965 pQTL 2.27e-09 0.0841 0.014 0.0 0.0 0.129
ENSG00000136044 APPL2 -149965 eQTL 0.00197 0.0829 0.0267 0.0 0.0 0.132
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 eQTL 3.29e-07 0.0698 0.0136 0.0 0.0 0.132
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 eQTL 5.56e-19 0.448 0.0493 0.0 0.0 0.132
ENSG00000151131 C12orf45 99922 eQTL 0.00156 -0.0734 0.0231 0.0 0.0 0.132
ENSG00000171310 CHST11 630943 eQTL 0.000156 0.0792 0.0209 0.0 0.0 0.132


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136051 WASHC4 -21086 1.98e-05 2.7e-05 3.73e-06 1.35e-05 3.33e-06 9.53e-06 3.25e-05 3.59e-06 2.13e-05 1.01e-05 2.78e-05 1.08e-05 3.85e-05 9.95e-06 5.35e-06 1.27e-05 1.03e-05 1.75e-05 5.97e-06 4.81e-06 9.31e-06 2.09e-05 2.22e-05 6.49e-06 3.25e-05 5.52e-06 8.84e-06 9.24e-06 2.34e-05 1.73e-05 1.33e-05 1.58e-06 1.93e-06 5.15e-06 8.64e-06 4.55e-06 2.18e-06 2.77e-06 3.48e-06 2.79e-06 1.2e-06 2.95e-05 2.63e-06 2.81e-07 1.93e-06 2.96e-06 3.24e-06 1.4e-06 1.32e-06
ENSG00000136052 SLC41A2 127494 4.26e-06 5.79e-06 7.38e-07 3.47e-06 9.03e-07 1.35e-06 4.08e-06 1.01e-06 5.08e-06 2.01e-06 4.86e-06 3.45e-06 7.53e-06 2.15e-06 1.42e-06 3.71e-06 2.02e-06 3.36e-06 1.36e-06 9.85e-07 1.93e-06 4.49e-06 3.78e-06 1.57e-06 5.89e-06 1.24e-06 2.29e-06 1.44e-06 4.1e-06 3.06e-06 2.13e-06 4.43e-07 7.33e-07 1.8e-06 2.05e-06 1.06e-06 9.6e-07 4.67e-07 1.08e-06 7.4e-07 1.82e-07 5.64e-06 3.65e-07 1.52e-07 3.69e-07 6.92e-07 8.3e-07 4.26e-07 3.24e-07
ENSG00000171310 CHST11 630943 2.76e-07 1.78e-07 5.82e-08 3.05e-07 9.87e-08 8.37e-08 1.81e-07 5.85e-08 1.54e-07 8.53e-08 1.61e-07 1.2e-07 2.38e-07 8e-08 5.36e-08 8.71e-08 4.18e-08 1.64e-07 7.09e-08 6.02e-08 1.18e-07 1.31e-07 1.64e-07 3.22e-08 2.02e-07 1.26e-07 1.23e-07 1.47e-07 1.22e-07 1.05e-07 1.07e-07 6.87e-08 3.51e-08 1.03e-07 1.01e-07 2.68e-08 6.77e-08 7.61e-08 5.27e-08 2.2e-08 5.65e-08 1.6e-07 3.25e-08 9.66e-08 4.91e-08 1.03e-08 9.29e-08 0.0 4.83e-08