logo

Genes within 1Mb (chr12:102529208:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 6.07e-01 0.0255 0.0495 0.15 B L1
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 9.98e-02 0.142 0.0857 0.15 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 8.25e-01 0.0116 0.0524 0.15 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 4.23e-01 0.0608 0.0757 0.15 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.28e-02 -0.147 0.0584 0.15 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 1.50e-01 0.0968 0.0669 0.15 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 789736 sc-eQTL 2.53e-01 0.122 0.107 0.15 B L1
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 3.88e-01 0.0789 0.0912 0.15 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 1.16e-01 0.16 0.102 0.15 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 4.58e-01 0.0709 0.0953 0.15 B L1
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0893 0.081 0.15 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 2.19e-02 -0.25 0.108 0.15 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 7.23e-01 -0.027 0.076 0.15 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.59e-03 -0.18 0.0562 0.15 CD4T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 3.46e-01 0.1 0.106 0.15 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 1.42e-01 -0.144 0.0977 0.15 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 4.39e-02 -0.214 0.105 0.15 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 8.76e-02 -0.119 0.0694 0.15 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 5.64e-02 -0.131 0.0685 0.15 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 8.35e-01 0.0206 0.099 0.15 CD8T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 7.71e-01 0.0327 0.112 0.15 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 7.88e-01 0.0297 0.111 0.146 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0774 0.101 0.146 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 2.43e-01 0.13 0.111 0.146 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0401 0.106 0.146 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 6.07e-01 0.0451 0.0875 0.146 DC L1
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 9.83e-01 0.00212 0.0991 0.146 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 8.29e-01 -0.025 0.115 0.146 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0211 0.0923 0.15 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 6.08e-02 -0.146 0.0775 0.15 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 5.89e-01 -0.053 0.0979 0.15 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 2.10e-02 -0.203 0.0873 0.15 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 2.30e-01 0.0866 0.0719 0.15 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0862 0.0997 0.148 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0599 0.0926 0.148 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0757 0.067 0.148 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.41e-02 -0.183 0.0738 0.148 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 3.22e-01 0.106 0.106 0.148 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 6.34e-01 0.0596 0.125 0.148 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 4.75e-01 0.0267 0.0372 0.15 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 1.72e-01 0.097 0.0707 0.15 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 6.79e-03 -0.279 0.102 0.15 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0298 0.0748 0.15 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 7.83e-03 -0.2 0.0745 0.15 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 2.84e-01 0.0973 0.0906 0.15 Other_T L1
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 9.97e-01 0.000424 0.108 0.15 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 6.32e-01 0.0363 0.0756 0.15 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 1.24e-01 -0.135 0.0875 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 8.52e-01 0.00456 0.0245 0.143 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0913 0.127 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 8.97e-01 0.0121 0.0938 0.143 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 3.56e-01 0.123 0.133 0.143 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 2.20e-01 -0.156 0.126 0.143 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 5.61e-01 0.0742 0.127 0.143 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 789736 sc-eQTL 9.57e-01 0.0056 0.105 0.143 B_Activated L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 1.15e-01 0.175 0.11 0.143 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 2.33e-01 -0.126 0.105 0.143 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0784 0.0988 0.143 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0399 0.0493 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 5.61e-01 0.0715 0.123 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0795 0.0658 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 4.08e-01 0.0809 0.0974 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 3.40e-02 -0.213 0.0998 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 3.40e-02 0.228 0.107 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 789736 sc-eQTL 7.84e-01 0.0312 0.114 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 7.88e-01 0.0293 0.109 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 5.97e-02 -0.224 0.118 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 4.07e-01 0.0949 0.114 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 3.00e-01 0.0474 0.0456 0.151 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00162 0.121 0.151 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 7.11e-02 -0.142 0.0783 0.151 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 2.92e-01 -0.114 0.108 0.151 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.61e-02 -0.252 0.104 0.151 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0829 0.11 0.151 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 789736 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0196 0.114 0.151 B_Memory L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 7.27e-01 0.0399 0.114 0.151 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0445 0.116 0.151 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 5.37e-01 0.0656 0.106 0.151 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 8.52e-02 -0.108 0.0624 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 5.23e-01 0.0727 0.114 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 8.16e-01 0.0138 0.0591 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 2.28e-01 0.101 0.0834 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.00e-01 -0.138 0.0834 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 2.72e-01 0.1 0.0907 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 789736 sc-eQTL 2.02e-01 0.157 0.123 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 6.54e-01 0.0536 0.119 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 1.81e-01 0.161 0.12 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0208 0.113 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0654 0.0552 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 6.10e-01 0.0579 0.113 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 9.90e-01 0.00076 0.0607 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0437 0.094 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00324 0.104 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 1.47e-01 0.15 0.103 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 789736 sc-eQTL 6.17e-01 0.0544 0.109 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 7.89e-01 0.0315 0.117 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0909 0.125 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 1.32e-01 0.163 0.108 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 7.42e-01 0.0394 0.12 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 2.36e-01 -0.142 0.119 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 2.18e-02 0.239 0.103 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 3.07e-02 0.252 0.116 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 9.02e-01 0.0134 0.109 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0907 0.0938 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 1.87e-02 -0.254 0.107 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0156 0.0836 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.54e-02 -0.166 0.068 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 6.33e-01 0.0532 0.111 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 9.51e-01 0.00595 0.0965 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 2.54e-02 -0.248 0.11 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 8.04e-01 0.0214 0.0861 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 7.56e-03 -0.176 0.0651 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00383 0.112 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 5.88e-02 -0.214 0.113 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 2.96e-03 -0.322 0.107 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0554 0.105 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0479 0.0963 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0952 0.119 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 5.68e-01 0.0593 0.104 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 2.54e-01 -0.121 0.106 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0632 0.085 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 2.23e-01 -0.118 0.0968 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 4.57e-01 0.0899 0.121 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0189 0.117 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 2.89e-01 -0.117 0.11 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 9.22e-02 -0.184 0.109 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 2.61e-01 -0.11 0.0978 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0839 0.0744 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 3.61e-01 -0.105 0.115 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 7.08e-01 0.0426 0.114 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0488 0.115 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 7.78e-02 -0.181 0.102 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0788 0.106 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0848 0.102 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 6.96e-01 0.0436 0.111 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 2.21e-01 0.134 0.109 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0169 0.115 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 3.77e-02 -0.225 0.108 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 5.44e-02 -0.223 0.115 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0534 0.104 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 5.00e-01 0.0777 0.115 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0821 0.115 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0351 0.0405 0.152 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 1.64e-01 -0.158 0.113 0.152 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 5.27e-03 -0.307 0.109 0.152 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 3.33e-01 0.0953 0.0981 0.152 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 2.40e-01 -0.117 0.0997 0.152 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 3.75e-01 0.101 0.113 0.152 MAIT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00681 0.106 0.152 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 9.59e-01 0.00578 0.111 0.152 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 9.75e-01 0.00312 0.0984 0.152 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 2.74e-02 -0.271 0.122 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0591 0.0894 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 2.92e-01 -0.109 0.103 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.56e-01 -0.151 0.106 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 6.68e-01 0.0481 0.112 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 2.22e-01 0.145 0.118 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 4.98e-01 0.0747 0.11 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0361 0.108 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 7.95e-02 -0.142 0.0808 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 5.85e-02 -0.177 0.0929 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 2.51e-01 0.131 0.113 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 9.88e-01 0.00192 0.128 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 4.68e-01 0.0821 0.113 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 5.05e-02 -0.226 0.115 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 7.04e-02 -0.168 0.0923 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0332 0.115 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 3.87e-01 -0.103 0.118 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 8.22e-01 0.0263 0.117 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0895 0.11 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 1.29e-01 -0.157 0.103 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0503 0.0785 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.41e-02 -0.212 0.0856 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 5.27e-01 0.0715 0.113 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 4.95e-02 -0.239 0.121 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 7.74e-01 0.0301 0.104 0.122 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 1.04e-01 0.228 0.139 0.122 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0198 0.109 0.122 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 3.09e-01 0.16 0.156 0.122 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0184 0.128 0.122 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 3.80e-01 0.114 0.129 0.122 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 789736 sc-eQTL 8.19e-01 0.0345 0.151 0.122 PB L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 1.57e-01 -0.19 0.133 0.122 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 6.03e-01 0.0719 0.138 0.122 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 4.52e-01 0.0962 0.127 0.122 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 2.68e-01 0.0458 0.0412 0.148 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 7.89e-01 0.0223 0.0834 0.148 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0516 0.11 0.148 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 3.73e-01 0.0728 0.0816 0.148 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 2.51e-02 -0.214 0.0948 0.148 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 1.73e-01 0.112 0.0819 0.148 Pro_T L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 1.95e-02 -0.246 0.105 0.148 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 3.75e-01 0.0677 0.0761 0.148 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0925 0.0832 0.148 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 9.74e-01 0.00383 0.116 0.15 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 1.06e-01 -0.194 0.12 0.15 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 4.33e-02 -0.212 0.104 0.15 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 6.40e-03 -0.261 0.0947 0.15 Treg L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 8.46e-03 0.256 0.0963 0.15 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 5.32e-01 0.069 0.11 0.141 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0893 0.107 0.141 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 1.44e-02 0.337 0.137 0.141 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 2.52e-01 -0.14 0.122 0.141 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 2.84e-01 0.102 0.0952 0.141 cDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0361 0.0854 0.141 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 3.22e-01 0.108 0.109 0.141 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 8.12e-01 0.0248 0.104 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 5.26e-02 -0.152 0.0778 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 8.30e-01 0.0224 0.104 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.38e-01 -0.134 0.09 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 5.27e-01 0.0488 0.077 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0131 0.113 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 1.21e-01 -0.134 0.0863 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0392 0.106 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 7.85e-02 -0.189 0.107 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 8.21e-01 0.019 0.0837 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 9.73e-01 0.00492 0.144 0.161 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 2.79e-01 -0.146 0.134 0.161 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 1.24e-02 -0.252 0.0994 0.161 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 3.68e-01 -0.118 0.131 0.161 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0888 0.133 0.161 gdT L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 5.67e-01 0.0751 0.131 0.161 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 7.49e-01 0.042 0.131 0.161 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 4.01e-01 -0.101 0.12 0.161 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 4.49e-01 0.0881 0.116 0.149 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 6.57e-01 0.0473 0.106 0.149 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 2.65e-01 -0.139 0.125 0.149 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.05e-02 -0.298 0.115 0.149 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 2.06e-01 0.129 0.102 0.149 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 1.81e-01 -0.156 0.116 0.145 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 1.83e-01 -0.144 0.107 0.145 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 9.71e-02 -0.214 0.128 0.145 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 9.21e-01 0.0103 0.104 0.145 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 2.74e-01 0.106 0.097 0.145 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0467 0.135 0.144 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 3.01e-01 -0.121 0.117 0.144 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 1.44e-01 -0.181 0.123 0.144 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 8.05e-01 0.028 0.113 0.144 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 4.71e-02 -0.173 0.0866 0.144 pDC L2
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 9.59e-01 0.00598 0.117 0.144 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0199 0.116 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 4.76e-01 0.0408 0.057 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 7.96e-01 0.0297 0.115 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 1.08e-01 -0.097 0.06 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 7.89e-01 0.0254 0.0948 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 2.69e-03 -0.245 0.0808 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 2.84e-01 0.106 0.0985 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 789736 sc-eQTL 9.02e-01 0.0141 0.114 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 5.40e-01 0.0547 0.0891 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 1.62e-01 -0.167 0.119 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 1.92e-01 0.154 0.118 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 47464 sc-eQTL 3.45e-02 -0.139 0.0655 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 1.13e-01 0.171 0.108 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 9.01e-01 0.00667 0.0535 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 5.99e-01 0.0403 0.0766 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.28e-01 -0.122 0.0797 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 1.20e-01 0.13 0.0835 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 789736 sc-eQTL 2.77e-01 0.132 0.121 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000179088 C12orf42 -966802 sc-eQTL 8.65e-01 0.0196 0.115 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 4.97e-01 0.0839 0.123 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 331623 sc-eQTL 3.23e-01 0.111 0.112 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 8.51e-01 0.0182 0.0964 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 2.42e-02 -0.175 0.077 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0378 0.1 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 2.49e-02 -0.197 0.0872 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 5.34e-01 0.045 0.0724 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0236 0.112 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 2.97e-01 -0.102 0.098 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 3.52e-02 -0.249 0.118 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 1.56e-01 -0.14 0.0982 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 1.24e-01 0.131 0.0846 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 409088 sc-eQTL 7.33e-01 0.0361 0.106 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 832261 sc-eQTL 2.97e-01 -0.108 0.103 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0808 0.0705 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 467059 sc-eQTL 4.51e-02 -0.163 0.0807 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 651628 sc-eQTL 5.87e-01 0.0595 0.109 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 409023 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0695 0.129 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 832261 eQTL 6.66e-04 -0.12 0.0352 0.0 0.0 0.159
ENSG00000111670 GNPTAB 698249 eQTL 1.64e-02 -0.0468 0.0195 0.0 0.0 0.159
ENSG00000120860 WASHC3 467059 pQTL 0.000112 -0.0495 0.0128 0.0 0.0 0.16
ENSG00000120860 WASHC3 467059 eQTL 9.5e-12 -0.118 0.0171 0.0 0.0 0.159
ENSG00000185480 PARPBP 409023 eQTL 0.041 0.0654 0.032 0.0 0.0 0.159
ENSG00000258230 AC063950.1 755453 eQTL 0.025 -0.0864 0.0385 0.0 0.0 0.159

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 832261 2.76e-07 1.36e-07 3.59e-08 2.05e-07 9.24e-08 1e-07 1.44e-07 5.37e-08 1.41e-07 4.4e-08 1.55e-07 8.14e-08 1.45e-07 6.38e-08 5.99e-08 7.26e-08 3.98e-08 1.21e-07 5.82e-08 4.45e-08 1.13e-07 1.23e-07 1.34e-07 3.23e-08 1.37e-07 1.16e-07 1.08e-07 9.32e-08 1.05e-07 1.1e-07 9.7e-08 4.22e-08 3.56e-08 8.44e-08 6.67e-08 3.22e-08 5.42e-08 9.26e-08 6.55e-08 3.8e-08 4.76e-08 1.4e-07 5.24e-08 1.44e-08 3.41e-08 1.99e-08 1.24e-07 3.79e-09 4.8e-08
ENSG00000120860 WASHC3 467059 9.39e-07 6.78e-07 6.57e-08 4.29e-07 1.07e-07 1.57e-07 4.09e-07 9.07e-08 2.53e-07 1.28e-07 6.88e-07 2.09e-07 6.77e-07 8.85e-08 1.18e-07 1.06e-07 1.62e-07 2.96e-07 1.5e-07 8.25e-08 1.61e-07 2.63e-07 2.67e-07 1.15e-07 4.54e-07 2e-07 1.83e-07 1.54e-07 2.03e-07 2.97e-07 2.55e-07 4.93e-08 5.53e-08 1.24e-07 3.07e-07 1.8e-07 8.6e-08 6.56e-08 5.28e-08 5.8e-08 6.28e-08 5.52e-07 4.36e-08 1.8e-08 1.27e-07 8.94e-09 8.67e-08 3.04e-09 6.03e-08
ENSG00000136048 \N 651628 3.53e-07 2.17e-07 4.48e-08 2.45e-07 1.02e-07 8.45e-08 1.81e-07 5.85e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.83e-07 1.05e-07 2.13e-07 7.37e-08 5.72e-08 7.36e-08 4.31e-08 1.51e-07 7.18e-08 5.04e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.58e-07 3.49e-08 1.68e-07 1.22e-07 1.18e-07 9.74e-08 1.22e-07 1.03e-07 1.14e-07 3.66e-08 3.13e-08 9.3e-08 4.04e-08 5.04e-08 5.45e-08 8.37e-08 6.39e-08 5.24e-08 4.88e-08 1.6e-07 3.13e-08 7.3e-09 4e-08 1.8e-08 1.19e-07 1.98e-09 4.55e-08