Genes within 1Mb (chr12:102364210:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 5.58e-01 -0.025 0.0425 0.22 B L1
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 7.35e-01 0.0251 0.074 0.22 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0155 0.045 0.22 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0241 0.0651 0.22 B L1
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0258 0.0636 0.22 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 7.51e-02 -0.0904 0.0506 0.22 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0459 0.0577 0.22 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 624738 sc-eQTL 7.79e-01 0.0258 0.0918 0.22 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 5.32e-02 0.169 0.0871 0.22 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 9.59e-01 0.00425 0.082 0.22 B L1
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 4.55e-01 0.0503 0.0672 0.22 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 2.56e-01 -0.103 0.0905 0.22 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 1.23e-01 -0.097 0.0626 0.22 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 9.55e-02 0.113 0.0676 0.22 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 4.99e-02 -0.0931 0.0472 0.22 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 9.72e-03 0.211 0.0809 0.22 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 9.06e-02 -0.15 0.0885 0.22 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 5.94e-01 0.0312 0.0584 0.22 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 5.02e-01 0.0547 0.0814 0.22 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00152 0.0578 0.22 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0885 0.0827 0.22 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 7.00e-01 0.0366 0.095 0.218 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 6.65e-02 -0.159 0.0861 0.218 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 8.63e-01 0.0165 0.0955 0.218 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0397 0.106 0.218 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 5.73e-03 -0.25 0.0895 0.218 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0511 0.0752 0.218 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 6.03e-02 0.186 0.0984 0.218 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 3.43e-03 0.231 0.0781 0.22 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 5.10e-01 0.0444 0.0674 0.22 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00917 0.0846 0.22 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 6.09e-02 0.162 0.0861 0.22 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0717 0.0762 0.22 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 2.49e-01 0.0717 0.0621 0.22 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 8.12e-02 0.147 0.0837 0.221 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 1.37e-01 -0.116 0.0779 0.221 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0659 0.0566 0.221 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 9.37e-01 0.0066 0.0839 0.221 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 7.83e-01 0.0174 0.0632 0.221 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 4.89e-02 -0.177 0.0892 0.221 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 1.12e-01 0.167 0.105 0.221 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 2.02e-01 -0.041 0.032 0.22 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 8.33e-01 0.013 0.0612 0.22 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0705 0.0892 0.22 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 3.30e-01 0.0628 0.0643 0.22 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 9.63e-01 0.0034 0.0734 0.22 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0583 0.0651 0.22 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 6.19e-02 -0.146 0.0776 0.22 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 4.03e-01 0.0545 0.0651 0.22 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 6.98e-03 -0.203 0.0745 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 2.94e-01 0.0211 0.02 0.219 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0295 0.104 0.219 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 1.55e-01 -0.109 0.0766 0.219 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0188 0.109 0.219 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 1.61e-02 -0.261 0.108 0.219 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0472 0.104 0.219 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0337 0.105 0.219 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 624738 sc-eQTL 3.22e-01 -0.085 0.0857 0.219 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0361 0.0864 0.219 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 2.68e-01 -0.09 0.081 0.219 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 2.24e-01 0.0509 0.0418 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 2.72e-01 -0.115 0.104 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 5.91e-01 0.0301 0.056 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 2.61e-01 0.0932 0.0826 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 2.62e-01 0.116 0.103 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 9.48e-01 0.00559 0.0856 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 4.77e-01 0.0653 0.0918 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 624738 sc-eQTL 2.65e-01 -0.108 0.0963 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 2.61e-02 0.225 0.1 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0429 0.0972 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 6.46e-01 0.0177 0.0385 0.22 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 1.14e-01 0.16 0.101 0.22 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0564 0.0662 0.22 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0741 0.0907 0.22 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 3.86e-01 0.086 0.0989 0.22 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 4.84e-01 0.0621 0.0886 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 3.61e-01 0.0849 0.0928 0.22 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 624738 sc-eQTL 6.62e-01 0.0419 0.0957 0.22 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 1.52e-01 0.14 0.0974 0.22 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0392 0.0891 0.22 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0156 0.0531 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 4.56e-01 0.0717 0.096 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 7.95e-01 0.013 0.0499 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0968 0.0703 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0334 0.0936 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00228 0.0709 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 1.11e-01 -0.122 0.0763 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 624738 sc-eQTL 6.13e-01 0.0528 0.104 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 4.12e-01 0.0833 0.101 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 2.05e-01 -0.12 0.0947 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 4.06e-01 0.0388 0.0466 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 7.36e-01 0.0324 0.0957 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 6.15e-01 0.0258 0.0512 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0022 0.0794 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 6.90e-01 0.0404 0.101 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0942 0.0878 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 7.05e-01 -0.033 0.0871 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 624738 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0271 0.0918 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 3.33e-01 0.102 0.106 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 7.83e-01 0.0252 0.0912 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0378 0.102 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 1.57e-01 0.144 0.101 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0433 0.0889 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 3.87e-01 0.0897 0.103 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 1.22e-01 -0.153 0.0989 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 3.38e-01 0.0735 0.0766 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0764 0.0883 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0711 0.0681 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 2.20e-01 0.0988 0.0803 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0643 0.0561 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 1.80e-01 0.111 0.0825 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 1.76e-01 -0.129 0.0952 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0638 0.0739 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 7.93e-01 0.0228 0.0867 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0784 0.0566 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0163 0.0966 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0433 0.0929 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 2.85e-01 0.0957 0.0893 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 7.07e-01 0.0344 0.0915 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0608 0.0819 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0189 0.0877 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 5.66e-02 -0.171 0.0891 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 6.22e-01 0.0355 0.0719 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 6.19e-01 0.0479 0.0961 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0107 0.0821 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0716 0.102 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 2.67e-01 0.103 0.0929 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0498 0.0926 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0851 0.083 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 8.04e-01 0.0238 0.096 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 4.38e-01 0.0491 0.0632 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 7.28e-01 0.034 0.0976 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 4.31e-01 0.0792 0.1 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0903 0.0898 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 7.14e-01 0.0341 0.0931 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 2.14e-01 -0.124 0.0994 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 8.22e-01 0.0202 0.0894 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0102 0.0974 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 2.45e-01 0.114 0.0982 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0886 0.093 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 4.03e-02 -0.204 0.0988 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 3.82e-01 0.0896 0.102 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 7.12e-01 0.0331 0.0895 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0674 0.0986 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0121 0.0347 0.221 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 1.81e-01 0.13 0.097 0.221 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0693 0.0948 0.221 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 7.32e-01 0.0289 0.0841 0.221 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 1.24e-01 0.158 0.102 0.221 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 6.01e-01 0.0448 0.0855 0.221 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 6.73e-01 -0.041 0.097 0.221 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 7.72e-03 0.251 0.0934 0.221 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 2.00e-01 -0.108 0.0838 0.221 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 3.84e-01 0.0945 0.108 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0322 0.0786 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 1.54e-01 -0.129 0.0904 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 3.53e-02 0.217 0.102 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 5.59e-02 0.178 0.0928 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 1.24e-01 -0.151 0.098 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 4.47e-01 0.0792 0.104 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 5.92e-01 0.0498 0.0928 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 2.58e-01 -0.103 0.0905 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0491 0.0685 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0928 0.0919 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 8.11e-01 0.0189 0.079 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 3.42e-03 -0.278 0.0939 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 5.33e-01 0.0673 0.108 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 5.05e-01 0.068 0.102 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 1.78e-01 -0.141 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 7.01e-01 0.0323 0.0839 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0264 0.112 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 3.62e-01 -0.095 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0426 0.107 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 3.04e-01 -0.108 0.105 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 8.14e-02 0.164 0.0938 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0992 0.0881 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 1.16e-01 -0.105 0.0667 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0245 0.0942 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 1.62e-01 -0.104 0.0738 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0222 0.0966 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 4.34e-02 0.21 0.103 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 4.22e-01 0.0588 0.0729 0.211 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 1.19e-01 -0.153 0.0974 0.211 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 1.19e-01 -0.119 0.0756 0.211 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 1.70e-01 0.15 0.109 0.211 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 9.54e-01 0.00449 0.0775 0.211 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0413 0.0894 0.211 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 9.63e-01 0.00419 0.0908 0.211 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 624738 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0393 0.105 0.211 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0337 0.0965 0.211 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 6.35e-01 0.0425 0.0893 0.211 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 8.63e-01 -0.00608 0.0351 0.224 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 6.21e-01 0.035 0.0708 0.224 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0853 0.0937 0.224 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 3.12e-01 0.0702 0.0693 0.224 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 3.52e-01 0.0698 0.0749 0.224 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0747 0.0814 0.224 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0891 0.0696 0.224 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00625 0.0648 0.224 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 3.69e-02 -0.147 0.0701 0.224 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0864 0.1 0.22 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0196 0.104 0.22 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 5.57e-01 0.0535 0.091 0.22 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 2.21e-01 0.126 0.102 0.22 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0889 0.0832 0.22 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 4.58e-01 0.0723 0.0971 0.215 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0728 0.0947 0.215 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 4.11e-01 0.101 0.122 0.215 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0504 0.115 0.215 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 7.37e-03 -0.287 0.106 0.215 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 3.07e-01 0.0859 0.0839 0.215 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 2.16e-01 0.119 0.0956 0.215 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 3.53e-02 0.191 0.0901 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00683 0.0687 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 2.39e-01 -0.107 0.0908 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 3.22e-01 0.091 0.0916 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 2.45e-01 -0.092 0.0789 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0173 0.0675 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 1.86e-01 0.132 0.0993 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 9.13e-01 0.00833 0.0764 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0893 0.0928 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 7.22e-01 0.0365 0.102 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 8.60e-01 0.0168 0.0946 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 4.51e-01 0.0556 0.0737 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 6.47e-02 -0.238 0.128 0.221 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 1.85e-02 -0.283 0.119 0.221 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 5.71e-02 0.173 0.0901 0.221 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0815 0.126 0.221 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00863 0.118 0.221 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 6.05e-01 -0.062 0.12 0.221 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 3.29e-03 0.341 0.114 0.221 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 8.31e-02 -0.186 0.107 0.221 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 6.79e-01 0.0413 0.0995 0.213 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 1.97e-01 -0.118 0.0907 0.213 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0302 0.107 0.213 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 1.43e-01 0.151 0.103 0.213 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0752 0.1 0.213 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 1.37e-01 0.13 0.0871 0.213 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0593 0.098 0.222 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 4.62e-01 0.0667 0.0905 0.222 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 9.56e-01 0.00604 0.109 0.222 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0349 0.0912 0.222 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 8.73e-01 -0.014 0.0877 0.222 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 2.59e-01 0.0922 0.0814 0.222 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 8.77e-01 0.0188 0.121 0.22 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 1.22e-01 -0.163 0.105 0.22 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 6.62e-01 0.0489 0.112 0.22 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 8.15e-01 0.0274 0.117 0.22 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0559 0.102 0.22 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0402 0.0789 0.22 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0943 0.105 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 4.80e-01 0.0346 0.0489 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 3.13e-01 0.0992 0.0981 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0295 0.0517 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 6.61e-01 0.0357 0.0813 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 8.31e-01 0.0202 0.0947 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 5.45e-01 0.0428 0.0706 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 6.74e-01 0.0357 0.0846 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 624738 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0905 0.0974 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 1.61e-02 0.244 0.101 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0148 0.101 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -117534 sc-eQTL 6.33e-01 0.0268 0.0561 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 5.53e-01 0.0545 0.0917 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 9.83e-01 -0.000993 0.0453 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0462 0.0648 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 7.62e-01 0.0275 0.0906 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0428 0.0678 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 1.49e-01 -0.103 0.0708 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 624738 sc-eQTL 7.34e-01 0.0349 0.103 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 3.08e-01 0.107 0.104 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 166625 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0284 0.0952 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 1.75e-02 0.202 0.0845 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 8.39e-01 0.0141 0.0692 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0501 0.0891 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 2.76e-01 0.0981 0.0899 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0613 0.0783 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 3.63e-01 0.0585 0.0642 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 7.85e-01 0.0256 0.0939 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 8.95e-01 0.0109 0.082 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 9.13e-01 0.0108 0.0993 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 3.78e-01 0.0838 0.0947 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0441 0.0823 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 1.09e-01 0.114 0.0706 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 244090 sc-eQTL 1.10e-01 0.142 0.0885 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 667263 sc-eQTL 1.40e-01 -0.128 0.0864 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 533251 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0723 0.0593 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 956438 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0671 0.0846 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 302061 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0543 0.0685 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 486630 sc-eQTL 5.74e-02 -0.175 0.0914 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 244025 sc-eQTL 3.36e-01 0.104 0.108 0.222 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 244090 eQTL 7.54e-05 0.0799 0.0201 0.0 0.0 0.228
ENSG00000120860 WASHC3 302061 pQTL 0.00829 -0.0287 0.0109 0.0 0.0 0.227
ENSG00000120860 WASHC3 302061 eQTL 1.05e-06 -0.0706 0.0144 0.0 0.0 0.228
ENSG00000136048 DRAM1 486630 eQTL 0.00735 0.0442 0.0164 0.0 0.0 0.228
ENSG00000185480 PARPBP 244025 eQTL 1.23e-07 0.14 0.0262 0.00137 0.0 0.228


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 NUP37 244090 1.58e-06 1.91e-06 3e-07 1.28e-06 4.41e-07 6.4e-07 1.25e-06 4.75e-07 1.78e-06 6.73e-07 1.89e-06 1.31e-06 2.63e-06 5.23e-07 3.35e-07 1.06e-06 1.11e-06 1.21e-06 5.4e-07 7.55e-07 6.57e-07 1.96e-06 1.59e-06 1.02e-06 2.41e-06 1.02e-06 1.01e-06 1.05e-06 1.66e-06 1.32e-06 7.6e-07 2.5e-07 3.99e-07 8.91e-07 8.31e-07 6.3e-07 7.29e-07 3.45e-07 6.21e-07 2.18e-07 3.04e-07 2.13e-06 4.24e-07 1.41e-07 3.83e-07 3.22e-07 4.08e-07 2.49e-07 2.82e-07
ENSG00000120860 WASHC3 302061 1.23e-06 9.39e-07 2.59e-07 1.02e-06 3.36e-07 5.4e-07 1.59e-06 3.68e-07 1.41e-06 5.98e-07 1.79e-06 7.5e-07 2.15e-06 3.03e-07 5.62e-07 9.27e-07 8.89e-07 7.19e-07 8.21e-07 6.21e-07 7.54e-07 1.6e-06 8.31e-07 5.54e-07 2.26e-06 6.01e-07 9.15e-07 8.09e-07 1.39e-06 1.24e-06 6.96e-07 2.89e-07 2.56e-07 6.61e-07 5.49e-07 4.3e-07 6.81e-07 2.54e-07 4.94e-07 2.88e-07 3.06e-07 1.43e-06 1.23e-07 5.67e-08 3.22e-07 1.11e-07 2.09e-07 4.88e-08 1.56e-07
ENSG00000185480 PARPBP 244025 1.58e-06 1.91e-06 3e-07 1.28e-06 4.41e-07 6.4e-07 1.25e-06 4.75e-07 1.78e-06 6.77e-07 1.89e-06 1.31e-06 2.63e-06 5.23e-07 3.35e-07 1.06e-06 1.11e-06 1.21e-06 5.4e-07 7.55e-07 6.57e-07 1.96e-06 1.59e-06 1.02e-06 2.41e-06 1.02e-06 1.01e-06 1.05e-06 1.66e-06 1.32e-06 7.9e-07 2.5e-07 3.99e-07 8.91e-07 8.31e-07 6.3e-07 7.3e-07 3.45e-07 6.21e-07 1.68e-07 3.04e-07 2.13e-06 4.24e-07 1.41e-07 3.83e-07 3.22e-07 4.08e-07 2.49e-07 2.82e-07