Genes within 1Mb (chr12:102341855:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 5.58e-01 -0.025 0.0425 0.22 B L1
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 7.35e-01 0.0251 0.074 0.22 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0155 0.045 0.22 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0241 0.0651 0.22 B L1
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0258 0.0636 0.22 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 7.51e-02 -0.0904 0.0506 0.22 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0459 0.0577 0.22 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 602383 sc-eQTL 7.79e-01 0.0258 0.0918 0.22 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 5.32e-02 0.169 0.0871 0.22 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 9.59e-01 0.00425 0.082 0.22 B L1
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 4.55e-01 0.0503 0.0672 0.22 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 2.56e-01 -0.103 0.0905 0.22 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 1.23e-01 -0.097 0.0626 0.22 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 9.55e-02 0.113 0.0676 0.22 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 4.99e-02 -0.0931 0.0472 0.22 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 9.72e-03 0.211 0.0809 0.22 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 9.06e-02 -0.15 0.0885 0.22 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 5.94e-01 0.0312 0.0584 0.22 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 5.02e-01 0.0547 0.0814 0.22 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00152 0.0578 0.22 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0885 0.0827 0.22 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 7.00e-01 0.0366 0.095 0.218 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 6.65e-02 -0.159 0.0861 0.218 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 8.63e-01 0.0165 0.0955 0.218 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0397 0.106 0.218 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 5.73e-03 -0.25 0.0895 0.218 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0511 0.0752 0.218 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 6.03e-02 0.186 0.0984 0.218 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 3.43e-03 0.231 0.0781 0.22 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 5.10e-01 0.0444 0.0674 0.22 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00917 0.0846 0.22 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 6.09e-02 0.162 0.0861 0.22 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0717 0.0762 0.22 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 2.49e-01 0.0717 0.0621 0.22 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 8.12e-02 0.147 0.0837 0.221 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 1.37e-01 -0.116 0.0779 0.221 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0659 0.0566 0.221 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 9.37e-01 0.0066 0.0839 0.221 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 7.83e-01 0.0174 0.0632 0.221 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 4.89e-02 -0.177 0.0892 0.221 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 1.12e-01 0.167 0.105 0.221 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 2.02e-01 -0.041 0.032 0.22 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 8.33e-01 0.013 0.0612 0.22 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0705 0.0892 0.22 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 3.30e-01 0.0628 0.0643 0.22 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 9.63e-01 0.0034 0.0734 0.22 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0583 0.0651 0.22 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 6.19e-02 -0.146 0.0776 0.22 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 4.03e-01 0.0545 0.0651 0.22 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 6.98e-03 -0.203 0.0745 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 2.94e-01 0.0211 0.02 0.219 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0295 0.104 0.219 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 1.55e-01 -0.109 0.0766 0.219 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0188 0.109 0.219 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 1.61e-02 -0.261 0.108 0.219 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0472 0.104 0.219 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0337 0.105 0.219 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 602383 sc-eQTL 3.22e-01 -0.085 0.0857 0.219 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0361 0.0864 0.219 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 2.68e-01 -0.09 0.081 0.219 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 2.24e-01 0.0509 0.0418 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 2.72e-01 -0.115 0.104 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 5.91e-01 0.0301 0.056 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 2.61e-01 0.0932 0.0826 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 2.62e-01 0.116 0.103 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 9.48e-01 0.00559 0.0856 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 4.77e-01 0.0653 0.0918 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 602383 sc-eQTL 2.65e-01 -0.108 0.0963 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 2.61e-02 0.225 0.1 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0429 0.0972 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 6.46e-01 0.0177 0.0385 0.22 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 1.14e-01 0.16 0.101 0.22 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0564 0.0662 0.22 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0741 0.0907 0.22 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 3.86e-01 0.086 0.0989 0.22 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 4.84e-01 0.0621 0.0886 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 3.61e-01 0.0849 0.0928 0.22 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 602383 sc-eQTL 6.62e-01 0.0419 0.0957 0.22 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 1.52e-01 0.14 0.0974 0.22 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0392 0.0891 0.22 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0156 0.0531 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 4.56e-01 0.0717 0.096 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 7.95e-01 0.013 0.0499 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0968 0.0703 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0334 0.0936 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00228 0.0709 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 1.11e-01 -0.122 0.0763 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 602383 sc-eQTL 6.13e-01 0.0528 0.104 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 4.12e-01 0.0833 0.101 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 2.05e-01 -0.12 0.0947 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 4.06e-01 0.0388 0.0466 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 7.36e-01 0.0324 0.0957 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 6.15e-01 0.0258 0.0512 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0022 0.0794 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 6.90e-01 0.0404 0.101 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0942 0.0878 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 7.05e-01 -0.033 0.0871 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 602383 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0271 0.0918 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 3.33e-01 0.102 0.106 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 7.83e-01 0.0252 0.0912 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0378 0.102 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 1.57e-01 0.144 0.101 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0433 0.0889 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 3.87e-01 0.0897 0.103 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 1.22e-01 -0.153 0.0989 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 3.38e-01 0.0735 0.0766 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0764 0.0883 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0711 0.0681 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 2.20e-01 0.0988 0.0803 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0643 0.0561 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 1.80e-01 0.111 0.0825 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 1.76e-01 -0.129 0.0952 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0638 0.0739 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 7.93e-01 0.0228 0.0867 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0784 0.0566 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0163 0.0966 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0433 0.0929 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 2.85e-01 0.0957 0.0893 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 7.07e-01 0.0344 0.0915 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0608 0.0819 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0189 0.0877 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 5.66e-02 -0.171 0.0891 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 6.22e-01 0.0355 0.0719 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 6.19e-01 0.0479 0.0961 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0107 0.0821 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0716 0.102 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 2.67e-01 0.103 0.0929 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0498 0.0926 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0851 0.083 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 8.04e-01 0.0238 0.096 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 4.38e-01 0.0491 0.0632 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 7.28e-01 0.034 0.0976 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 4.31e-01 0.0792 0.1 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0903 0.0898 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 7.14e-01 0.0341 0.0931 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 2.14e-01 -0.124 0.0994 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 8.22e-01 0.0202 0.0894 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0102 0.0974 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 2.45e-01 0.114 0.0982 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0886 0.093 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 4.03e-02 -0.204 0.0988 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 3.82e-01 0.0896 0.102 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 7.12e-01 0.0331 0.0895 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0674 0.0986 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0121 0.0347 0.221 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 1.81e-01 0.13 0.097 0.221 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0693 0.0948 0.221 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 7.32e-01 0.0289 0.0841 0.221 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 1.24e-01 0.158 0.102 0.221 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 6.01e-01 0.0448 0.0855 0.221 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 6.73e-01 -0.041 0.097 0.221 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 7.72e-03 0.251 0.0934 0.221 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 2.00e-01 -0.108 0.0838 0.221 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 3.84e-01 0.0945 0.108 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0322 0.0786 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 1.54e-01 -0.129 0.0904 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 3.53e-02 0.217 0.102 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 5.59e-02 0.178 0.0928 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 1.24e-01 -0.151 0.098 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 4.47e-01 0.0792 0.104 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 5.92e-01 0.0498 0.0928 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 2.58e-01 -0.103 0.0905 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0491 0.0685 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0928 0.0919 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 8.11e-01 0.0189 0.079 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 3.42e-03 -0.278 0.0939 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 5.33e-01 0.0673 0.108 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 5.05e-01 0.068 0.102 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 1.78e-01 -0.141 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 7.01e-01 0.0323 0.0839 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0264 0.112 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 3.62e-01 -0.095 0.104 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0426 0.107 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 3.04e-01 -0.108 0.105 0.215 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 8.14e-02 0.164 0.0938 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0992 0.0881 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 1.16e-01 -0.105 0.0667 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0245 0.0942 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 1.62e-01 -0.104 0.0738 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0222 0.0966 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 4.34e-02 0.21 0.103 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 4.22e-01 0.0588 0.0729 0.211 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 1.19e-01 -0.153 0.0974 0.211 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 1.19e-01 -0.119 0.0756 0.211 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 1.70e-01 0.15 0.109 0.211 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 9.54e-01 0.00449 0.0775 0.211 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0413 0.0894 0.211 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 9.63e-01 0.00419 0.0908 0.211 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 602383 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0393 0.105 0.211 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0337 0.0965 0.211 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 6.35e-01 0.0425 0.0893 0.211 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 8.63e-01 -0.00608 0.0351 0.224 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 6.21e-01 0.035 0.0708 0.224 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0853 0.0937 0.224 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 3.12e-01 0.0702 0.0693 0.224 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 3.52e-01 0.0698 0.0749 0.224 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0747 0.0814 0.224 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0891 0.0696 0.224 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00625 0.0648 0.224 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 3.69e-02 -0.147 0.0701 0.224 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0864 0.1 0.22 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0196 0.104 0.22 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 5.57e-01 0.0535 0.091 0.22 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 2.21e-01 0.126 0.102 0.22 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0889 0.0832 0.22 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 4.58e-01 0.0723 0.0971 0.215 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0728 0.0947 0.215 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 4.11e-01 0.101 0.122 0.215 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0504 0.115 0.215 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 7.37e-03 -0.287 0.106 0.215 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 3.07e-01 0.0859 0.0839 0.215 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 2.16e-01 0.119 0.0956 0.215 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 3.53e-02 0.191 0.0901 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00683 0.0687 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 2.39e-01 -0.107 0.0908 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 3.22e-01 0.091 0.0916 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 2.45e-01 -0.092 0.0789 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0173 0.0675 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 1.86e-01 0.132 0.0993 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 9.13e-01 0.00833 0.0764 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0893 0.0928 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 7.22e-01 0.0365 0.102 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 8.60e-01 0.0168 0.0946 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 4.51e-01 0.0556 0.0737 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 6.47e-02 -0.238 0.128 0.221 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 1.85e-02 -0.283 0.119 0.221 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 5.71e-02 0.173 0.0901 0.221 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0815 0.126 0.221 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00863 0.118 0.221 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 6.05e-01 -0.062 0.12 0.221 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 3.29e-03 0.341 0.114 0.221 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 8.31e-02 -0.186 0.107 0.221 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 6.79e-01 0.0413 0.0995 0.213 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 1.97e-01 -0.118 0.0907 0.213 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0302 0.107 0.213 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 1.43e-01 0.151 0.103 0.213 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0752 0.1 0.213 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 1.37e-01 0.13 0.0871 0.213 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0593 0.098 0.222 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 4.62e-01 0.0667 0.0905 0.222 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 9.56e-01 0.00604 0.109 0.222 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0349 0.0912 0.222 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 8.73e-01 -0.014 0.0877 0.222 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 2.59e-01 0.0922 0.0814 0.222 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 8.77e-01 0.0188 0.121 0.22 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 1.22e-01 -0.163 0.105 0.22 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 6.62e-01 0.0489 0.112 0.22 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 8.15e-01 0.0274 0.117 0.22 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0559 0.102 0.22 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0402 0.0789 0.22 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0943 0.105 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 4.80e-01 0.0346 0.0489 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 3.13e-01 0.0992 0.0981 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0295 0.0517 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 6.61e-01 0.0357 0.0813 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 8.31e-01 0.0202 0.0947 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 5.45e-01 0.0428 0.0706 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 6.74e-01 0.0357 0.0846 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 602383 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0905 0.0974 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 1.61e-02 0.244 0.101 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0148 0.101 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -139889 sc-eQTL 6.33e-01 0.0268 0.0561 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 5.53e-01 0.0545 0.0917 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 9.83e-01 -0.000993 0.0453 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0462 0.0648 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 7.62e-01 0.0275 0.0906 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0428 0.0678 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 1.49e-01 -0.103 0.0708 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 602383 sc-eQTL 7.34e-01 0.0349 0.103 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 3.08e-01 0.107 0.104 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 144270 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0284 0.0952 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 1.75e-02 0.202 0.0845 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 8.39e-01 0.0141 0.0692 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0501 0.0891 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 2.76e-01 0.0981 0.0899 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0613 0.0783 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 3.63e-01 0.0585 0.0642 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 7.85e-01 0.0256 0.0939 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 8.95e-01 0.0109 0.082 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 9.13e-01 0.0108 0.0993 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 3.78e-01 0.0838 0.0947 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0441 0.0823 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 1.09e-01 0.114 0.0706 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 221735 sc-eQTL 1.10e-01 0.142 0.0885 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 644908 sc-eQTL 1.40e-01 -0.128 0.0864 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 510896 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0723 0.0593 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 934083 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0671 0.0846 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 279706 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0543 0.0685 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 464275 sc-eQTL 5.74e-02 -0.175 0.0914 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 221670 sc-eQTL 3.36e-01 0.104 0.108 0.222 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 221735 eQTL 8.39e-05 0.0794 0.0201 0.0 0.0 0.228
ENSG00000120860 WASHC3 279706 pQTL 0.00815 -0.0288 0.0109 0.0 0.0 0.227
ENSG00000120860 WASHC3 279706 eQTL 1.01e-06 -0.0707 0.0144 0.0 0.0 0.228
ENSG00000136048 DRAM1 464275 eQTL 0.00695 0.0445 0.0164 0.0 0.0 0.228
ENSG00000185480 PARPBP 221670 eQTL 8.57e-08 0.141 0.0262 0.00172 0.00113 0.228


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 NUP37 221735 1.44e-06 2.16e-06 2.51e-07 1.27e-06 4.55e-07 6.52e-07 1.26e-06 3.99e-07 1.72e-06 7.04e-07 1.91e-06 1.29e-06 2.73e-06 7.13e-07 3.66e-07 1e-06 1.04e-06 1.18e-06 5.23e-07 6.87e-07 6.18e-07 1.96e-06 1.64e-06 9.49e-07 2.51e-06 8.55e-07 1.01e-06 1.04e-06 1.7e-06 1.63e-06 7.46e-07 2.62e-07 3.9e-07 6.25e-07 8.27e-07 6.03e-07 7.27e-07 3.21e-07 5.34e-07 2.08e-07 3.2e-07 2.5e-06 3.32e-07 2.07e-07 3.75e-07 3.28e-07 3.64e-07 2.52e-07 3.01e-07
ENSG00000120860 WASHC3 279706 1.24e-06 1e-06 3.45e-07 1.04e-06 3.51e-07 4.7e-07 1.59e-06 3.41e-07 1.49e-06 4.52e-07 1.81e-06 7.48e-07 2.1e-06 2.89e-07 5.31e-07 9.17e-07 8.37e-07 6.56e-07 8.41e-07 6.43e-07 6.56e-07 1.6e-06 8.31e-07 6.25e-07 2.19e-06 4.33e-07 8.99e-07 8.09e-07 1.28e-06 1.25e-06 6.63e-07 1.87e-07 2.61e-07 6.95e-07 5.95e-07 4.56e-07 6.17e-07 2.39e-07 3.87e-07 2.65e-07 3.06e-07 1.56e-06 5.81e-08 8.98e-08 1.65e-07 1.26e-07 2.36e-07 3.7e-08 1.69e-07
ENSG00000185480 PARPBP 221670 1.44e-06 2.16e-06 2.52e-07 1.27e-06 4.55e-07 6.52e-07 1.26e-06 3.99e-07 1.72e-06 7.04e-07 1.91e-06 1.29e-06 2.73e-06 7.13e-07 3.66e-07 1.03e-06 1.04e-06 1.18e-06 5.23e-07 6.87e-07 6.18e-07 1.96e-06 1.64e-06 9.49e-07 2.58e-06 8.55e-07 1.04e-06 1.04e-06 1.7e-06 1.63e-06 7.46e-07 2.62e-07 3.9e-07 6.25e-07 8.27e-07 6.03e-07 7.27e-07 3.21e-07 5.34e-07 2.08e-07 3.2e-07 2.5e-06 3.32e-07 2.07e-07 3.75e-07 3.28e-07 3.64e-07 2.52e-07 3.01e-07