logo

Genes within 1Mb (chr12:102329886:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0293 0.039 0.256 B L1
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 8.47e-01 0.0132 0.068 0.256 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0231 0.0413 0.256 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 8.13e-01 0.0141 0.0598 0.256 B L1
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0209 0.0584 0.256 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 9.31e-02 -0.0784 0.0465 0.256 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0384 0.053 0.256 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 590414 sc-eQTL 6.61e-01 0.037 0.0843 0.256 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 7.28e-02 0.145 0.0801 0.256 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0282 0.0753 0.256 B L1
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 3.37e-01 0.0596 0.0619 0.256 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 9.98e-02 -0.138 0.0832 0.256 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0588 0.0579 0.256 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 9.92e-02 0.103 0.0624 0.256 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 2.88e-02 -0.0957 0.0435 0.256 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 9.56e-03 0.194 0.0743 0.256 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 4.08e-02 -0.167 0.081 0.256 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 4.50e-01 0.0406 0.0536 0.256 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 3.83e-01 0.0653 0.0747 0.256 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0242 0.0531 0.256 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 1.59e-01 -0.107 0.0758 0.256 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 6.07e-01 0.045 0.0873 0.252 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0939 0.0796 0.252 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 1.14e-01 0.138 0.0873 0.252 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 4.87e-01 0.0678 0.0972 0.252 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 1.13e-03 -0.27 0.0816 0.252 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0873 0.0689 0.252 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 2.52e-01 0.104 0.0909 0.252 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 9.00e-04 0.241 0.0714 0.256 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 8.88e-01 0.00873 0.0621 0.256 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 7.64e-01 0.0234 0.0778 0.256 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 2.40e-01 0.0939 0.0796 0.256 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 2.56e-02 -0.156 0.0695 0.256 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 5.02e-01 0.0385 0.0572 0.256 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 1.54e-01 0.111 0.0773 0.258 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 4.07e-02 -0.147 0.0714 0.258 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0818 0.052 0.258 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0126 0.0773 0.258 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 9.58e-01 0.0031 0.0582 0.258 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 4.16e-02 -0.168 0.0821 0.258 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 1.64e-01 0.135 0.0968 0.258 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 3.52e-02 -0.0619 0.0292 0.256 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00382 0.0563 0.256 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 3.13e-01 -0.083 0.082 0.256 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 1.60e-01 0.0832 0.059 0.256 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0331 0.0675 0.256 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0847 0.0597 0.256 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 9.69e-02 -0.119 0.0715 0.256 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 5.73e-01 0.0339 0.0599 0.256 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 2.57e-02 -0.155 0.0689 0.256 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 1.75e-02 0.0433 0.018 0.255 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0923 0.0949 0.255 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 1.42e-01 -0.103 0.0699 0.255 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 9.78e-01 0.00274 0.0999 0.255 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 5.55e-02 -0.19 0.0987 0.255 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0291 0.0951 0.255 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 8.65e-01 0.0162 0.0954 0.255 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 590414 sc-eQTL 6.50e-02 -0.144 0.0776 0.255 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 8.13e-01 0.0187 0.0789 0.255 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0731 0.0739 0.255 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 4.81e-01 0.0272 0.0385 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 2.24e-01 -0.117 0.0957 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 8.03e-01 0.0129 0.0515 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 1.49e-01 0.11 0.0758 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 5.19e-01 0.0614 0.0952 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0317 0.0787 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 5.65e-01 0.0486 0.0844 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 590414 sc-eQTL 1.57e-01 -0.126 0.0884 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 1.71e-01 0.127 0.0928 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 2.16e-01 -0.111 0.0891 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 8.12e-01 0.00843 0.0354 0.256 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 2.53e-01 0.107 0.0931 0.256 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0265 0.061 0.256 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0545 0.0834 0.256 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 7.02e-01 0.0349 0.0911 0.256 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 2.87e-01 0.0869 0.0813 0.256 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 5.07e-01 0.0568 0.0854 0.256 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 590414 sc-eQTL 2.52e-01 0.101 0.0877 0.256 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 2.25e-01 0.109 0.0897 0.256 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0357 0.0819 0.256 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0256 0.0487 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 4.22e-01 0.0709 0.0881 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0155 0.0458 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0485 0.0648 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0503 0.0858 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 5.11e-01 0.0428 0.065 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 1.11e-01 -0.112 0.0701 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 590414 sc-eQTL 4.30e-01 0.0755 0.0956 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 3.16e-01 0.0934 0.093 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0914 0.087 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 7.23e-01 0.0152 0.0429 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 7.29e-01 0.0306 0.088 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 6.30e-01 0.0227 0.0471 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 6.65e-01 0.0317 0.073 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 3.98e-01 0.0786 0.0927 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 1.48e-01 -0.117 0.0805 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0175 0.0801 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 590414 sc-eQTL 8.40e-01 0.0171 0.0844 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 3.24e-01 0.096 0.0971 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0133 0.0839 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 7.95e-01 0.025 0.0963 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 3.17e-01 0.0966 0.0963 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 7.31e-01 -0.029 0.0844 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 7.63e-01 0.0296 0.0983 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0904 0.0941 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 1.67e-01 0.0976 0.0704 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 1.63e-01 -0.114 0.0812 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0301 0.0628 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 1.47e-01 0.107 0.0738 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 1.09e-01 -0.0828 0.0515 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 7.56e-01 0.0237 0.076 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 9.16e-02 -0.148 0.0871 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0388 0.0678 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 9.27e-01 0.00726 0.0795 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0808 0.0519 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0235 0.0884 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0905 0.0849 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 1.81e-01 0.11 0.0816 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 5.88e-01 0.0454 0.0837 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 9.00e-01 0.00942 0.075 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0694 0.0803 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 3.31e-02 -0.175 0.0816 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0104 0.066 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 5.79e-01 0.049 0.0882 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0524 0.0752 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0461 0.0936 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 4.10e-01 0.0706 0.0856 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0491 0.0851 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 8.25e-01 0.0169 0.0765 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 5.98e-01 0.0466 0.0882 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 6.00e-01 0.0305 0.0581 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0223 0.0898 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 4.34e-01 0.0728 0.0928 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 1.89e-01 -0.109 0.083 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0603 0.0861 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 2.50e-01 -0.106 0.0921 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 5.40e-01 0.0508 0.0826 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 9.09e-01 0.0103 0.0902 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 2.57e-01 0.104 0.0912 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 2.20e-01 -0.106 0.0862 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 1.07e-01 -0.149 0.0921 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 5.97e-01 0.0504 0.095 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 9.64e-01 0.00378 0.0831 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0797 0.0915 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0261 0.0322 0.258 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 1.38e-01 0.134 0.0901 0.258 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 2.18e-01 -0.109 0.088 0.258 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 9.37e-01 0.00624 0.0783 0.258 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 2.46e-01 0.111 0.0954 0.258 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00418 0.0796 0.258 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000197 0.0903 0.258 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 1.56e-03 0.277 0.0863 0.258 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0878 0.0781 0.258 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 2.82e-01 0.108 0.1 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0371 0.0727 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 5.77e-02 -0.159 0.0833 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 3.77e-02 0.198 0.0949 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 7.24e-02 0.155 0.086 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 1.24e-01 -0.14 0.0907 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 7.91e-01 0.0256 0.0963 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 5.48e-01 0.0515 0.0856 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 9.32e-02 -0.14 0.0832 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0808 0.0631 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 1.24e-01 -0.131 0.0846 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 8.73e-01 0.0117 0.0729 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 1.12e-02 -0.223 0.0871 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 3.12e-01 0.101 0.0993 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0212 0.0935 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 1.93e-01 -0.125 0.0956 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 6.58e-01 0.0341 0.0771 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0281 0.103 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 1.35e-01 -0.143 0.0952 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0615 0.0983 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 2.98e-01 -0.101 0.0965 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 1.41e-01 0.128 0.0869 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 1.79e-01 -0.11 0.0814 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 1.54e-01 -0.0885 0.0617 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0387 0.087 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0873 0.0683 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0119 0.0893 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 1.36e-01 0.143 0.0959 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 1.28e-01 0.104 0.0676 0.252 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0481 0.0918 0.252 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0993 0.0707 0.252 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 8.27e-02 0.177 0.101 0.252 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 6.11e-01 0.0369 0.0723 0.252 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 9.79e-01 0.00215 0.0835 0.252 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0422 0.0846 0.252 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 590414 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0186 0.0984 0.252 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00716 0.0902 0.252 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 2.97e-01 0.087 0.0831 0.252 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 8.64e-01 -0.00548 0.0319 0.261 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0395 0.0642 0.261 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0622 0.0851 0.261 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 1.10e-01 0.101 0.0626 0.261 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 4.13e-01 0.0557 0.068 0.261 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0964 0.0737 0.261 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0887 0.0631 0.261 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 5.18e-01 -0.038 0.0587 0.261 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 6.24e-02 -0.119 0.0638 0.261 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0987 0.0908 0.256 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0656 0.0946 0.256 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 2.84e-01 0.0886 0.0825 0.256 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 1.68e-01 0.128 0.0927 0.256 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0949 0.0754 0.256 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 7.92e-01 0.024 0.091 0.249 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0572 0.0886 0.249 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 1.06e-01 0.185 0.114 0.249 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 8.84e-01 0.0157 0.108 0.249 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 8.62e-03 -0.263 0.0991 0.249 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 5.76e-01 0.0441 0.0787 0.249 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 8.79e-01 0.0137 0.0898 0.249 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 4.02e-03 0.235 0.0809 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0604 0.0621 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0546 0.0824 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00497 0.0831 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 5.21e-02 -0.139 0.071 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0446 0.061 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 8.51e-02 0.155 0.0898 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 9.16e-01 0.00731 0.0693 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 3.37e-01 -0.081 0.0841 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 3.46e-01 0.0875 0.0926 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0671 0.0857 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 6.56e-01 0.0298 0.0669 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 7.74e-02 -0.204 0.115 0.264 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 1.31e-02 -0.267 0.106 0.264 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 5.44e-02 0.157 0.0808 0.264 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0605 0.113 0.264 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 7.20e-01 -0.038 0.106 0.264 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 3.28e-01 -0.105 0.107 0.264 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 5.22e-03 0.291 0.103 0.264 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 1.09e-01 -0.154 0.0957 0.264 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 5.45e-01 0.0544 0.0896 0.251 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 1.09e-01 -0.131 0.0815 0.251 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000176 0.0963 0.251 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 2.04e-01 0.118 0.0929 0.251 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0833 0.09 0.251 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 2.48e-01 0.0911 0.0785 0.251 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0898 0.0914 0.253 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0042 0.0846 0.253 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 8.32e-01 0.0216 0.101 0.253 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0274 0.0852 0.253 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0678 0.0818 0.253 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 2.76e-01 0.083 0.076 0.253 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 6.65e-01 0.0482 0.111 0.251 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0621 0.0968 0.251 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 2.20e-01 0.126 0.102 0.251 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 8.94e-01 0.0143 0.107 0.251 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 2.27e-01 -0.113 0.0933 0.251 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 3.63e-01 -0.066 0.0723 0.251 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0757 0.096 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 4.95e-01 0.0306 0.0448 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 6.01e-01 0.0471 0.09 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0358 0.0473 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 5.01e-01 0.0502 0.0744 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0415 0.0867 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 5.55e-01 0.0383 0.0647 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 5.07e-01 0.0514 0.0775 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 590414 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0959 0.0891 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 1.10e-01 0.149 0.093 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 5.18e-01 -0.06 0.0926 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -151858 sc-eQTL 8.57e-01 0.00934 0.0518 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 5.01e-01 0.057 0.0846 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0234 0.0418 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 9.26e-01 0.0056 0.0599 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 8.52e-01 0.0156 0.0836 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0343 0.0626 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 1.19e-01 -0.102 0.0653 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 590414 sc-eQTL 5.16e-01 0.0615 0.0946 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 1.97e-01 0.124 0.0961 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 132301 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0338 0.0878 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 2.35e-03 0.236 0.0765 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0204 0.0632 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 8.54e-01 -0.015 0.0814 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 6.29e-01 0.0398 0.0822 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 7.11e-02 -0.129 0.0711 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 5.93e-01 0.0314 0.0587 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 9.03e-01 0.0104 0.0856 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0519 0.0747 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 5.40e-01 0.0555 0.0904 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 3.41e-01 0.0823 0.0863 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0964 0.0748 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 3.23e-01 0.064 0.0646 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 209766 sc-eQTL 2.72e-01 0.0905 0.0822 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 632939 sc-eQTL 6.22e-02 -0.15 0.0798 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 498927 sc-eQTL 9.21e-02 -0.0926 0.0547 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 922114 sc-eQTL 2.21e-01 -0.096 0.0781 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 267737 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0563 0.0634 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 452306 sc-eQTL 8.24e-02 -0.148 0.0847 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 209701 sc-eQTL 3.39e-01 0.096 0.1 0.259 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 209766 eQTL 4.7e-05 0.0761 0.0186 0.0 0.0 0.26
ENSG00000111666 CHPT1 632939 eQTL 2.82e-02 -0.0597 0.0272 0.0 0.0 0.26
ENSG00000120860 WASHC3 267737 pQTL 0.00381 -0.0292 0.0101 0.0 0.0 0.259
ENSG00000120860 WASHC3 267737 eQTL 2.9e-09 -0.0792 0.0132 0.0 0.0 0.26
ENSG00000185480 PARPBP 209701 eQTL 1.3e-08 0.139 0.0242 0.00318 0.00296 0.26

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 NUP37 209766 1.64e-06 1.53e-06 2.53e-07 1.25e-06 4.65e-07 6.63e-07 1.26e-06 4.27e-07 1.73e-06 7.13e-07 1.95e-06 1.25e-06 2.69e-06 4.46e-07 3.61e-07 1e-06 1.07e-06 1.21e-06 5.4e-07 6.46e-07 6.41e-07 1.95e-06 1.58e-06 8.95e-07 2.42e-06 1.01e-06 1e-06 9.87e-07 1.74e-06 1.5e-06 7.52e-07 2.43e-07 3.97e-07 7.63e-07 7.04e-07 6.16e-07 6.81e-07 3.45e-07 5.47e-07 2.33e-07 3.05e-07 2.22e-06 3.43e-07 1.66e-07 3.87e-07 3.25e-07 3.5e-07 1.7e-07 2.82e-07
ENSG00000120860 WASHC3 267737 1.2e-06 9.73e-07 3.21e-07 9.43e-07 3.5e-07 4.92e-07 1.6e-06 4.04e-07 1.46e-06 4.65e-07 1.76e-06 6.43e-07 2.16e-06 2.88e-07 5.31e-07 9.16e-07 8.49e-07 7.19e-07 8.18e-07 6.52e-07 6.81e-07 1.6e-06 8.31e-07 5.77e-07 2.3e-06 6.01e-07 9.05e-07 6.88e-07 1.33e-06 1.29e-06 6.96e-07 1.87e-07 2.42e-07 6.89e-07 6.22e-07 4.49e-07 5.93e-07 2.38e-07 4.2e-07 3.15e-07 2.83e-07 1.52e-06 6.21e-08 8.04e-08 2.78e-07 1.27e-07 2.28e-07 6.95e-08 1.68e-07
ENSG00000185480 PARPBP 209701 1.64e-06 1.53e-06 2.53e-07 1.25e-06 4.65e-07 6.63e-07 1.26e-06 4.27e-07 1.73e-06 7.13e-07 1.95e-06 1.25e-06 2.64e-06 4.46e-07 3.61e-07 1e-06 1.07e-06 1.21e-06 5.4e-07 6.46e-07 6.41e-07 1.95e-06 1.58e-06 8.95e-07 2.42e-06 1.01e-06 1e-06 9.87e-07 1.74e-06 1.5e-06 7.52e-07 2.43e-07 3.97e-07 7.63e-07 7.04e-07 6.16e-07 6.81e-07 3.45e-07 5.47e-07 2.33e-07 3.05e-07 2.22e-06 3.43e-07 1.66e-07 3.87e-07 3.25e-07 3.5e-07 1.7e-07 2.82e-07