logo

Genes within 1Mb (chr12:102223360:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 2.80e-01 0.0501 0.0462 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 2.59e-01 0.091 0.0804 0.199 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 7.21e-01 0.0175 0.049 0.199 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 5.67e-01 0.0407 0.0708 0.199 B L1
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 7.52e-01 0.0255 0.0806 0.199 B L1
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 5.04e-01 0.0463 0.0692 0.199 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 1.54e-03 -0.174 0.0542 0.199 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 2.41e-02 0.141 0.0622 0.199 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 483888 sc-eQTL 3.73e-01 0.0891 0.0998 0.199 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 3.36e-01 0.0921 0.0955 0.199 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 2.45e-01 0.104 0.089 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00688 0.075 0.199 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0485 0.101 0.199 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 6.91e-01 0.0279 0.0701 0.199 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0411 0.0776 0.199 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000343 0.0759 0.199 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 5.38e-09 -0.298 0.049 0.199 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0598 0.0914 0.199 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0977 0.0989 0.199 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 3.17e-01 -0.065 0.0649 0.199 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0426 0.0821 0.199 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 2.51e-01 0.104 0.0903 0.199 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 3.04e-04 -0.229 0.0624 0.199 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 3.80e-01 0.0809 0.0921 0.199 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0262 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 7.52e-01 0.0302 0.0953 0.198 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 5.11e-01 -0.069 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 1.50e-01 -0.161 0.112 0.198 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 3.18e-01 0.116 0.116 0.198 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0492 0.1 0.198 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 5.74e-01 0.0465 0.0826 0.198 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 4.66e-01 0.0795 0.109 0.198 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0755 0.0872 0.199 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0589 0.0738 0.199 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0395 0.0926 0.199 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 8.44e-01 0.0203 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 2.45e-01 -0.11 0.0948 0.199 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 1.64e-05 -0.353 0.0801 0.199 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0212 0.0682 0.199 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 8.27e-01 0.0204 0.0931 0.197 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 5.21e-01 0.0555 0.0863 0.197 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0463 0.0626 0.197 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 9.42e-01 0.00729 0.101 0.197 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0865 0.0925 0.197 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 4.70e-04 -0.241 0.0678 0.197 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 4.15e-01 0.0811 0.0992 0.197 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 7.69e-01 0.0342 0.117 0.197 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 3.58e-01 0.0325 0.0353 0.199 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 1.16e-01 0.106 0.067 0.199 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0819 0.0983 0.199 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0815 0.0708 0.199 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 7.60e-01 0.034 0.111 0.199 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 8.51e-01 0.0152 0.0809 0.199 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 6.25e-03 -0.195 0.0706 0.199 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00561 0.0862 0.199 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 3.03e-01 0.074 0.0717 0.199 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0922 0.0833 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0337 0.0222 0.202 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 3.92e-01 0.0993 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 2.76e-01 0.0934 0.0855 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 6.46e-01 0.0561 0.122 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00831 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 1.33e-01 0.182 0.121 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 3.93e-02 -0.238 0.115 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 2.71e-01 0.128 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 483888 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0284 0.0957 0.202 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0405 0.0963 0.202 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 8.94e-01 0.0121 0.0905 0.202 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000827 0.0466 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0719 0.116 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0847 0.062 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0651 0.0919 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 1.32e-01 0.154 0.102 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.115 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 2.36e-02 -0.214 0.0939 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 2.87e-01 0.109 0.102 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 483888 sc-eQTL 7.90e-01 0.0286 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 3.39e-01 -0.108 0.112 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 1.86e-01 0.143 0.108 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 7.79e-01 0.0121 0.0432 0.2 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 7.42e-01 0.0376 0.114 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0297 0.0745 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 7.17e-01 -0.037 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0671 0.112 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0509 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 7.08e-02 -0.18 0.0989 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0171 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 483888 sc-eQTL 8.65e-02 -0.184 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0493 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 3.48e-01 -0.094 0.1 0.2 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 8.60e-02 -0.1 0.0581 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 5.33e-01 0.0662 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 1.98e-01 0.0708 0.0548 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 5.47e-01 -0.047 0.0778 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0609 0.0924 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 1.61e-02 0.247 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 8.64e-03 -0.204 0.0768 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 4.54e-01 0.0634 0.0845 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 483888 sc-eQTL 3.22e-02 0.245 0.114 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 7.58e-01 0.0345 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 3.26e-01 -0.103 0.105 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 2.00e-02 -0.119 0.0509 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 4.63e-01 0.0777 0.106 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0346 0.0565 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 5.10e-01 0.0577 0.0876 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 7.49e-01 0.0326 0.102 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0797 0.111 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 9.31e-01 0.00843 0.0972 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 5.87e-03 0.263 0.0945 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 483888 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0663 0.101 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0678 0.117 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 3.01e-01 0.104 0.1 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 3.43e-01 0.111 0.117 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0332 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 7.96e-01 0.0266 0.103 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0189 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0788 0.12 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 9.24e-01 0.011 0.115 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0655 0.0869 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0571 0.1 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 8.58e-01 0.0139 0.0774 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00351 0.0843 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 9.66e-01 0.00385 0.0914 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 2.30e-06 -0.294 0.0605 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 1.15e-01 0.14 0.0885 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0794 0.103 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 1.16e-01 0.125 0.079 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0147 0.0994 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0402 0.093 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 1.41e-05 -0.26 0.0584 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0696 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 1.62e-01 -0.143 0.102 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 7.49e-01 0.0316 0.0986 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0629 0.107 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 9.93e-01 0.000859 0.101 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 1.22e-01 -0.139 0.0898 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 6.82e-01 0.0399 0.0973 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00903 0.0998 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 9.22e-01 0.00782 0.0798 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0653 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 5.32e-01 0.0668 0.107 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0907 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 4.17e-01 0.092 0.113 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 9.27e-01 0.00953 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 1.45e-01 -0.15 0.103 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 6.79e-01 0.0385 0.0929 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 8.66e-01 0.0166 0.0988 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 8.19e-01 0.0246 0.107 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 7.50e-04 -0.235 0.0688 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0443 0.109 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 6.59e-01 0.0493 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 6.31e-01 -0.048 0.0998 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0865 0.103 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0388 0.113 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 4.43e-01 0.0851 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 9.34e-01 0.00817 0.0992 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 8.54e-01 0.0199 0.108 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0893 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0482 0.103 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 2.56e-03 -0.329 0.108 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 8.86e-01 -0.017 0.118 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 7.63e-01 0.0341 0.113 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 6.37e-01 0.0466 0.0988 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0106 0.039 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00998 0.11 0.201 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 7.49e-02 -0.19 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 9.48e-01 0.00616 0.0946 0.201 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0677 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 5.17e-01 -0.075 0.116 0.201 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 5.00e-02 -0.188 0.0953 0.201 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 6.04e-01 0.0566 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 2.96e-01 0.112 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 2.60e-01 -0.107 0.0944 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 1.18e-01 -0.183 0.116 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0558 0.0847 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 6.07e-01 0.0504 0.0979 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0538 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 3.06e-02 -0.24 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 3.82e-02 -0.208 0.0999 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 4.14e-01 0.0868 0.106 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 6.10e-01 0.0573 0.112 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 3.78e-02 0.214 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 2.28e-01 0.122 0.101 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 9.35e-02 -0.128 0.0758 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 7.22e-01 0.0377 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 7.78e-01 0.029 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 8.31e-03 -0.23 0.0863 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 2.74e-01 0.117 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00147 0.12 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 1.79e-01 0.142 0.106 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0682 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0653 0.0873 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 3.21e-01 -0.113 0.114 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 1.17e-01 0.183 0.116 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00582 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 2.15e-01 -0.138 0.111 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00453 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0118 0.104 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0221 0.0972 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 6.05e-01 0.0383 0.0738 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0467 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 1.32e-01 -0.156 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 4.27e-03 -0.231 0.08 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 7.65e-01 0.0318 0.106 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 5.42e-01 -0.07 0.115 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 9.57e-01 0.00457 0.0851 0.178 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 2.53e-01 0.131 0.114 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 2.77e-01 0.0965 0.0884 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 5.58e-01 0.075 0.128 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0883 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 2.08e-01 -0.114 0.0896 0.178 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 4.86e-02 -0.204 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 4.11e-01 0.087 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 483888 sc-eQTL 1.76e-01 0.166 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 2.11e-01 0.14 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 4.83e-01 0.073 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0112 0.0383 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 4.86e-01 0.0539 0.0772 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 9.06e-01 0.0121 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 7.95e-01 0.0197 0.0757 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 5.70e-01 0.0615 0.108 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00391 0.0818 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 2.27e-02 -0.202 0.0878 0.198 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 5.73e-01 0.043 0.0762 0.198 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 1.65e-02 0.168 0.0697 0.198 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 6.91e-01 0.0308 0.0772 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 8.23e-01 0.0244 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0559 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0954 0.099 0.199 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0534 0.108 0.199 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 6.55e-01 -0.05 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0905 0.199 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 8.85e-01 0.0153 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 7.77e-01 0.0291 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 6.64e-01 0.0577 0.132 0.202 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 3.57e-01 -0.111 0.12 0.202 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0703 0.124 0.202 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 1.20e-01 -0.181 0.116 0.202 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 3.38e-01 0.0873 0.0909 0.202 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 9.12e-02 0.175 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 9.62e-01 0.00474 0.0993 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0375 0.0748 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0635 0.0992 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0717 0.112 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0739 0.1 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 3.75e-02 -0.179 0.0854 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0581 0.0735 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0902 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0382 0.0817 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 7.75e-01 0.0285 0.0993 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 1.40e-01 0.172 0.116 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0536 0.109 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 2.19e-03 -0.307 0.0989 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0303 0.0788 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 6.10e-01 0.0687 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 4.36e-01 0.0984 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 1.84e-02 -0.222 0.0932 0.209 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0272 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 4.46e-01 0.1 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 2.10e-01 -0.154 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 8.14e-01 0.0295 0.125 0.209 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 1.01e-01 -0.2 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0238 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 6.83e-01 0.0401 0.0982 0.202 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0758 0.115 0.202 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0201 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0246 0.112 0.202 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 4.61e-05 -0.432 0.104 0.202 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 5.24e-01 0.0603 0.0943 0.202 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 8.49e-01 0.0206 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 2.34e-01 -0.118 0.0991 0.195 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 9.05e-01 0.0142 0.119 0.195 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 1.46e-01 -0.151 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0992 0.0998 0.195 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 5.28e-04 -0.329 0.0934 0.195 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0296 0.0896 0.195 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0309 0.128 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 1.97e-01 -0.144 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 8.70e-02 -0.201 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0573 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 1.34e-01 0.185 0.123 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0601 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0596 0.0832 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 5.55e-01 0.0653 0.111 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 6.25e-01 0.0265 0.054 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0138 0.109 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 3.02e-01 -0.059 0.057 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0274 0.0898 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 3.29e-01 0.0902 0.0923 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 6.99e-01 0.0404 0.105 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 1.57e-03 -0.244 0.0763 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 5.06e-01 0.0623 0.0934 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 483888 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0811 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0601 0.113 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 2.89e-01 0.118 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -258384 sc-eQTL 2.48e-02 -0.139 0.0615 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 3.29e-01 0.0993 0.102 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 7.92e-01 0.0133 0.0502 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 7.11e-01 0.0267 0.0719 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0455 0.088 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 4.70e-02 0.199 0.0995 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 6.04e-02 -0.141 0.0746 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 2.73e-02 0.173 0.078 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 483888 sc-eQTL 1.97e-01 0.147 0.113 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 6.99e-01 0.0449 0.116 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 25775 sc-eQTL 5.89e-01 0.0571 0.105 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0717 0.0911 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0598 0.0736 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0413 0.0949 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 4.70e-01 0.0811 0.112 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0624 0.0959 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 3.60e-03 -0.241 0.0818 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0738 0.0683 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0119 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0895 0.0913 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 3.09e-01 -0.113 0.11 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0842 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0526 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 4.39e-06 -0.412 0.0873 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 8.74e-01 0.0126 0.0792 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 103240 sc-eQTL 9.33e-02 0.166 0.0986 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 526413 sc-eQTL 4.21e-01 0.078 0.0967 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0486 0.0663 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 943255 sc-eQTL 7.63e-01 0.0307 0.102 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 815588 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000618 0.0945 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 161211 sc-eQTL 1.16e-02 -0.192 0.0753 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 345780 sc-eQTL 8.33e-01 0.0217 0.103 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 103175 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0304 0.121 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 526413 eQTL 4.66e-05 -0.123 0.0302 0.0 0.0 0.197
ENSG00000111670 GNPTAB 392401 eQTL 4.24e-02 -0.0341 0.0168 0.0 0.0 0.197
ENSG00000120860 WASHC3 161211 pQTL 1.9e-05 -0.0478 0.0111 0.0 0.0 0.189
ENSG00000120860 WASHC3 161211 eQTL 5.430000000000001e-29 -0.163 0.0141 0.0115 0.0115 0.197

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 526413 7.87e-07 4.93e-07 1.14e-07 3.48e-07 1.05e-07 1.74e-07 5.28e-07 1.55e-07 4.74e-07 2.37e-07 6.39e-07 3.84e-07 7.36e-07 1.23e-07 2.48e-07 2.83e-07 2.98e-07 3.95e-07 2.12e-07 1.55e-07 2.05e-07 3.87e-07 3.19e-07 1.63e-07 7.72e-07 2.7e-07 2.94e-07 2.63e-07 3.86e-07 4.72e-07 2.83e-07 6.06e-08 4.49e-08 1.49e-07 3.04e-07 9.51e-08 1.1e-07 8.21e-08 6.38e-08 2.74e-08 1.03e-07 4.35e-07 2.67e-08 1.7e-08 1.16e-07 1.22e-08 1.11e-07 3.35e-09 6.03e-08
ENSG00000120860 WASHC3 161211 4.01e-06 3.74e-06 8.24e-07 2.02e-06 1.64e-06 8.5e-07 2.77e-06 9.78e-07 3.65e-06 1.92e-06 3.8e-06 2.74e-06 6.4e-06 1.34e-06 1.42e-06 2.9e-06 1.85e-06 2.78e-06 1.28e-06 9.64e-07 2.62e-06 4.07e-06 3.49e-06 1.4e-06 4.75e-06 1.62e-06 2.39e-06 1.81e-06 4.28e-06 3.38e-06 2.02e-06 5.25e-07 5.91e-07 1.73e-06 1.94e-06 9.58e-07 9.64e-07 4.74e-07 9.31e-07 4.57e-07 7.51e-07 4.34e-06 4.6e-07 1.8e-07 4.86e-07 3.94e-07 8.71e-07 3.18e-07 4.54e-07
ENSG00000136048 \N 345780 1.27e-06 9.31e-07 3.45e-07 6.06e-07 3.48e-07 4.59e-07 1.26e-06 3.62e-07 1.39e-06 4.32e-07 1.39e-06 6.31e-07 2e-06 2.78e-07 5.35e-07 9.13e-07 7.87e-07 6.21e-07 7.25e-07 6.82e-07 6.12e-07 1.28e-06 9.22e-07 6.54e-07 1.95e-06 4.79e-07 8.68e-07 6.93e-07 1.28e-06 1.23e-06 5.72e-07 1.73e-07 2.19e-07 6.95e-07 5.2e-07 4.67e-07 5.17e-07 1.58e-07 3.73e-07 2.91e-07 3.04e-07 1.54e-06 5.53e-08 2.65e-08 1.45e-07 1.34e-07 2.29e-07 8.67e-08 1.56e-07