logo

Genes within 1Mb (chr12:102206159:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 2.80e-01 0.0501 0.0462 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 2.59e-01 0.091 0.0804 0.199 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 7.21e-01 0.0175 0.049 0.199 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 5.67e-01 0.0407 0.0708 0.199 B L1
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 7.52e-01 0.0255 0.0806 0.199 B L1
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 5.04e-01 0.0463 0.0692 0.199 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 1.54e-03 -0.174 0.0542 0.199 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 2.41e-02 0.141 0.0622 0.199 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 466687 sc-eQTL 3.73e-01 0.0891 0.0998 0.199 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 3.36e-01 0.0921 0.0955 0.199 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 2.45e-01 0.104 0.089 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00688 0.075 0.199 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0485 0.101 0.199 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 6.91e-01 0.0279 0.0701 0.199 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0411 0.0776 0.199 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000343 0.0759 0.199 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 5.38e-09 -0.298 0.049 0.199 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0598 0.0914 0.199 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0977 0.0989 0.199 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 3.17e-01 -0.065 0.0649 0.199 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0426 0.0821 0.199 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 2.51e-01 0.104 0.0903 0.199 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 3.04e-04 -0.229 0.0624 0.199 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 3.80e-01 0.0809 0.0921 0.199 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0262 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 7.52e-01 0.0302 0.0953 0.198 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 5.11e-01 -0.069 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 1.50e-01 -0.161 0.112 0.198 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 3.18e-01 0.116 0.116 0.198 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0492 0.1 0.198 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 5.74e-01 0.0465 0.0826 0.198 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 4.66e-01 0.0795 0.109 0.198 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0755 0.0872 0.199 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0589 0.0738 0.199 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0395 0.0926 0.199 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 8.44e-01 0.0203 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 2.45e-01 -0.11 0.0948 0.199 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 1.64e-05 -0.353 0.0801 0.199 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0212 0.0682 0.199 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 8.27e-01 0.0204 0.0931 0.197 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 5.21e-01 0.0555 0.0863 0.197 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0463 0.0626 0.197 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 9.42e-01 0.00729 0.101 0.197 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0865 0.0925 0.197 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 4.70e-04 -0.241 0.0678 0.197 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 4.15e-01 0.0811 0.0992 0.197 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 7.69e-01 0.0342 0.117 0.197 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 3.58e-01 0.0325 0.0353 0.199 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 1.16e-01 0.106 0.067 0.199 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0819 0.0983 0.199 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0815 0.0708 0.199 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 7.60e-01 0.034 0.111 0.199 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 8.51e-01 0.0152 0.0809 0.199 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 6.25e-03 -0.195 0.0706 0.199 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00561 0.0862 0.199 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 3.03e-01 0.074 0.0717 0.199 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0922 0.0833 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0337 0.0222 0.202 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 3.92e-01 0.0993 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 2.76e-01 0.0934 0.0855 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 6.46e-01 0.0561 0.122 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00831 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 1.33e-01 0.182 0.121 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 3.93e-02 -0.238 0.115 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 2.71e-01 0.128 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 466687 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0284 0.0957 0.202 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0405 0.0963 0.202 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 8.94e-01 0.0121 0.0905 0.202 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000827 0.0466 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0719 0.116 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0847 0.062 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0651 0.0919 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 1.32e-01 0.154 0.102 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.115 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 2.36e-02 -0.214 0.0939 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 2.87e-01 0.109 0.102 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 466687 sc-eQTL 7.90e-01 0.0286 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 3.39e-01 -0.108 0.112 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 1.86e-01 0.143 0.108 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 7.79e-01 0.0121 0.0432 0.2 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 7.42e-01 0.0376 0.114 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0297 0.0745 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 7.17e-01 -0.037 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0671 0.112 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0509 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 7.08e-02 -0.18 0.0989 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0171 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 466687 sc-eQTL 8.65e-02 -0.184 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0493 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 3.48e-01 -0.094 0.1 0.2 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 8.60e-02 -0.1 0.0581 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 5.33e-01 0.0662 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 1.98e-01 0.0708 0.0548 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 5.47e-01 -0.047 0.0778 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0609 0.0924 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 1.61e-02 0.247 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 8.64e-03 -0.204 0.0768 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 4.54e-01 0.0634 0.0845 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 466687 sc-eQTL 3.22e-02 0.245 0.114 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 7.58e-01 0.0345 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 3.26e-01 -0.103 0.105 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 2.00e-02 -0.119 0.0509 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 4.63e-01 0.0777 0.106 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0346 0.0565 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 5.10e-01 0.0577 0.0876 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 7.49e-01 0.0326 0.102 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0797 0.111 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 9.31e-01 0.00843 0.0972 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 5.87e-03 0.263 0.0945 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 466687 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0663 0.101 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0678 0.117 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 3.01e-01 0.104 0.1 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 3.43e-01 0.111 0.117 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0332 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 7.96e-01 0.0266 0.103 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0189 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0788 0.12 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 9.24e-01 0.011 0.115 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0655 0.0869 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0571 0.1 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 8.58e-01 0.0139 0.0774 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00351 0.0843 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 9.66e-01 0.00385 0.0914 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 2.30e-06 -0.294 0.0605 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 1.15e-01 0.14 0.0885 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0794 0.103 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 1.16e-01 0.125 0.079 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0147 0.0994 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0402 0.093 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 1.41e-05 -0.26 0.0584 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0696 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 1.62e-01 -0.143 0.102 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 7.49e-01 0.0316 0.0986 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0629 0.107 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 9.93e-01 0.000859 0.101 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 1.22e-01 -0.139 0.0898 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 6.82e-01 0.0399 0.0973 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00903 0.0998 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 9.22e-01 0.00782 0.0798 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0653 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 5.32e-01 0.0668 0.107 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0907 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 4.17e-01 0.092 0.113 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 9.27e-01 0.00953 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 1.45e-01 -0.15 0.103 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 6.79e-01 0.0385 0.0929 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 8.66e-01 0.0166 0.0988 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 8.19e-01 0.0246 0.107 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 7.50e-04 -0.235 0.0688 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0443 0.109 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 6.59e-01 0.0493 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 6.31e-01 -0.048 0.0998 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0865 0.103 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0388 0.113 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 4.43e-01 0.0851 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 9.34e-01 0.00817 0.0992 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 8.54e-01 0.0199 0.108 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0893 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0482 0.103 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 2.56e-03 -0.329 0.108 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 8.86e-01 -0.017 0.118 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 7.63e-01 0.0341 0.113 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 6.37e-01 0.0466 0.0988 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0106 0.039 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00998 0.11 0.201 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 7.49e-02 -0.19 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 9.48e-01 0.00616 0.0946 0.201 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0677 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 5.17e-01 -0.075 0.116 0.201 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 5.00e-02 -0.188 0.0953 0.201 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 6.04e-01 0.0566 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 2.96e-01 0.112 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 2.60e-01 -0.107 0.0944 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 1.18e-01 -0.183 0.116 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0558 0.0847 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 6.07e-01 0.0504 0.0979 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0538 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 3.06e-02 -0.24 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 3.82e-02 -0.208 0.0999 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 4.14e-01 0.0868 0.106 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 6.10e-01 0.0573 0.112 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 3.78e-02 0.214 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 2.28e-01 0.122 0.101 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 9.35e-02 -0.128 0.0758 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 7.22e-01 0.0377 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 7.78e-01 0.029 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 8.31e-03 -0.23 0.0863 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 2.74e-01 0.117 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00147 0.12 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 1.79e-01 0.142 0.106 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0682 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0653 0.0873 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 3.21e-01 -0.113 0.114 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 1.17e-01 0.183 0.116 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00582 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 2.15e-01 -0.138 0.111 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00453 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0118 0.104 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0221 0.0972 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 6.05e-01 0.0383 0.0738 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0467 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 1.32e-01 -0.156 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 4.27e-03 -0.231 0.08 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 7.65e-01 0.0318 0.106 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 5.42e-01 -0.07 0.115 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 9.57e-01 0.00457 0.0851 0.178 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 2.53e-01 0.131 0.114 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 2.77e-01 0.0965 0.0884 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 5.58e-01 0.075 0.128 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0883 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 2.08e-01 -0.114 0.0896 0.178 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 4.86e-02 -0.204 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 4.11e-01 0.087 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 466687 sc-eQTL 1.76e-01 0.166 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 2.11e-01 0.14 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 4.83e-01 0.073 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0112 0.0383 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 4.86e-01 0.0539 0.0772 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 9.06e-01 0.0121 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 7.95e-01 0.0197 0.0757 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 5.70e-01 0.0615 0.108 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00391 0.0818 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 2.27e-02 -0.202 0.0878 0.198 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 5.73e-01 0.043 0.0762 0.198 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 1.65e-02 0.168 0.0697 0.198 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 6.91e-01 0.0308 0.0772 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 8.23e-01 0.0244 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0559 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0954 0.099 0.199 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0534 0.108 0.199 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 6.55e-01 -0.05 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0905 0.199 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 8.85e-01 0.0153 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 7.77e-01 0.0291 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 6.64e-01 0.0577 0.132 0.202 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 3.57e-01 -0.111 0.12 0.202 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0703 0.124 0.202 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 1.20e-01 -0.181 0.116 0.202 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 3.38e-01 0.0873 0.0909 0.202 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 9.12e-02 0.175 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 9.62e-01 0.00474 0.0993 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0375 0.0748 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0635 0.0992 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0717 0.112 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0739 0.1 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 3.75e-02 -0.179 0.0854 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0581 0.0735 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0902 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0382 0.0817 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 7.75e-01 0.0285 0.0993 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 1.40e-01 0.172 0.116 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0536 0.109 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 2.19e-03 -0.307 0.0989 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0303 0.0788 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 6.10e-01 0.0687 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 4.36e-01 0.0984 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 1.84e-02 -0.222 0.0932 0.209 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0272 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 4.46e-01 0.1 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 2.10e-01 -0.154 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 8.14e-01 0.0295 0.125 0.209 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 1.01e-01 -0.2 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0238 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 6.83e-01 0.0401 0.0982 0.202 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0758 0.115 0.202 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0201 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0246 0.112 0.202 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 4.61e-05 -0.432 0.104 0.202 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 5.24e-01 0.0603 0.0943 0.202 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 8.49e-01 0.0206 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 2.34e-01 -0.118 0.0991 0.195 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 9.05e-01 0.0142 0.119 0.195 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 1.46e-01 -0.151 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0992 0.0998 0.195 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 5.28e-04 -0.329 0.0934 0.195 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0296 0.0896 0.195 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0309 0.128 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 1.97e-01 -0.144 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 8.70e-02 -0.201 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0573 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 1.34e-01 0.185 0.123 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0601 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0596 0.0832 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 5.55e-01 0.0653 0.111 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 6.25e-01 0.0265 0.054 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0138 0.109 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 3.02e-01 -0.059 0.057 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0274 0.0898 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 3.29e-01 0.0902 0.0923 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 6.99e-01 0.0404 0.105 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 1.57e-03 -0.244 0.0763 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 5.06e-01 0.0623 0.0934 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 466687 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0811 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0601 0.113 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 2.89e-01 0.118 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -275585 sc-eQTL 2.48e-02 -0.139 0.0615 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 3.29e-01 0.0993 0.102 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 7.92e-01 0.0133 0.0502 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 7.11e-01 0.0267 0.0719 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0455 0.088 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 4.70e-02 0.199 0.0995 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 6.04e-02 -0.141 0.0746 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 2.73e-02 0.173 0.078 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 466687 sc-eQTL 1.97e-01 0.147 0.113 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 6.99e-01 0.0449 0.116 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 8574 sc-eQTL 5.89e-01 0.0571 0.105 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0717 0.0911 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0598 0.0736 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0413 0.0949 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 4.70e-01 0.0811 0.112 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0624 0.0959 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 3.60e-03 -0.241 0.0818 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0738 0.0683 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0119 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0895 0.0913 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 3.09e-01 -0.113 0.11 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0842 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0526 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 4.39e-06 -0.412 0.0873 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 8.74e-01 0.0126 0.0792 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 86039 sc-eQTL 9.33e-02 0.166 0.0986 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 509212 sc-eQTL 4.21e-01 0.078 0.0967 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0486 0.0663 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 926054 sc-eQTL 7.63e-01 0.0307 0.102 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 798387 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000618 0.0945 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 144010 sc-eQTL 1.16e-02 -0.192 0.0753 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 328579 sc-eQTL 8.33e-01 0.0217 0.103 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 85974 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0304 0.121 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 509212 eQTL 4.27e-05 -0.124 0.0302 0.0 0.0 0.197
ENSG00000111670 GNPTAB 375200 eQTL 4.35e-02 -0.0339 0.0168 0.0 0.0 0.197
ENSG00000120860 WASHC3 144010 pQTL 1.83e-05 -0.0479 0.0111 0.0 0.0 0.189
ENSG00000120860 WASHC3 144010 eQTL 7.85e-29 -0.162 0.0141 0.01 0.00999 0.197

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 509212 5.14e-07 3.12e-07 9.16e-08 3.56e-07 1.07e-07 1.54e-07 4.09e-07 8.37e-08 2.6e-07 1.65e-07 3.21e-07 2.28e-07 4.34e-07 9.18e-08 1.27e-07 1.46e-07 1.17e-07 2.93e-07 1.27e-07 7.4e-08 1.68e-07 2.45e-07 2.56e-07 7.22e-08 3.98e-07 2.07e-07 1.85e-07 1.69e-07 2.13e-07 2.75e-07 1.93e-07 8.48e-08 5.73e-08 1.23e-07 1.69e-07 6.94e-08 8.87e-08 7.53e-08 4.17e-08 7.89e-08 3.43e-08 2.65e-07 2.84e-08 1.76e-08 8.59e-08 9.12e-09 9.52e-08 1.13e-08 5.13e-08
ENSG00000120860 WASHC3 144010 4.26e-06 4.86e-06 8.35e-07 2.84e-06 1.33e-06 1.57e-06 4.29e-06 9.79e-07 5.06e-06 2.44e-06 5.19e-06 3.54e-06 7.5e-06 2.33e-06 1.35e-06 3.32e-06 2.05e-06 3.32e-06 1.48e-06 1.02e-06 3e-06 4.63e-06 3.72e-06 1.62e-06 5.44e-06 1.65e-06 2.49e-06 1.73e-06 4.26e-06 4.04e-06 2.75e-06 5.58e-07 5.87e-07 1.86e-06 2.09e-06 9.86e-07 9.37e-07 4.08e-07 9.23e-07 4.27e-07 4.41e-07 5.54e-06 4.01e-07 1.55e-07 4.39e-07 5.17e-07 9.64e-07 5.36e-07 4.38e-07
ENSG00000136048 \N 328579 1.26e-06 9.3e-07 3.2e-07 7e-07 1.87e-07 4.67e-07 1.18e-06 3.25e-07 1.14e-06 3.82e-07 1.35e-06 5.97e-07 1.65e-06 2.72e-07 4.35e-07 6.94e-07 8.11e-07 5.8e-07 5.29e-07 4.95e-07 4.39e-07 1.04e-06 7.96e-07 5.39e-07 1.92e-06 3.28e-07 6.7e-07 5.67e-07 1.01e-06 1.08e-06 5.62e-07 1.54e-07 2.33e-07 4.29e-07 3.98e-07 4.69e-07 4.74e-07 2.03e-07 3.5e-07 8.82e-08 2.58e-07 1.3e-06 9.55e-08 4.18e-08 1.82e-07 7.77e-08 2.08e-07 6.95e-08 1.7e-07