logo

Genes within 1Mb (chr12:102199966:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0307 0.0496 0.156 B L1
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 5.92e-01 0.0464 0.0864 0.156 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 4.43e-02 -0.105 0.052 0.156 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00976 0.076 0.156 B L1
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 9.17e-01 0.00904 0.0864 0.156 B L1
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 1.70e-01 0.102 0.074 0.156 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 8.95e-02 0.101 0.0591 0.156 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0566 0.0673 0.156 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 460494 sc-eQTL 1.42e-01 -0.157 0.107 0.156 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 6.26e-01 0.05 0.103 0.156 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 1.92e-02 0.223 0.0945 0.156 B L1
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 1.61e-01 -0.111 0.0791 0.156 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 3.01e-01 -0.111 0.107 0.156 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 8.69e-02 0.127 0.0739 0.156 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 3.70e-01 0.0738 0.0822 0.156 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0264 0.0805 0.156 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 4.58e-04 0.195 0.0547 0.156 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0105 0.101 0.156 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0191 0.11 0.156 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0131 0.072 0.156 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 7.00e-02 -0.164 0.0902 0.156 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0476 0.1 0.156 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 7.50e-01 0.0227 0.0712 0.156 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 3.35e-01 0.0984 0.102 0.156 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 5.99e-02 0.205 0.108 0.162 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 2.74e-01 0.109 0.0996 0.162 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 1.44e-01 -0.16 0.109 0.162 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 8.11e-01 0.0281 0.118 0.162 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0948 0.122 0.162 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 8.44e-01 0.0206 0.105 0.162 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 1.03e-01 0.141 0.086 0.162 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 4.77e-01 0.0813 0.114 0.162 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 1.21e-01 -0.145 0.0928 0.156 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0271 0.079 0.156 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 1.43e-01 -0.145 0.0986 0.156 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 3.34e-01 0.107 0.11 0.156 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 7.01e-01 0.0391 0.102 0.156 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 1.50e-02 0.216 0.0883 0.156 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 8.70e-02 0.125 0.0724 0.156 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 1.51e-02 -0.247 0.101 0.157 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 1.27e-01 -0.145 0.0945 0.157 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 3.21e-01 0.0683 0.0687 0.157 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 1.15e-01 0.174 0.11 0.157 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0311 0.102 0.157 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 3.66e-03 0.221 0.0752 0.157 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 5.07e-01 0.0725 0.109 0.157 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0378 0.128 0.157 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0162 0.0388 0.156 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 9.46e-02 -0.123 0.0735 0.156 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 5.02e-01 0.0726 0.108 0.156 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 2.87e-01 0.083 0.0778 0.156 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 1.05e-01 -0.197 0.121 0.156 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 7.72e-01 0.0257 0.0888 0.156 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 1.81e-03 0.244 0.0771 0.156 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 4.07e-02 0.193 0.0937 0.156 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0697 0.0787 0.156 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 4.13e-03 0.261 0.0899 0.156 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 7.37e-01 -0.00828 0.0246 0.158 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0572 0.128 0.158 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 2.47e-01 -0.109 0.0941 0.158 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0105 0.134 0.158 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 3.24e-01 0.128 0.129 0.158 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0634 0.134 0.158 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 3.89e-03 0.365 0.125 0.158 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00252 0.128 0.158 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 460494 sc-eQTL 3.40e-01 0.101 0.105 0.158 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0672 0.106 0.158 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 3.83e-02 0.206 0.0985 0.158 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 6.56e-01 0.022 0.0494 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 2.36e-01 0.146 0.123 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0294 0.066 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 7.45e-01 0.0317 0.0976 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 2.06e-01 -0.137 0.108 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 8.05e-01 0.0302 0.122 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00837 0.101 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 3.11e-01 0.11 0.108 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 460494 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0831 0.114 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 1.65e-01 0.166 0.119 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 6.68e-02 0.209 0.114 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0476 0.045 0.155 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 3.01e-01 0.123 0.119 0.155 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 1.40e-01 -0.115 0.0774 0.155 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 6.00e-01 0.056 0.106 0.155 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00902 0.117 0.155 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 4.55e-01 0.087 0.116 0.155 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 2.60e-01 -0.117 0.104 0.155 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0171 0.109 0.155 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 460494 sc-eQTL 8.49e-01 0.0214 0.112 0.155 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 4.58e-01 0.0854 0.115 0.155 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 1.06e-01 0.169 0.104 0.155 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00677 0.064 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0562 0.116 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0642 0.0601 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 6.99e-01 -0.033 0.0852 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0259 0.101 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 9.64e-01 0.00512 0.113 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 4.28e-01 0.0677 0.0853 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0288 0.0926 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 460494 sc-eQTL 2.05e-02 -0.29 0.124 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 8.09e-01 0.0296 0.122 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 1.18e-02 0.287 0.113 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 8.78e-01 -0.00868 0.0563 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 4.56e-01 0.0861 0.115 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 6.56e-02 -0.113 0.0613 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0998 0.0955 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 5.25e-01 0.0705 0.111 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 7.36e-02 0.217 0.121 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 7.35e-01 0.036 0.106 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 1.59e-01 -0.148 0.105 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 460494 sc-eQTL 3.46e-01 0.104 0.11 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 5.49e-01 0.0766 0.127 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 6.71e-01 0.0468 0.11 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 2.10e-02 -0.282 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 8.57e-01 0.0221 0.123 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0127 0.108 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 6.68e-01 0.0508 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 7.09e-01 0.0469 0.125 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0593 0.12 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0752 0.0917 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0871 0.106 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 6.51e-02 0.15 0.081 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 6.98e-01 0.0346 0.0889 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0596 0.0963 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 3.43e-03 0.195 0.066 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0768 0.0958 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0738 0.111 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 6.43e-01 0.0398 0.0856 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 3.98e-01 0.0907 0.107 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 8.26e-01 -0.022 0.1 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 2.23e-04 0.239 0.0637 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 5.38e-01 0.0712 0.115 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0614 0.111 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00638 0.107 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 6.78e-01 0.0481 0.116 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0624 0.109 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 3.88e-01 0.0846 0.0978 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 5.71e-01 0.0618 0.109 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 5.01e-01 0.0753 0.112 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 9.01e-01 0.0111 0.0894 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0105 0.121 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 8.81e-01 0.018 0.12 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 1.81e-01 -0.136 0.102 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 4.76e-01 0.0904 0.127 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0126 0.111 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0657 0.11 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 6.51e-01 0.0448 0.0989 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 1.87e-01 -0.139 0.105 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 9.01e-02 -0.193 0.113 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 5.09e-01 0.0497 0.0751 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 9.59e-01 0.00601 0.116 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 2.55e-01 -0.14 0.122 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0214 0.11 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 2.36e-01 0.135 0.114 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 7.48e-01 0.0399 0.124 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0279 0.122 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0858 0.109 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 4.63e-01 0.0876 0.119 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00717 0.118 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 4.00e-01 0.0937 0.111 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 1.18e-01 0.186 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 2.47e-01 -0.148 0.128 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 8.64e-01 -0.021 0.122 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0874 0.107 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 9.57e-02 0.196 0.117 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 6.38e-01 0.02 0.0423 0.158 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 1.64e-01 -0.165 0.118 0.158 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 8.00e-01 0.0294 0.116 0.158 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 5.74e-02 0.194 0.102 0.158 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 1.47e-02 -0.298 0.121 0.158 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0505 0.125 0.158 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 1.82e-01 0.139 0.104 0.158 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 1.86e-01 0.156 0.118 0.158 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 3.32e-01 -0.112 0.116 0.158 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 2.35e-02 0.231 0.101 0.158 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 1.18e-01 0.2 0.127 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 2.04e-01 -0.118 0.0924 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 1.54e-01 0.153 0.107 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 2.36e-01 0.148 0.125 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0166 0.122 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 8.88e-02 0.188 0.11 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 9.73e-01 0.00396 0.116 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 2.84e-01 -0.132 0.123 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 6.66e-03 -0.304 0.111 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 7.38e-02 -0.197 0.11 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 2.56e-01 0.0947 0.0832 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 3.51e-01 0.108 0.116 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0288 0.112 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 2.02e-01 0.122 0.0956 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 1.11e-01 0.185 0.116 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 7.73e-01 -0.038 0.131 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 1.01e-01 -0.194 0.118 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0442 0.121 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0652 0.0975 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 4.89e-01 0.0883 0.127 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 1.43e-01 -0.191 0.13 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 3.76e-01 0.107 0.121 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 4.47e-01 0.0947 0.124 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 2.73e-02 0.269 0.121 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 9.02e-02 -0.193 0.113 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0326 0.107 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 1.15e-01 0.127 0.0804 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 1.76e-01 0.153 0.112 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 4.38e-01 0.0881 0.113 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 3.69e-02 0.186 0.0885 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0328 0.116 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0994 0.126 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0274 0.0893 0.163 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 2.37e-01 -0.142 0.12 0.163 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0308 0.0933 0.163 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 3.85e-01 0.117 0.134 0.163 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 9.96e-02 -0.253 0.152 0.163 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 7.33e-01 0.0324 0.0946 0.163 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 1.70e-01 0.15 0.108 0.163 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 6.74e-01 0.0467 0.111 0.163 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 460494 sc-eQTL 2.40e-01 -0.151 0.128 0.163 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 7.86e-01 0.032 0.118 0.163 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 9.99e-01 9.4e-05 0.109 0.163 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 1.61e-01 0.0587 0.0417 0.159 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0155 0.0845 0.159 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0065 0.112 0.159 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 7.48e-01 0.0266 0.0829 0.159 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0549 0.118 0.159 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0159 0.0895 0.159 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 2.40e-01 0.114 0.097 0.159 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 1.63e-01 0.116 0.083 0.159 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000547 0.0773 0.159 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 7.91e-02 0.148 0.0839 0.159 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 9.67e-01 0.00495 0.119 0.156 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 2.56e-01 -0.141 0.124 0.156 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 2.67e-01 0.12 0.108 0.156 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 9.38e-01 0.00915 0.118 0.156 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 5.42e-01 0.0747 0.122 0.156 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 4.08e-01 0.0822 0.0992 0.156 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 9.20e-01 0.0111 0.11 0.159 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 5.44e-01 0.0655 0.108 0.159 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 6.97e-04 -0.465 0.135 0.159 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 2.89e-01 0.134 0.126 0.159 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0875 0.13 0.159 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 1.77e-01 0.165 0.122 0.159 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0627 0.0955 0.159 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 5.49e-01 0.0653 0.109 0.159 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 1.75e-01 -0.143 0.105 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0465 0.0796 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0378 0.106 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 3.64e-02 0.248 0.118 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0386 0.106 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 1.67e-01 0.127 0.0914 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 1.82e-01 0.104 0.0779 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0349 0.116 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0475 0.0889 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 1.69e-01 -0.148 0.108 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0625 0.127 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 2.64e-01 0.133 0.119 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 1.58e-01 0.155 0.11 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 4.75e-02 0.169 0.085 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 3.15e-01 -0.15 0.149 0.164 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 7.16e-01 0.0511 0.14 0.164 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 8.28e-02 0.183 0.105 0.164 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0617 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 2.87e-01 -0.156 0.146 0.164 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00054 0.136 0.164 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 8.03e-01 0.0346 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0688 0.136 0.164 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 1.15e-04 0.469 0.118 0.164 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0065 0.118 0.156 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0723 0.108 0.156 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 1.69e-01 -0.175 0.127 0.156 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 4.55e-01 -0.089 0.119 0.156 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 1.81e-02 -0.29 0.122 0.156 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 2.12e-01 0.149 0.119 0.156 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 5.08e-01 -0.069 0.104 0.156 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0166 0.118 0.154 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 9.08e-02 0.183 0.108 0.154 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 6.64e-01 0.0566 0.13 0.154 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0699 0.114 0.154 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 1.41e-02 0.267 0.108 0.154 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 2.02e-01 0.134 0.105 0.154 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0296 0.0978 0.154 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 2.76e-01 0.148 0.135 0.164 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 3.54e-01 0.11 0.118 0.164 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 5.75e-01 0.0701 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0623 0.124 0.164 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 8.19e-01 0.0301 0.131 0.164 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 9.77e-01 0.00335 0.114 0.164 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 6.91e-02 0.16 0.0874 0.164 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 5.67e-01 0.0672 0.117 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0151 0.0575 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 7.12e-01 0.0427 0.115 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0531 0.0607 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 5.86e-01 0.052 0.0954 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0216 0.0983 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 6.69e-01 0.0476 0.111 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0526 0.083 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 4.14e-01 0.0812 0.0993 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 460494 sc-eQTL 7.54e-01 -0.036 0.115 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 5.07e-01 0.0796 0.12 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 1.42e-02 0.29 0.117 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -281778 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0545 0.0681 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 8.49e-01 0.0213 0.112 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 1.41e-01 -0.081 0.0548 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0908 0.0786 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 7.71e-01 0.0281 0.0965 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 5.37e-01 0.068 0.11 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 2.03e-01 0.105 0.0822 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 2.24e-01 -0.105 0.0862 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 460494 sc-eQTL 3.44e-01 -0.118 0.125 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 7.85e-01 0.0348 0.127 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR 2381 sc-eQTL 2.44e-01 0.135 0.115 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0883 0.0975 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0734 0.0788 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 2.80e-01 -0.11 0.101 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 1.11e-01 0.191 0.119 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 8.00e-01 0.0261 0.103 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 1.26e-01 0.137 0.089 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 5.37e-02 0.141 0.0727 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0326 0.115 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 6.85e-01 0.0408 0.1 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 2.69e-01 -0.134 0.121 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0812 0.117 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0265 0.116 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 5.39e-02 0.194 0.0999 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 5.35e-01 -0.054 0.0869 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 79846 sc-eQTL 1.15e-04 -0.409 0.104 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 503019 sc-eQTL 1.25e-01 -0.161 0.105 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 369007 sc-eQTL 3.52e-01 0.067 0.0718 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 919861 sc-eQTL 1.79e-01 0.148 0.11 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 792194 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00927 0.102 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 137817 sc-eQTL 1.89e-02 0.194 0.0819 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 322386 sc-eQTL 4.07e-01 0.0926 0.111 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 79781 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0108 0.131 0.153 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000017427 IGF1 -281778 eQTL 0.0028 0.0845 0.0282 0.0 0.0 0.15
ENSG00000075188 NUP37 79846 eQTL 0.00348 -0.0675 0.023 0.0 0.0 0.15
ENSG00000120860 WASHC3 137817 pQTL 0.023 0.0271 0.0119 0.0 0.0 0.156
ENSG00000120860 WASHC3 137817 eQTL 3.9e-10 0.103 0.0163 0.0 0.0 0.15
ENSG00000185480 PARPBP 79781 eQTL 0.00392 -0.0874 0.0302 0.0 0.0 0.15

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 IGF1 -281778 1.38e-06 1.29e-06 2.16e-07 1.27e-06 4.41e-07 6.28e-07 1.52e-06 3.77e-07 1.73e-06 7.15e-07 2.07e-06 1.13e-06 2.66e-06 4.19e-07 3.96e-07 1.02e-06 9.8e-07 1.05e-06 5.9e-07 5.49e-07 6.34e-07 1.98e-06 1.1e-06 6.2e-07 2.33e-06 8.08e-07 9.86e-07 1.1e-06 1.6e-06 1.2e-06 8.35e-07 2.62e-07 3.44e-07 5.72e-07 6.99e-07 5.31e-07 7.14e-07 3.43e-07 4.58e-07 2.09e-07 2.74e-07 1.73e-06 3.51e-07 1.25e-07 3.83e-07 3.44e-07 3.2e-07 1.43e-07 2.79e-07
ENSG00000075188 NUP37 79846 7.83e-06 9.25e-06 1.23e-06 5.05e-06 2.39e-06 3.88e-06 1.01e-05 2.09e-06 8.81e-06 5.04e-06 1.19e-05 5.14e-06 1.29e-05 3.84e-06 2.54e-06 6.33e-06 3.75e-06 6.22e-06 2.64e-06 2.85e-06 5.71e-06 8.99e-06 6.92e-06 3.38e-06 1.31e-05 3.98e-06 5.24e-06 4.45e-06 8.8e-06 7.71e-06 5.07e-06 9.99e-07 1.17e-06 3.24e-06 4.27e-06 2.56e-06 1.85e-06 1.95e-06 1.6e-06 1.02e-06 1.08e-06 1.14e-05 1.48e-06 2.52e-07 7.68e-07 1.67e-06 1.82e-06 6.92e-07 4.9e-07
ENSG00000120860 WASHC3 137817 4.74e-06 4.86e-06 6.91e-07 3.1e-06 1.63e-06 1.69e-06 4.58e-06 1.18e-06 5.07e-06 2.65e-06 5.78e-06 3.32e-06 7.12e-06 1.94e-06 1.27e-06 3.81e-06 1.78e-06 3.55e-06 1.5e-06 1.39e-06 2.71e-06 4.89e-06 4.04e-06 1.53e-06 7.21e-06 2.01e-06 2.25e-06 1.74e-06 4.36e-06 4.04e-06 2.85e-06 4.03e-07 6.5e-07 1.6e-06 2.05e-06 1.18e-06 1.02e-06 4.71e-07 9.45e-07 5.64e-07 8.27e-07 5.71e-06 4.91e-07 1.49e-07 7.87e-07 1.07e-06 1.15e-06 7.21e-07 5.14e-07