logo

Genes within 1Mb (chr12:102194697:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 2.80e-01 0.0501 0.0462 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 2.59e-01 0.091 0.0804 0.199 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 7.21e-01 0.0175 0.049 0.199 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 5.67e-01 0.0407 0.0708 0.199 B L1
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 7.52e-01 0.0255 0.0806 0.199 B L1
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 5.04e-01 0.0463 0.0692 0.199 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 1.54e-03 -0.174 0.0542 0.199 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 2.41e-02 0.141 0.0622 0.199 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 455225 sc-eQTL 3.73e-01 0.0891 0.0998 0.199 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 3.36e-01 0.0921 0.0955 0.199 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 2.45e-01 0.104 0.089 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00688 0.075 0.199 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0485 0.101 0.199 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 6.91e-01 0.0279 0.0701 0.199 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0411 0.0776 0.199 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000343 0.0759 0.199 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 5.38e-09 -0.298 0.049 0.199 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0598 0.0914 0.199 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0977 0.0989 0.199 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 3.17e-01 -0.065 0.0649 0.199 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0426 0.0821 0.199 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 2.51e-01 0.104 0.0903 0.199 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 3.04e-04 -0.229 0.0624 0.199 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 3.80e-01 0.0809 0.0921 0.199 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0262 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 7.52e-01 0.0302 0.0953 0.198 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 5.11e-01 -0.069 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 1.50e-01 -0.161 0.112 0.198 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 3.18e-01 0.116 0.116 0.198 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0492 0.1 0.198 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 5.74e-01 0.0465 0.0826 0.198 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 4.66e-01 0.0795 0.109 0.198 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0755 0.0872 0.199 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0589 0.0738 0.199 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0395 0.0926 0.199 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 8.44e-01 0.0203 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 2.45e-01 -0.11 0.0948 0.199 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 1.64e-05 -0.353 0.0801 0.199 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0212 0.0682 0.199 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 8.27e-01 0.0204 0.0931 0.197 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 5.21e-01 0.0555 0.0863 0.197 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0463 0.0626 0.197 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 9.42e-01 0.00729 0.101 0.197 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0865 0.0925 0.197 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 4.70e-04 -0.241 0.0678 0.197 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 4.15e-01 0.0811 0.0992 0.197 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 7.69e-01 0.0342 0.117 0.197 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 3.58e-01 0.0325 0.0353 0.199 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 1.16e-01 0.106 0.067 0.199 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0819 0.0983 0.199 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0815 0.0708 0.199 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 7.60e-01 0.034 0.111 0.199 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 8.51e-01 0.0152 0.0809 0.199 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 6.25e-03 -0.195 0.0706 0.199 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00561 0.0862 0.199 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 3.03e-01 0.074 0.0717 0.199 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0922 0.0833 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0337 0.0222 0.202 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 3.92e-01 0.0993 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 2.76e-01 0.0934 0.0855 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 6.46e-01 0.0561 0.122 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00831 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 1.33e-01 0.182 0.121 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 3.93e-02 -0.238 0.115 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 2.71e-01 0.128 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 455225 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0284 0.0957 0.202 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0405 0.0963 0.202 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 8.94e-01 0.0121 0.0905 0.202 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000827 0.0466 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0719 0.116 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0847 0.062 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0651 0.0919 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 1.32e-01 0.154 0.102 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.115 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 2.36e-02 -0.214 0.0939 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 2.87e-01 0.109 0.102 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 455225 sc-eQTL 7.90e-01 0.0286 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 3.39e-01 -0.108 0.112 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 1.86e-01 0.143 0.108 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 7.79e-01 0.0121 0.0432 0.2 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 7.42e-01 0.0376 0.114 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0297 0.0745 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 7.17e-01 -0.037 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0671 0.112 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0509 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 7.08e-02 -0.18 0.0989 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0171 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 455225 sc-eQTL 8.65e-02 -0.184 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0493 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 3.48e-01 -0.094 0.1 0.2 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 8.60e-02 -0.1 0.0581 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 5.33e-01 0.0662 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 1.98e-01 0.0708 0.0548 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 5.47e-01 -0.047 0.0778 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0609 0.0924 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 1.61e-02 0.247 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 8.64e-03 -0.204 0.0768 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 4.54e-01 0.0634 0.0845 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 455225 sc-eQTL 3.22e-02 0.245 0.114 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 7.58e-01 0.0345 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 3.26e-01 -0.103 0.105 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 2.00e-02 -0.119 0.0509 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 4.63e-01 0.0777 0.106 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0346 0.0565 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 5.10e-01 0.0577 0.0876 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 7.49e-01 0.0326 0.102 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0797 0.111 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 9.31e-01 0.00843 0.0972 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 5.87e-03 0.263 0.0945 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 455225 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0663 0.101 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0678 0.117 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 3.01e-01 0.104 0.1 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 3.43e-01 0.111 0.117 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0332 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 7.96e-01 0.0266 0.103 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0189 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0788 0.12 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 9.24e-01 0.011 0.115 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0655 0.0869 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0571 0.1 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 8.58e-01 0.0139 0.0774 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00351 0.0843 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 9.66e-01 0.00385 0.0914 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 2.30e-06 -0.294 0.0605 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 1.15e-01 0.14 0.0885 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0794 0.103 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 1.16e-01 0.125 0.079 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0147 0.0994 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0402 0.093 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 1.41e-05 -0.26 0.0584 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0696 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 1.62e-01 -0.143 0.102 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 7.49e-01 0.0316 0.0986 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0629 0.107 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 9.93e-01 0.000859 0.101 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 1.22e-01 -0.139 0.0898 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 6.82e-01 0.0399 0.0973 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00903 0.0998 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 9.22e-01 0.00782 0.0798 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0653 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 5.32e-01 0.0668 0.107 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0907 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 4.17e-01 0.092 0.113 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 9.27e-01 0.00953 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 1.45e-01 -0.15 0.103 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 6.79e-01 0.0385 0.0929 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 8.66e-01 0.0166 0.0988 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 8.19e-01 0.0246 0.107 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 7.50e-04 -0.235 0.0688 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0443 0.109 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 6.59e-01 0.0493 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 6.31e-01 -0.048 0.0998 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0865 0.103 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0388 0.113 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 4.43e-01 0.0851 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 9.34e-01 0.00817 0.0992 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 8.54e-01 0.0199 0.108 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0893 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0482 0.103 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 2.56e-03 -0.329 0.108 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 8.86e-01 -0.017 0.118 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 7.63e-01 0.0341 0.113 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 6.37e-01 0.0466 0.0988 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0106 0.039 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00998 0.11 0.201 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 7.49e-02 -0.19 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 9.48e-01 0.00616 0.0946 0.201 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0677 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 5.17e-01 -0.075 0.116 0.201 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 5.00e-02 -0.188 0.0953 0.201 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 6.04e-01 0.0566 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 2.96e-01 0.112 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 2.60e-01 -0.107 0.0944 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 1.18e-01 -0.183 0.116 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0558 0.0847 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 6.07e-01 0.0504 0.0979 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0538 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 3.06e-02 -0.24 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 3.82e-02 -0.208 0.0999 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 4.14e-01 0.0868 0.106 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 6.10e-01 0.0573 0.112 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 3.78e-02 0.214 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 2.28e-01 0.122 0.101 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 9.35e-02 -0.128 0.0758 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 7.22e-01 0.0377 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 7.78e-01 0.029 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 8.31e-03 -0.23 0.0863 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 2.74e-01 0.117 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00147 0.12 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 1.79e-01 0.142 0.106 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0682 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0653 0.0873 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 3.21e-01 -0.113 0.114 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 1.17e-01 0.183 0.116 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00582 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 2.15e-01 -0.138 0.111 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00453 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0118 0.104 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0221 0.0972 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 6.05e-01 0.0383 0.0738 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0467 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 1.32e-01 -0.156 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 4.27e-03 -0.231 0.08 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 7.65e-01 0.0318 0.106 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 5.42e-01 -0.07 0.115 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 9.57e-01 0.00457 0.0851 0.178 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 2.53e-01 0.131 0.114 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 2.77e-01 0.0965 0.0884 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 5.58e-01 0.075 0.128 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0883 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 2.08e-01 -0.114 0.0896 0.178 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 4.86e-02 -0.204 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 4.11e-01 0.087 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 455225 sc-eQTL 1.76e-01 0.166 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 2.11e-01 0.14 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 4.83e-01 0.073 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0112 0.0383 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 4.86e-01 0.0539 0.0772 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 9.06e-01 0.0121 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 7.95e-01 0.0197 0.0757 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 5.70e-01 0.0615 0.108 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00391 0.0818 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 2.27e-02 -0.202 0.0878 0.198 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 5.73e-01 0.043 0.0762 0.198 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 1.65e-02 0.168 0.0697 0.198 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 6.91e-01 0.0308 0.0772 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 8.23e-01 0.0244 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0559 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0954 0.099 0.199 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0534 0.108 0.199 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 6.55e-01 -0.05 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0905 0.199 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 8.85e-01 0.0153 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 7.77e-01 0.0291 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 6.64e-01 0.0577 0.132 0.202 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 3.57e-01 -0.111 0.12 0.202 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0703 0.124 0.202 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 1.20e-01 -0.181 0.116 0.202 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 3.38e-01 0.0873 0.0909 0.202 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 9.12e-02 0.175 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 9.62e-01 0.00474 0.0993 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0375 0.0748 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0635 0.0992 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0717 0.112 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0739 0.1 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 3.75e-02 -0.179 0.0854 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0581 0.0735 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0902 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0382 0.0817 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 7.75e-01 0.0285 0.0993 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 1.40e-01 0.172 0.116 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0536 0.109 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 2.19e-03 -0.307 0.0989 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0303 0.0788 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 6.10e-01 0.0687 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 4.36e-01 0.0984 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 1.84e-02 -0.222 0.0932 0.209 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0272 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 4.46e-01 0.1 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 2.10e-01 -0.154 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 8.14e-01 0.0295 0.125 0.209 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 1.01e-01 -0.2 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0238 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 6.83e-01 0.0401 0.0982 0.202 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0758 0.115 0.202 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0201 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0246 0.112 0.202 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 4.61e-05 -0.432 0.104 0.202 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 5.24e-01 0.0603 0.0943 0.202 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 8.49e-01 0.0206 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 2.34e-01 -0.118 0.0991 0.195 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 9.05e-01 0.0142 0.119 0.195 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 1.46e-01 -0.151 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0992 0.0998 0.195 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 5.28e-04 -0.329 0.0934 0.195 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0296 0.0896 0.195 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0309 0.128 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 1.97e-01 -0.144 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 8.70e-02 -0.201 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0573 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 1.34e-01 0.185 0.123 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0601 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0596 0.0832 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 5.55e-01 0.0653 0.111 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 6.25e-01 0.0265 0.054 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0138 0.109 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 3.02e-01 -0.059 0.057 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0274 0.0898 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 3.29e-01 0.0902 0.0923 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 6.99e-01 0.0404 0.105 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 1.57e-03 -0.244 0.0763 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 5.06e-01 0.0623 0.0934 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 455225 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0811 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0601 0.113 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 2.89e-01 0.118 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -287047 sc-eQTL 2.48e-02 -0.139 0.0615 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 3.29e-01 0.0993 0.102 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 7.92e-01 0.0133 0.0502 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 7.11e-01 0.0267 0.0719 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0455 0.088 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 4.70e-02 0.199 0.0995 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 6.04e-02 -0.141 0.0746 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 2.73e-02 0.173 0.078 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 455225 sc-eQTL 1.97e-01 0.147 0.113 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 6.99e-01 0.0449 0.116 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -2888 sc-eQTL 5.89e-01 0.0571 0.105 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0717 0.0911 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0598 0.0736 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0413 0.0949 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 4.70e-01 0.0811 0.112 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0624 0.0959 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 3.60e-03 -0.241 0.0818 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0738 0.0683 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0119 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0895 0.0913 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 3.09e-01 -0.113 0.11 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0842 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0526 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 4.39e-06 -0.412 0.0873 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 8.74e-01 0.0126 0.0792 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 74577 sc-eQTL 9.33e-02 0.166 0.0986 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 497750 sc-eQTL 4.21e-01 0.078 0.0967 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0486 0.0663 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 914592 sc-eQTL 7.63e-01 0.0307 0.102 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 786925 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000618 0.0945 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 132548 sc-eQTL 1.16e-02 -0.192 0.0753 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 317117 sc-eQTL 8.33e-01 0.0217 0.103 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 74512 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0304 0.121 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 497750 eQTL 4.31e-05 -0.124 0.0301 0.0 0.0 0.197
ENSG00000111670 GNPTAB 363738 eQTL 4.29e-02 -0.0339 0.0167 0.0 0.0 0.197
ENSG00000120860 WASHC3 132548 pQTL 1.87e-05 -0.0477 0.0111 0.0 0.0 0.189
ENSG00000120860 WASHC3 132548 eQTL 8.5e-29 -0.162 0.0141 0.00965 0.00962 0.197

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 497750 8.15e-07 4e-07 1.03e-07 3.48e-07 1.06e-07 1.74e-07 5.01e-07 1.11e-07 3.62e-07 2.16e-07 4.97e-07 3.36e-07 6.47e-07 1.07e-07 1.68e-07 2e-07 1.85e-07 3.58e-07 1.7e-07 1.28e-07 1.89e-07 3.34e-07 3.07e-07 1.32e-07 6.02e-07 2.4e-07 2.52e-07 2.19e-07 3e-07 3.93e-07 2.55e-07 7.33e-08 5.6e-08 1.37e-07 2.7e-07 6.18e-08 1.1e-07 8.21e-08 6.29e-08 5.61e-08 9.91e-08 3.73e-07 2.71e-08 1.75e-08 1.25e-07 1.59e-08 8.24e-08 3.25e-09 5.05e-08
ENSG00000120860 WASHC3 132548 4.39e-06 4.05e-06 7.79e-07 2.27e-06 1.33e-06 1.19e-06 3.08e-06 1.01e-06 3.58e-06 1.99e-06 4.1e-06 2.94e-06 6.51e-06 1.4e-06 1.46e-06 2.67e-06 1.82e-06 2.7e-06 1.33e-06 9.5e-07 2.51e-06 4.1e-06 3.43e-06 1.38e-06 4.9e-06 1.43e-06 2.35e-06 1.57e-06 4.26e-06 3.44e-06 2.01e-06 5.26e-07 6.12e-07 1.79e-06 1.95e-06 9.43e-07 9.21e-07 4.93e-07 1.06e-06 3.98e-07 6.7e-07 4.65e-06 3.97e-07 1.8e-07 5.95e-07 5.87e-07 8.39e-07 3.34e-07 3.41e-07
ENSG00000136048 \N 317117 1.33e-06 9.44e-07 3.08e-07 6.75e-07 2.79e-07 4.57e-07 1.24e-06 3.49e-07 1.24e-06 4.24e-07 1.41e-06 6.03e-07 1.95e-06 2.59e-07 4.95e-07 7.95e-07 8.26e-07 5.82e-07 5.83e-07 6.8e-07 4.39e-07 1.22e-06 8.52e-07 6.37e-07 1.95e-06 3.91e-07 7.31e-07 7.22e-07 1.18e-06 1.12e-06 5.67e-07 1.56e-07 1.87e-07 6.19e-07 4.49e-07 4.41e-07 4.82e-07 1.7e-07 3.6e-07 1.54e-07 2.72e-07 1.53e-06 5.73e-08 2.71e-08 1.79e-07 1.17e-07 2.14e-07 7.75e-08 1.05e-07