logo

Genes within 1Mb (chr12:102186895:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 3.29e-01 0.0446 0.0456 0.201 B L1
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 2.38e-01 0.0937 0.0792 0.201 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 7.61e-01 0.0147 0.0483 0.201 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 6.63e-01 0.0305 0.0698 0.201 B L1
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 6.79e-01 0.0329 0.0794 0.201 B L1
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 5.13e-01 0.0447 0.0682 0.201 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 1.97e-03 -0.167 0.0534 0.201 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 2.27e-02 0.141 0.0612 0.201 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 447423 sc-eQTL 4.07e-01 0.0818 0.0983 0.201 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 3.02e-01 0.0974 0.0941 0.201 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 2.15e-01 0.109 0.0876 0.201 B L1
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00845 0.0739 0.201 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0473 0.0997 0.201 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 7.22e-01 0.0247 0.0691 0.201 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0236 0.0765 0.201 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00181 0.0748 0.201 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 1.26e-08 -0.287 0.0485 0.201 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0443 0.09 0.201 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0941 0.0974 0.201 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0721 0.0639 0.201 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0452 0.0808 0.201 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 2.56e-01 0.101 0.0889 0.201 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 4.08e-04 -0.221 0.0615 0.201 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 4.11e-01 0.0747 0.0906 0.201 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0141 0.103 0.2 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 8.24e-01 0.0209 0.0937 0.2 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0662 0.103 0.2 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 1.57e-01 -0.156 0.11 0.2 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 3.53e-01 0.106 0.114 0.2 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0508 0.0984 0.2 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 5.03e-01 0.0544 0.0812 0.2 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 3.68e-01 0.0965 0.107 0.2 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 3.05e-01 -0.088 0.0856 0.201 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0548 0.0726 0.201 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0345 0.0911 0.201 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 8.68e-01 0.0169 0.102 0.201 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 1.97e-01 -0.12 0.0932 0.201 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 2.36e-05 -0.341 0.0789 0.201 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 6.87e-01 -0.027 0.067 0.201 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 8.24e-01 0.0204 0.0915 0.2 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 4.36e-01 0.0663 0.0848 0.2 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0538 0.0615 0.2 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 8.08e-01 0.0242 0.0991 0.2 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0832 0.0909 0.2 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 4.75e-04 -0.237 0.0667 0.2 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 4.43e-01 0.075 0.0976 0.2 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 7.08e-01 0.043 0.115 0.2 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 3.76e-01 0.0308 0.0347 0.201 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 8.93e-02 0.112 0.0658 0.201 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0753 0.0967 0.201 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0745 0.0697 0.201 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 8.08e-01 0.0266 0.109 0.201 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 8.67e-01 0.0134 0.0795 0.201 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 7.06e-03 -0.189 0.0695 0.201 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 9.60e-01 0.00422 0.0848 0.201 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 3.79e-01 0.0622 0.0705 0.201 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 2.18e-01 -0.101 0.0819 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0319 0.0218 0.204 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 4.55e-01 0.0853 0.114 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 2.31e-01 0.101 0.0839 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 5.46e-01 0.0723 0.12 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0106 0.116 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 1.00e-01 0.196 0.119 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 2.05e-02 -0.262 0.112 0.204 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 2.76e-01 0.125 0.114 0.204 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 447423 sc-eQTL 7.66e-01 -0.028 0.0939 0.204 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 6.58e-01 -0.042 0.0945 0.204 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 9.32e-01 0.0076 0.0888 0.204 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0026 0.0458 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0555 0.114 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0851 0.061 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0553 0.0905 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 1.19e-01 0.157 0.1 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0172 0.113 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 2.37e-02 -0.211 0.0924 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 2.95e-01 0.105 0.1 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 447423 sc-eQTL 8.95e-01 0.0139 0.106 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 3.10e-01 -0.113 0.111 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 1.56e-01 0.15 0.106 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 7.61e-01 0.0129 0.0426 0.203 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 6.33e-01 0.0537 0.112 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0239 0.0734 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 6.76e-01 -0.042 0.1 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0691 0.11 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0502 0.11 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 4.72e-02 -0.194 0.0973 0.203 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0198 0.103 0.203 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 447423 sc-eQTL 7.56e-02 -0.188 0.105 0.203 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0486 0.108 0.203 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 3.16e-01 -0.099 0.0984 0.203 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 8.67e-02 -0.0985 0.0572 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 5.27e-01 0.066 0.104 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 2.01e-01 0.0693 0.054 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0617 0.0765 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0495 0.091 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 1.50e-02 0.246 0.1 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 8.15e-03 -0.202 0.0756 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 4.34e-01 0.0653 0.0832 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 447423 sc-eQTL 3.16e-02 0.242 0.112 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 6.90e-01 0.0441 0.11 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0838 0.103 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 2.07e-02 -0.117 0.0501 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 4.81e-01 0.0734 0.104 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0351 0.0557 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 5.49e-01 0.0518 0.0863 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 7.08e-01 0.0375 0.1 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0866 0.11 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 7.52e-01 0.0303 0.0957 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 6.17e-03 0.258 0.0931 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 447423 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0644 0.0997 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 6.39e-01 -0.054 0.115 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 3.11e-01 0.101 0.099 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 2.94e-01 0.121 0.115 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0272 0.115 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 8.06e-01 0.0248 0.101 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0129 0.111 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0439 0.118 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 9.04e-01 0.0136 0.113 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0618 0.0857 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0537 0.0988 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 8.57e-01 0.0138 0.0763 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 8.84e-01 0.0121 0.0831 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 9.91e-01 0.00104 0.09 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 4.59e-06 -0.281 0.0598 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 1.50e-01 0.126 0.0872 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 4.23e-01 -0.081 0.101 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 1.39e-01 0.116 0.0778 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0174 0.0979 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0495 0.0916 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 2.18e-05 -0.25 0.0576 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 3.59e-01 -0.096 0.105 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 1.44e-01 -0.147 0.1 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 8.40e-01 0.0196 0.097 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0549 0.105 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00828 0.0992 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 1.23e-01 -0.137 0.0884 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 5.30e-01 0.0601 0.0956 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00582 0.0981 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 9.91e-01 0.000852 0.0785 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0659 0.106 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 6.50e-01 0.0477 0.105 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 2.15e-01 -0.111 0.0892 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 5.07e-01 0.074 0.111 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 8.24e-01 0.0228 0.102 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 1.55e-01 -0.145 0.101 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 7.98e-01 0.0234 0.0914 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 9.12e-01 0.0107 0.0972 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 7.15e-01 0.0386 0.106 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 9.89e-04 -0.226 0.0678 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0288 0.107 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 7.57e-01 0.034 0.11 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0309 0.0983 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0872 0.102 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0347 0.111 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 5.98e-01 0.0575 0.109 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 9.09e-01 0.0111 0.0976 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 9.31e-01 0.00919 0.106 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 3.43e-01 -0.102 0.107 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0303 0.101 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 3.87e-03 -0.31 0.106 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0253 0.116 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 6.96e-01 0.0435 0.111 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 4.96e-01 0.0662 0.0971 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 3.00e-01 0.111 0.107 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0103 0.0384 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00337 0.108 0.203 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 8.83e-02 -0.179 0.104 0.203 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00196 0.0931 0.203 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 5.91e-01 -0.06 0.112 0.203 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0871 0.114 0.203 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 4.65e-02 -0.188 0.0937 0.203 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 5.23e-01 0.0686 0.107 0.203 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 3.57e-01 0.0968 0.105 0.203 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 2.32e-01 -0.111 0.0928 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 1.13e-01 -0.182 0.114 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0468 0.0832 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 7.11e-01 0.0357 0.0962 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0388 0.112 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 4.88e-02 -0.216 0.109 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 3.57e-02 -0.208 0.0982 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 4.24e-01 0.0836 0.104 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 7.08e-01 0.0413 0.11 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 3.02e-02 0.219 0.1 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 1.77e-01 0.134 0.0987 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 7.36e-02 -0.134 0.0744 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 6.08e-01 0.0535 0.104 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 8.86e-01 0.0145 0.101 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 8.57e-03 -0.225 0.0848 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 3.20e-01 0.104 0.104 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 9.94e-01 0.000891 0.118 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 2.46e-01 0.121 0.104 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0511 0.107 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0617 0.0859 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0991 0.112 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 1.39e-01 0.17 0.114 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00789 0.107 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 2.75e-01 -0.12 0.109 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 9.92e-01 0.00107 0.108 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0115 0.102 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0209 0.0955 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 6.97e-01 0.0283 0.0725 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0244 0.101 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 1.53e-01 -0.145 0.101 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 4.74e-03 -0.225 0.0787 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 8.58e-01 0.0187 0.104 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0514 0.113 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 9.57e-01 0.00457 0.0851 0.178 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 2.53e-01 0.131 0.114 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 2.77e-01 0.0965 0.0884 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 5.58e-01 0.075 0.128 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0883 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 2.08e-01 -0.114 0.0896 0.178 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 4.86e-02 -0.204 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 4.11e-01 0.087 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 447423 sc-eQTL 1.76e-01 0.166 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 2.11e-01 0.14 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 4.83e-01 0.073 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0112 0.0377 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 4.40e-01 0.0588 0.076 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00323 0.101 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 6.72e-01 0.0316 0.0746 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 6.96e-01 0.0416 0.107 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 9.70e-01 0.00306 0.0806 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 2.02e-02 -0.202 0.0865 0.2 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 6.36e-01 0.0356 0.0751 0.2 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 1.06e-02 0.177 0.0685 0.2 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 7.81e-01 0.0212 0.0761 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 8.11e-01 0.0258 0.108 0.201 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0466 0.112 0.201 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0935 0.0976 0.201 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0443 0.106 0.201 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0465 0.11 0.201 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 2.01e-01 -0.114 0.0891 0.201 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 7.30e-01 0.0357 0.103 0.205 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 8.48e-01 0.0193 0.101 0.205 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 6.37e-01 0.0614 0.13 0.205 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 2.97e-01 -0.123 0.118 0.205 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0819 0.122 0.205 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 1.14e-01 -0.181 0.114 0.205 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 2.74e-01 0.0978 0.0892 0.205 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 6.55e-02 0.187 0.101 0.205 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0131 0.0976 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0379 0.0735 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0663 0.0975 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0671 0.11 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0804 0.0982 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 4.49e-02 -0.169 0.084 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0621 0.0722 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0927 0.105 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0264 0.0804 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 6.94e-01 0.0385 0.0977 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 1.43e-01 0.168 0.114 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0512 0.108 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 2.27e-03 -0.301 0.0973 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 5.89e-01 -0.042 0.0775 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 5.68e-01 0.0754 0.132 0.212 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 3.90e-01 0.106 0.123 0.212 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 2.35e-02 -0.209 0.0913 0.212 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0384 0.123 0.212 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 4.26e-01 0.103 0.129 0.212 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 2.40e-01 -0.141 0.12 0.212 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 7.61e-01 0.0372 0.122 0.212 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 8.74e-02 -0.204 0.119 0.212 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 9.20e-02 -0.184 0.109 0.212 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0277 0.106 0.204 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 7.36e-01 0.0327 0.0966 0.204 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0576 0.113 0.204 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0441 0.106 0.204 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0399 0.11 0.204 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 6.14e-05 -0.418 0.102 0.204 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 4.95e-01 0.0635 0.0928 0.204 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 8.76e-01 0.0165 0.106 0.197 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 2.43e-01 -0.114 0.0975 0.197 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 9.18e-01 0.0121 0.117 0.197 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 1.77e-01 -0.138 0.102 0.197 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 3.03e-01 -0.101 0.0982 0.197 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 9.90e-04 -0.308 0.0921 0.197 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0286 0.0882 0.197 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0462 0.125 0.198 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 1.82e-01 -0.145 0.108 0.198 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 7.15e-02 -0.207 0.114 0.198 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0361 0.115 0.198 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 1.26e-01 0.184 0.12 0.198 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0596 0.105 0.198 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0619 0.0813 0.198 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 4.68e-01 0.0785 0.108 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 6.26e-01 0.026 0.0532 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 9.70e-01 0.00401 0.107 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0575 0.0561 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0236 0.0884 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 3.16e-01 0.0913 0.0908 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 6.85e-01 0.0418 0.103 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 1.02e-03 -0.25 0.075 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 5.01e-01 0.062 0.092 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 447423 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0962 0.106 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0683 0.111 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 2.56e-01 0.125 0.11 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -294849 sc-eQTL 2.57e-02 -0.136 0.0605 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 3.29e-01 0.0979 0.1 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 8.16e-01 0.0115 0.0495 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 8.63e-01 0.0122 0.0708 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0361 0.0867 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 5.17e-02 0.192 0.098 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 8.13e-02 -0.129 0.0736 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 2.62e-02 0.172 0.0768 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 447423 sc-eQTL 2.02e-01 0.143 0.112 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 6.09e-01 0.0584 0.114 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -10690 sc-eQTL 5.37e-01 0.0642 0.104 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0842 0.0894 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0552 0.0724 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0393 0.0932 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 4.77e-01 0.0785 0.11 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0663 0.0942 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 4.03e-03 -0.234 0.0805 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0809 0.0671 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0169 0.103 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0884 0.0898 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 3.52e-01 -0.101 0.109 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0849 0.105 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0669 0.104 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 9.37e-06 -0.392 0.0862 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 8.12e-01 0.0185 0.078 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 66775 sc-eQTL 9.20e-02 0.164 0.097 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 489948 sc-eQTL 3.57e-01 0.0878 0.0951 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0546 0.0651 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 906790 sc-eQTL 6.31e-01 0.0481 0.1 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 779123 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00815 0.0929 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 124746 sc-eQTL 1.16e-02 -0.189 0.0741 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 309315 sc-eQTL 8.77e-01 0.0157 0.101 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 66710 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0145 0.119 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 489948 eQTL 4.47e-05 -0.124 0.0302 0.0 0.0 0.197
ENSG00000111670 GNPTAB 355936 eQTL 4.33e-02 -0.0339 0.0168 0.0 0.0 0.197
ENSG00000120860 WASHC3 124746 pQTL 1.76e-05 -0.048 0.0111 0.0 0.0 0.189
ENSG00000120860 WASHC3 124746 eQTL 7.5e-29 -0.163 0.0141 0.0101 0.0101 0.197

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 489948 8.48e-07 6.04e-07 1.96e-07 4.27e-07 1.04e-07 3.11e-07 5.9e-07 2.68e-07 6.53e-07 3.1e-07 8.28e-07 5.01e-07 8.34e-07 1.54e-07 3e-07 3.4e-07 5.56e-07 4.27e-07 3.06e-07 1.91e-07 2.29e-07 5.11e-07 4.08e-07 2.6e-07 7.94e-07 2.38e-07 4.62e-07 2.69e-07 4.88e-07 6.27e-07 3.49e-07 3.34e-08 5.75e-08 2.1e-07 3.44e-07 2.25e-07 2.79e-07 1.41e-07 8.61e-08 1.58e-08 1.14e-07 4.95e-07 6.17e-08 1.99e-08 1.81e-07 3.46e-08 1.45e-07 5.93e-08 4.96e-08
ENSG00000120860 WASHC3 124746 4.82e-06 5.75e-06 1.32e-06 3.5e-06 1.84e-06 1.55e-06 7.51e-06 1.69e-06 4.89e-06 3.49e-06 7.55e-06 3.28e-06 9.02e-06 2.24e-06 1.01e-06 4.67e-06 2.94e-06 3.76e-06 2.28e-06 2.27e-06 3.43e-06 6.99e-06 4.8e-06 2.22e-06 8.46e-06 2.82e-06 3.82e-06 1.76e-06 6.2e-06 5e-06 3.29e-06 8.65e-07 8.38e-07 2.83e-06 2.22e-06 2.06e-06 1.72e-06 1.35e-06 1.38e-06 9.98e-07 9.3e-07 6.66e-06 8.89e-07 1.32e-07 6.82e-07 1.21e-06 9.95e-07 7.42e-07 4.77e-07
ENSG00000136048 \N 309315 1.27e-06 1.08e-06 2.93e-07 1.26e-06 3.95e-07 6.12e-07 1.53e-06 4.45e-07 1.74e-06 7.1e-07 1.84e-06 9.31e-07 2.33e-06 2.79e-07 4.96e-07 1e-06 9.81e-07 9.65e-07 5.93e-07 4.63e-07 6.34e-07 1.91e-06 1.14e-06 5.73e-07 2.23e-06 9.19e-07 1.02e-06 9.36e-07 1.59e-06 1.25e-06 8.06e-07 2.81e-07 3.22e-07 5.59e-07 5.67e-07 6.07e-07 6.46e-07 3.25e-07 5.16e-07 2.31e-07 3.58e-07 1.52e-06 4.23e-07 8.98e-08 3.58e-07 2.73e-07 3.5e-07 2.52e-07 2.23e-07