logo

Genes within 1Mb (chr12:102153072:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 3.04e-01 0.0475 0.0461 0.201 B L1
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 2.18e-01 0.099 0.0802 0.201 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 6.16e-01 0.0245 0.0489 0.201 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 7.09e-01 0.0264 0.0707 0.201 B L1
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 6.84e-01 0.0327 0.0804 0.201 B L1
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 4.86e-01 0.0482 0.0691 0.201 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 1.31e-03 -0.176 0.054 0.201 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 2.29e-02 0.142 0.062 0.201 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 413600 sc-eQTL 3.64e-01 0.0906 0.0996 0.201 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 4.42e-01 0.0735 0.0954 0.201 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 2.57e-01 0.101 0.0888 0.201 B L1
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 9.55e-01 0.00422 0.0749 0.201 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 7.00e-01 -0.039 0.101 0.201 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 8.08e-01 0.017 0.0701 0.201 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0434 0.0774 0.201 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 8.25e-01 0.0168 0.0758 0.201 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 1.39e-08 -0.29 0.0491 0.201 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0616 0.0913 0.201 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0848 0.0989 0.201 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0649 0.0649 0.201 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0329 0.082 0.201 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 2.71e-01 0.0997 0.0903 0.201 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 3.54e-04 -0.227 0.0624 0.201 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 4.04e-01 0.077 0.092 0.201 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0277 0.104 0.2 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 6.68e-01 0.0409 0.0951 0.2 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 4.39e-01 -0.081 0.105 0.2 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 1.09e-01 -0.18 0.112 0.2 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 4.01e-01 0.0974 0.116 0.2 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0457 0.0999 0.2 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 4.94e-01 0.0564 0.0824 0.2 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 4.36e-01 0.0847 0.109 0.2 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0718 0.0869 0.201 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0487 0.0736 0.201 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0276 0.0923 0.201 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 8.27e-01 0.0225 0.103 0.201 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0997 0.0945 0.201 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 1.77e-05 -0.351 0.0798 0.201 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0155 0.068 0.201 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 9.05e-01 0.0111 0.0929 0.2 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 4.15e-01 0.0704 0.0861 0.2 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0454 0.0625 0.2 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 8.58e-01 0.018 0.101 0.2 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0874 0.0923 0.2 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 1.20e-03 -0.223 0.068 0.2 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 4.34e-01 0.0776 0.0991 0.2 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 7.01e-01 0.0447 0.116 0.2 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 3.74e-01 0.0314 0.0352 0.201 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 9.73e-02 0.111 0.0669 0.201 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0658 0.0982 0.201 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0777 0.0707 0.201 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 6.73e-01 0.0468 0.111 0.201 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 8.10e-01 0.0195 0.0807 0.201 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 7.57e-03 -0.19 0.0706 0.201 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00592 0.0861 0.201 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 3.39e-01 0.0685 0.0716 0.201 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0956 0.0831 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 1.27e-01 -0.034 0.0222 0.204 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 3.02e-01 0.12 0.115 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 1.81e-01 0.114 0.0851 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 7.31e-01 0.0419 0.121 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 9.05e-01 0.0141 0.118 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 1.91e-01 0.159 0.121 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 4.03e-02 -0.236 0.114 0.204 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 2.25e-01 0.141 0.116 0.204 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 413600 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0334 0.0954 0.204 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0433 0.096 0.204 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 9.50e-01 0.00569 0.0902 0.204 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00184 0.0465 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0719 0.116 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 2.03e-01 -0.079 0.0619 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0668 0.0918 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 1.03e-01 0.166 0.101 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00868 0.115 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 3.61e-02 -0.198 0.094 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 3.11e-01 0.103 0.102 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 413600 sc-eQTL 7.78e-01 0.0302 0.107 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 3.42e-01 -0.107 0.112 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 1.88e-01 0.142 0.107 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 7.80e-01 0.0121 0.0432 0.203 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 6.31e-01 0.0548 0.114 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0119 0.0745 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0341 0.102 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0535 0.112 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0455 0.111 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 7.78e-02 -0.175 0.0988 0.203 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0358 0.104 0.203 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 413600 sc-eQTL 1.51e-01 -0.154 0.107 0.203 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0616 0.11 0.203 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0797 0.0999 0.203 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 8.38e-02 -0.101 0.0581 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 5.28e-01 0.0669 0.106 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 1.77e-01 0.0741 0.0548 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 4.41e-01 -0.06 0.0777 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0705 0.0923 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 3.00e-02 0.223 0.102 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 4.33e-03 -0.221 0.0765 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 3.62e-01 0.0771 0.0844 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 413600 sc-eQTL 3.65e-02 0.239 0.114 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 8.71e-01 0.0181 0.112 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 2.69e-01 -0.116 0.104 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 1.88e-02 -0.12 0.0508 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 4.12e-01 0.0867 0.105 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0327 0.0565 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 5.87e-01 0.0476 0.0875 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 7.94e-01 0.0266 0.102 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0628 0.111 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 9.85e-01 0.00187 0.0971 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 7.56e-03 0.255 0.0945 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 413600 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0693 0.101 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0563 0.117 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 3.24e-01 0.0993 0.1 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 3.49e-01 0.11 0.117 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0103 0.117 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 8.43e-01 0.0203 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00724 0.113 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0594 0.119 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 9.31e-01 0.00993 0.115 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0484 0.0869 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0491 0.1 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 9.79e-01 0.00206 0.0773 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0115 0.0842 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 8.70e-01 0.0149 0.0912 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 4.88e-06 -0.285 0.0607 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 1.33e-01 0.133 0.0884 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0669 0.102 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 1.19e-01 0.123 0.0789 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00973 0.0993 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 8.13e-01 -0.022 0.0929 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 3.93e-05 -0.246 0.0586 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0696 0.106 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 1.93e-01 -0.133 0.102 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 7.11e-01 0.0366 0.0985 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0636 0.107 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 9.20e-01 0.0102 0.101 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 1.42e-01 -0.132 0.0898 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 6.34e-01 0.0463 0.0971 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 9.69e-01 0.00385 0.0997 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 9.54e-01 0.00458 0.0797 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0487 0.108 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 5.34e-01 0.0664 0.107 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 2.43e-01 -0.106 0.0907 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 4.24e-01 0.0905 0.113 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 9.87e-01 0.00169 0.104 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 1.71e-01 -0.141 0.103 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 7.75e-01 0.0266 0.0929 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 8.23e-01 0.0221 0.0987 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 8.90e-01 0.0149 0.107 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 8.93e-04 -0.232 0.0688 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0499 0.109 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 7.80e-01 0.0312 0.111 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0272 0.0999 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0853 0.103 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0481 0.113 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 4.69e-01 0.0803 0.111 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00194 0.0992 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 9.48e-01 0.007 0.108 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0929 0.108 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0457 0.103 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 2.03e-03 -0.336 0.107 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0225 0.118 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 7.36e-01 0.0381 0.113 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 7.60e-01 0.0302 0.0987 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 3.25e-01 0.107 0.109 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0124 0.0389 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0066 0.109 0.203 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 1.12e-01 -0.169 0.106 0.203 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0048 0.0943 0.203 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0534 0.113 0.203 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0581 0.115 0.203 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 5.64e-02 -0.182 0.0951 0.203 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 6.22e-01 0.0537 0.109 0.203 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 2.86e-01 0.114 0.106 0.203 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 2.23e-01 -0.115 0.094 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 1.05e-01 -0.189 0.116 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0641 0.0846 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 5.64e-01 0.0565 0.0978 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 6.12e-01 -0.058 0.114 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 2.72e-02 -0.245 0.11 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 5.99e-02 -0.189 0.1 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 4.36e-01 0.0829 0.106 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 6.26e-01 0.0546 0.112 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 4.59e-02 0.205 0.102 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 1.70e-01 0.138 0.1 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 9.32e-02 -0.127 0.0756 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 6.64e-01 0.046 0.106 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 8.03e-01 0.0256 0.102 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 1.14e-02 -0.22 0.0862 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 2.75e-01 0.116 0.106 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 9.43e-01 0.00856 0.12 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 2.17e-01 0.131 0.106 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0571 0.109 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0668 0.0873 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 3.56e-01 -0.105 0.114 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 1.14e-01 0.184 0.116 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00391 0.108 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 1.97e-01 -0.144 0.111 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 9.91e-01 0.0012 0.11 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00841 0.104 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00262 0.0971 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 5.75e-01 0.0414 0.0737 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 6.62e-01 -0.045 0.103 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 1.14e-01 -0.163 0.103 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 9.86e-03 -0.209 0.0802 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 7.46e-01 0.0344 0.106 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0691 0.115 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 9.57e-01 0.00457 0.0851 0.178 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 2.53e-01 0.131 0.114 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 2.77e-01 0.0965 0.0884 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 5.58e-01 0.075 0.128 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0883 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 2.08e-01 -0.114 0.0896 0.178 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 4.86e-02 -0.204 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 4.11e-01 0.087 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 413600 sc-eQTL 1.76e-01 0.166 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 2.11e-01 0.14 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 4.83e-01 0.073 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0124 0.0382 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 5.11e-01 0.0507 0.077 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 8.83e-01 0.0151 0.102 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 8.35e-01 0.0158 0.0756 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 5.59e-01 0.0631 0.108 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00295 0.0816 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 9.86e-03 -0.227 0.0873 0.2 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 5.57e-01 0.0447 0.076 0.2 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 1.70e-02 0.167 0.0695 0.2 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 7.51e-01 0.0245 0.0771 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 9.87e-01 0.00178 0.109 0.201 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0599 0.114 0.201 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 2.71e-01 -0.109 0.099 0.201 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 7.82e-01 -0.03 0.108 0.201 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 5.67e-01 -0.064 0.112 0.201 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0994 0.0906 0.201 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 8.65e-01 0.018 0.105 0.205 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 7.61e-01 0.0312 0.103 0.205 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 6.52e-01 0.0599 0.132 0.205 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 3.03e-01 -0.124 0.12 0.205 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0724 0.124 0.205 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 1.31e-01 -0.176 0.116 0.205 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 3.17e-01 0.0912 0.0909 0.205 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 1.15e-01 0.163 0.103 0.205 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 8.82e-01 0.0147 0.0989 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 7.08e-01 -0.028 0.0746 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0501 0.0989 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0645 0.111 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0678 0.0996 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 4.05e-02 -0.175 0.0851 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0616 0.0732 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0964 0.106 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0277 0.0815 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 7.49e-01 0.0318 0.0992 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 1.80e-01 0.156 0.116 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0354 0.109 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 2.19e-03 -0.306 0.0987 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0204 0.0787 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 5.43e-01 0.082 0.134 0.212 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 3.54e-01 0.117 0.126 0.212 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 2.75e-02 -0.208 0.0934 0.212 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0103 0.126 0.212 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 5.51e-01 0.0786 0.131 0.212 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 3.01e-01 -0.127 0.122 0.212 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 8.17e-01 0.0289 0.125 0.212 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 6.99e-02 -0.221 0.121 0.212 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 1.52e-01 -0.16 0.111 0.212 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0141 0.107 0.204 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 6.14e-01 0.0496 0.098 0.204 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0837 0.115 0.204 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0122 0.108 0.204 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0365 0.112 0.204 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 5.27e-05 -0.428 0.104 0.204 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 5.81e-01 0.052 0.0942 0.204 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 9.40e-01 0.00805 0.108 0.197 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 2.43e-01 -0.116 0.099 0.197 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 8.60e-01 0.021 0.119 0.197 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 1.88e-01 -0.137 0.104 0.197 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0975 0.0997 0.197 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 6.54e-04 -0.323 0.0933 0.197 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00993 0.0895 0.197 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0374 0.128 0.198 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 2.54e-01 -0.127 0.111 0.198 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 5.67e-02 -0.223 0.116 0.198 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0817 0.117 0.198 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 2.07e-01 0.155 0.123 0.198 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0597 0.107 0.198 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0424 0.0831 0.198 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 4.66e-01 0.0806 0.11 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 6.45e-01 0.0249 0.0539 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00214 0.108 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0482 0.0569 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0315 0.0896 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 2.54e-01 0.105 0.092 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 6.63e-01 0.0455 0.104 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 2.73e-03 -0.231 0.0763 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 5.51e-01 0.0557 0.0933 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 413600 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0668 0.107 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0699 0.113 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 2.69e-01 0.123 0.111 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -328672 sc-eQTL 2.59e-02 -0.138 0.0614 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 3.28e-01 0.0995 0.101 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 7.65e-01 0.015 0.0502 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 8.33e-01 0.0152 0.0719 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0543 0.0879 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 5.79e-02 0.19 0.0995 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 3.63e-02 -0.157 0.0744 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 2.00e-02 0.182 0.0778 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 413600 sc-eQTL 2.16e-01 0.141 0.113 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 7.77e-01 0.0328 0.116 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -44513 sc-eQTL 6.81e-01 0.0434 0.105 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0657 0.0907 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0494 0.0734 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 7.59e-01 -0.029 0.0945 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 4.80e-01 0.079 0.112 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 6.02e-01 -0.05 0.0955 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 3.78e-03 -0.239 0.0816 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0698 0.0681 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0165 0.105 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0841 0.0912 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 3.13e-01 -0.112 0.11 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0711 0.106 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0591 0.106 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 5.57e-06 -0.407 0.0873 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 7.80e-01 0.0221 0.0791 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 32952 sc-eQTL 1.13e-01 0.157 0.0985 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 456125 sc-eQTL 3.18e-01 0.0966 0.0965 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0487 0.0661 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 872967 sc-eQTL 6.82e-01 0.0417 0.102 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 745300 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00212 0.0943 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 90923 sc-eQTL 2.07e-02 -0.176 0.0754 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 275492 sc-eQTL 8.61e-01 0.018 0.103 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 32887 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0185 0.121 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 456125 eQTL 4.65e-05 -0.124 0.0302 0.0 0.0 0.197
ENSG00000111670 GNPTAB 322113 eQTL 4.35e-02 -0.0339 0.0168 0.0 0.0 0.197
ENSG00000120860 WASHC3 90923 pQTL 1.69e-05 -0.0482 0.0112 0.0 0.0 0.189
ENSG00000120860 WASHC3 90923 eQTL 7.560000000000001e-29 -0.163 0.0141 0.01 0.01 0.197

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 456125 1.04e-06 6.81e-07 1.31e-07 4.29e-07 1.04e-07 2.95e-07 6.29e-07 1.65e-07 6.03e-07 2.81e-07 9.46e-07 5.15e-07 9.97e-07 1.58e-07 3.13e-07 2.89e-07 4.87e-07 4.22e-07 2.65e-07 1.89e-07 2.48e-07 5.17e-07 4.2e-07 2.27e-07 1.22e-06 2.56e-07 4.16e-07 3.24e-07 4.76e-07 7.09e-07 3.68e-07 5.88e-08 5.75e-08 1.77e-07 3.82e-07 1.19e-07 1.11e-07 1.06e-07 7.81e-08 1.57e-08 1.15e-07 6.8e-07 4.59e-08 5.54e-09 1.45e-07 2.64e-08 1.1e-07 2.44e-08 5.96e-08
ENSG00000120860 WASHC3 90923 6.16e-06 7.85e-06 7.57e-07 3.81e-06 1.89e-06 2.56e-06 9.17e-06 1.29e-06 5.07e-06 3.57e-06 8.88e-06 3.67e-06 1.12e-05 3.18e-06 1.55e-06 4.67e-06 3.77e-06 3.78e-06 2.11e-06 2.07e-06 3.4e-06 7.51e-06 5.54e-06 2.22e-06 1.06e-05 2.4e-06 3.6e-06 2.27e-06 6.95e-06 7.66e-06 3.68e-06 4.96e-07 6.72e-07 2.77e-06 2.47e-06 1.61e-06 1.27e-06 9.96e-07 1.38e-06 7.91e-07 8.81e-07 8.17e-06 8.15e-07 1.56e-07 7.94e-07 1.01e-06 9.16e-07 6.91e-07 6.19e-07
ENSG00000136048 \N 275492 1.43e-06 1.29e-06 2.14e-07 1.25e-06 3.82e-07 6.27e-07 1.46e-06 4.04e-07 1.67e-06 5.9e-07 2e-06 9.26e-07 2.61e-06 3.26e-07 4.76e-07 9.36e-07 1.01e-06 9.53e-07 7.2e-07 4.51e-07 7.55e-07 1.91e-06 1.1e-06 5.89e-07 2.44e-06 7.59e-07 1.06e-06 8.31e-07 1.64e-06 1.31e-06 8.57e-07 2.89e-07 3e-07 6.19e-07 6.11e-07 4.74e-07 6.89e-07 3.16e-07 4.58e-07 2.93e-07 3.18e-07 1.77e-06 1.67e-07 1.14e-07 3.22e-07 2.32e-07 2.66e-07 8.15e-08 1.71e-07