logo

Genes within 1Mb (chr12:102146976:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 2.80e-01 0.0501 0.0462 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 2.59e-01 0.091 0.0804 0.199 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 7.21e-01 0.0175 0.049 0.199 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 5.67e-01 0.0407 0.0708 0.199 B L1
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 7.52e-01 0.0255 0.0806 0.199 B L1
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 5.04e-01 0.0463 0.0692 0.199 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 1.54e-03 -0.174 0.0542 0.199 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 2.41e-02 0.141 0.0622 0.199 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 407504 sc-eQTL 3.73e-01 0.0891 0.0998 0.199 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 3.36e-01 0.0921 0.0955 0.199 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 2.45e-01 0.104 0.089 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00688 0.075 0.199 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0485 0.101 0.199 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 6.91e-01 0.0279 0.0701 0.199 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0411 0.0776 0.199 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000343 0.0759 0.199 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 5.38e-09 -0.298 0.049 0.199 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0598 0.0914 0.199 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0977 0.0989 0.199 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 3.17e-01 -0.065 0.0649 0.199 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0426 0.0821 0.199 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 2.51e-01 0.104 0.0903 0.199 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 3.04e-04 -0.229 0.0624 0.199 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 3.80e-01 0.0809 0.0921 0.199 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0262 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 7.52e-01 0.0302 0.0953 0.198 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 5.11e-01 -0.069 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 1.50e-01 -0.161 0.112 0.198 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 3.18e-01 0.116 0.116 0.198 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0492 0.1 0.198 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 5.74e-01 0.0465 0.0826 0.198 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 4.66e-01 0.0795 0.109 0.198 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0755 0.0872 0.199 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0589 0.0738 0.199 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0395 0.0926 0.199 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 8.44e-01 0.0203 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 2.45e-01 -0.11 0.0948 0.199 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 1.64e-05 -0.353 0.0801 0.199 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0212 0.0682 0.199 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 8.27e-01 0.0204 0.0931 0.197 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 5.21e-01 0.0555 0.0863 0.197 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0463 0.0626 0.197 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 9.42e-01 0.00729 0.101 0.197 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0865 0.0925 0.197 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 4.70e-04 -0.241 0.0678 0.197 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 4.15e-01 0.0811 0.0992 0.197 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 7.69e-01 0.0342 0.117 0.197 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 3.58e-01 0.0325 0.0353 0.199 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 1.16e-01 0.106 0.067 0.199 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0819 0.0983 0.199 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0815 0.0708 0.199 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 7.60e-01 0.034 0.111 0.199 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 8.51e-01 0.0152 0.0809 0.199 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 6.25e-03 -0.195 0.0706 0.199 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00561 0.0862 0.199 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 3.03e-01 0.074 0.0717 0.199 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0922 0.0833 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0337 0.0222 0.202 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 3.92e-01 0.0993 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 2.76e-01 0.0934 0.0855 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 6.46e-01 0.0561 0.122 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00831 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 1.33e-01 0.182 0.121 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 3.93e-02 -0.238 0.115 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 2.71e-01 0.128 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 407504 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0284 0.0957 0.202 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0405 0.0963 0.202 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 8.94e-01 0.0121 0.0905 0.202 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000827 0.0466 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0719 0.116 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0847 0.062 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0651 0.0919 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 1.32e-01 0.154 0.102 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.115 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 2.36e-02 -0.214 0.0939 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 2.87e-01 0.109 0.102 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 407504 sc-eQTL 7.90e-01 0.0286 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 3.39e-01 -0.108 0.112 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 1.86e-01 0.143 0.108 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 7.79e-01 0.0121 0.0432 0.2 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 7.42e-01 0.0376 0.114 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0297 0.0745 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 7.17e-01 -0.037 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0671 0.112 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0509 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 7.08e-02 -0.18 0.0989 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0171 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 407504 sc-eQTL 8.65e-02 -0.184 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0493 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 3.48e-01 -0.094 0.1 0.2 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 8.60e-02 -0.1 0.0581 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 5.33e-01 0.0662 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 1.98e-01 0.0708 0.0548 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 5.47e-01 -0.047 0.0778 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0609 0.0924 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 1.61e-02 0.247 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 8.64e-03 -0.204 0.0768 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 4.54e-01 0.0634 0.0845 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 407504 sc-eQTL 3.22e-02 0.245 0.114 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 7.58e-01 0.0345 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 3.26e-01 -0.103 0.105 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 2.00e-02 -0.119 0.0509 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 4.63e-01 0.0777 0.106 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0346 0.0565 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 5.10e-01 0.0577 0.0876 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 7.49e-01 0.0326 0.102 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0797 0.111 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 9.31e-01 0.00843 0.0972 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 5.87e-03 0.263 0.0945 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 407504 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0663 0.101 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0678 0.117 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 3.01e-01 0.104 0.1 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 3.43e-01 0.111 0.117 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0332 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 7.96e-01 0.0266 0.103 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0189 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0788 0.12 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 9.24e-01 0.011 0.115 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0655 0.0869 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0571 0.1 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 8.58e-01 0.0139 0.0774 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00351 0.0843 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 9.66e-01 0.00385 0.0914 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 2.30e-06 -0.294 0.0605 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 1.15e-01 0.14 0.0885 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0794 0.103 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 1.16e-01 0.125 0.079 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0147 0.0994 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0402 0.093 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 1.41e-05 -0.26 0.0584 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0696 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 1.62e-01 -0.143 0.102 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 7.49e-01 0.0316 0.0986 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0629 0.107 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 9.93e-01 0.000859 0.101 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 1.22e-01 -0.139 0.0898 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 6.82e-01 0.0399 0.0973 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00903 0.0998 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 9.22e-01 0.00782 0.0798 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0653 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 5.32e-01 0.0668 0.107 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0907 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 4.17e-01 0.092 0.113 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 9.27e-01 0.00953 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 1.45e-01 -0.15 0.103 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 6.79e-01 0.0385 0.0929 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 8.66e-01 0.0166 0.0988 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 8.19e-01 0.0246 0.107 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 7.50e-04 -0.235 0.0688 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0443 0.109 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 6.59e-01 0.0493 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 6.31e-01 -0.048 0.0998 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0865 0.103 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0388 0.113 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 4.43e-01 0.0851 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 9.34e-01 0.00817 0.0992 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 8.54e-01 0.0199 0.108 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0893 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0482 0.103 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 2.56e-03 -0.329 0.108 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 8.86e-01 -0.017 0.118 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 7.63e-01 0.0341 0.113 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 6.37e-01 0.0466 0.0988 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0106 0.039 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00998 0.11 0.201 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 7.49e-02 -0.19 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 9.48e-01 0.00616 0.0946 0.201 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0677 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 5.17e-01 -0.075 0.116 0.201 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 5.00e-02 -0.188 0.0953 0.201 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 6.04e-01 0.0566 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 2.96e-01 0.112 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 2.60e-01 -0.107 0.0944 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 1.18e-01 -0.183 0.116 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0558 0.0847 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 6.07e-01 0.0504 0.0979 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0538 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 3.06e-02 -0.24 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 3.82e-02 -0.208 0.0999 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 4.14e-01 0.0868 0.106 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 6.10e-01 0.0573 0.112 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 3.78e-02 0.214 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 2.28e-01 0.122 0.101 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 9.35e-02 -0.128 0.0758 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 7.22e-01 0.0377 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 7.78e-01 0.029 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 8.31e-03 -0.23 0.0863 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 2.74e-01 0.117 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00147 0.12 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 1.79e-01 0.142 0.106 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0682 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0653 0.0873 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 3.21e-01 -0.113 0.114 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 1.17e-01 0.183 0.116 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00582 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 2.15e-01 -0.138 0.111 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00453 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0118 0.104 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0221 0.0972 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 6.05e-01 0.0383 0.0738 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0467 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 1.32e-01 -0.156 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 4.27e-03 -0.231 0.08 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 7.65e-01 0.0318 0.106 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 5.42e-01 -0.07 0.115 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 9.57e-01 0.00457 0.0851 0.178 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 2.53e-01 0.131 0.114 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 2.77e-01 0.0965 0.0884 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 5.58e-01 0.075 0.128 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0883 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 2.08e-01 -0.114 0.0896 0.178 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 4.86e-02 -0.204 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 4.11e-01 0.087 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 407504 sc-eQTL 1.76e-01 0.166 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 2.11e-01 0.14 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 4.83e-01 0.073 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0112 0.0383 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 4.86e-01 0.0539 0.0772 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 9.06e-01 0.0121 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 7.95e-01 0.0197 0.0757 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 5.70e-01 0.0615 0.108 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00391 0.0818 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 2.27e-02 -0.202 0.0878 0.198 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 5.73e-01 0.043 0.0762 0.198 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 1.65e-02 0.168 0.0697 0.198 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 6.91e-01 0.0308 0.0772 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 8.23e-01 0.0244 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0559 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0954 0.099 0.199 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0534 0.108 0.199 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 6.55e-01 -0.05 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0905 0.199 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 8.85e-01 0.0153 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 7.77e-01 0.0291 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 6.64e-01 0.0577 0.132 0.202 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 3.57e-01 -0.111 0.12 0.202 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0703 0.124 0.202 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 1.20e-01 -0.181 0.116 0.202 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 3.38e-01 0.0873 0.0909 0.202 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 9.12e-02 0.175 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 9.62e-01 0.00474 0.0993 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0375 0.0748 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0635 0.0992 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0717 0.112 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0739 0.1 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 3.75e-02 -0.179 0.0854 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0581 0.0735 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0902 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0382 0.0817 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 7.75e-01 0.0285 0.0993 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 1.40e-01 0.172 0.116 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0536 0.109 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 2.19e-03 -0.307 0.0989 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0303 0.0788 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 6.10e-01 0.0687 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 4.36e-01 0.0984 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 1.84e-02 -0.222 0.0932 0.209 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0272 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 4.46e-01 0.1 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 2.10e-01 -0.154 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 8.14e-01 0.0295 0.125 0.209 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 1.01e-01 -0.2 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0238 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 6.83e-01 0.0401 0.0982 0.202 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0758 0.115 0.202 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0201 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0246 0.112 0.202 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 4.61e-05 -0.432 0.104 0.202 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 5.24e-01 0.0603 0.0943 0.202 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 8.49e-01 0.0206 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 2.34e-01 -0.118 0.0991 0.195 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 9.05e-01 0.0142 0.119 0.195 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 1.46e-01 -0.151 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0992 0.0998 0.195 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 5.28e-04 -0.329 0.0934 0.195 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0296 0.0896 0.195 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0309 0.128 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 1.97e-01 -0.144 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 8.70e-02 -0.201 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0573 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 1.34e-01 0.185 0.123 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0601 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0596 0.0832 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 5.55e-01 0.0653 0.111 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 6.25e-01 0.0265 0.054 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0138 0.109 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 3.02e-01 -0.059 0.057 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0274 0.0898 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 3.29e-01 0.0902 0.0923 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 6.99e-01 0.0404 0.105 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 1.57e-03 -0.244 0.0763 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 5.06e-01 0.0623 0.0934 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 407504 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0811 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0601 0.113 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 2.89e-01 0.118 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -334768 sc-eQTL 2.48e-02 -0.139 0.0615 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 3.29e-01 0.0993 0.102 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 7.92e-01 0.0133 0.0502 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 7.11e-01 0.0267 0.0719 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0455 0.088 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 4.70e-02 0.199 0.0995 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 6.04e-02 -0.141 0.0746 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 2.73e-02 0.173 0.078 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 407504 sc-eQTL 1.97e-01 0.147 0.113 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 6.99e-01 0.0449 0.116 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -50609 sc-eQTL 5.89e-01 0.0571 0.105 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0717 0.0911 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0598 0.0736 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0413 0.0949 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 4.70e-01 0.0811 0.112 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0624 0.0959 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 3.60e-03 -0.241 0.0818 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0738 0.0683 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0119 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0895 0.0913 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 3.09e-01 -0.113 0.11 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0842 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0526 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 4.39e-06 -0.412 0.0873 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 8.74e-01 0.0126 0.0792 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 26856 sc-eQTL 9.33e-02 0.166 0.0986 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 450029 sc-eQTL 4.21e-01 0.078 0.0967 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0486 0.0663 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 866871 sc-eQTL 7.63e-01 0.0307 0.102 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 739204 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000618 0.0945 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 84827 sc-eQTL 1.16e-02 -0.192 0.0753 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 269396 sc-eQTL 8.33e-01 0.0217 0.103 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 26791 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0304 0.121 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 450029 eQTL 3.68e-05 -0.125 0.0302 0.0 0.0 0.198
ENSG00000111670 GNPTAB 316017 eQTL 4.65e-02 -0.0335 0.0168 0.0 0.0 0.198
ENSG00000120860 WASHC3 84827 pQTL 1.05e-05 -0.0493 0.0111 0.0 0.0 0.19
ENSG00000120860 WASHC3 84827 eQTL 1.1999999999999999e-28 -0.162 0.0141 0.00681 0.00685 0.198

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 450029 8.48e-07 9.01e-07 3.02e-07 3.54e-07 1.4e-07 3.2e-07 7.25e-07 2.62e-07 7.56e-07 3.04e-07 1.09e-06 5.39e-07 1.1e-06 2.06e-07 3.86e-07 3.57e-07 6.98e-07 5.02e-07 3.64e-07 2.25e-07 2.86e-07 5.66e-07 3.99e-07 3.53e-07 1.36e-06 2.44e-07 5.04e-07 4.11e-07 5.56e-07 8.63e-07 4.61e-07 4.75e-08 9.79e-08 2.08e-07 3.57e-07 3.47e-07 2.94e-07 1.41e-07 7.63e-08 1.56e-08 4.32e-08 8.03e-07 6.28e-08 1.38e-07 1.81e-07 3.54e-08 1.54e-07 7.35e-08 9.23e-08
ENSG00000120860 WASHC3 84827 1.05e-05 1.48e-05 2.47e-06 8.32e-06 2.45e-06 5.8e-06 1.59e-05 2.33e-06 1.25e-05 6e-06 1.69e-05 6.62e-06 2.17e-05 4.48e-06 3.97e-06 7.34e-06 6.68e-06 9.74e-06 3.42e-06 3.12e-06 6.79e-06 1.18e-05 1.12e-05 3.67e-06 2.04e-05 4.73e-06 7.12e-06 5.53e-06 1.41e-05 1.07e-05 8.26e-06 1.06e-06 1.24e-06 3.72e-06 5.47e-06 3.03e-06 1.85e-06 1.99e-06 2.01e-06 1.26e-06 1.01e-06 1.63e-05 1.6e-06 2.2e-07 8.64e-07 2.04e-06 1.93e-06 6.52e-07 5e-07
ENSG00000136048 \N 269396 1.63e-06 3.18e-06 4.65e-07 1.76e-06 4.38e-07 8.2e-07 1.63e-06 6.45e-07 1.82e-06 7.18e-07 2.45e-06 1.26e-06 3.47e-06 1.12e-06 6.23e-07 1.15e-06 1.14e-06 1.89e-06 7.85e-07 9.31e-07 1.11e-06 2.57e-06 1.82e-06 9.56e-07 2.84e-06 1.27e-06 1.3e-06 1.64e-06 1.81e-06 1.66e-06 1.67e-06 2.51e-07 5.29e-07 9.63e-07 9.13e-07 9.68e-07 8.47e-07 4.1e-07 6.03e-07 1.85e-07 2.88e-07 2.92e-06 5.55e-07 1.62e-07 3.3e-07 3.14e-07 5.13e-07 2.23e-07 1.53e-07