logo

Genes within 1Mb (chr12:102146179:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 2.80e-01 0.0501 0.0462 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 2.59e-01 0.091 0.0804 0.199 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 7.21e-01 0.0175 0.049 0.199 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 5.67e-01 0.0407 0.0708 0.199 B L1
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 7.52e-01 0.0255 0.0806 0.199 B L1
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 5.04e-01 0.0463 0.0692 0.199 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 1.54e-03 -0.174 0.0542 0.199 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 2.41e-02 0.141 0.0622 0.199 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 406707 sc-eQTL 3.73e-01 0.0891 0.0998 0.199 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 3.36e-01 0.0921 0.0955 0.199 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 2.45e-01 0.104 0.089 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00688 0.075 0.199 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0485 0.101 0.199 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 6.91e-01 0.0279 0.0701 0.199 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0411 0.0776 0.199 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000343 0.0759 0.199 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 5.38e-09 -0.298 0.049 0.199 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0598 0.0914 0.199 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0977 0.0989 0.199 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 3.17e-01 -0.065 0.0649 0.199 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0426 0.0821 0.199 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 2.51e-01 0.104 0.0903 0.199 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 3.04e-04 -0.229 0.0624 0.199 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 3.80e-01 0.0809 0.0921 0.199 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0262 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 7.52e-01 0.0302 0.0953 0.198 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 5.11e-01 -0.069 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 1.50e-01 -0.161 0.112 0.198 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 3.18e-01 0.116 0.116 0.198 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0492 0.1 0.198 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 5.74e-01 0.0465 0.0826 0.198 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 4.66e-01 0.0795 0.109 0.198 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0755 0.0872 0.199 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0589 0.0738 0.199 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0395 0.0926 0.199 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 8.44e-01 0.0203 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 2.45e-01 -0.11 0.0948 0.199 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 1.64e-05 -0.353 0.0801 0.199 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0212 0.0682 0.199 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 8.27e-01 0.0204 0.0931 0.197 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 5.21e-01 0.0555 0.0863 0.197 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0463 0.0626 0.197 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 9.42e-01 0.00729 0.101 0.197 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0865 0.0925 0.197 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 4.70e-04 -0.241 0.0678 0.197 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 4.15e-01 0.0811 0.0992 0.197 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 7.69e-01 0.0342 0.117 0.197 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 3.58e-01 0.0325 0.0353 0.199 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 1.16e-01 0.106 0.067 0.199 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0819 0.0983 0.199 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0815 0.0708 0.199 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 7.60e-01 0.034 0.111 0.199 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 8.51e-01 0.0152 0.0809 0.199 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 6.25e-03 -0.195 0.0706 0.199 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00561 0.0862 0.199 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 3.03e-01 0.074 0.0717 0.199 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0922 0.0833 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0337 0.0222 0.202 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 3.92e-01 0.0993 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 2.76e-01 0.0934 0.0855 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 6.46e-01 0.0561 0.122 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00831 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 1.33e-01 0.182 0.121 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 3.93e-02 -0.238 0.115 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 2.71e-01 0.128 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 406707 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0284 0.0957 0.202 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0405 0.0963 0.202 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 8.94e-01 0.0121 0.0905 0.202 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000827 0.0466 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0719 0.116 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0847 0.062 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0651 0.0919 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 1.32e-01 0.154 0.102 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.115 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 2.36e-02 -0.214 0.0939 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 2.87e-01 0.109 0.102 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 406707 sc-eQTL 7.90e-01 0.0286 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 3.39e-01 -0.108 0.112 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 1.86e-01 0.143 0.108 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 7.79e-01 0.0121 0.0432 0.2 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 7.42e-01 0.0376 0.114 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0297 0.0745 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 7.17e-01 -0.037 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0671 0.112 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0509 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 7.08e-02 -0.18 0.0989 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0171 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 406707 sc-eQTL 8.65e-02 -0.184 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0493 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 3.48e-01 -0.094 0.1 0.2 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 8.60e-02 -0.1 0.0581 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 5.33e-01 0.0662 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 1.98e-01 0.0708 0.0548 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 5.47e-01 -0.047 0.0778 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0609 0.0924 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 1.61e-02 0.247 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 8.64e-03 -0.204 0.0768 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 4.54e-01 0.0634 0.0845 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 406707 sc-eQTL 3.22e-02 0.245 0.114 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 7.58e-01 0.0345 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 3.26e-01 -0.103 0.105 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 2.00e-02 -0.119 0.0509 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 4.63e-01 0.0777 0.106 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0346 0.0565 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 5.10e-01 0.0577 0.0876 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 7.49e-01 0.0326 0.102 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0797 0.111 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 9.31e-01 0.00843 0.0972 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 5.87e-03 0.263 0.0945 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 406707 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0663 0.101 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0678 0.117 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 3.01e-01 0.104 0.1 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 3.43e-01 0.111 0.117 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0332 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 7.96e-01 0.0266 0.103 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0189 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0788 0.12 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 9.24e-01 0.011 0.115 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0655 0.0869 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0571 0.1 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 8.58e-01 0.0139 0.0774 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00351 0.0843 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 9.66e-01 0.00385 0.0914 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 2.30e-06 -0.294 0.0605 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 1.15e-01 0.14 0.0885 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0794 0.103 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 1.16e-01 0.125 0.079 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0147 0.0994 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0402 0.093 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 1.41e-05 -0.26 0.0584 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0696 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 1.62e-01 -0.143 0.102 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 7.49e-01 0.0316 0.0986 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0629 0.107 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 9.93e-01 0.000859 0.101 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 1.22e-01 -0.139 0.0898 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 6.82e-01 0.0399 0.0973 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00903 0.0998 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 9.22e-01 0.00782 0.0798 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0653 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 5.32e-01 0.0668 0.107 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0907 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 4.17e-01 0.092 0.113 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 9.27e-01 0.00953 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 1.45e-01 -0.15 0.103 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 6.79e-01 0.0385 0.0929 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 8.66e-01 0.0166 0.0988 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 8.19e-01 0.0246 0.107 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 7.50e-04 -0.235 0.0688 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0443 0.109 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 6.59e-01 0.0493 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 6.31e-01 -0.048 0.0998 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0865 0.103 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0388 0.113 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 4.43e-01 0.0851 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 9.34e-01 0.00817 0.0992 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 8.54e-01 0.0199 0.108 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0893 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0482 0.103 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 2.56e-03 -0.329 0.108 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 8.86e-01 -0.017 0.118 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 7.63e-01 0.0341 0.113 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 6.37e-01 0.0466 0.0988 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0106 0.039 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00998 0.11 0.201 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 7.49e-02 -0.19 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 9.48e-01 0.00616 0.0946 0.201 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0677 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 5.17e-01 -0.075 0.116 0.201 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 5.00e-02 -0.188 0.0953 0.201 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 6.04e-01 0.0566 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 2.96e-01 0.112 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 2.60e-01 -0.107 0.0944 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 1.18e-01 -0.183 0.116 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0558 0.0847 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 6.07e-01 0.0504 0.0979 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0538 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 3.06e-02 -0.24 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 3.82e-02 -0.208 0.0999 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 4.14e-01 0.0868 0.106 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 6.10e-01 0.0573 0.112 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 3.78e-02 0.214 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 2.28e-01 0.122 0.101 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 9.35e-02 -0.128 0.0758 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 7.22e-01 0.0377 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 7.78e-01 0.029 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 8.31e-03 -0.23 0.0863 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 2.74e-01 0.117 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00147 0.12 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 1.79e-01 0.142 0.106 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0682 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0653 0.0873 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 3.21e-01 -0.113 0.114 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 1.17e-01 0.183 0.116 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00582 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 2.15e-01 -0.138 0.111 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00453 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0118 0.104 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0221 0.0972 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 6.05e-01 0.0383 0.0738 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0467 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 1.32e-01 -0.156 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 4.27e-03 -0.231 0.08 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 7.65e-01 0.0318 0.106 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 5.42e-01 -0.07 0.115 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 9.57e-01 0.00457 0.0851 0.178 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 2.53e-01 0.131 0.114 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 2.77e-01 0.0965 0.0884 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 5.58e-01 0.075 0.128 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0883 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 2.08e-01 -0.114 0.0896 0.178 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 4.86e-02 -0.204 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 4.11e-01 0.087 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 406707 sc-eQTL 1.76e-01 0.166 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 2.11e-01 0.14 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 4.83e-01 0.073 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0112 0.0383 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 4.86e-01 0.0539 0.0772 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 9.06e-01 0.0121 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 7.95e-01 0.0197 0.0757 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 5.70e-01 0.0615 0.108 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00391 0.0818 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 2.27e-02 -0.202 0.0878 0.198 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 5.73e-01 0.043 0.0762 0.198 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 1.65e-02 0.168 0.0697 0.198 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 6.91e-01 0.0308 0.0772 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 8.23e-01 0.0244 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0559 0.114 0.199 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0954 0.099 0.199 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0534 0.108 0.199 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 6.55e-01 -0.05 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0905 0.199 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 8.85e-01 0.0153 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 7.77e-01 0.0291 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 6.64e-01 0.0577 0.132 0.202 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 3.57e-01 -0.111 0.12 0.202 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0703 0.124 0.202 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 1.20e-01 -0.181 0.116 0.202 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 3.38e-01 0.0873 0.0909 0.202 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 9.12e-02 0.175 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 9.62e-01 0.00474 0.0993 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0375 0.0748 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0635 0.0992 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0717 0.112 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0739 0.1 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 3.75e-02 -0.179 0.0854 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0581 0.0735 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0902 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0382 0.0817 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 7.75e-01 0.0285 0.0993 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 1.40e-01 0.172 0.116 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0536 0.109 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 2.19e-03 -0.307 0.0989 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0303 0.0788 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 6.10e-01 0.0687 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 4.36e-01 0.0984 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 1.84e-02 -0.222 0.0932 0.209 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0272 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 4.46e-01 0.1 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 2.10e-01 -0.154 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 8.14e-01 0.0295 0.125 0.209 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 1.01e-01 -0.2 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0238 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 6.83e-01 0.0401 0.0982 0.202 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0758 0.115 0.202 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0201 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0246 0.112 0.202 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 4.61e-05 -0.432 0.104 0.202 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 5.24e-01 0.0603 0.0943 0.202 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 8.49e-01 0.0206 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 2.34e-01 -0.118 0.0991 0.195 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 9.05e-01 0.0142 0.119 0.195 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 1.46e-01 -0.151 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0992 0.0998 0.195 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 5.28e-04 -0.329 0.0934 0.195 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0296 0.0896 0.195 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0309 0.128 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 1.97e-01 -0.144 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 8.70e-02 -0.201 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0573 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 1.34e-01 0.185 0.123 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0601 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0596 0.0832 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 5.55e-01 0.0653 0.111 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 6.25e-01 0.0265 0.054 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0138 0.109 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 3.02e-01 -0.059 0.057 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0274 0.0898 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 3.29e-01 0.0902 0.0923 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 6.99e-01 0.0404 0.105 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 1.57e-03 -0.244 0.0763 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 5.06e-01 0.0623 0.0934 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 406707 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0811 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0601 0.113 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 2.89e-01 0.118 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -335565 sc-eQTL 2.48e-02 -0.139 0.0615 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 3.29e-01 0.0993 0.102 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 7.92e-01 0.0133 0.0502 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 7.11e-01 0.0267 0.0719 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0455 0.088 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 4.70e-02 0.199 0.0995 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 6.04e-02 -0.141 0.0746 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 2.73e-02 0.173 0.078 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 406707 sc-eQTL 1.97e-01 0.147 0.113 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 6.99e-01 0.0449 0.116 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -51406 sc-eQTL 5.89e-01 0.0571 0.105 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0717 0.0911 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0598 0.0736 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0413 0.0949 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 4.70e-01 0.0811 0.112 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0624 0.0959 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 3.60e-03 -0.241 0.0818 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0738 0.0683 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0119 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0895 0.0913 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 3.09e-01 -0.113 0.11 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0842 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0526 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 4.39e-06 -0.412 0.0873 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 8.74e-01 0.0126 0.0792 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 26059 sc-eQTL 9.33e-02 0.166 0.0986 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 449232 sc-eQTL 4.21e-01 0.078 0.0967 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0486 0.0663 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 866074 sc-eQTL 7.63e-01 0.0307 0.102 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 738407 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000618 0.0945 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 84030 sc-eQTL 1.16e-02 -0.192 0.0753 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 268599 sc-eQTL 8.33e-01 0.0217 0.103 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 25994 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0304 0.121 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 449232 eQTL 4.65e-05 -0.124 0.0302 0.0 0.0 0.197
ENSG00000111670 GNPTAB 315220 eQTL 4.35e-02 -0.0339 0.0168 0.0 0.0 0.197
ENSG00000120860 WASHC3 84030 pQTL 1.69e-05 -0.0482 0.0112 0.0 0.0 0.189
ENSG00000120860 WASHC3 84030 eQTL 7.560000000000001e-29 -0.163 0.0141 0.01 0.01 0.197

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 449232 8.63e-07 5.6e-07 1.31e-07 3.96e-07 1.05e-07 2.24e-07 5.49e-07 1.59e-07 4.74e-07 2.43e-07 6.56e-07 3.91e-07 7.71e-07 1.49e-07 2.26e-07 2.69e-07 3.69e-07 3.95e-07 2.13e-07 1.8e-07 2.17e-07 3.92e-07 3.69e-07 1.76e-07 7.94e-07 2.7e-07 3.1e-07 2.71e-07 3.88e-07 5.99e-07 2.83e-07 6.37e-08 5.31e-08 1.52e-07 3.48e-07 1.58e-07 1.02e-07 1.09e-07 6.33e-08 2.53e-08 9.7e-08 5.09e-07 4.59e-08 1.97e-08 1.48e-07 1.33e-08 1.29e-07 2.44e-08 5.96e-08
ENSG00000120860 WASHC3 84030 5.68e-06 6.3e-06 7.79e-07 3.51e-06 1.74e-06 1.95e-06 8.3e-06 1.31e-06 4.68e-06 3.3e-06 8.09e-06 3.23e-06 1.02e-05 2.5e-06 9.95e-07 4.58e-06 3e-06 3.79e-06 1.63e-06 1.99e-06 2.8e-06 6.58e-06 5.02e-06 1.91e-06 8.91e-06 2.25e-06 3.05e-06 1.83e-06 6.27e-06 7.04e-06 3.4e-06 5.12e-07 7.61e-07 2.6e-06 2.4e-06 1.84e-06 1.2e-06 6.96e-07 1.38e-06 7.43e-07 8.27e-07 8.39e-06 6.86e-07 1.51e-07 7.75e-07 9.68e-07 1.05e-06 6.25e-07 6.2e-07
ENSG00000136048 \N 268599 1.27e-06 1.07e-06 2.28e-07 1.17e-06 3.58e-07 6.05e-07 1.55e-06 4.06e-07 1.43e-06 5.9e-07 1.89e-06 8.37e-07 2.41e-06 2.92e-07 5.37e-07 9.85e-07 9.07e-07 7.94e-07 8.61e-07 5.21e-07 8.02e-07 1.71e-06 8.95e-07 5.38e-07 2.25e-06 6.95e-07 9.3e-07 8.91e-07 1.45e-06 1.21e-06 7.41e-07 2.89e-07 3e-07 6.21e-07 5.6e-07 4.9e-07 7.09e-07 2.88e-07 4.72e-07 3.12e-07 3.03e-07 1.6e-06 1.53e-07 7.3e-08 3.26e-07 1.47e-07 2.3e-07 9.32e-08 1.82e-07