logo

Genes within 1Mb (chr12:102137788:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 3.13e-01 0.0467 0.0462 0.197 B L1
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 2.59e-01 0.0909 0.0803 0.197 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 7.18e-01 0.0177 0.0489 0.197 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 6.18e-01 0.0353 0.0708 0.197 B L1
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 7.26e-01 0.0283 0.0805 0.197 B L1
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 4.61e-01 0.0511 0.0691 0.197 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 8.15e-04 -0.183 0.054 0.197 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 2.36e-02 0.142 0.0621 0.197 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 398316 sc-eQTL 3.38e-01 0.0957 0.0996 0.197 B L1
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 3.36e-01 0.092 0.0954 0.197 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 2.22e-01 0.109 0.0889 0.197 B L1
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0112 0.0753 0.197 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0559 0.102 0.197 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 6.78e-01 0.0293 0.0705 0.197 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0431 0.0779 0.197 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00823 0.0763 0.197 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 1.99e-09 -0.307 0.049 0.197 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0642 0.0915 0.197 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 3.24e-01 -0.098 0.0991 0.197 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0734 0.065 0.197 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 6.44e-01 -0.038 0.0822 0.197 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 2.83e-01 0.0975 0.0905 0.197 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 1.92e-04 -0.237 0.0624 0.197 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 3.58e-01 0.0849 0.0922 0.197 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0329 0.105 0.196 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 7.51e-01 0.0304 0.0956 0.196 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 5.31e-01 -0.066 0.105 0.196 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 1.77e-01 -0.152 0.112 0.196 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 4.55e-01 0.0872 0.116 0.196 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0354 0.1 0.196 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 5.60e-01 0.0483 0.0828 0.196 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 4.17e-01 0.0888 0.109 0.196 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0728 0.0874 0.197 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0582 0.074 0.197 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0583 0.0929 0.197 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 9.78e-01 0.00289 0.104 0.197 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 2.01e-01 -0.122 0.095 0.197 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 2.19e-05 -0.349 0.0804 0.197 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0171 0.0684 0.197 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 6.96e-01 0.0365 0.0932 0.195 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 5.67e-01 0.0495 0.0865 0.195 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0482 0.0627 0.195 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0122 0.101 0.195 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0853 0.0926 0.195 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 5.82e-04 -0.238 0.068 0.195 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 2.78e-01 0.108 0.0993 0.195 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 6.95e-01 0.0458 0.117 0.195 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 5.21e-01 0.0228 0.0354 0.197 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 1.15e-01 0.106 0.0672 0.197 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0932 0.0984 0.197 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0809 0.071 0.197 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 6.17e-01 0.0556 0.111 0.197 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 8.45e-01 0.0159 0.0811 0.197 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 1.29e-02 -0.178 0.071 0.197 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 9.63e-01 0.00404 0.0864 0.197 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 2.87e-01 0.0767 0.0718 0.197 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 2.14e-01 -0.104 0.0834 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0357 0.0223 0.199 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 6.54e-01 0.0523 0.116 0.199 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 2.65e-01 0.0959 0.0858 0.199 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 4.76e-01 0.0873 0.122 0.199 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 9.47e-01 0.00794 0.118 0.199 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 1.29e-01 0.185 0.121 0.199 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 3.22e-02 -0.248 0.115 0.199 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 2.69e-01 0.129 0.117 0.199 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 398316 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0314 0.096 0.199 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0365 0.0967 0.199 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0233 0.0908 0.199 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00133 0.0466 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0425 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0828 0.062 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0592 0.0919 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 1.18e-01 0.159 0.102 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 9.33e-01 0.00965 0.115 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 2.40e-02 -0.214 0.0939 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 2.57e-01 0.116 0.102 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 398316 sc-eQTL 6.40e-01 0.0502 0.107 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 2.73e-01 -0.123 0.112 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 1.62e-01 0.151 0.107 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 7.83e-01 0.0119 0.0433 0.198 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 6.74e-01 0.0482 0.114 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0272 0.0747 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0484 0.102 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 6.96e-01 -0.044 0.112 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0215 0.112 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 7.40e-02 -0.178 0.0992 0.198 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0324 0.105 0.198 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 398316 sc-eQTL 1.33e-01 -0.162 0.107 0.198 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0547 0.11 0.198 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 3.81e-01 -0.088 0.1 0.198 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 1.12e-01 -0.0929 0.0582 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 5.34e-01 0.0659 0.106 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 2.06e-01 0.0695 0.0548 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0473 0.0778 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0592 0.0924 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 1.87e-02 0.241 0.102 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 5.05e-03 -0.217 0.0767 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 4.83e-01 0.0594 0.0845 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 398316 sc-eQTL 3.30e-02 0.244 0.114 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 8.03e-01 0.028 0.112 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0899 0.105 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 2.21e-02 -0.117 0.0509 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 5.22e-01 0.0677 0.106 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0383 0.0565 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 5.33e-01 0.0547 0.0876 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 8.50e-01 0.0193 0.102 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 4.91e-01 -0.077 0.111 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 9.27e-01 0.00888 0.0972 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 5.09e-03 0.268 0.0945 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 398316 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0693 0.101 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0471 0.117 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 2.58e-01 0.114 0.1 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 2.49e-01 0.136 0.117 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0258 0.118 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 7.73e-01 0.0297 0.103 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0245 0.113 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 3.72e-01 -0.107 0.12 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 8.23e-01 0.0258 0.115 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0764 0.0874 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0653 0.101 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 8.61e-01 0.0137 0.0778 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00582 0.0848 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0118 0.0919 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 7.99e-07 -0.308 0.0606 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 1.33e-01 0.134 0.0889 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0866 0.103 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 9.47e-02 0.133 0.0793 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0172 0.0999 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0262 0.0935 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 8.35e-06 -0.267 0.0585 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0657 0.107 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 1.42e-01 -0.151 0.102 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 7.80e-01 0.0277 0.0989 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0649 0.107 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 8.62e-01 0.0176 0.101 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 1.91e-01 -0.118 0.0902 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 6.61e-01 0.0427 0.0973 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0153 0.0999 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 9.04e-01 0.00965 0.0799 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0653 0.108 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 5.56e-01 0.063 0.107 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 1.77e-01 -0.123 0.0908 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 3.64e-01 0.103 0.113 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 9.72e-01 0.00373 0.105 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 1.24e-01 -0.16 0.103 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00188 0.0934 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 9.37e-01 0.00789 0.0993 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 7.45e-01 0.0351 0.108 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 8.37e-04 -0.234 0.0692 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0204 0.11 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 6.91e-01 0.0443 0.111 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 6.52e-01 -0.045 0.0997 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0866 0.103 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0415 0.113 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 4.08e-01 0.0916 0.11 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 9.21e-01 0.00979 0.099 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 8.79e-01 0.0164 0.108 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0877 0.109 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0474 0.103 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 1.90e-03 -0.339 0.108 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 9.93e-01 0.00104 0.119 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 8.39e-01 0.0231 0.113 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 6.34e-01 0.0472 0.099 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 3.48e-01 0.102 0.109 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 8.16e-01 -0.00913 0.0391 0.199 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0224 0.11 0.199 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 4.91e-02 -0.209 0.106 0.199 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 9.08e-01 0.011 0.0947 0.199 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0557 0.113 0.199 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0762 0.116 0.199 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 7.90e-02 -0.169 0.0956 0.199 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 5.95e-01 0.0582 0.109 0.199 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 2.38e-01 0.126 0.107 0.199 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 2.80e-01 -0.102 0.0945 0.199 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 1.19e-01 -0.183 0.117 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0556 0.0849 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 7.25e-01 0.0345 0.0981 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0752 0.115 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 1.87e-02 -0.262 0.11 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 7.33e-02 -0.181 0.1 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 5.01e-01 0.0717 0.106 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 5.17e-01 0.0729 0.112 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 3.25e-02 0.22 0.102 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 2.20e-01 0.124 0.101 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 9.99e-02 -0.125 0.0758 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 8.23e-01 0.0237 0.106 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 7.38e-01 0.0343 0.102 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 7.36e-03 -0.234 0.0863 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 1.62e-01 0.149 0.106 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000376 0.12 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 2.06e-01 0.134 0.106 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0663 0.109 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0497 0.0877 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 2.65e-01 -0.128 0.114 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 1.09e-01 0.188 0.116 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 9.64e-01 0.0049 0.109 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 3.21e-01 -0.111 0.112 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 9.71e-01 0.00397 0.11 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 8.56e-01 0.0189 0.104 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0399 0.0975 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 7.32e-01 0.0254 0.074 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0467 0.103 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 1.23e-01 -0.16 0.103 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 3.18e-03 -0.239 0.0802 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 6.94e-01 0.0419 0.107 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0687 0.115 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 7.69e-01 0.0252 0.0854 0.174 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 2.66e-01 0.128 0.114 0.174 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 3.53e-01 0.0829 0.0889 0.174 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 5.18e-01 0.083 0.128 0.174 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0607 0.147 0.174 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0929 0.0901 0.174 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 5.37e-02 -0.2 0.103 0.174 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 4.76e-01 0.0757 0.106 0.174 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 398316 sc-eQTL 2.42e-01 0.144 0.122 0.174 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 2.12e-01 0.141 0.112 0.174 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 6.13e-01 0.0529 0.104 0.174 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0183 0.0384 0.196 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 4.46e-01 0.059 0.0773 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 8.16e-01 0.0239 0.103 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 8.45e-01 0.0149 0.0759 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 5.22e-01 0.0694 0.108 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 9.14e-01 0.00882 0.082 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 2.72e-02 -0.196 0.0881 0.196 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 5.00e-01 0.0516 0.0763 0.196 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 1.29e-02 0.175 0.0698 0.196 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 7.85e-01 0.0212 0.0775 0.196 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 7.72e-01 0.0317 0.109 0.197 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0657 0.114 0.197 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 2.83e-01 -0.107 0.0992 0.197 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0413 0.108 0.197 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0185 0.112 0.197 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 2.44e-01 -0.106 0.0907 0.197 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 9.56e-01 0.00582 0.106 0.2 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 7.21e-01 0.0368 0.103 0.2 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 6.19e-01 0.0662 0.133 0.2 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0978 0.12 0.2 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0901 0.125 0.2 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 1.56e-01 -0.167 0.117 0.2 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 3.17e-01 0.0916 0.0913 0.2 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 7.35e-02 0.186 0.103 0.2 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 9.91e-01 0.00109 0.0995 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0354 0.075 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 4.16e-01 -0.081 0.0994 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0699 0.112 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0965 0.1 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 4.96e-02 -0.169 0.0857 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0538 0.0737 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0739 0.107 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0408 0.0819 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 8.88e-01 0.0141 0.0997 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 1.90e-01 0.153 0.116 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0518 0.11 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 2.36e-03 -0.306 0.0993 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0387 0.079 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 6.10e-01 0.0687 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 4.36e-01 0.0984 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 1.84e-02 -0.222 0.0932 0.209 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0272 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 4.46e-01 0.1 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 2.10e-01 -0.154 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 8.14e-01 0.0295 0.125 0.209 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 1.01e-01 -0.2 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0222 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 7.10e-01 0.0366 0.0985 0.2 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0632 0.116 0.2 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0309 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0263 0.112 0.2 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 3.21e-05 -0.442 0.104 0.2 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 4.22e-01 0.0761 0.0946 0.2 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00947 0.108 0.192 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 2.23e-01 -0.121 0.0993 0.192 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00828 0.119 0.192 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 8.55e-02 -0.179 0.104 0.192 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0775 0.1 0.192 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 4.15e-04 -0.336 0.0935 0.192 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0313 0.0898 0.192 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0291 0.128 0.192 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 1.72e-01 -0.152 0.111 0.192 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 6.80e-02 -0.215 0.117 0.192 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0531 0.118 0.192 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 2.47e-01 0.143 0.123 0.192 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0567 0.108 0.192 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0646 0.0834 0.192 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 4.94e-01 0.076 0.111 0.192 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 6.34e-01 0.0258 0.054 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00346 0.109 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0546 0.057 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0253 0.0897 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 2.55e-01 0.105 0.0921 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 4.51e-01 0.0788 0.104 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 1.72e-03 -0.242 0.0763 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 5.21e-01 0.0601 0.0934 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 398316 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0503 0.108 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0702 0.113 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 3.31e-01 0.109 0.112 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -343956 sc-eQTL 3.32e-02 -0.132 0.0615 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 3.42e-01 0.0967 0.101 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 7.77e-01 0.0142 0.0502 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 7.42e-01 0.0237 0.0719 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0473 0.088 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 4.87e-02 0.197 0.0995 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 3.75e-02 -0.156 0.0744 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 2.69e-02 0.174 0.0779 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 398316 sc-eQTL 2.02e-01 0.145 0.113 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 6.95e-01 0.0455 0.116 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -59797 sc-eQTL 5.02e-01 0.0708 0.105 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0624 0.0913 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 4.17e-01 -0.06 0.0738 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0617 0.0951 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 5.31e-01 0.0705 0.112 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0772 0.0961 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 4.63e-03 -0.235 0.0821 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0725 0.0685 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 7.90e-01 -0.028 0.105 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0956 0.0916 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 3.17e-01 -0.111 0.111 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 3.22e-01 -0.106 0.107 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0429 0.106 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 2.81e-06 -0.421 0.0875 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 8.30e-01 0.0171 0.0795 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 17668 sc-eQTL 6.40e-02 0.184 0.0987 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 440841 sc-eQTL 4.58e-01 0.072 0.0969 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 sc-eQTL 4.71e-01 -0.048 0.0664 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 857683 sc-eQTL 8.77e-01 0.0159 0.102 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 730016 sc-eQTL 9.49e-01 0.00611 0.0946 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 75639 sc-eQTL 1.06e-02 -0.195 0.0755 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 260208 sc-eQTL 5.91e-01 0.0554 0.103 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP 17603 sc-eQTL 8.43e-01 -0.024 0.121 0.196 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 440841 eQTL 6.36e-05 -0.122 0.0303 0.0 0.0 0.197
ENSG00000111670 GNPTAB 306829 eQTL 4.41e-02 -0.034 0.0168 0.0 0.0 0.197
ENSG00000120860 WASHC3 75639 pQTL 8.11e-06 -0.0502 0.0112 0.0 0.0 0.189
ENSG00000120860 WASHC3 75639 eQTL 6.61e-29 -0.163 0.0142 0.0102 0.0103 0.197

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 440841 1.26e-06 8.34e-07 1.6e-07 4.36e-07 9.9e-08 3.41e-07 6.87e-07 1.78e-07 6.92e-07 3.22e-07 1.07e-06 5.22e-07 1.16e-06 1.98e-07 3.31e-07 3.96e-07 5.56e-07 4.44e-07 2.88e-07 2.25e-07 2.42e-07 5.36e-07 4.77e-07 2.92e-07 1.47e-06 2.49e-07 4.25e-07 3.89e-07 5.9e-07 8.36e-07 4.08e-07 4.34e-08 4.92e-08 2.1e-07 3.69e-07 1.54e-07 1.94e-07 1.06e-07 8.43e-08 1.63e-08 1.23e-07 9.5e-07 5.91e-08 1.23e-08 1.94e-07 3.92e-08 1.37e-07 4.41e-08 5.96e-08
ENSG00000120860 WASHC3 75639 8.64e-06 9.76e-06 1.23e-06 5.02e-06 2.44e-06 4.24e-06 1.07e-05 2.07e-06 9.21e-06 5.11e-06 1.24e-05 5.28e-06 1.45e-05 3.74e-06 2.66e-06 6.62e-06 4.38e-06 7.18e-06 2.64e-06 2.8e-06 5.11e-06 9.52e-06 8.1e-06 3.38e-06 1.54e-05 3.89e-06 4.73e-06 3.96e-06 9.86e-06 7.93e-06 5.38e-06 1.01e-06 1.29e-06 3.31e-06 4.58e-06 2.53e-06 1.78e-06 1.97e-06 1.84e-06 9.95e-07 1.01e-06 1.3e-05 1.42e-06 2.03e-07 8.01e-07 1.75e-06 1.74e-06 6.55e-07 4.44e-07
ENSG00000136048 \N 260208 1.61e-06 2.12e-06 2.16e-07 1.22e-06 5.07e-07 6.22e-07 1.2e-06 4.17e-07 1.7e-06 7.25e-07 1.86e-06 1.32e-06 2.68e-06 5.79e-07 3.64e-07 1.1e-06 1.07e-06 1.16e-06 5.36e-07 5.06e-07 6.15e-07 1.95e-06 1.63e-06 7.61e-07 2.57e-06 9.13e-07 1.05e-06 1.07e-06 1.68e-06 1.37e-06 7.56e-07 2.82e-07 3.27e-07 6.25e-07 7.57e-07 5.42e-07 6.89e-07 3.6e-07 5.39e-07 1.86e-07 3.53e-07 2.77e-06 3.67e-07 1.74e-07 3.43e-07 3.19e-07 3.64e-07 1.97e-07 1.86e-07