logo

Genes within 1Mb (chr12:102116153:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 3.13e-01 0.0467 0.0462 0.197 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 2.59e-01 0.0909 0.0803 0.197 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 7.18e-01 0.0177 0.0489 0.197 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 6.18e-01 0.0353 0.0708 0.197 B L1
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 7.26e-01 0.0283 0.0805 0.197 B L1
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 4.61e-01 0.0511 0.0691 0.197 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 8.15e-04 -0.183 0.054 0.197 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 2.36e-02 0.142 0.0621 0.197 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 376681 sc-eQTL 3.38e-01 0.0957 0.0996 0.197 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 3.36e-01 0.092 0.0954 0.197 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 2.22e-01 0.109 0.0889 0.197 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0112 0.0753 0.197 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0559 0.102 0.197 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 6.78e-01 0.0293 0.0705 0.197 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0431 0.0779 0.197 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00823 0.0763 0.197 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 1.99e-09 -0.307 0.049 0.197 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0642 0.0915 0.197 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 3.24e-01 -0.098 0.0991 0.197 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0734 0.065 0.197 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 6.44e-01 -0.038 0.0822 0.197 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 2.83e-01 0.0975 0.0905 0.197 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 1.92e-04 -0.237 0.0624 0.197 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 3.58e-01 0.0849 0.0922 0.197 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0329 0.105 0.196 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 7.51e-01 0.0304 0.0956 0.196 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 5.31e-01 -0.066 0.105 0.196 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 1.77e-01 -0.152 0.112 0.196 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 4.55e-01 0.0872 0.116 0.196 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0354 0.1 0.196 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 5.60e-01 0.0483 0.0828 0.196 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 4.17e-01 0.0888 0.109 0.196 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0728 0.0874 0.197 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0582 0.074 0.197 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0583 0.0929 0.197 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 9.78e-01 0.00289 0.104 0.197 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 2.01e-01 -0.122 0.095 0.197 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 2.19e-05 -0.349 0.0804 0.197 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0171 0.0684 0.197 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 6.96e-01 0.0365 0.0932 0.195 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 5.67e-01 0.0495 0.0865 0.195 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0482 0.0627 0.195 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0122 0.101 0.195 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0853 0.0926 0.195 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 5.82e-04 -0.238 0.068 0.195 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 2.78e-01 0.108 0.0993 0.195 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 6.95e-01 0.0458 0.117 0.195 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 5.21e-01 0.0228 0.0354 0.197 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 1.15e-01 0.106 0.0672 0.197 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0932 0.0984 0.197 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0809 0.071 0.197 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 6.17e-01 0.0556 0.111 0.197 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 8.45e-01 0.0159 0.0811 0.197 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 1.29e-02 -0.178 0.071 0.197 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 9.63e-01 0.00404 0.0864 0.197 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 2.87e-01 0.0767 0.0718 0.197 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 2.14e-01 -0.104 0.0834 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0357 0.0223 0.199 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 6.54e-01 0.0523 0.116 0.199 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 2.65e-01 0.0959 0.0858 0.199 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 4.76e-01 0.0873 0.122 0.199 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 9.47e-01 0.00794 0.118 0.199 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 1.29e-01 0.185 0.121 0.199 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 3.22e-02 -0.248 0.115 0.199 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 2.69e-01 0.129 0.117 0.199 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 376681 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0314 0.096 0.199 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0365 0.0967 0.199 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0233 0.0908 0.199 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00133 0.0466 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0425 0.116 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0828 0.062 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0592 0.0919 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 1.18e-01 0.159 0.102 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 9.33e-01 0.00965 0.115 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 2.40e-02 -0.214 0.0939 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 2.57e-01 0.116 0.102 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 376681 sc-eQTL 6.40e-01 0.0502 0.107 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 2.73e-01 -0.123 0.112 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 1.62e-01 0.151 0.107 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 7.83e-01 0.0119 0.0433 0.198 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 6.74e-01 0.0482 0.114 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0272 0.0747 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0484 0.102 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 6.96e-01 -0.044 0.112 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0215 0.112 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 7.40e-02 -0.178 0.0992 0.198 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0324 0.105 0.198 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 376681 sc-eQTL 1.33e-01 -0.162 0.107 0.198 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0547 0.11 0.198 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 3.81e-01 -0.088 0.1 0.198 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 1.12e-01 -0.0929 0.0582 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 5.34e-01 0.0659 0.106 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 2.06e-01 0.0695 0.0548 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0473 0.0778 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0592 0.0924 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 1.87e-02 0.241 0.102 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 5.05e-03 -0.217 0.0767 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 4.83e-01 0.0594 0.0845 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 376681 sc-eQTL 3.30e-02 0.244 0.114 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 8.03e-01 0.028 0.112 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0899 0.105 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 2.21e-02 -0.117 0.0509 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 5.22e-01 0.0677 0.106 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0383 0.0565 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 5.33e-01 0.0547 0.0876 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 8.50e-01 0.0193 0.102 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 4.91e-01 -0.077 0.111 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 9.27e-01 0.00888 0.0972 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 5.09e-03 0.268 0.0945 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 376681 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0693 0.101 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0471 0.117 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 2.58e-01 0.114 0.1 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 2.49e-01 0.136 0.117 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0258 0.118 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 7.73e-01 0.0297 0.103 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0245 0.113 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 3.72e-01 -0.107 0.12 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 8.23e-01 0.0258 0.115 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0764 0.0874 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0653 0.101 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 8.61e-01 0.0137 0.0778 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00582 0.0848 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0118 0.0919 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 7.99e-07 -0.308 0.0606 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 1.33e-01 0.134 0.0889 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0866 0.103 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 9.47e-02 0.133 0.0793 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0172 0.0999 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0262 0.0935 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 8.35e-06 -0.267 0.0585 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0657 0.107 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 1.42e-01 -0.151 0.102 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 7.80e-01 0.0277 0.0989 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0649 0.107 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 8.62e-01 0.0176 0.101 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 1.91e-01 -0.118 0.0902 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 6.61e-01 0.0427 0.0973 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0153 0.0999 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 9.04e-01 0.00965 0.0799 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0653 0.108 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 5.56e-01 0.063 0.107 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 1.77e-01 -0.123 0.0908 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 3.64e-01 0.103 0.113 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 9.72e-01 0.00373 0.105 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 1.24e-01 -0.16 0.103 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00188 0.0934 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 9.37e-01 0.00789 0.0993 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 7.45e-01 0.0351 0.108 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 8.37e-04 -0.234 0.0692 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0204 0.11 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 6.91e-01 0.0443 0.111 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 6.52e-01 -0.045 0.0997 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0866 0.103 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0415 0.113 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 4.08e-01 0.0916 0.11 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 9.21e-01 0.00979 0.099 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 8.79e-01 0.0164 0.108 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0877 0.109 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0474 0.103 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 1.90e-03 -0.339 0.108 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 9.93e-01 0.00104 0.119 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 8.39e-01 0.0231 0.113 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 6.34e-01 0.0472 0.099 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 3.48e-01 0.102 0.109 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 8.16e-01 -0.00913 0.0391 0.199 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0224 0.11 0.199 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 4.91e-02 -0.209 0.106 0.199 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 9.08e-01 0.011 0.0947 0.199 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0557 0.113 0.199 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0762 0.116 0.199 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 7.90e-02 -0.169 0.0956 0.199 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 5.95e-01 0.0582 0.109 0.199 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 2.38e-01 0.126 0.107 0.199 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 2.80e-01 -0.102 0.0945 0.199 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 1.19e-01 -0.183 0.117 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0556 0.0849 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 7.25e-01 0.0345 0.0981 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0752 0.115 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 1.87e-02 -0.262 0.11 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 7.33e-02 -0.181 0.1 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 5.01e-01 0.0717 0.106 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 5.17e-01 0.0729 0.112 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 3.25e-02 0.22 0.102 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 2.20e-01 0.124 0.101 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 9.99e-02 -0.125 0.0758 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 8.23e-01 0.0237 0.106 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 7.38e-01 0.0343 0.102 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 7.36e-03 -0.234 0.0863 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 1.62e-01 0.149 0.106 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000376 0.12 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 2.06e-01 0.134 0.106 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0663 0.109 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0497 0.0877 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 2.65e-01 -0.128 0.114 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 1.09e-01 0.188 0.116 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 9.64e-01 0.0049 0.109 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 3.21e-01 -0.111 0.112 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 9.71e-01 0.00397 0.11 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 8.56e-01 0.0189 0.104 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0399 0.0975 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 7.32e-01 0.0254 0.074 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0467 0.103 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 1.23e-01 -0.16 0.103 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 3.18e-03 -0.239 0.0802 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 6.94e-01 0.0419 0.107 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0687 0.115 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 7.69e-01 0.0252 0.0854 0.174 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 2.66e-01 0.128 0.114 0.174 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 3.53e-01 0.0829 0.0889 0.174 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 5.18e-01 0.083 0.128 0.174 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0607 0.147 0.174 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0929 0.0901 0.174 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 5.37e-02 -0.2 0.103 0.174 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 4.76e-01 0.0757 0.106 0.174 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 376681 sc-eQTL 2.42e-01 0.144 0.122 0.174 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 2.12e-01 0.141 0.112 0.174 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 6.13e-01 0.0529 0.104 0.174 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0183 0.0384 0.196 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 4.46e-01 0.059 0.0773 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 8.16e-01 0.0239 0.103 0.196 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 8.45e-01 0.0149 0.0759 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 5.22e-01 0.0694 0.108 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 9.14e-01 0.00882 0.082 0.196 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 2.72e-02 -0.196 0.0881 0.196 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 5.00e-01 0.0516 0.0763 0.196 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 1.29e-02 0.175 0.0698 0.196 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 7.85e-01 0.0212 0.0775 0.196 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 7.72e-01 0.0317 0.109 0.197 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0657 0.114 0.197 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 2.83e-01 -0.107 0.0992 0.197 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0413 0.108 0.197 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0185 0.112 0.197 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 2.44e-01 -0.106 0.0907 0.197 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 9.56e-01 0.00582 0.106 0.2 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 7.21e-01 0.0368 0.103 0.2 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 6.19e-01 0.0662 0.133 0.2 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0978 0.12 0.2 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0901 0.125 0.2 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 1.56e-01 -0.167 0.117 0.2 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 3.17e-01 0.0916 0.0913 0.2 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 7.35e-02 0.186 0.103 0.2 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 9.91e-01 0.00109 0.0995 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0354 0.075 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 4.16e-01 -0.081 0.0994 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0699 0.112 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0965 0.1 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 4.96e-02 -0.169 0.0857 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0538 0.0737 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0739 0.107 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0408 0.0819 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 8.88e-01 0.0141 0.0997 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 1.90e-01 0.153 0.116 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0518 0.11 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 2.36e-03 -0.306 0.0993 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0387 0.079 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 6.10e-01 0.0687 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 4.36e-01 0.0984 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 1.84e-02 -0.222 0.0932 0.209 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0272 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 4.46e-01 0.1 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 2.10e-01 -0.154 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 8.14e-01 0.0295 0.125 0.209 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 1.01e-01 -0.2 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0222 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 7.10e-01 0.0366 0.0985 0.2 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0632 0.116 0.2 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0309 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0263 0.112 0.2 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 3.21e-05 -0.442 0.104 0.2 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 4.22e-01 0.0761 0.0946 0.2 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00947 0.108 0.192 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 2.23e-01 -0.121 0.0993 0.192 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00828 0.119 0.192 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 8.55e-02 -0.179 0.104 0.192 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0775 0.1 0.192 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 4.15e-04 -0.336 0.0935 0.192 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0313 0.0898 0.192 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0291 0.128 0.192 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 1.72e-01 -0.152 0.111 0.192 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 6.80e-02 -0.215 0.117 0.192 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0531 0.118 0.192 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 2.47e-01 0.143 0.123 0.192 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0567 0.108 0.192 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0646 0.0834 0.192 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 4.94e-01 0.076 0.111 0.192 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 6.34e-01 0.0258 0.054 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00346 0.109 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0546 0.057 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0253 0.0897 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 2.55e-01 0.105 0.0921 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 4.51e-01 0.0788 0.104 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 1.72e-03 -0.242 0.0763 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 5.21e-01 0.0601 0.0934 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 376681 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0503 0.108 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0702 0.113 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 3.31e-01 0.109 0.112 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -365591 sc-eQTL 3.32e-02 -0.132 0.0615 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 3.42e-01 0.0967 0.101 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 7.77e-01 0.0142 0.0502 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 7.42e-01 0.0237 0.0719 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0473 0.088 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 4.87e-02 0.197 0.0995 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 3.75e-02 -0.156 0.0744 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 2.69e-02 0.174 0.0779 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 376681 sc-eQTL 2.02e-01 0.145 0.113 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 6.95e-01 0.0455 0.116 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -81432 sc-eQTL 5.02e-01 0.0708 0.105 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0624 0.0913 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 4.17e-01 -0.06 0.0738 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0617 0.0951 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 5.31e-01 0.0705 0.112 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0772 0.0961 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 4.63e-03 -0.235 0.0821 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0725 0.0685 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 7.90e-01 -0.028 0.105 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0956 0.0916 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 3.17e-01 -0.111 0.111 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 3.22e-01 -0.106 0.107 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0429 0.106 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 2.81e-06 -0.421 0.0875 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 8.30e-01 0.0171 0.0795 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -3967 sc-eQTL 6.40e-02 0.184 0.0987 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 419206 sc-eQTL 4.58e-01 0.072 0.0969 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 sc-eQTL 4.71e-01 -0.048 0.0664 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 836048 sc-eQTL 8.77e-01 0.0159 0.102 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 708381 sc-eQTL 9.49e-01 0.00611 0.0946 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 54004 sc-eQTL 1.06e-02 -0.195 0.0755 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 238573 sc-eQTL 5.91e-01 0.0554 0.103 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -4032 sc-eQTL 8.43e-01 -0.024 0.121 0.196 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 419206 eQTL 5.34e-05 -0.123 0.0304 0.0 0.0 0.196
ENSG00000111670 GNPTAB 285194 eQTL 3.37e-02 -0.0359 0.0169 0.0 0.0 0.196
ENSG00000120860 WASHC3 54004 pQTL 7.34e-06 -0.0505 0.0112 0.0 0.0 0.188
ENSG00000120860 WASHC3 54004 eQTL 7.89e-29 -0.164 0.0142 0.00897 0.00902 0.196

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 419206 1.25e-06 8.81e-07 2.91e-07 3.5e-07 1.19e-07 4.67e-07 1.02e-06 2.71e-07 9.02e-07 3.11e-07 1.19e-06 5.68e-07 1.46e-06 2.61e-07 4.37e-07 6.35e-07 5.63e-07 5.27e-07 4.49e-07 3.54e-07 2.8e-07 7.73e-07 6.33e-07 3.32e-07 1.92e-06 2.9e-07 6.81e-07 4.92e-07 7.69e-07 8.5e-07 4.54e-07 3.7e-08 1.35e-07 3.55e-07 3.52e-07 3.1e-07 2.96e-07 1.36e-07 1.6e-07 8.36e-09 1.39e-07 1.09e-06 6.65e-08 2.68e-08 1.62e-07 7.16e-08 1.87e-07 8.58e-08 6.58e-08
ENSG00000120860 WASHC3 54004 1.05e-05 1.25e-05 2.3e-06 7.53e-06 2.32e-06 5.46e-06 1.46e-05 2.2e-06 1.09e-05 6.03e-06 1.54e-05 6.86e-06 1.99e-05 4.51e-06 3.75e-06 7.72e-06 5.59e-06 9.66e-06 2.98e-06 3.12e-06 6.46e-06 1.1e-05 1.12e-05 3.54e-06 2.02e-05 4.3e-06 7.16e-06 5.03e-06 1.27e-05 9.7e-06 7.63e-06 9.82e-07 1.15e-06 3.72e-06 5.46e-06 2.84e-06 1.79e-06 1.99e-06 2.14e-06 9.86e-07 1.01e-06 1.57e-05 1.61e-06 1.92e-07 8.86e-07 1.72e-06 1.99e-06 6.06e-07 4.15e-07
ENSG00000136048 \N 238573 2.28e-06 2.51e-06 3.32e-07 1.64e-06 4.37e-07 8.22e-07 1.82e-06 5.97e-07 1.7e-06 8.15e-07 2.11e-06 1.29e-06 3.44e-06 1.36e-06 6.04e-07 1.52e-06 1.12e-06 1.59e-06 7.13e-07 7.68e-07 7.75e-07 2.32e-06 2.1e-06 9.28e-07 3.53e-06 1.22e-06 1.36e-06 1.29e-06 1.78e-06 1.61e-06 1.19e-06 2.62e-07 3.75e-07 1.24e-06 9.93e-07 7.08e-07 7.35e-07 3.94e-07 6.93e-07 2.06e-07 3.53e-07 2.83e-06 6.27e-07 2.15e-07 3.39e-07 3.14e-07 7.88e-07 2.22e-07 2.41e-07