logo

Genes within 1Mb (chr12:102082350:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 3.65e-01 0.0413 0.0455 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 2.38e-01 0.0936 0.0791 0.199 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 7.57e-01 0.0149 0.0482 0.199 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 7.18e-01 0.0253 0.0698 0.199 B L1
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 6.54e-01 0.0355 0.0793 0.199 B L1
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 4.70e-01 0.0493 0.0681 0.199 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 1.07e-03 -0.177 0.0532 0.199 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 2.23e-02 0.141 0.0612 0.199 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 342878 sc-eQTL 3.70e-01 0.0882 0.0982 0.199 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 3.02e-01 0.0972 0.094 0.199 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 1.94e-01 0.114 0.0875 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0127 0.0742 0.199 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0545 0.1 0.199 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 7.10e-01 0.0259 0.0695 0.199 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0253 0.0768 0.199 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00949 0.0751 0.199 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 4.91e-09 -0.296 0.0485 0.199 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0485 0.0901 0.199 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0944 0.0975 0.199 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0802 0.0639 0.199 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0408 0.0809 0.199 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 2.88e-01 0.0949 0.0891 0.199 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 2.63e-04 -0.228 0.0615 0.199 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 3.88e-01 0.0785 0.0908 0.199 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0205 0.103 0.198 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 8.23e-01 0.021 0.094 0.198 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0632 0.103 0.198 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 1.84e-01 -0.147 0.11 0.198 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 4.96e-01 0.0782 0.115 0.198 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0375 0.0987 0.198 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 4.91e-01 0.0562 0.0814 0.198 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 3.26e-01 0.106 0.107 0.198 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0855 0.0859 0.199 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0541 0.0728 0.199 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0527 0.0913 0.199 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 1.00e+00 -3.68e-06 0.102 0.199 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 1.61e-01 -0.131 0.0933 0.199 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 3.13e-05 -0.337 0.0792 0.199 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 7.33e-01 -0.023 0.0672 0.199 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 6.95e-01 0.036 0.0917 0.197 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 4.77e-01 0.0606 0.085 0.197 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0557 0.0616 0.197 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 9.57e-01 0.00541 0.0993 0.197 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0821 0.0911 0.197 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 5.85e-04 -0.233 0.0669 0.197 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 3.02e-01 0.101 0.0976 0.197 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 6.37e-01 0.0543 0.115 0.197 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 5.40e-01 0.0214 0.0348 0.199 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 8.84e-02 0.113 0.0659 0.199 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0861 0.0968 0.199 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0738 0.0698 0.199 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 6.65e-01 0.0474 0.109 0.199 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 8.61e-01 0.014 0.0797 0.199 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 1.43e-02 -0.173 0.0698 0.199 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 8.73e-01 0.0136 0.0849 0.199 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 3.61e-01 0.0647 0.0706 0.199 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 1.71e-01 -0.113 0.0819 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0338 0.0219 0.202 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 7.28e-01 0.0398 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 2.22e-01 0.103 0.0842 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 3.94e-01 0.102 0.12 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 9.65e-01 0.00508 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 9.65e-02 0.199 0.119 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 1.65e-02 -0.272 0.112 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 2.74e-01 0.125 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 342878 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0309 0.0943 0.202 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0381 0.0949 0.202 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0266 0.0891 0.202 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00309 0.0458 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0271 0.114 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0832 0.061 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0495 0.0905 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 1.06e-01 0.162 0.1 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 9.30e-01 0.00993 0.113 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 2.41e-02 -0.21 0.0924 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 2.64e-01 0.112 0.1 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 342878 sc-eQTL 7.41e-01 0.0349 0.105 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 2.49e-01 -0.128 0.11 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 1.35e-01 0.158 0.106 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 7.65e-01 0.0128 0.0427 0.2 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 5.70e-01 0.064 0.113 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0214 0.0736 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0531 0.101 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0466 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0217 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 4.95e-02 -0.193 0.0975 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0346 0.103 0.2 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 342878 sc-eQTL 1.17e-01 -0.166 0.106 0.2 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0538 0.109 0.2 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0932 0.0987 0.2 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 1.12e-01 -0.0914 0.0573 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 5.29e-01 0.0657 0.104 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 2.09e-01 0.068 0.054 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0619 0.0765 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0478 0.0909 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 1.74e-02 0.24 0.1 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 4.80e-03 -0.215 0.0754 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 4.61e-01 0.0614 0.0832 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 342878 sc-eQTL 3.23e-02 0.241 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 7.32e-01 0.0377 0.11 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 4.92e-01 -0.071 0.103 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 2.28e-02 -0.115 0.0502 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 5.41e-01 0.0637 0.104 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0387 0.0557 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 5.73e-01 0.0488 0.0863 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 8.06e-01 0.0246 0.1 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 4.45e-01 -0.084 0.11 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 7.48e-01 0.0308 0.0957 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 5.38e-03 0.262 0.0931 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 342878 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0673 0.0998 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0339 0.115 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 2.68e-01 0.11 0.099 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 2.11e-01 0.145 0.115 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 8.63e-01 -0.02 0.116 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 7.84e-01 0.0278 0.101 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0182 0.111 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0711 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 8.05e-01 0.028 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0724 0.0861 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0616 0.0993 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 8.60e-01 0.0136 0.0766 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 9.05e-01 0.01 0.0835 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0142 0.0905 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 1.69e-06 -0.295 0.0599 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 1.72e-01 0.12 0.0876 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 3.86e-01 -0.088 0.101 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 1.15e-01 0.124 0.0781 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0198 0.0983 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 6.96e-01 -0.036 0.092 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 1.32e-05 -0.257 0.0577 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0923 0.105 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 1.26e-01 -0.154 0.1 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 8.72e-01 0.0157 0.0972 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0569 0.105 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 9.37e-01 0.00787 0.0994 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 1.90e-01 -0.117 0.0887 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 5.12e-01 0.0628 0.0957 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0119 0.0982 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 9.74e-01 0.00261 0.0785 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0658 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 6.76e-01 0.0439 0.105 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 1.76e-01 -0.121 0.0892 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 4.49e-01 0.0844 0.111 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 8.67e-01 0.0173 0.103 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 1.33e-01 -0.153 0.102 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0158 0.0919 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 9.82e-01 0.00218 0.0977 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 6.44e-01 0.049 0.106 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 1.10e-03 -0.225 0.0681 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00546 0.108 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 7.90e-01 0.0292 0.11 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0281 0.0982 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0873 0.101 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0373 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 5.57e-01 0.0639 0.109 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 8.96e-01 0.0127 0.0975 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 9.56e-01 0.00585 0.106 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 3.51e-01 -0.1 0.107 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0295 0.101 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 2.92e-03 -0.32 0.106 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00784 0.117 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 7.69e-01 0.0328 0.111 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 4.93e-01 0.0669 0.0973 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 3.28e-01 0.105 0.107 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 8.17e-01 -0.00888 0.0384 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0154 0.108 0.201 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 5.91e-02 -0.198 0.104 0.201 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 9.77e-01 0.00269 0.0932 0.201 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0483 0.112 0.201 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0883 0.114 0.201 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 7.34e-02 -0.169 0.094 0.201 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 5.14e-01 0.0701 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 2.93e-01 0.111 0.105 0.201 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 2.50e-01 -0.107 0.0929 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 1.14e-01 -0.182 0.115 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0466 0.0834 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 8.34e-01 0.0202 0.0965 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0595 0.113 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 3.11e-02 -0.236 0.109 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 6.84e-02 -0.181 0.0987 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 5.11e-01 0.0689 0.105 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 6.10e-01 0.0564 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 2.60e-02 0.225 0.1 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 1.70e-01 0.136 0.0987 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 7.87e-02 -0.131 0.0744 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 7.01e-01 0.04 0.104 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 8.46e-01 0.0196 0.101 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 7.60e-03 -0.229 0.0848 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 1.97e-01 0.135 0.104 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 9.87e-01 0.00194 0.118 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 2.79e-01 0.113 0.104 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0491 0.107 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0466 0.0862 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 3.17e-01 -0.113 0.113 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 1.30e-01 0.174 0.115 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 9.82e-01 0.00247 0.107 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0935 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 9.31e-01 0.00933 0.108 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 8.60e-01 0.0181 0.102 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 6.92e-01 -0.038 0.0958 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 8.28e-01 0.0158 0.0728 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0243 0.101 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 1.43e-01 -0.149 0.102 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 3.56e-03 -0.232 0.0788 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 7.87e-01 0.0283 0.105 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0501 0.113 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 7.69e-01 0.0252 0.0854 0.174 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 2.66e-01 0.128 0.114 0.174 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 3.53e-01 0.0829 0.0889 0.174 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 5.18e-01 0.083 0.128 0.174 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0607 0.147 0.174 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0929 0.0901 0.174 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 5.37e-02 -0.2 0.103 0.174 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 4.76e-01 0.0757 0.106 0.174 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 342878 sc-eQTL 2.42e-01 0.144 0.122 0.174 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 2.12e-01 0.141 0.112 0.174 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 6.13e-01 0.0529 0.104 0.174 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0181 0.0378 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 4.03e-01 0.0638 0.0762 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 9.36e-01 0.00814 0.101 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 7.18e-01 0.027 0.0748 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 6.45e-01 0.0492 0.107 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 8.49e-01 0.0154 0.0808 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 2.43e-02 -0.197 0.0867 0.198 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 5.60e-01 0.0439 0.0752 0.198 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 8.21e-03 0.183 0.0686 0.198 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 8.77e-01 0.0118 0.0763 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 7.61e-01 0.0328 0.108 0.199 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 6.18e-01 -0.056 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 2.87e-01 -0.104 0.0977 0.199 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0325 0.107 0.199 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 8.85e-01 -0.016 0.11 0.199 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 2.27e-01 -0.108 0.0893 0.199 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 7.97e-01 0.0267 0.104 0.202 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 7.92e-01 0.0267 0.101 0.202 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 5.94e-01 0.0697 0.131 0.202 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 3.50e-01 -0.111 0.118 0.202 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 4.11e-01 -0.101 0.123 0.202 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 1.47e-01 -0.167 0.115 0.202 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 2.56e-01 0.102 0.0895 0.202 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 5.23e-02 0.198 0.101 0.202 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0167 0.0978 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0359 0.0737 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0832 0.0977 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0654 0.11 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 3.00e-01 -0.102 0.0983 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 5.88e-02 -0.16 0.0843 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0579 0.0724 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0769 0.105 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0288 0.0806 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 8.02e-01 0.0246 0.098 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 1.93e-01 0.149 0.114 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0493 0.108 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 2.45e-03 -0.299 0.0976 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0501 0.0777 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 5.68e-01 0.0754 0.132 0.212 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 3.90e-01 0.106 0.123 0.212 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 2.35e-02 -0.209 0.0913 0.212 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0384 0.123 0.212 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 4.26e-01 0.103 0.129 0.212 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 2.40e-01 -0.141 0.12 0.212 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 7.61e-01 0.0372 0.122 0.212 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 8.74e-02 -0.204 0.119 0.212 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 9.20e-02 -0.184 0.109 0.212 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0263 0.106 0.202 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 7.63e-01 0.0293 0.0969 0.202 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0453 0.114 0.202 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0547 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0417 0.11 0.202 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 4.34e-05 -0.428 0.102 0.202 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 3.98e-01 0.0789 0.093 0.202 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0126 0.106 0.195 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 2.32e-01 -0.117 0.0978 0.195 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0096 0.118 0.195 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 1.07e-01 -0.165 0.102 0.195 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0804 0.0986 0.195 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 7.94e-04 -0.314 0.0923 0.195 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0303 0.0884 0.195 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0446 0.125 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 1.59e-01 -0.153 0.109 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 5.57e-02 -0.22 0.114 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0319 0.115 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 2.31e-01 0.145 0.121 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0563 0.105 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0666 0.0815 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 4.13e-01 0.0887 0.108 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 6.35e-01 0.0253 0.0532 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 8.96e-01 0.014 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0533 0.0561 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0216 0.0883 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 2.45e-01 0.106 0.0907 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 4.43e-01 0.079 0.103 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 1.12e-03 -0.248 0.0749 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 5.16e-01 0.0598 0.0919 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 342878 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0662 0.106 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0781 0.111 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 2.94e-01 0.116 0.11 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -399394 sc-eQTL 3.42e-02 -0.129 0.0606 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 3.42e-01 0.0953 0.0999 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 8.02e-01 0.0124 0.0494 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 8.96e-01 0.00929 0.0708 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0378 0.0866 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 5.35e-02 0.19 0.098 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 5.21e-02 -0.143 0.0734 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 2.59e-02 0.172 0.0767 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 342878 sc-eQTL 2.07e-01 0.141 0.112 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 6.06e-01 0.0589 0.114 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -115235 sc-eQTL 4.56e-01 0.0774 0.104 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0753 0.0897 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0554 0.0726 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 5.28e-01 -0.059 0.0934 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 5.38e-01 0.0682 0.11 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0805 0.0944 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 5.15e-03 -0.228 0.0808 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0797 0.0673 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0325 0.103 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0943 0.0901 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 3.61e-01 -0.1 0.109 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 3.15e-01 -0.106 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0577 0.104 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 6.16e-06 -0.401 0.0864 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 7.70e-01 0.0229 0.0782 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -37770 sc-eQTL 6.34e-02 0.181 0.097 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 385403 sc-eQTL 3.90e-01 0.0821 0.0953 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 sc-eQTL 4.09e-01 -0.054 0.0653 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 802245 sc-eQTL 7.36e-01 0.0338 0.1 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 674578 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00167 0.0931 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 20201 sc-eQTL 1.06e-02 -0.191 0.0742 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 204770 sc-eQTL 6.34e-01 0.0482 0.101 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -37835 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00827 0.119 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 385403 eQTL 6.15e-05 -0.123 0.0306 0.0 0.0 0.196
ENSG00000111670 GNPTAB 251391 eQTL 3.17e-02 -0.0365 0.017 0.0 0.0 0.196
ENSG00000120860 WASHC3 20201 pQTL 4.88e-06 -0.0518 0.0113 0.0 0.0 0.188
ENSG00000120860 WASHC3 20201 eQTL 5.470000000000001e-29 -0.165 0.0143 0.0112 0.0111 0.196

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 385403 1.25e-06 9e-07 1.63e-07 3.17e-07 1.54e-07 3.58e-07 7.44e-07 2.73e-07 8.29e-07 2.85e-07 1.1e-06 5.75e-07 1.35e-06 2.05e-07 3.9e-07 4.12e-07 7.47e-07 5.02e-07 3.43e-07 3.54e-07 2.62e-07 5.66e-07 5.66e-07 3.27e-07 1.66e-06 2.38e-07 5.05e-07 4.71e-07 6.85e-07 8.89e-07 4.55e-07 4.28e-08 1.36e-07 2.46e-07 3.52e-07 2.13e-07 2.36e-07 1.56e-07 1.1e-07 1.98e-08 2.11e-07 9.59e-07 6.81e-08 4.15e-08 1.8e-07 7.64e-08 1.62e-07 8.43e-08 5.55e-08
ENSG00000120860 WASHC3 20201 1.57e-05 2.01e-05 3.68e-06 1.15e-05 3.38e-06 8.94e-06 2.59e-05 3.36e-06 1.78e-05 9.53e-06 2.42e-05 9.35e-06 3.39e-05 8.31e-06 5.24e-06 1.06e-05 1.05e-05 1.6e-05 5.87e-06 4.89e-06 9.31e-06 1.91e-05 1.93e-05 6.56e-06 3.01e-05 5.34e-06 8.03e-06 8.12e-06 2.05e-05 2.06e-05 1.29e-05 1.51e-06 2.15e-06 5.65e-06 8.46e-06 4.55e-06 2.6e-06 2.81e-06 3.62e-06 2.79e-06 1.67e-06 2.41e-05 2.63e-06 3.6e-07 1.97e-06 2.69e-06 3.43e-06 1.52e-06 1.23e-06
ENSG00000136048 \N 204770 2.28e-06 2.44e-06 2.73e-07 1.69e-06 4.82e-07 8.18e-07 1.56e-06 5.72e-07 1.74e-06 8.27e-07 2.35e-06 1.35e-06 3.5e-06 1.22e-06 5.74e-07 1.2e-06 1.06e-06 1.57e-06 6.65e-07 9.52e-07 8.81e-07 2.32e-06 2.04e-06 1.02e-06 3.39e-06 1.22e-06 1.19e-06 1.44e-06 1.88e-06 1.67e-06 1.29e-06 3.03e-07 4.16e-07 1.14e-06 1.02e-06 6.3e-07 7.83e-07 4.1e-07 6.93e-07 3.33e-07 1.83e-07 2.83e-06 3.95e-07 1.89e-07 3.67e-07 3.09e-07 5.13e-07 2.26e-07 2.79e-07