logo

Genes within 1Mb (chr12:102035664:CAT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 3.27e-01 0.0452 0.046 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 2.96e-01 0.084 0.0801 0.199 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 9.65e-01 0.00217 0.0488 0.199 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 7.12e-01 0.0261 0.0706 0.199 B L1
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 7.19e-01 0.0289 0.0803 0.199 B L1
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 4.37e-01 0.0537 0.0689 0.199 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 9.77e-04 -0.18 0.0538 0.199 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 2.36e-02 0.141 0.0619 0.199 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 296192 sc-eQTL 3.93e-01 0.0851 0.0994 0.199 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 3.35e-01 0.0918 0.0951 0.199 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 2.82e-01 0.0957 0.0887 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 8.31e-01 -0.016 0.075 0.199 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 5.74e-01 -0.057 0.101 0.199 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 6.86e-01 0.0284 0.0702 0.199 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0372 0.0776 0.199 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00991 0.0759 0.199 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 2.50e-09 -0.304 0.0489 0.199 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0664 0.0912 0.199 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 3.11e-01 -0.1 0.0988 0.199 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0803 0.0647 0.199 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0433 0.082 0.199 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 2.74e-01 0.099 0.0902 0.199 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 1.66e-04 -0.238 0.0621 0.199 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 3.59e-01 0.0846 0.0919 0.199 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0157 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 7.16e-01 0.0346 0.095 0.198 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0712 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 1.42e-01 -0.164 0.111 0.198 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 4.93e-01 0.0794 0.116 0.198 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 8.33e-01 -0.021 0.0997 0.198 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 5.50e-01 0.0492 0.0823 0.198 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 3.00e-01 0.112 0.108 0.198 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0765 0.0866 0.199 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0633 0.0733 0.199 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0455 0.092 0.199 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 8.78e-01 0.0158 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 2.20e-01 -0.116 0.0942 0.199 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 2.36e-05 -0.345 0.0797 0.199 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 8.83e-01 -0.01 0.0678 0.199 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 6.29e-01 0.0449 0.0929 0.197 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 6.11e-01 0.0439 0.0863 0.197 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0515 0.0625 0.197 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0256 0.101 0.197 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0978 0.0923 0.197 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 2.81e-04 -0.25 0.0676 0.197 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 2.75e-01 0.108 0.099 0.197 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 6.64e-01 0.0507 0.116 0.197 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 5.35e-01 0.0219 0.0353 0.199 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 1.12e-01 0.107 0.0668 0.199 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0863 0.098 0.199 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0689 0.0707 0.199 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 6.54e-01 0.0496 0.111 0.199 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 8.68e-01 0.0135 0.0807 0.199 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 1.60e-02 -0.172 0.0707 0.199 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0141 0.086 0.199 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 2.80e-01 0.0774 0.0715 0.199 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 2.20e-01 -0.102 0.083 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0365 0.0222 0.202 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 7.67e-01 0.0344 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 3.06e-01 0.0877 0.0855 0.202 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 4.35e-01 0.0951 0.122 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 7.83e-01 0.0325 0.118 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 9.21e-02 0.204 0.121 0.202 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 3.02e-02 -0.25 0.114 0.202 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 2.27e-01 0.14 0.116 0.202 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 296192 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0208 0.0956 0.202 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0231 0.0962 0.202 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 7.82e-01 -0.025 0.0904 0.202 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00256 0.0465 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0638 0.116 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0969 0.0618 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 5.14e-01 -0.06 0.0917 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 9.35e-02 0.171 0.101 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 9.42e-01 0.00836 0.115 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 2.12e-02 -0.218 0.0937 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 2.05e-01 0.129 0.101 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 296192 sc-eQTL 7.22e-01 0.0381 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 3.09e-01 -0.114 0.112 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 1.88e-01 0.142 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 4.79e-01 0.0306 0.0431 0.2 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 5.94e-01 0.0608 0.114 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0383 0.0744 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0425 0.102 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0518 0.112 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0299 0.111 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 8.80e-02 -0.169 0.0988 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0342 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 296192 sc-eQTL 1.15e-01 -0.169 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0615 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0917 0.0998 0.2 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 1.09e-01 -0.0935 0.058 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 5.46e-01 0.0638 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 3.31e-01 0.0534 0.0548 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0506 0.0776 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0628 0.0922 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 2.30e-02 0.233 0.102 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 6.23e-03 -0.212 0.0765 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 4.70e-01 0.0611 0.0844 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 296192 sc-eQTL 3.74e-02 0.238 0.114 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 8.21e-01 0.0253 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 3.32e-01 -0.101 0.104 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 2.14e-02 -0.118 0.0508 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 6.41e-01 0.0491 0.105 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0511 0.0563 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 6.07e-01 0.0451 0.0874 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 9.02e-01 0.0125 0.101 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0648 0.111 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 9.69e-01 0.00375 0.0969 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 5.34e-03 0.265 0.0942 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 296192 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0813 0.101 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0544 0.116 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 2.13e-01 0.125 0.1 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 3.07e-01 0.12 0.117 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0303 0.118 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 7.99e-01 0.0262 0.103 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0112 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0937 0.12 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 9.65e-01 0.00506 0.115 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0795 0.0869 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0653 0.1 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 8.59e-01 0.0138 0.0775 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000573 0.0844 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 8.87e-01 -0.013 0.0914 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 8.94e-07 -0.305 0.0603 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 1.38e-01 0.132 0.0886 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0833 0.103 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 8.88e-02 0.135 0.079 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0128 0.0995 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 7.64e-01 -0.028 0.0931 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 7.26e-06 -0.268 0.0583 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0644 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 1.58e-01 -0.144 0.102 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 8.44e-01 0.0194 0.0987 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0685 0.107 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 8.10e-01 0.0243 0.101 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 2.48e-01 -0.104 0.0901 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 5.93e-01 0.052 0.097 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0205 0.0996 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 9.32e-01 0.00684 0.0796 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0762 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 4.14e-01 0.0871 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 1.42e-01 -0.133 0.0904 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 4.23e-01 0.0905 0.113 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 9.67e-01 0.00426 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 1.41e-01 -0.152 0.103 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00752 0.093 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 8.45e-01 0.0194 0.0988 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 8.36e-01 0.0222 0.107 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 1.06e-03 -0.229 0.0689 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0107 0.109 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 8.49e-01 0.0212 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0444 0.0995 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0731 0.103 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0557 0.112 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 4.20e-01 0.089 0.11 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 8.84e-01 0.0144 0.0988 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 7.12e-01 0.0399 0.108 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 3.44e-01 -0.103 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0478 0.103 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 1.28e-03 -0.352 0.108 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00797 0.119 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 8.93e-01 0.0153 0.114 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 5.93e-01 0.0531 0.0992 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 4.71e-01 0.0789 0.109 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 8.36e-01 -0.00809 0.039 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 9.84e-01 0.00225 0.11 0.201 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 4.07e-02 -0.218 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 8.93e-01 0.0127 0.0946 0.201 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0393 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0771 0.116 0.201 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 1.12e-01 -0.152 0.0956 0.201 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 7.03e-01 0.0417 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 2.95e-01 0.112 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 2.77e-01 -0.103 0.0944 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 9.01e-02 -0.198 0.116 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0552 0.0845 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 8.66e-01 0.0165 0.0977 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0811 0.114 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 1.21e-02 -0.278 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 7.79e-02 -0.177 0.1 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 6.69e-01 0.0454 0.106 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 4.91e-01 0.0772 0.112 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 3.73e-02 0.214 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 2.18e-01 0.124 0.1 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 8.37e-02 -0.131 0.0756 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 8.54e-01 0.0195 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 8.87e-01 0.0146 0.102 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 3.98e-03 -0.25 0.0859 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 1.43e-01 0.156 0.106 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 8.88e-01 0.0169 0.12 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 2.40e-01 0.125 0.106 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0679 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0456 0.0874 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 2.52e-01 -0.131 0.114 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 1.04e-01 0.189 0.116 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00718 0.109 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 3.44e-01 -0.105 0.111 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00747 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 6.97e-01 0.0404 0.104 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0505 0.0971 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 6.93e-01 0.0291 0.0737 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0575 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 1.49e-01 -0.149 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 2.93e-03 -0.24 0.0798 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 6.72e-01 0.0449 0.106 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0618 0.115 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 9.27e-01 0.00781 0.0851 0.178 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 2.91e-01 0.121 0.114 0.178 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 3.75e-01 0.079 0.0886 0.178 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 4.64e-01 0.0936 0.127 0.178 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 7.19e-01 -0.053 0.147 0.178 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0862 0.0898 0.178 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 5.33e-02 -0.2 0.102 0.178 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 5.43e-01 0.0643 0.105 0.178 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 296192 sc-eQTL 2.02e-01 0.156 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 1.93e-01 0.146 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 6.47e-01 0.0477 0.104 0.178 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0147 0.0382 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 4.46e-01 0.0587 0.0769 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 7.36e-01 0.0344 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 7.07e-01 0.0284 0.0755 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 5.87e-01 0.0586 0.108 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00364 0.0816 0.198 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 3.26e-02 -0.189 0.0877 0.198 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 6.20e-01 0.0377 0.076 0.198 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 1.35e-02 0.173 0.0694 0.198 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 7.90e-01 0.0205 0.077 0.198 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 8.54e-01 0.0201 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 5.26e-01 -0.072 0.113 0.199 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 2.92e-01 -0.104 0.0988 0.199 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0129 0.108 0.199 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0157 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 2.41e-01 -0.106 0.0903 0.199 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 7.86e-01 0.0285 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 6.94e-01 0.0403 0.102 0.202 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 5.89e-01 0.0714 0.132 0.202 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 3.59e-01 -0.11 0.119 0.202 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 4.18e-01 -0.1 0.124 0.202 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 1.65e-01 -0.161 0.116 0.202 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0904 0.202 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 6.99e-02 0.187 0.103 0.202 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0109 0.0987 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0387 0.0744 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0752 0.0986 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 6.33e-01 -0.053 0.111 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0958 0.0993 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 3.94e-02 -0.176 0.085 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0454 0.0731 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 4.52e-01 -0.08 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0475 0.0813 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 6.82e-01 0.0407 0.0989 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 1.70e-01 0.159 0.115 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0505 0.109 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 2.19e-03 -0.306 0.0985 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0282 0.0785 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 6.10e-01 0.0687 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 4.36e-01 0.0984 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 1.84e-02 -0.222 0.0932 0.209 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0272 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 4.46e-01 0.1 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 2.10e-01 -0.154 0.122 0.209 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 8.14e-01 0.0295 0.125 0.209 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 1.01e-01 -0.2 0.121 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00389 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 8.42e-01 0.0195 0.0979 0.202 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0609 0.115 0.202 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0343 0.108 0.202 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00949 0.111 0.202 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 6.30e-05 -0.423 0.103 0.202 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 3.87e-01 0.0814 0.0939 0.202 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 9.97e-01 0.000372 0.107 0.195 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 2.59e-01 -0.112 0.0988 0.195 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0166 0.119 0.195 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 9.96e-02 -0.171 0.103 0.195 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 4.83e-01 -0.07 0.0997 0.195 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 7.58e-04 -0.319 0.0932 0.195 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0393 0.0893 0.195 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0263 0.128 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 1.70e-01 -0.153 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 6.01e-02 -0.221 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0627 0.117 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 2.56e-01 0.14 0.123 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0283 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0967 0.0829 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 3.40e-01 0.106 0.11 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 4.86e-01 0.0376 0.0538 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0167 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0686 0.0567 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0257 0.0895 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 2.18e-01 0.113 0.0918 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 4.74e-01 0.0747 0.104 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 1.85e-03 -0.24 0.0761 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 4.96e-01 0.0635 0.0931 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 296192 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0631 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0651 0.112 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 4.07e-01 0.0924 0.111 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -446080 sc-eQTL 2.80e-02 -0.136 0.0613 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 3.76e-01 0.0897 0.101 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 9.92e-01 0.000509 0.05 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 8.52e-01 0.0134 0.0717 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0517 0.0877 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 5.03e-02 0.195 0.0991 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 3.74e-02 -0.155 0.0742 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 2.48e-02 0.176 0.0776 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 296192 sc-eQTL 2.39e-01 0.133 0.113 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 7.23e-01 0.0409 0.115 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -161921 sc-eQTL 5.35e-01 0.0652 0.105 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0719 0.0905 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0646 0.0732 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0426 0.0943 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 4.42e-01 0.0859 0.111 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0758 0.0953 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 3.74e-03 -0.239 0.0814 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0618 0.068 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0112 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0982 0.0911 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 2.81e-01 -0.119 0.11 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 3.26e-01 -0.104 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0292 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 7.99e-06 -0.4 0.0874 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 8.56e-01 0.0143 0.0791 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -84456 sc-eQTL 5.32e-02 0.191 0.0983 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 338717 sc-eQTL 4.99e-01 0.0654 0.0967 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0485 0.0662 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 755559 sc-eQTL 9.64e-01 0.00458 0.102 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 627892 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00433 0.0944 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 sc-eQTL 5.99e-03 -0.208 0.075 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 158084 sc-eQTL 5.39e-01 0.0631 0.103 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -84521 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0174 0.121 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 338717 eQTL 8.28e-05 -0.124 0.0313 0.0 0.0 0.194
ENSG00000111670 GNPTAB 204705 eQTL 2.03e-02 -0.0403 0.0173 0.0 0.0 0.194
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 pQTL 6.23e-06 -0.0524 0.0115 0.0 0.0 0.186
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 eQTL 3.85e-28 -0.166 0.0146 0.00472 0.00474 0.194

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 338717 1.29e-06 9.28e-07 1.05e-07 4.29e-07 1.1e-07 4.9e-07 6.52e-07 7.79e-08 5.02e-07 2.26e-07 1.08e-06 6.07e-07 1.07e-06 1.57e-07 2.14e-07 2.23e-07 5.27e-07 4.07e-07 2.79e-07 5.61e-08 2.3e-07 7.21e-07 4.69e-07 7.36e-08 1.14e-06 2.64e-07 1.39e-07 1.1e-07 4.15e-07 7.6e-07 3.49e-07 3.95e-08 5.75e-08 1.23e-07 1.39e-07 2.99e-07 1.07e-07 6.98e-08 5.8e-08 5.96e-08 3.91e-08 7.38e-07 6.14e-07 2.03e-07 3.2e-08 2.64e-08 1e-07 2.13e-09 5.69e-08
ENSG00000120860 WASHC3 -26485 0.000225 0.000134 7.58e-06 2.87e-05 9.46e-06 2.28e-05 8.25e-05 6.2e-06 5.44e-05 2.03e-05 9.41e-05 2.43e-05 0.000118 2.11e-05 7.75e-06 4.01e-05 2.01e-05 4.39e-05 9.51e-06 8.35e-06 2.26e-05 0.000101 5.33e-05 1.51e-05 9.26e-05 1.81e-05 1.99e-05 2.28e-05 4.2e-05 3.34e-05 4.26e-05 1.33e-06 4.01e-06 9.11e-06 1.47e-05 9.02e-06 3.58e-06 3.17e-06 6.54e-06 3.48e-06 1.78e-06 9.01e-05 1.68e-05 5.2e-07 4.77e-06 5.99e-06 8.19e-06 1.35e-06 4.4e-07