logo

Genes within 1Mb (chr12:101993226:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 4.53e-02 0.117 0.0584 0.109 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 5.85e-01 0.0561 0.102 0.109 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 2.58e-02 0.138 0.0616 0.109 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 3.26e-02 -0.192 0.0892 0.109 B L1
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 2.34e-01 -0.122 0.102 0.109 B L1
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 8.99e-01 0.0112 0.0881 0.109 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 1.46e-01 -0.102 0.0702 0.109 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0369 0.0799 0.109 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 253754 sc-eQTL 7.26e-01 0.0445 0.127 0.109 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 3.75e-01 -0.108 0.121 0.109 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 3.17e-02 0.243 0.112 0.109 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 1.31e-01 0.139 0.0919 0.109 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 6.74e-03 0.335 0.123 0.109 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0884 0.0863 0.109 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0807 0.0955 0.109 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 2.41e-02 -0.21 0.0924 0.109 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 3.80e-01 0.0575 0.0653 0.109 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 1.17e-02 -0.287 0.113 0.109 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 4.99e-04 0.426 0.121 0.109 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 6.65e-01 0.0353 0.0814 0.109 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 1.14e-01 -0.162 0.102 0.109 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0253 0.113 0.109 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0273 0.0805 0.109 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 3.62e-02 0.241 0.114 0.109 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 9.96e-01 0.000687 0.126 0.113 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 2.86e-01 0.123 0.115 0.113 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 2.65e-01 -0.141 0.127 0.113 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 3.85e-01 0.118 0.136 0.113 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 7.38e-02 0.251 0.14 0.113 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0782 0.121 0.113 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00803 0.1 0.113 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 7.84e-01 0.0362 0.132 0.113 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 2.52e-01 -0.123 0.107 0.109 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 3.08e-01 0.0925 0.0906 0.109 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 4.07e-01 0.0944 0.114 0.109 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 1.31e-01 -0.191 0.126 0.109 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 5.52e-01 0.0696 0.117 0.109 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0371 0.103 0.109 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 4.93e-01 0.0575 0.0837 0.109 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 3.59e-01 -0.106 0.115 0.109 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 5.13e-02 0.209 0.106 0.109 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 9.82e-01 0.00171 0.0778 0.109 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 5.22e-01 0.0802 0.125 0.109 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 1.24e-01 -0.177 0.114 0.109 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 1.84e-01 0.115 0.0864 0.109 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 3.64e-01 -0.112 0.123 0.109 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0654 0.145 0.109 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 7.06e-01 0.0168 0.0444 0.109 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 5.30e-01 0.0531 0.0845 0.109 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 2.41e-02 0.277 0.122 0.109 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0309 0.0891 0.109 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 3.06e-01 0.143 0.139 0.109 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00899 0.101 0.109 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0162 0.0902 0.109 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 1.98e-01 -0.139 0.108 0.109 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0252 0.0901 0.109 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 3.32e-01 0.102 0.105 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 4.11e-01 0.0232 0.0282 0.112 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 9.38e-02 0.245 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0405 0.108 0.112 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 7.72e-02 -0.271 0.152 0.112 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 2.77e-01 -0.162 0.148 0.112 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 7.03e-01 0.0586 0.154 0.112 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 5.53e-01 -0.087 0.146 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 3.91e-01 0.126 0.147 0.112 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 253754 sc-eQTL 7.41e-01 0.0399 0.121 0.112 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 3.68e-01 -0.11 0.121 0.112 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 8.31e-01 0.0244 0.114 0.112 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0691 0.0588 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0516 0.147 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 3.06e-01 0.0808 0.0787 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0355 0.117 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0918 0.129 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 8.87e-01 0.0208 0.146 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 8.24e-01 0.0268 0.121 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0753 0.129 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 253754 sc-eQTL 7.08e-01 -0.051 0.136 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 1.26e-01 -0.218 0.142 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 4.63e-01 0.101 0.137 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0634 0.0538 0.11 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 2.71e-01 0.157 0.142 0.11 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 3.74e-02 0.193 0.092 0.11 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 3.97e-01 -0.108 0.127 0.11 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 1.12e-01 -0.222 0.139 0.11 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0472 0.139 0.11 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 7.80e-01 0.0348 0.124 0.11 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 3.66e-01 0.118 0.13 0.11 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 253754 sc-eQTL 9.23e-01 -0.013 0.134 0.11 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0948 0.137 0.11 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 4.41e-01 0.0964 0.125 0.11 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00667 0.0737 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 9.96e-01 0.000728 0.133 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 9.50e-02 0.116 0.0689 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 1.43e-01 -0.144 0.0976 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0641 0.116 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0797 0.13 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0698 0.0982 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00677 0.107 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 253754 sc-eQTL 5.73e-01 0.0817 0.145 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 2.78e-01 0.153 0.141 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 5.12e-02 0.256 0.131 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0191 0.065 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 5.53e-01 0.0792 0.133 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 1.93e-01 0.0928 0.071 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0758 0.11 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 7.91e-01 0.034 0.128 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 4.05e-01 0.117 0.14 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 1.58e-02 -0.294 0.121 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0944 0.121 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 253754 sc-eQTL 2.28e-01 0.154 0.127 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0407 0.147 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 8.35e-01 0.0265 0.127 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0962 0.143 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 3.12e-03 0.419 0.14 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 1.31e-01 -0.189 0.124 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 3.53e-01 -0.128 0.137 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 1.88e-01 0.192 0.145 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 9.42e-03 -0.361 0.138 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 5.03e-01 0.0719 0.107 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 2.10e-02 0.284 0.122 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0267 0.0954 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 8.80e-01 0.0157 0.104 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 5.82e-02 -0.213 0.112 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 8.09e-02 0.137 0.0781 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 6.31e-01 0.054 0.112 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 4.19e-03 0.367 0.127 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0559 0.1 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0954 0.125 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 5.73e-02 -0.222 0.116 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0376 0.077 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0156 0.136 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 4.14e-03 0.372 0.128 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 6.62e-01 0.055 0.126 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0119 0.136 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 3.97e-01 -0.109 0.128 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 7.69e-01 0.0338 0.115 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0769 0.121 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 4.18e-03 0.353 0.122 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 8.17e-01 0.0231 0.0993 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0501 0.134 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0346 0.133 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0425 0.113 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 3.60e-01 0.129 0.141 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 2.22e-02 -0.297 0.129 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 4.31e-03 0.367 0.127 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0593 0.116 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 1.78e-01 -0.167 0.123 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 8.46e-01 0.0261 0.135 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0565 0.0885 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 3.88e-01 0.118 0.137 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 2.65e-01 -0.156 0.139 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 2.66e-02 0.276 0.123 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 2.03e-01 -0.165 0.129 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 4.70e-01 -0.102 0.141 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0326 0.139 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0226 0.124 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 9.13e-01 0.0148 0.135 0.109 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 8.98e-01 0.0183 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 1.70e-01 0.184 0.133 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 1.33e-01 0.216 0.143 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0634 0.154 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 4.40e-01 0.114 0.147 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 3.76e-01 0.114 0.129 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 8.61e-01 0.0249 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0428 0.0482 0.11 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 4.46e-01 -0.103 0.135 0.11 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 1.53e-01 0.189 0.131 0.11 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 9.67e-01 0.00491 0.117 0.11 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 6.59e-01 0.0619 0.14 0.11 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 7.09e-01 0.0535 0.143 0.11 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 3.14e-01 0.12 0.119 0.11 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0526 0.135 0.11 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0341 0.132 0.11 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 8.76e-01 0.0183 0.117 0.11 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 2.46e-01 -0.17 0.146 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 3.30e-02 0.225 0.105 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 7.81e-01 -0.034 0.122 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 6.82e-02 -0.26 0.142 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0949 0.139 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 9.41e-01 0.00934 0.126 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 6.46e-01 0.0611 0.133 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 6.14e-01 0.0707 0.14 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 4.14e-01 -0.104 0.127 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 8.15e-02 0.216 0.124 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 8.53e-01 0.0175 0.0941 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 7.59e-01 0.0401 0.131 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 1.57e-01 -0.179 0.126 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 1.45e-01 0.157 0.108 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0483 0.131 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0764 0.148 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 1.38e-01 0.197 0.132 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 2.11e-01 0.171 0.136 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0121 0.11 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 4.17e-01 0.117 0.143 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00328 0.147 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0644 0.136 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 6.52e-02 -0.257 0.139 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0884 0.138 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 7.44e-01 0.043 0.131 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 2.51e-02 0.274 0.122 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 6.96e-01 0.0366 0.0934 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 3.71e-01 0.116 0.13 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0154 0.131 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 2.24e-01 0.125 0.103 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 2.51e-01 -0.154 0.134 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 4.64e-01 0.106 0.145 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0627 0.112 0.119 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0883 0.15 0.119 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 4.09e-01 0.0964 0.116 0.119 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 1.70e-01 -0.23 0.166 0.119 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 2.37e-01 -0.228 0.192 0.119 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0902 0.118 0.119 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 2.22e-01 -0.167 0.136 0.119 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 3.92e-01 0.119 0.138 0.119 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 253754 sc-eQTL 2.17e-01 0.199 0.16 0.119 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0049 0.148 0.119 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 9.60e-01 0.00683 0.137 0.119 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 8.42e-01 -0.00953 0.0478 0.111 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0932 0.0963 0.111 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 1.48e-03 0.402 0.125 0.111 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0262 0.0946 0.111 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 4.24e-01 0.108 0.135 0.111 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 2.08e-01 -0.128 0.102 0.111 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 3.03e-01 -0.115 0.111 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0653 0.0951 0.111 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0838 0.0881 0.111 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0233 0.0965 0.111 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 5.12e-01 0.0904 0.137 0.109 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 1.46e-02 0.348 0.141 0.109 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0565 0.125 0.109 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 4.41e-01 -0.105 0.136 0.109 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 1.04e-01 -0.228 0.14 0.109 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 9.93e-01 0.000946 0.114 0.109 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 6.09e-01 0.0644 0.126 0.112 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0995 0.122 0.112 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 4.96e-01 -0.108 0.158 0.112 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 1.36e-02 0.352 0.141 0.112 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 2.88e-03 0.438 0.145 0.112 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 1.12e-01 -0.221 0.139 0.112 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0452 0.109 0.112 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 1.86e-01 0.164 0.123 0.112 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 9.72e-01 0.00425 0.122 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 2.62e-01 0.103 0.0919 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 5.58e-01 0.0717 0.122 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 2.87e-01 -0.146 0.137 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 7.67e-01 0.0366 0.123 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0156 0.106 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 2.02e-01 0.116 0.0902 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 2.31e-01 -0.159 0.132 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 1.71e-01 0.139 0.101 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0717 0.124 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0525 0.145 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 2.70e-01 -0.15 0.136 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 3.62e-01 -0.115 0.126 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 6.12e-01 0.0498 0.0981 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 6.03e-01 0.0879 0.168 0.106 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 3.53e-01 0.147 0.158 0.106 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0666 0.119 0.106 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 2.39e-01 0.185 0.157 0.106 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 2.85e-01 -0.176 0.164 0.106 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 4.08e-01 0.127 0.153 0.106 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 8.91e-01 0.0214 0.156 0.106 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 6.98e-01 0.0598 0.153 0.106 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 5.82e-01 0.0775 0.14 0.106 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0809 0.134 0.109 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 3.29e-01 0.119 0.122 0.109 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 1.06e-01 0.232 0.143 0.109 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 1.38e-01 -0.199 0.134 0.109 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 6.32e-01 0.0668 0.139 0.109 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0637 0.134 0.109 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0485 0.118 0.109 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 2.94e-01 -0.14 0.133 0.113 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 8.37e-01 0.0253 0.123 0.113 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 1.53e-01 0.21 0.146 0.113 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 7.34e-02 -0.23 0.128 0.113 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 6.84e-01 0.0505 0.124 0.113 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 4.03e-01 0.0995 0.119 0.113 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 8.38e-01 0.0227 0.111 0.113 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00957 0.154 0.119 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 2.60e-01 0.151 0.133 0.119 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 8.51e-01 0.0267 0.141 0.119 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0758 0.141 0.119 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 8.26e-01 0.0326 0.148 0.119 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 5.70e-01 0.0735 0.129 0.119 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0682 0.0998 0.119 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 1.21e-01 -0.205 0.132 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 1.27e-01 -0.103 0.0673 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 3.77e-01 0.12 0.136 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 9.72e-02 0.118 0.0711 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0535 0.112 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 2.55e-01 -0.132 0.115 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 9.27e-01 0.012 0.131 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 7.31e-01 0.0337 0.0978 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 8.37e-01 0.0241 0.117 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 253754 sc-eQTL 3.66e-01 -0.122 0.135 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 1.77e-02 -0.333 0.139 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 5.44e-01 0.085 0.14 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -488518 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00689 0.0782 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 7.80e-01 0.0357 0.128 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 6.69e-02 0.115 0.0626 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 7.48e-02 -0.161 0.0897 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0144 0.111 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00152 0.126 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 1.26e-01 -0.144 0.094 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0721 0.099 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 253754 sc-eQTL 2.43e-01 0.167 0.143 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 4.42e-01 0.112 0.145 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -204359 sc-eQTL 9.66e-02 0.22 0.132 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 3.07e-01 -0.115 0.113 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 1.23e-01 0.141 0.0907 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 7.77e-01 0.0332 0.117 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 4.37e-01 -0.108 0.139 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 6.80e-01 -0.049 0.119 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0634 0.103 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 3.57e-01 0.078 0.0846 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 3.43e-01 -0.122 0.128 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 4.45e-01 0.086 0.112 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 1.40e-02 0.332 0.134 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 1.28e-02 -0.324 0.129 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 5.74e-01 0.0732 0.13 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 4.74e-01 0.0808 0.113 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 7.43e-01 0.032 0.0974 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -126894 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0365 0.122 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 296279 sc-eQTL 3.10e-02 0.256 0.118 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 162267 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00843 0.0816 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 713121 sc-eQTL 2.43e-01 0.146 0.125 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 585454 sc-eQTL 2.12e-01 -0.145 0.116 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 sc-eQTL 1.83e-01 0.125 0.0937 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 115646 sc-eQTL 2.32e-01 -0.151 0.126 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -126959 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0225 0.149 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 eQTL 0.000219 0.0704 0.019 0.0 0.0 0.129
ENSG00000136048 DRAM1 115646 eQTL 0.00239 -0.0658 0.0216 0.0 0.0 0.129
ENSG00000185480 PARPBP -126959 eQTL 9.43e-06 -0.154 0.0346 0.0 0.0 0.129

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120860 WASHC3 -68923 8.88e-06 9.55e-06 1.34e-06 4.87e-06 2.4e-06 4.2e-06 1.02e-05 2.07e-06 8.87e-06 4.92e-06 1.16e-05 5.17e-06 1.36e-05 3.95e-06 2.59e-06 6.47e-06 4.1e-06 7.6e-06 2.72e-06 2.77e-06 5.07e-06 9e-06 7.49e-06 3.28e-06 1.31e-05 4.03e-06 4.86e-06 3.75e-06 9.77e-06 8.12e-06 4.95e-06 9.52e-07 1.13e-06 3.28e-06 3.56e-06 2.7e-06 1.91e-06 1.95e-06 2.18e-06 1.04e-06 9.63e-07 1.2e-05 1.39e-06 1.9e-07 9.54e-07 1.81e-06 1.39e-06 7.04e-07 4.83e-07
ENSG00000136048 DRAM1 115646 5.07e-06 5.24e-06 6.25e-07 3.09e-06 1.58e-06 1.5e-06 5.67e-06 1.1e-06 5.05e-06 2.76e-06 6.14e-06 3.36e-06 7.69e-06 1.97e-06 1.04e-06 4.04e-06 1.94e-06 4.01e-06 1.44e-06 1.51e-06 2.67e-06 5.09e-06 4.6e-06 1.84e-06 7.72e-06 2.06e-06 2.42e-06 1.55e-06 4.56e-06 4.8e-06 2.83e-06 4.18e-07 7.54e-07 1.82e-06 2.13e-06 1.13e-06 1.08e-06 4.39e-07 9.13e-07 6.06e-07 7.54e-07 6.44e-06 5.98e-07 1.69e-07 8.11e-07 1.19e-06 1.14e-06 7.05e-07 5.74e-07
ENSG00000185480 PARPBP -126959 4.63e-06 4.83e-06 7.32e-07 2.68e-06 1.59e-06 1.68e-06 4.27e-06 1.07e-06 5.13e-06 2.5e-06 5.26e-06 3.54e-06 7.06e-06 2.34e-06 1.31e-06 3.89e-06 1.91e-06 3.71e-06 1.61e-06 1.18e-06 3.07e-06 4.9e-06 4.46e-06 1.48e-06 6.16e-06 1.95e-06 2.35e-06 1.85e-06 4.3e-06 4.34e-06 2.81e-06 5.58e-07 5.21e-07 1.52e-06 2e-06 1.16e-06 1.06e-06 4.24e-07 8.13e-07 4.88e-07 6.13e-07 5.56e-06 3.65e-07 1.59e-07 7.7e-07 9.82e-07 1.01e-06 5.52e-07 4.53e-07