Genes within 1Mb (chr12:101961571:AT:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 2.16e-01 0.0643 0.0518 0.171 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0243 0.0904 0.171 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 1.05e-02 0.14 0.0541 0.171 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0968 0.0792 0.171 B L1
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 5.00e-01 -0.061 0.0903 0.171 B L1
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 9.67e-01 0.00326 0.0777 0.171 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0637 0.062 0.171 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0536 0.0705 0.171 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 222099 sc-eQTL 7.74e-01 0.0322 0.112 0.171 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0942 0.107 0.171 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 8.34e-01 0.021 0.1 0.171 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 9.80e-01 0.00197 0.0798 0.171 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 2.75e-03 0.32 0.105 0.171 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 1.14e-02 -0.188 0.0736 0.171 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 6.45e-01 0.0381 0.0826 0.171 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 9.32e-01 0.00692 0.0808 0.171 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0567 0.0564 0.171 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 4.54e-03 -0.288 0.1 0.171 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 1.55e-03 0.347 0.108 0.171 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00533 0.0728 0.171 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 5.66e-01 0.0527 0.0918 0.171 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 8.48e-02 -0.174 0.101 0.171 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 4.78e-01 0.0511 0.0719 0.171 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 3.04e-01 0.106 0.103 0.171 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0834 0.112 0.169 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 4.21e-02 0.207 0.101 0.169 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 1.79e-01 -0.151 0.112 0.169 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 5.73e-01 0.0679 0.12 0.169 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 1.67e-01 0.172 0.124 0.169 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 6.59e-01 0.0474 0.107 0.169 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0426 0.0884 0.169 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 6.72e-01 0.0495 0.117 0.169 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 1.56e-01 -0.133 0.0935 0.171 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 2.92e-01 0.0838 0.0793 0.171 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 5.57e-01 0.0585 0.0996 0.171 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 3.04e-02 -0.24 0.11 0.171 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 6.15e-01 0.0516 0.102 0.171 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0197 0.09 0.171 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0117 0.0734 0.171 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 4.82e-02 -0.2 0.101 0.172 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 3.32e-02 0.2 0.0934 0.172 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0511 0.0683 0.172 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 8.58e-01 0.0197 0.11 0.172 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 2.42e-01 -0.118 0.101 0.172 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 5.43e-01 0.0465 0.0762 0.172 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0885 0.108 0.172 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 2.82e-01 -0.137 0.127 0.172 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 7.14e-01 0.0143 0.0389 0.171 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 7.86e-01 0.0201 0.0741 0.171 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 7.90e-02 0.19 0.107 0.171 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 4.51e-01 -0.059 0.078 0.171 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 8.95e-02 0.207 0.121 0.171 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 1.58e-01 -0.126 0.0886 0.171 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0738 0.0789 0.171 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0565 0.0948 0.171 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0396 0.079 0.171 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 8.34e-01 0.0193 0.0919 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 2.39e-01 0.0289 0.0244 0.176 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 2.48e-01 0.147 0.127 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00804 0.094 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 1.30e-02 -0.329 0.131 0.176 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 3.04e-01 -0.133 0.129 0.176 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00856 0.133 0.176 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 3.22e-01 -0.126 0.127 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 3.36e-02 0.27 0.126 0.176 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 222099 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0325 0.105 0.176 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000993 0.106 0.176 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 7.52e-01 0.0314 0.0992 0.176 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0526 0.0521 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 7.25e-01 0.0458 0.13 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 4.44e-01 0.0535 0.0698 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 8.73e-01 0.0165 0.103 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0663 0.115 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0351 0.129 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 2.08e-02 0.245 0.105 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 1.74e-01 -0.155 0.114 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 222099 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0427 0.12 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 2.99e-02 -0.273 0.125 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 2.14e-01 0.151 0.121 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 5.74e-01 0.027 0.048 0.17 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 7.35e-01 0.043 0.127 0.17 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 3.05e-01 0.0849 0.0826 0.17 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0992 0.113 0.17 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 1.10e-01 -0.199 0.124 0.17 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 8.01e-01 0.0312 0.124 0.17 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 4.73e-01 0.0795 0.111 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 3.48e-01 0.109 0.116 0.17 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 222099 sc-eQTL 6.82e-01 0.0491 0.119 0.17 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0587 0.122 0.17 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 6.43e-01 0.0516 0.111 0.17 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 7.94e-01 0.0169 0.0646 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 2.09e-01 -0.147 0.116 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 1.90e-01 0.0795 0.0605 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 7.02e-01 -0.033 0.0859 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 7.36e-01 0.0345 0.102 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 1.45e-01 -0.166 0.113 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 4.10e-01 -0.071 0.0861 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0397 0.0934 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 222099 sc-eQTL 4.65e-01 0.0928 0.127 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 1.17e-01 0.193 0.123 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 6.21e-01 0.0573 0.116 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0197 0.0571 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 2.59e-01 0.132 0.117 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 1.69e-02 0.149 0.0618 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 6.36e-01 -0.046 0.0971 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 7.58e-01 0.0347 0.113 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 8.04e-01 0.0307 0.124 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 1.72e-01 -0.147 0.107 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 2.62e-01 -0.12 0.106 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 222099 sc-eQTL 6.74e-01 0.0472 0.112 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0596 0.129 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 9.53e-01 0.00662 0.112 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 2.81e-01 -0.134 0.124 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 1.70e-02 0.296 0.123 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 5.85e-01 0.0596 0.109 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0868 0.12 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 4.21e-01 0.102 0.127 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 5.47e-02 -0.233 0.121 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0738 0.0932 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 5.70e-03 0.295 0.106 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 1.45e-01 -0.121 0.0825 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 4.48e-01 0.0687 0.0902 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0155 0.0979 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0297 0.0684 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 9.49e-01 0.00622 0.0965 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 7.67e-03 0.295 0.109 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 1.26e-02 -0.214 0.0849 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 6.05e-01 0.0559 0.108 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0293 0.101 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 1.18e-01 -0.103 0.0658 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0124 0.117 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 2.25e-02 0.256 0.112 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0821 0.109 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 2.35e-01 0.14 0.117 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0786 0.111 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0181 0.0996 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 3.08e-01 -0.108 0.106 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 1.57e-02 0.262 0.108 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0587 0.0871 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 6.30e-01 0.0568 0.118 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 3.03e-01 -0.12 0.116 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 6.66e-01 0.043 0.0995 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 2.95e-01 0.13 0.123 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 2.93e-02 -0.245 0.112 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 8.89e-03 0.292 0.111 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 4.40e-01 -0.078 0.101 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 9.64e-01 0.00484 0.107 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 2.99e-01 -0.121 0.116 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 5.12e-01 0.0503 0.0767 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0828 0.118 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 7.33e-02 -0.222 0.123 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 3.69e-02 0.232 0.11 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0924 0.115 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0515 0.126 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 6.98e-01 0.048 0.124 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 8.63e-01 0.0192 0.111 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 6.91e-01 -0.048 0.121 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 7.54e-01 0.0391 0.125 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 4.08e-01 0.0975 0.118 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 8.25e-01 0.0279 0.126 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 5.29e-01 0.0853 0.135 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 9.00e-01 0.0163 0.129 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 2.25e-01 0.137 0.113 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0349 0.125 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 1.37e-01 -0.0631 0.0423 0.171 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 8.43e-02 -0.205 0.118 0.171 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 2.86e-02 0.253 0.115 0.171 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0832 0.103 0.171 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 2.62e-01 0.138 0.123 0.171 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 3.98e-01 -0.106 0.126 0.171 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 9.35e-01 0.00861 0.105 0.171 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0842 0.119 0.171 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 3.12e-01 -0.118 0.116 0.171 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0593 0.103 0.171 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 3.84e-02 -0.266 0.127 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 1.29e-02 0.23 0.0918 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 9.31e-02 -0.18 0.107 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 2.29e-01 -0.151 0.125 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 4.08e-01 -0.102 0.123 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 9.71e-01 0.00401 0.111 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 2.60e-01 0.132 0.117 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0983 0.123 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 5.44e-02 -0.215 0.111 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 7.53e-02 0.194 0.109 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 5.30e-01 -0.052 0.0828 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 9.70e-01 0.00434 0.115 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 3.19e-01 -0.111 0.111 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 4.08e-01 0.079 0.0952 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0655 0.116 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00335 0.13 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 2.36e-01 0.139 0.117 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 3.20e-01 0.119 0.12 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0443 0.0964 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 4.72e-01 0.0908 0.126 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 8.19e-01 0.0296 0.129 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0512 0.12 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 2.82e-02 -0.268 0.121 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 2.52e-01 -0.138 0.121 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0654 0.114 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 4.44e-02 0.214 0.106 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0511 0.081 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0507 0.113 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0118 0.114 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 3.43e-01 0.085 0.0893 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 2.11e-01 -0.146 0.116 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 3.45e-01 0.119 0.126 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 6.43e-01 0.0447 0.0961 0.181 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 9.62e-01 0.0062 0.13 0.181 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 1.27e-01 0.153 0.0995 0.181 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 4.19e-02 -0.292 0.142 0.181 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 4.82e-01 -0.117 0.166 0.181 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 9.23e-01 0.00991 0.102 0.181 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 4.58e-02 -0.233 0.116 0.181 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 7.60e-01 0.0366 0.119 0.181 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 222099 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0432 0.139 0.181 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0151 0.127 0.181 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 1.52e-01 -0.168 0.117 0.181 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 9.05e-01 0.00503 0.0421 0.17 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 1.96e-01 -0.11 0.0846 0.17 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 9.96e-03 0.288 0.111 0.17 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0695 0.0831 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 8.20e-02 0.206 0.118 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 2.36e-01 -0.107 0.0896 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 2.93e-01 -0.103 0.0975 0.17 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 4.33e-01 0.0658 0.0837 0.17 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0711 0.0775 0.17 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0268 0.0849 0.17 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 3.75e-01 0.107 0.12 0.171 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 1.82e-03 0.385 0.122 0.171 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0605 0.109 0.171 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 7.69e-01 0.0349 0.119 0.171 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 6.41e-02 -0.227 0.122 0.171 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 8.73e-01 -0.016 0.0997 0.171 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 3.31e-01 -0.106 0.109 0.168 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 7.54e-01 0.0334 0.106 0.168 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 3.81e-01 -0.12 0.137 0.168 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 6.58e-02 0.228 0.123 0.168 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 3.25e-03 0.376 0.126 0.168 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 4.03e-01 -0.101 0.121 0.168 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 2.08e-01 -0.119 0.094 0.168 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 4.36e-01 0.0839 0.108 0.168 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00571 0.107 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 1.64e-01 0.113 0.0807 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 7.17e-01 0.039 0.107 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 2.16e-02 -0.276 0.119 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 2.20e-01 0.133 0.108 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0362 0.0934 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0201 0.0796 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 1.33e-02 -0.286 0.115 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 7.01e-01 0.0342 0.0891 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0757 0.108 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00213 0.127 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 2.27e-01 -0.144 0.119 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 4.94e-01 0.0756 0.11 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 8.91e-01 0.0118 0.086 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 5.05e-01 0.102 0.153 0.167 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0678 0.143 0.167 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 3.22e-01 -0.107 0.108 0.167 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 4.02e-01 0.12 0.142 0.167 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 1.23e-01 -0.23 0.148 0.167 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 2.45e-01 0.162 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 4.82e-01 0.0997 0.141 0.167 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 8.80e-01 0.021 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0183 0.127 0.167 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 1.64e-01 -0.162 0.116 0.171 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 3.45e-01 0.101 0.107 0.171 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 1.02e-01 0.205 0.125 0.171 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0722 0.117 0.171 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 3.64e-01 0.11 0.121 0.171 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0706 0.117 0.171 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0183 0.103 0.171 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00376 0.118 0.179 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 3.02e-01 0.113 0.109 0.179 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 3.46e-01 0.123 0.13 0.179 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 2.47e-02 -0.255 0.113 0.179 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0812 0.11 0.179 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 6.28e-01 0.0513 0.106 0.179 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 4.29e-01 0.0778 0.0982 0.179 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0465 0.141 0.172 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 3.69e-01 0.11 0.122 0.172 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0273 0.13 0.172 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0858 0.129 0.172 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0436 0.136 0.172 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 9.93e-01 0.00107 0.119 0.172 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0749 0.0915 0.172 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 2.57e-01 -0.138 0.121 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0171 0.0601 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 3.62e-01 0.11 0.121 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 2.49e-01 0.0732 0.0633 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0541 0.0998 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 5.20e-02 -0.199 0.102 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000384 0.116 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 1.03e-01 0.141 0.0863 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 6.55e-01 0.0466 0.104 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 222099 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0163 0.12 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 6.44e-02 -0.231 0.124 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 4.07e-01 0.103 0.124 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -520173 sc-eQTL 6.22e-01 0.0337 0.0683 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0665 0.112 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 4.98e-02 0.108 0.0547 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0629 0.0789 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 7.78e-01 0.0273 0.0967 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0949 0.11 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 2.17e-01 -0.102 0.0824 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0973 0.0864 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 222099 sc-eQTL 4.63e-01 0.0918 0.125 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 3.38e-01 0.122 0.127 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -236014 sc-eQTL 6.04e-01 0.0602 0.116 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 1.13e-01 -0.156 0.0979 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 2.19e-01 0.0978 0.0793 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 8.84e-01 -0.015 0.102 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 1.26e-01 -0.185 0.12 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 7.50e-01 0.0331 0.104 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0362 0.0901 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0248 0.0739 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0629 0.114 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 2.18e-01 0.123 0.0993 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 2.74e-02 0.265 0.119 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 3.87e-02 -0.239 0.115 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0354 0.115 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 7.70e-01 0.0293 0.1 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 4.71e-01 0.0622 0.0862 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -158549 sc-eQTL 1.35e-01 -0.16 0.107 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 264624 sc-eQTL 4.30e-02 0.211 0.104 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 130612 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0523 0.0715 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 681466 sc-eQTL 7.04e-01 0.0418 0.11 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 553799 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0961 0.102 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 sc-eQTL 4.68e-01 0.0599 0.0825 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 83991 sc-eQTL 2.51e-01 -0.127 0.111 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -158614 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0333 0.13 0.172 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120860 WASHC3 -100578 eQTL 0.0125 0.0382 0.0152 0.0 0.0 0.196
ENSG00000136048 DRAM1 83991 eQTL 0.00219 -0.0531 0.0173 0.0 0.0 0.196
ENSG00000185480 PARPBP -158614 eQTL 0.00219 -0.0856 0.0279 0.0 0.0 0.196
ENSG00000196091 MYBPC1 393218 pQTL 0.0132 -0.0547 0.022 0.00231 0.0 0.19
ENSG00000258230 AC063950.1 187816 eQTL 0.0455 0.0674 0.0337 0.0 0.0 0.196


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 83991 6.53e-05 2.13e-05 6.39e-06 9.91e-06 2.36e-06 7.78e-06 2.01e-05 1.49e-06 1.41e-05 6.24e-06 1.82e-05 8.18e-06 1.93e-05 7.19e-06 5.38e-06 7.69e-06 8.54e-06 1.18e-05 2.97e-06 2.41e-06 6.85e-06 1.31e-05 1.93e-05 2.27e-06 2.14e-05 4.61e-06 5.24e-06 4.66e-06 1.66e-05 1.15e-05 8.36e-06 4.33e-07 5.37e-07 2.99e-06 4.78e-06 3.78e-06 1.65e-06 1.97e-06 1.12e-06 4.16e-07 3.59e-07 1.97e-05 2.68e-06 2.01e-07 7.68e-07 2.35e-06 9.85e-07 6.35e-07 3.18e-07
ENSG00000185480 PARPBP -158614 1.59e-05 1e-05 2.38e-06 5.14e-06 1.51e-06 4.25e-06 1.06e-05 9.98e-07 6.39e-06 3.57e-06 1.07e-05 5.33e-06 9.55e-06 3.79e-06 3.17e-06 3.77e-06 3.76e-06 3.94e-06 1.56e-06 1.18e-06 2.73e-06 6.84e-06 7.49e-06 1.82e-06 9.14e-06 2.37e-06 2.43e-06 1.73e-06 8.7e-06 7.86e-06 4.02e-06 4.44e-08 3.74e-07 1.79e-06 2.07e-06 2.68e-06 1.1e-06 4.92e-07 1.18e-06 3.21e-07 1.09e-07 8.47e-06 1.38e-06 1.95e-07 2.86e-07 1.05e-06 5.13e-07 2.65e-07 9.5e-08