Genes within 1Mb (chr12:101951541:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 2.96e-02 0.15 0.0686 0.077 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 6.01e-01 0.0631 0.121 0.077 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 2.19e-03 0.222 0.0717 0.077 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0716 0.106 0.077 B L1
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 3.50e-01 -0.113 0.12 0.077 B L1
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 7.73e-01 -0.03 0.104 0.077 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 1.35e-01 -0.124 0.0826 0.077 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0841 0.094 0.077 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 212069 sc-eQTL 2.12e-01 -0.187 0.149 0.077 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 7.34e-02 -0.256 0.142 0.077 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0141 0.134 0.077 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 1.41e-01 0.162 0.109 0.077 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 9.09e-03 0.384 0.146 0.077 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 2.51e-01 -0.118 0.102 0.077 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 2.57e-01 -0.129 0.113 0.077 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 1.86e-01 -0.147 0.111 0.077 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 1.84e-01 -0.103 0.0775 0.077 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 6.34e-02 -0.253 0.136 0.077 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 1.36e-02 0.363 0.146 0.077 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 7.15e-01 0.0356 0.0972 0.077 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 3.68e-01 0.111 0.123 0.077 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 2.67e-01 -0.15 0.135 0.077 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0516 0.0962 0.077 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 1.84e-01 0.183 0.137 0.077 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 2.82e-01 -0.166 0.153 0.077 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 6.29e-01 0.0681 0.141 0.077 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 1.17e-01 -0.242 0.154 0.077 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0871 0.166 0.077 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 6.97e-01 0.0668 0.171 0.077 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 4.32e-01 -0.116 0.147 0.077 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0556 0.122 0.077 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 9.19e-01 0.0164 0.161 0.077 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0597 0.129 0.077 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 7.19e-01 0.0392 0.109 0.077 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0243 0.136 0.077 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 2.59e-01 -0.172 0.152 0.077 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 7.44e-01 0.0457 0.14 0.077 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0176 0.123 0.077 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 9.18e-01 0.0104 0.1 0.077 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 3.81e-01 -0.122 0.139 0.077 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 3.15e-02 0.276 0.128 0.077 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 5.08e-01 -0.062 0.0935 0.077 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 6.11e-01 0.0766 0.15 0.077 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 3.26e-01 -0.136 0.138 0.077 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 4.85e-01 0.0729 0.104 0.077 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 9.22e-01 0.0146 0.148 0.077 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 4.65e-01 -0.127 0.174 0.077 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 8.37e-01 0.0108 0.0525 0.077 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 4.23e-01 0.0802 0.0999 0.077 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 4.44e-02 0.293 0.145 0.077 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0317 0.105 0.077 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 1.90e-01 0.216 0.164 0.077 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0365 0.12 0.077 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 4.00e-02 -0.218 0.106 0.077 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0276 0.128 0.077 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 2.01e-01 -0.136 0.106 0.077 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0665 0.124 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 3.83e-01 0.029 0.0331 0.079 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 1.13e-01 0.273 0.171 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0356 0.127 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 5.46e-02 -0.346 0.179 0.079 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 5.02e-01 -0.118 0.175 0.079 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000701 0.181 0.079 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 3.35e-02 -0.364 0.17 0.079 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 4.08e-02 0.352 0.171 0.079 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 212069 sc-eQTL 6.92e-01 0.0563 0.142 0.079 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00532 0.143 0.079 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 6.66e-01 0.0581 0.134 0.079 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0846 0.0698 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0402 0.174 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 5.04e-02 0.183 0.0928 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 3.77e-01 0.122 0.138 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0682 0.154 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 6.84e-01 0.0706 0.173 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 6.15e-01 0.072 0.143 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 4.37e-01 -0.119 0.153 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 212069 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0996 0.161 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 5.45e-01 -0.103 0.169 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 3.67e-01 -0.146 0.162 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0218 0.063 0.078 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 2.68e-01 0.185 0.166 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 2.00e-02 0.252 0.107 0.078 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 8.69e-01 0.0245 0.149 0.078 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 1.67e-01 -0.226 0.163 0.078 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 1.98e-01 -0.209 0.162 0.078 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 7.14e-01 0.0533 0.145 0.078 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 5.99e-02 0.286 0.151 0.078 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 212069 sc-eQTL 8.79e-01 0.0239 0.157 0.078 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 3.04e-01 -0.165 0.16 0.078 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 5.99e-01 0.0769 0.146 0.078 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 4.71e-01 -0.063 0.0872 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0973 0.158 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 1.01e-02 0.21 0.0808 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0325 0.116 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 8.85e-01 0.02 0.138 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 4.85e-01 -0.108 0.154 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 1.86e-01 -0.154 0.116 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 2.57e-01 -0.143 0.126 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 212069 sc-eQTL 4.57e-01 -0.128 0.171 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 5.07e-01 0.111 0.167 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 9.95e-01 0.000982 0.156 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0255 0.0764 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 3.15e-01 0.158 0.156 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 7.24e-02 0.15 0.0832 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 9.87e-01 0.00207 0.13 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 6.94e-01 0.0593 0.151 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 2.45e-01 0.192 0.165 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 4.54e-02 -0.287 0.143 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 2.15e-01 -0.177 0.142 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 212069 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0701 0.15 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 4.24e-02 -0.35 0.172 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0783 0.149 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0907 0.169 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 4.28e-02 0.341 0.167 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 4.47e-01 -0.112 0.148 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0997 0.162 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0373 0.172 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 2.04e-02 -0.381 0.163 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 7.02e-01 0.049 0.128 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 1.77e-02 0.348 0.146 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0139 0.114 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0576 0.124 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 2.50e-01 -0.154 0.134 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0337 0.0939 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 3.17e-01 0.134 0.133 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 7.87e-03 0.407 0.152 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 3.88e-01 -0.103 0.119 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0988 0.149 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 3.55e-01 -0.129 0.139 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 8.04e-02 -0.16 0.091 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 5.53e-01 0.0968 0.163 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 3.80e-01 0.138 0.157 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 8.12e-01 0.036 0.151 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 4.14e-01 0.134 0.163 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 8.33e-01 0.0326 0.155 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 8.65e-01 0.0236 0.138 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0544 0.145 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 2.26e-01 0.18 0.148 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0371 0.119 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 8.35e-01 0.0336 0.161 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0833 0.159 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 9.56e-01 0.00749 0.136 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 4.92e-01 0.116 0.169 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 4.55e-02 -0.311 0.155 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 5.31e-03 0.429 0.152 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 8.62e-01 0.0243 0.139 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 3.80e-01 0.13 0.148 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0074 0.161 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0873 0.106 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 9.78e-01 0.00455 0.164 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 1.68e-01 -0.231 0.167 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 9.74e-02 0.249 0.149 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 2.53e-01 -0.178 0.155 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00417 0.17 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 1.77e-02 -0.393 0.164 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 8.25e-01 0.0332 0.149 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 2.44e-01 -0.19 0.162 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 2.71e-01 0.183 0.166 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 8.75e-01 0.0247 0.158 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 4.70e-01 0.122 0.169 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 5.94e-01 0.0965 0.181 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 7.12e-01 0.064 0.173 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 2.11e-01 0.189 0.151 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 7.64e-01 0.0502 0.167 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0251 0.0576 0.078 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 1.90e-01 -0.212 0.161 0.078 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 6.08e-02 0.295 0.156 0.078 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0551 0.14 0.078 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 3.88e-01 0.145 0.167 0.078 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00275 0.171 0.078 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 9.26e-01 0.0133 0.142 0.078 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 7.80e-01 0.0451 0.161 0.078 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 9.81e-01 0.00381 0.158 0.078 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 5.87e-01 -0.076 0.14 0.078 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 3.35e-02 -0.364 0.17 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 8.72e-02 0.213 0.124 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0284 0.144 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 5.74e-02 -0.318 0.167 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 2.33e-01 -0.196 0.164 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0752 0.148 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 2.30e-01 0.188 0.156 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 9.84e-01 0.00341 0.165 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 2.85e-01 -0.164 0.153 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 3.40e-02 0.316 0.148 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 4.58e-01 -0.084 0.113 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 6.01e-01 0.0822 0.157 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0932 0.152 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 4.17e-01 0.106 0.13 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 8.94e-01 -0.021 0.158 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0612 0.178 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 2.75e-01 0.17 0.155 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 4.94e-01 0.109 0.16 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 2.79e-01 -0.139 0.128 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 9.17e-02 0.283 0.167 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 7.62e-01 0.0521 0.172 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 6.54e-01 0.0715 0.159 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 2.95e-01 -0.172 0.163 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 2.53e-01 -0.184 0.161 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0415 0.155 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 4.59e-02 0.29 0.144 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 3.08e-01 -0.113 0.11 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 6.49e-01 0.0703 0.154 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0607 0.155 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 6.07e-01 0.0629 0.122 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0432 0.159 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 5.23e-01 0.11 0.172 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 2.14e-01 -0.168 0.134 0.074 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 8.48e-01 0.0349 0.182 0.074 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 2.26e-01 0.171 0.14 0.074 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 3.80e-01 -0.178 0.202 0.074 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 4.17e-01 -0.189 0.232 0.074 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 8.93e-01 0.0193 0.143 0.074 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 5.06e-01 -0.11 0.165 0.074 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 9.56e-01 0.00929 0.168 0.074 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 212069 sc-eQTL 2.38e-01 0.23 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0034 0.178 0.074 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 5.91e-01 -0.089 0.165 0.074 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 9.05e-01 0.00678 0.0565 0.078 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 3.67e-01 -0.103 0.114 0.078 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 1.53e-03 0.473 0.147 0.078 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 5.54e-01 0.0662 0.112 0.078 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 1.78e-01 0.215 0.159 0.078 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 1.26e-01 -0.184 0.12 0.078 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 1.05e-02 -0.334 0.129 0.078 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 3.96e-01 0.0956 0.112 0.078 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 5.18e-02 -0.202 0.103 0.078 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0824 0.114 0.078 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 3.54e-01 0.153 0.165 0.077 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 3.66e-02 0.357 0.17 0.077 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 8.41e-01 -0.03 0.15 0.077 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 6.73e-01 -0.069 0.163 0.077 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 1.23e-01 -0.26 0.168 0.077 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 1.80e-01 -0.184 0.137 0.077 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 2.88e-01 -0.162 0.152 0.078 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 3.68e-01 -0.134 0.148 0.078 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 3.82e-01 -0.167 0.191 0.078 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 4.01e-01 0.146 0.173 0.078 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 1.25e-01 0.275 0.179 0.078 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 1.82e-02 -0.396 0.166 0.078 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0589 0.132 0.078 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 6.01e-01 0.0786 0.15 0.078 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0197 0.146 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 6.10e-01 0.0561 0.11 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 9.67e-01 0.00611 0.146 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 3.92e-01 -0.141 0.164 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 8.79e-01 0.0224 0.147 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0762 0.127 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 7.46e-01 0.0351 0.108 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 3.17e-01 -0.161 0.161 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 6.05e-01 0.0639 0.123 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 3.32e-01 -0.146 0.15 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0253 0.176 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 2.21e-01 -0.202 0.165 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0189 0.153 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 8.25e-01 0.0264 0.119 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 7.43e-01 0.063 0.192 0.085 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00425 0.18 0.085 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 3.21e-01 -0.135 0.135 0.085 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 5.08e-01 0.119 0.179 0.085 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 9.59e-01 0.00957 0.188 0.085 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 7.17e-01 0.0637 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 4.37e-01 -0.138 0.178 0.085 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0908 0.175 0.085 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 7.58e-01 0.0494 0.16 0.085 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 1.38e-01 -0.241 0.162 0.073 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0115 0.149 0.073 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 7.14e-01 0.0641 0.175 0.073 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 5.96e-01 0.087 0.164 0.073 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 8.21e-01 0.0384 0.17 0.073 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0498 0.164 0.073 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0721 0.143 0.073 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0925 0.157 0.081 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 4.67e-01 -0.105 0.145 0.081 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 8.83e-01 0.0255 0.173 0.081 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 7.27e-02 -0.271 0.15 0.081 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 7.66e-01 0.0435 0.146 0.081 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 1.16e-01 0.22 0.139 0.081 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 2.45e-01 0.152 0.13 0.081 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 3.73e-01 0.165 0.185 0.082 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 2.20e-01 0.198 0.16 0.082 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 9.77e-01 -0.005 0.171 0.082 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 1.34e-01 -0.254 0.169 0.082 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 9.98e-01 0.000452 0.179 0.082 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 8.20e-01 0.0355 0.156 0.082 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 2.62e-01 -0.135 0.12 0.082 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 1.78e-01 -0.215 0.159 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0724 0.0801 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 2.97e-01 0.168 0.161 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 2.81e-02 0.185 0.0838 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 4.98e-01 0.0904 0.133 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 2.20e-01 -0.168 0.137 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0915 0.155 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 7.15e-01 0.0424 0.116 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 4.73e-01 0.0997 0.139 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 212069 sc-eQTL 3.23e-01 -0.158 0.16 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 2.06e-01 -0.212 0.167 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0769 0.166 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -530203 sc-eQTL 7.21e-01 -0.033 0.0924 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 9.75e-01 0.00472 0.151 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 7.70e-03 0.198 0.0734 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0375 0.107 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 8.78e-01 0.0202 0.131 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 9.57e-01 0.00797 0.149 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 1.16e-01 -0.175 0.111 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 5.00e-02 -0.229 0.116 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 212069 sc-eQTL 3.08e-01 -0.172 0.169 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 4.92e-01 -0.119 0.172 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -246044 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0188 0.157 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 4.13e-01 -0.109 0.133 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 3.17e-01 0.108 0.108 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0646 0.139 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 5.68e-01 -0.094 0.164 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0643 0.141 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 2.86e-01 -0.131 0.122 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 8.36e-01 0.0208 0.1 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0842 0.155 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0455 0.135 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 7.91e-01 0.0435 0.164 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 1.02e-01 -0.257 0.157 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 8.85e-01 0.0226 0.156 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 2.22e-01 0.166 0.135 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 6.92e-01 0.0465 0.117 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -168579 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0539 0.147 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 254594 sc-eQTL 3.02e-02 0.309 0.142 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 120582 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0838 0.098 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 671436 sc-eQTL 2.65e-01 0.168 0.15 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 543769 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0943 0.14 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 sc-eQTL 4.48e-01 0.0859 0.113 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 73961 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0434 0.152 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -168644 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0389 0.179 0.078 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 254594 eQTL 1.29e-03 0.137 0.0424 0.0 0.0 0.0922
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 eQTL 0.00577 0.0581 0.021 0.0 0.0 0.0922
ENSG00000136048 DRAM1 73961 eQTL 0.0166 -0.0572 0.0239 0.0 0.0 0.0922
ENSG00000185480 PARPBP -168644 eQTL 0.000482 -0.134 0.0383 0.0 0.0 0.0922
ENSG00000258230 AC063950.1 177786 eQTL 0.0481 0.0918 0.0464 0.0 0.0 0.0922


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120860 WASHC3 -110608 5.14e-06 5e-06 4.9e-07 3.49e-06 7.76e-07 1.57e-06 3.23e-06 9.86e-07 3.65e-06 1.57e-06 4.22e-06 3.22e-06 6.4e-06 1.99e-06 9.71e-07 3.22e-06 1.87e-06 2.74e-06 1.45e-06 9.73e-07 1.39e-06 3.79e-06 3.51e-06 1.62e-06 8.52e-06 1.23e-06 2.47e-06 1.49e-06 3.85e-06 4.15e-06 2.03e-06 5.93e-07 4.55e-07 1.83e-06 2.23e-06 8.7e-07 7.7e-07 4.41e-07 1.22e-06 5.32e-07 3.2e-07 5.71e-06 7.18e-07 1.32e-07 3.42e-07 3.33e-07 8.28e-07 2.42e-07 2.62e-07
ENSG00000136048 DRAM1 73961 9.14e-06 9.3e-06 8.35e-07 5.02e-06 1.73e-06 4.01e-06 8.7e-06 1.25e-06 4.75e-06 2.85e-06 8.18e-06 3.3e-06 9.86e-06 3.9e-06 9e-07 4.67e-06 2.99e-06 3.85e-06 1.5e-06 1.41e-06 2.79e-06 5.98e-06 5.36e-06 1.55e-06 1.34e-05 2.01e-06 4.04e-06 1.73e-06 5.98e-06 7.09e-06 2.91e-06 4.62e-07 7.53e-07 2.18e-06 3.13e-06 8.53e-07 9.21e-07 4.73e-07 9.45e-07 8.19e-07 2.79e-07 9.18e-06 1.39e-06 1.64e-07 6.11e-07 1.28e-06 1.13e-06 3.79e-07 1.78e-07
ENSG00000185480 PARPBP -168644 2.41e-06 2.59e-06 2.18e-07 1.88e-06 3.75e-07 7.92e-07 1.32e-06 4.16e-07 1.8e-06 6.36e-07 2.06e-06 1.25e-06 2.68e-06 1.39e-06 3.95e-07 1.24e-06 1.08e-06 1.3e-06 5.56e-07 5.44e-07 7.54e-07 1.88e-06 1.46e-06 5.94e-07 3.56e-06 7.6e-07 1.27e-06 8.57e-07 1.79e-06 1.66e-06 8.13e-07 2.78e-07 1.98e-07 5.83e-07 9e-07 4.44e-07 7.46e-07 2.15e-07 4.53e-07 4.35e-07 2.8e-07 2.78e-06 3.97e-07 1.5e-07 1.81e-07 2.45e-07 2.6e-07 3.73e-08 8.83e-08