Genes within 1Mb (chr12:101948696:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 2.91e-01 0.0551 0.0521 0.177 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0342 0.0908 0.177 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 1.36e-02 0.135 0.0544 0.177 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0829 0.0797 0.177 B L1
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0944 0.0906 0.177 B L1
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 9.42e-01 0.00564 0.078 0.177 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0703 0.0623 0.177 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0334 0.0708 0.177 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 209224 sc-eQTL 8.39e-01 0.0229 0.113 0.177 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 2.69e-01 -0.119 0.108 0.177 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 8.71e-01 0.0163 0.101 0.177 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0108 0.0799 0.177 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 2.70e-03 0.32 0.106 0.177 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 1.18e-02 -0.187 0.0736 0.177 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 5.69e-01 0.0472 0.0826 0.177 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00831 0.0808 0.177 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0566 0.0565 0.177 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 8.19e-03 -0.268 0.1 0.177 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 1.38e-03 0.35 0.108 0.177 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 9.54e-01 0.00417 0.0725 0.177 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 4.31e-01 0.0721 0.0914 0.177 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 7.01e-02 -0.182 0.1 0.177 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 5.99e-01 0.0377 0.0717 0.177 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 1.72e-01 0.14 0.102 0.177 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0969 0.11 0.176 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 6.35e-02 0.187 0.1 0.176 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0925 0.111 0.176 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 7.66e-01 0.0355 0.119 0.176 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 1.07e-01 0.198 0.122 0.176 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 7.48e-01 0.0342 0.106 0.176 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0324 0.0876 0.176 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 8.86e-01 0.0166 0.116 0.176 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 1.53e-01 -0.133 0.0931 0.177 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 2.52e-01 0.0907 0.0789 0.177 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 4.42e-01 0.0764 0.0992 0.177 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 1.51e-02 -0.267 0.109 0.177 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 7.83e-01 0.0281 0.102 0.177 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 6.80e-01 -0.037 0.0896 0.177 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0205 0.0731 0.177 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 3.35e-02 -0.215 0.1 0.178 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 2.43e-02 0.211 0.0931 0.178 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 2.79e-01 -0.074 0.0681 0.178 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 6.40e-01 0.0515 0.11 0.178 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 1.48e-01 -0.146 0.101 0.178 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 8.66e-01 0.0128 0.0762 0.178 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0943 0.108 0.178 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 2.96e-01 -0.133 0.127 0.178 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 4.55e-01 0.029 0.0388 0.177 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 8.85e-01 0.0107 0.074 0.177 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 1.20e-01 0.168 0.107 0.177 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0792 0.0778 0.177 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 5.35e-02 0.234 0.121 0.177 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 1.34e-01 -0.133 0.0883 0.177 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0861 0.0787 0.177 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0452 0.0946 0.177 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0508 0.0788 0.177 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 8.63e-01 0.0159 0.0917 0.177 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 2.49e-01 0.0282 0.0243 0.181 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 2.17e-01 0.156 0.126 0.181 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0245 0.0936 0.181 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 1.17e-02 -0.333 0.131 0.181 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 2.78e-01 -0.139 0.128 0.181 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 8.86e-01 0.0191 0.133 0.181 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 2.97e-01 -0.132 0.126 0.181 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 4.21e-02 0.257 0.126 0.181 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 209224 sc-eQTL 9.27e-01 0.00955 0.104 0.181 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 8.59e-01 0.0187 0.105 0.181 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 8.51e-01 0.0186 0.0987 0.181 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0524 0.0519 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 9.01e-01 0.0161 0.129 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 5.51e-01 0.0415 0.0694 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0144 0.103 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0957 0.114 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0611 0.128 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 2.48e-02 0.237 0.105 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 1.58e-01 -0.16 0.113 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 209224 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0686 0.12 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 5.57e-02 -0.24 0.125 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 1.96e-01 0.156 0.12 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 6.11e-01 0.0243 0.0478 0.177 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 7.26e-01 0.0443 0.126 0.177 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 3.55e-01 0.0762 0.0822 0.177 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0352 0.113 0.177 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 9.54e-02 -0.206 0.123 0.177 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 7.64e-01 0.0371 0.123 0.177 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 5.59e-01 0.0645 0.11 0.177 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 2.08e-01 0.145 0.115 0.177 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 209224 sc-eQTL 9.95e-01 0.000769 0.119 0.177 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 6.11e-01 -0.062 0.122 0.177 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 3.95e-01 0.0943 0.111 0.177 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 8.30e-01 0.0139 0.0647 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 2.12e-01 -0.146 0.117 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 3.03e-01 0.0627 0.0607 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00402 0.0861 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 9.68e-01 0.00412 0.102 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 1.53e-01 -0.163 0.114 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0705 0.0862 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0227 0.0936 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 209224 sc-eQTL 4.24e-01 0.102 0.127 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 2.44e-01 0.144 0.123 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 5.41e-01 0.0709 0.116 0.177 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0214 0.0571 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 3.63e-01 0.107 0.117 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 9.24e-03 0.162 0.0617 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0378 0.0971 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00318 0.113 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 7.58e-01 0.0381 0.124 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 1.45e-01 -0.156 0.107 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 3.44e-01 -0.101 0.106 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 209224 sc-eQTL 8.05e-01 0.0278 0.112 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0494 0.129 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0278 0.112 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 2.01e-01 -0.158 0.123 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 4.17e-02 0.251 0.123 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 6.38e-01 0.051 0.108 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0877 0.119 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 5.79e-01 0.0701 0.126 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 9.75e-02 -0.2 0.12 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0781 0.0931 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 4.53e-03 0.303 0.106 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 1.33e-01 -0.125 0.0825 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 3.23e-01 0.0892 0.0901 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0329 0.0979 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0262 0.0684 0.177 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0333 0.0962 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 6.41e-03 0.3 0.109 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 4.42e-03 -0.243 0.0843 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 9.48e-01 0.00703 0.108 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0203 0.101 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0984 0.0657 0.177 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0225 0.117 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 1.66e-02 0.267 0.111 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0964 0.108 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 1.83e-01 0.155 0.116 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0477 0.11 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 7.16e-01 -0.036 0.0989 0.177 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0898 0.106 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 1.68e-02 0.258 0.107 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0558 0.0868 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 5.66e-01 0.0674 0.117 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 2.13e-01 -0.145 0.116 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 7.51e-01 0.0315 0.0991 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 1.93e-01 0.16 0.123 0.177 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 6.42e-02 -0.208 0.112 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 5.03e-03 0.311 0.11 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 4.20e-01 -0.081 0.1 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 9.41e-01 0.00793 0.107 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 2.92e-01 -0.122 0.116 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 6.34e-01 0.0364 0.0763 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0597 0.118 0.177 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 6.50e-02 -0.228 0.123 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 3.03e-02 0.24 0.11 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0845 0.115 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0698 0.125 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 5.95e-01 0.0656 0.123 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 8.42e-01 0.0221 0.11 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00664 0.12 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 8.82e-01 0.0186 0.125 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 6.17e-01 0.0591 0.118 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 9.19e-01 0.0129 0.126 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 7.29e-01 0.0471 0.135 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0375 0.13 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 1.71e-01 0.155 0.113 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0591 0.125 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0591 0.0422 0.177 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 6.93e-02 -0.215 0.118 0.177 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 4.93e-02 0.227 0.115 0.177 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0834 0.103 0.177 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 1.79e-01 0.165 0.123 0.177 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 3.90e-01 -0.108 0.125 0.177 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 9.76e-01 0.00313 0.104 0.177 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 3.86e-01 -0.103 0.118 0.177 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 2.65e-01 -0.129 0.116 0.177 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0887 0.103 0.177 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 2.60e-02 -0.284 0.127 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 1.12e-02 0.234 0.0913 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 6.45e-02 -0.198 0.106 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 3.73e-01 -0.111 0.125 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 2.68e-01 -0.135 0.122 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0139 0.111 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 3.08e-01 0.118 0.116 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0827 0.123 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 4.11e-02 -0.228 0.111 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 6.04e-02 0.205 0.108 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0897 0.0824 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 8.15e-01 0.0269 0.115 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0848 0.111 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 7.50e-01 0.0303 0.0951 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0596 0.115 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0258 0.13 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 2.67e-01 0.129 0.116 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 2.54e-01 0.136 0.119 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0365 0.0959 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 3.85e-01 0.109 0.125 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00527 0.128 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0569 0.119 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 3.11e-02 -0.262 0.121 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 2.31e-01 -0.144 0.12 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0396 0.114 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 4.85e-02 0.21 0.106 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0803 0.0808 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0376 0.113 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0442 0.114 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 4.99e-01 0.0605 0.0894 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 1.35e-01 -0.174 0.116 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 3.29e-01 0.123 0.126 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 6.18e-01 0.0479 0.0957 0.185 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00538 0.129 0.185 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 9.47e-02 0.167 0.0989 0.185 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 7.32e-02 -0.256 0.142 0.185 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0693 0.165 0.185 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 8.90e-01 0.0141 0.102 0.185 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 3.69e-02 -0.243 0.115 0.185 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 6.32e-01 0.0571 0.119 0.185 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 209224 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0451 0.138 0.185 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0524 0.126 0.185 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 1.37e-01 -0.174 0.116 0.185 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 9.49e-01 0.00267 0.0419 0.174 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0964 0.0843 0.174 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 3.72e-02 0.233 0.111 0.174 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0773 0.0827 0.174 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 3.22e-02 0.252 0.117 0.174 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 1.96e-01 -0.116 0.0891 0.174 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 2.36e-01 -0.115 0.097 0.174 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 4.26e-01 0.0665 0.0833 0.174 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0481 0.0772 0.174 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0381 0.0845 0.174 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 3.90e-01 0.103 0.119 0.177 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 2.05e-03 0.378 0.121 0.177 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0498 0.108 0.177 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 6.44e-01 0.0546 0.118 0.177 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 4.56e-02 -0.243 0.121 0.177 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0414 0.099 0.177 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 3.24e-01 -0.107 0.108 0.176 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 7.63e-01 0.0318 0.106 0.176 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0726 0.136 0.176 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 1.23e-01 0.19 0.123 0.176 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 5.49e-04 0.436 0.124 0.176 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0954 0.12 0.176 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0998 0.0933 0.176 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 6.51e-01 0.0484 0.107 0.176 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0533 0.107 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 1.20e-01 0.125 0.0803 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 6.38e-01 0.0505 0.107 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 1.05e-02 -0.307 0.119 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 3.94e-01 0.0921 0.108 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0654 0.093 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0266 0.0794 0.177 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 1.76e-02 -0.274 0.114 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 7.75e-01 0.0254 0.0889 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0593 0.108 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0282 0.127 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 2.79e-01 -0.129 0.119 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 4.22e-01 0.0885 0.11 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 8.19e-01 0.0197 0.0858 0.177 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 4.54e-01 0.113 0.151 0.176 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0465 0.142 0.176 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 2.16e-01 -0.132 0.106 0.176 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 3.62e-01 0.129 0.141 0.176 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 1.49e-01 -0.213 0.147 0.176 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 3.98e-01 0.117 0.138 0.176 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 3.53e-01 0.13 0.14 0.176 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 8.31e-01 0.0294 0.138 0.176 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0624 0.126 0.176 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 2.24e-01 -0.142 0.116 0.178 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 2.84e-01 0.114 0.106 0.178 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 7.05e-02 0.226 0.124 0.178 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0472 0.117 0.178 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 3.62e-01 0.111 0.121 0.178 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0585 0.117 0.178 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0295 0.102 0.178 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 7.84e-01 0.0322 0.118 0.183 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 3.42e-01 0.103 0.108 0.183 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 3.17e-01 0.13 0.13 0.183 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 2.22e-02 -0.259 0.112 0.183 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0981 0.109 0.183 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 5.73e-01 0.0593 0.105 0.183 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 3.27e-01 0.0961 0.0977 0.183 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0528 0.14 0.178 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 4.82e-01 0.0858 0.122 0.178 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 8.09e-01 0.0312 0.129 0.178 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 3.85e-01 -0.112 0.128 0.178 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0737 0.135 0.178 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0262 0.118 0.178 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0794 0.091 0.178 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 2.16e-01 -0.15 0.121 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0161 0.0597 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 4.74e-01 0.0859 0.12 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 3.42e-01 0.0599 0.0629 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0475 0.0991 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 2.69e-02 -0.225 0.101 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00615 0.115 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 1.52e-01 0.123 0.0858 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 5.88e-01 0.056 0.103 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 209224 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0446 0.119 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 1.01e-01 -0.204 0.124 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 2.81e-01 0.133 0.123 0.177 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -533048 sc-eQTL 6.60e-01 0.0301 0.0684 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 5.09e-01 -0.074 0.112 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 6.28e-02 0.103 0.0548 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0451 0.0791 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00719 0.0969 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0953 0.11 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 2.08e-01 -0.104 0.0825 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0663 0.0867 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 209224 sc-eQTL 4.79e-01 0.0887 0.125 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 4.93e-01 0.0875 0.127 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -248889 sc-eQTL 6.51e-01 0.0525 0.116 0.177 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 8.12e-02 -0.171 0.0974 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 1.85e-01 0.105 0.079 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000278 0.102 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 6.31e-02 -0.224 0.12 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 9.21e-01 0.0102 0.103 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 5.71e-01 -0.051 0.0898 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0298 0.0737 0.177 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 9.87e-01 0.00192 0.114 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 2.60e-01 0.112 0.099 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 1.99e-02 0.279 0.119 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 7.06e-02 -0.209 0.115 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 6.14e-01 -0.058 0.115 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 6.94e-01 0.0393 0.0997 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 4.31e-01 0.0678 0.0859 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -171424 sc-eQTL 1.23e-01 -0.165 0.106 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 251749 sc-eQTL 3.86e-02 0.215 0.103 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 117737 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0742 0.0714 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 668591 sc-eQTL 5.51e-01 0.0655 0.11 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 540924 sc-eQTL 2.80e-01 -0.11 0.102 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 sc-eQTL 7.72e-01 0.0239 0.0825 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 71116 sc-eQTL 2.23e-01 -0.135 0.11 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -171489 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0427 0.13 0.179 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120860 WASHC3 -113453 eQTL 0.0195 0.036 0.0154 0.0 0.0 0.196
ENSG00000136048 DRAM1 71116 eQTL 0.00214 -0.0536 0.0174 0.0 0.0 0.196
ENSG00000185480 PARPBP -171489 eQTL 0.00418 -0.0807 0.0281 0.0 0.0 0.196
ENSG00000196091 MYBPC1 380343 pQTL 0.0228 -0.0506 0.0222 0.00169 0.0 0.19
ENSG00000258230 AC063950.1 174941 eQTL 0.0356 0.0714 0.0339 0.0 0.0 0.196


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 71116 1.26e-05 1.51e-05 1.87e-06 1.22e-05 2.46e-06 4.74e-06 1.55e-05 2.18e-06 1.24e-05 5.42e-06 1.57e-05 5.73e-06 2.18e-05 5.48e-06 3.67e-06 8.04e-06 4.93e-06 9.67e-06 3.6e-06 3.14e-06 5.84e-06 1.05e-05 1.03e-05 3.66e-06 2.1e-05 3.74e-06 7.19e-06 5.22e-06 1.33e-05 9.7e-06 7.63e-06 1.09e-06 1.14e-06 3.54e-06 6.33e-06 3.03e-06 1.91e-06 1.84e-06 2.04e-06 1.4e-06 7.73e-07 1.7e-05 1.57e-06 1.9e-07 6.84e-07 1.72e-06 1.39e-06 6.9e-07 4.7e-07
ENSG00000185480 PARPBP -171489 4.74e-06 4.6e-06 3.28e-07 3.57e-06 4.49e-07 7.26e-07 2.53e-06 5.85e-07 2.52e-06 1.17e-06 3.14e-06 1.38e-06 4.79e-06 2.15e-06 9.15e-07 2.03e-06 9.82e-07 2.15e-06 1.45e-06 1.2e-06 1.32e-06 3.09e-06 2.88e-06 1.8e-06 3.75e-06 9.68e-07 1.56e-06 1.81e-06 2.39e-06 2.29e-06 1.81e-06 5.93e-07 6.01e-07 1.33e-06 1.73e-06 9.05e-07 9.41e-07 4.1e-07 1.33e-06 3.28e-07 2.83e-07 3.87e-06 4.55e-07 1.87e-07 3.01e-07 3.61e-07 3.5e-07 2.64e-07 2.05e-07