logo

Genes within 1Mb (chr12:101929211:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0341 0.0475 0.216 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00276 0.0827 0.216 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 8.54e-04 -0.166 0.049 0.216 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 5.99e-01 0.0383 0.0727 0.216 B L1
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0173 0.0827 0.216 B L1
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 9.69e-01 0.00277 0.0711 0.216 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 1.38e-02 -0.139 0.0561 0.216 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 3.35e-01 0.0622 0.0644 0.216 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 189739 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0141 0.103 0.216 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 8.05e-01 0.0243 0.0982 0.216 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0102 0.0916 0.216 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00988 0.0767 0.216 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 6.52e-09 -0.578 0.0956 0.216 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 1.45e-02 0.175 0.0708 0.216 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 3.60e-01 0.0726 0.0792 0.216 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 7.46e-01 0.0252 0.0776 0.216 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 2.54e-03 -0.162 0.0532 0.216 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0703 0.0945 0.216 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 9.19e-08 -0.53 0.0958 0.216 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 2.87e-03 0.199 0.0659 0.216 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 8.76e-01 0.0132 0.0849 0.216 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 7.90e-01 0.025 0.0937 0.216 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0677 0.0664 0.216 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 1.25e-01 0.146 0.0948 0.216 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0069 0.106 0.221 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 1.31e-03 -0.308 0.0946 0.221 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 2.91e-01 0.113 0.106 0.221 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0787 0.114 0.221 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 1.30e-01 0.179 0.118 0.221 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 1.06e-01 -0.165 0.101 0.221 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 1.98e-01 0.108 0.0838 0.221 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0103 0.111 0.221 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 2.66e-01 0.0997 0.0893 0.216 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 4.64e-04 -0.262 0.0737 0.216 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0173 0.0951 0.216 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 2.82e-01 0.114 0.106 0.216 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 8.83e-03 0.254 0.096 0.216 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 7.12e-03 -0.229 0.0844 0.216 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 1.53e-01 0.0999 0.0697 0.216 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 4.42e-02 0.191 0.0946 0.215 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 2.82e-07 -0.442 0.0832 0.215 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0317 0.0642 0.215 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 5.90e-01 0.0558 0.103 0.215 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 6.00e-01 0.0499 0.095 0.215 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 5.74e-02 -0.136 0.071 0.215 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0066 0.102 0.215 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 4.35e-01 0.0935 0.119 0.215 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0441 0.0369 0.216 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 5.59e-01 0.0413 0.0705 0.216 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 2.70e-05 -0.424 0.0989 0.216 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 1.76e-01 0.101 0.0741 0.216 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 4.53e-02 0.232 0.115 0.216 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0388 0.0847 0.216 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0625 0.0752 0.216 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 6.01e-01 0.0472 0.0902 0.216 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 6.66e-02 -0.138 0.0746 0.216 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 4.87e-02 -0.172 0.0867 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 9.03e-01 0.00277 0.0228 0.23 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0633 0.118 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 2.73e-02 -0.192 0.086 0.23 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 3.12e-01 0.125 0.124 0.23 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0472 0.12 0.23 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0268 0.124 0.23 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 2.78e-01 0.128 0.118 0.23 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 9.33e-01 0.00991 0.119 0.23 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 189739 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0475 0.0973 0.23 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0792 0.0978 0.23 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 1.00e-01 -0.151 0.0913 0.23 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 5.85e-01 -0.026 0.0476 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 6.70e-02 -0.217 0.118 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 5.19e-01 -0.041 0.0636 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 7.76e-01 0.0268 0.0941 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 8.51e-01 0.0196 0.105 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 9.78e-01 0.00326 0.118 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 3.88e-02 -0.2 0.0962 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 2.97e-01 0.109 0.104 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 189739 sc-eQTL 1.12e-01 -0.174 0.109 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 8.79e-02 0.196 0.114 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 3.57e-01 -0.102 0.11 0.217 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00219 0.0446 0.216 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0537 0.118 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 8.06e-03 -0.202 0.0755 0.216 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 5.98e-01 0.0555 0.105 0.216 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 1.33e-01 0.173 0.115 0.216 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0617 0.115 0.216 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0634 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 5.70e-01 0.0612 0.108 0.216 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 189739 sc-eQTL 7.33e-02 0.198 0.11 0.216 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 4.88e-01 0.0787 0.113 0.216 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 9.97e-01 0.000452 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0407 0.0599 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 5.45e-01 0.0658 0.108 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 9.47e-03 -0.145 0.0555 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 4.49e-01 0.0604 0.0796 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 1.00e-01 -0.155 0.0941 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 7.77e-01 -0.03 0.106 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0375 0.0799 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 3.09e-01 0.0882 0.0865 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 189739 sc-eQTL 7.04e-01 0.0448 0.118 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0832 0.114 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 3.08e-01 -0.109 0.107 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0214 0.053 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0589 0.109 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 5.35e-02 -0.112 0.0577 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 5.07e-01 0.0598 0.0901 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0243 0.105 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 5.55e-03 0.316 0.113 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 9.15e-02 -0.168 0.0993 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 9.97e-01 0.000381 0.099 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 189739 sc-eQTL 2.05e-01 -0.132 0.104 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 2.12e-01 0.15 0.12 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0151 0.104 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 4.09e-01 0.0965 0.117 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 3.76e-03 -0.336 0.115 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 6.81e-01 0.0421 0.102 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 1.70e-01 0.154 0.112 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 3.39e-01 -0.114 0.119 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 5.06e-01 0.0761 0.114 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0464 0.0883 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 3.23e-08 -0.544 0.0948 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 2.53e-04 0.283 0.0761 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 6.56e-01 0.0381 0.0855 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 5.87e-01 0.0504 0.0927 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 9.22e-03 -0.168 0.0638 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 7.28e-01 0.0323 0.0931 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 4.26e-08 -0.569 0.1 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 7.33e-01 0.0284 0.0831 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0544 0.104 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0481 0.0973 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0522 0.0638 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0342 0.11 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 4.13e-06 -0.476 0.101 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 1.10e-01 0.163 0.101 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 8.46e-01 0.0214 0.11 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 4.19e-02 0.211 0.103 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 2.48e-01 -0.108 0.0931 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0219 0.101 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 5.54e-07 -0.502 0.0972 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0319 0.0825 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0894 0.111 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 1.83e-01 0.147 0.11 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 1.73e-01 -0.128 0.0938 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 6.72e-02 0.214 0.116 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 2.10e-01 -0.134 0.106 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 2.49e-05 -0.438 0.102 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 1.21e-02 0.237 0.0937 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 4.85e-01 0.0706 0.101 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 3.15e-01 -0.11 0.11 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 2.99e-01 0.0752 0.0722 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 4.42e-01 0.0859 0.111 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 5.96e-02 0.219 0.115 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 2.33e-06 -0.48 0.0985 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 1.87e-01 0.142 0.108 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 7.90e-01 0.0313 0.118 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 6.19e-02 0.215 0.115 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 7.43e-02 -0.184 0.103 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 5.18e-01 0.0732 0.113 0.218 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0249 0.118 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 2.75e-03 -0.33 0.109 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 2.56e-01 0.135 0.119 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0143 0.128 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 9.14e-01 0.0133 0.122 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0224 0.107 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 3.37e-01 -0.113 0.118 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0135 0.0396 0.219 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 6.75e-01 0.0466 0.111 0.219 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 9.52e-08 -0.559 0.101 0.219 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 6.03e-02 0.18 0.0952 0.219 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 1.26e-01 0.176 0.114 0.219 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 7.49e-01 0.0377 0.117 0.219 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0947 0.0973 0.219 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 6.81e-01 0.0455 0.111 0.219 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 1.69e-01 0.149 0.108 0.219 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 2.64e-02 -0.212 0.0949 0.219 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 4.77e-01 0.0883 0.124 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 2.93e-03 -0.264 0.0878 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 4.29e-01 0.082 0.103 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 2.33e-01 0.144 0.121 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0847 0.118 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 2.65e-01 0.119 0.107 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 2.93e-01 -0.118 0.112 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 1.75e-01 0.161 0.118 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 2.21e-01 0.129 0.105 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 4.66e-07 -0.505 0.097 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0324 0.0779 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 2.60e-01 0.122 0.108 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 3.97e-02 0.214 0.104 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 3.83e-02 -0.185 0.0888 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 4.41e-01 0.0839 0.109 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 6.81e-01 0.0504 0.123 0.216 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0512 0.111 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 1.27e-03 -0.362 0.111 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0349 0.0914 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0603 0.12 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0842 0.122 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00549 0.113 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 9.48e-01 0.00767 0.117 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0373 0.115 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 4.16e-01 0.0869 0.107 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 4.13e-04 -0.348 0.097 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0465 0.0759 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0726 0.106 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 3.03e-01 -0.11 0.106 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0325 0.0839 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0284 0.109 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 1.38e-01 -0.175 0.117 0.216 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0294 0.086 0.204 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 1.09e-01 0.185 0.115 0.204 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0985 0.0894 0.204 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 3.96e-01 0.11 0.129 0.204 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 3.61e-01 0.136 0.148 0.204 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0151 0.0912 0.204 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0387 0.105 0.204 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 2.50e-01 0.123 0.106 0.204 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 189739 sc-eQTL 7.70e-01 0.0364 0.124 0.204 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 8.56e-01 0.0207 0.114 0.204 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 3.75e-01 0.0934 0.105 0.204 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0572 0.0402 0.215 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0609 0.0813 0.215 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 7.23e-03 -0.288 0.106 0.215 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 2.85e-01 0.0853 0.0796 0.215 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 2.93e-01 0.12 0.114 0.215 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 6.64e-01 0.0374 0.0862 0.215 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0475 0.0936 0.215 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0133 0.0803 0.215 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0652 0.0743 0.215 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0402 0.0814 0.215 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 6.89e-02 -0.206 0.112 0.216 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 3.61e-08 -0.627 0.11 0.216 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0328 0.103 0.216 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 3.23e-01 0.111 0.112 0.216 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 4.29e-01 0.0917 0.116 0.216 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 1.08e-01 -0.151 0.0936 0.216 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 8.25e-01 0.0232 0.105 0.229 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 4.52e-02 -0.204 0.101 0.229 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 9.03e-01 -0.016 0.132 0.229 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 3.42e-01 -0.113 0.119 0.229 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 1.80e-01 0.166 0.123 0.229 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 3.89e-01 -0.1 0.116 0.229 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 4.69e-01 0.0657 0.0905 0.229 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0338 0.103 0.229 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0177 0.102 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 2.05e-03 -0.236 0.0756 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0317 0.103 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 8.57e-01 0.0208 0.115 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 1.34e-01 0.155 0.103 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 1.75e-01 -0.121 0.0887 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 1.98e-01 0.0977 0.0757 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 8.48e-03 0.29 0.109 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 8.27e-02 -0.147 0.0845 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 6.86e-01 0.0418 0.103 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 1.70e-01 0.166 0.121 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 5.22e-02 0.22 0.113 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 1.91e-02 -0.246 0.104 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 2.93e-01 0.0863 0.0819 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 1.83e-01 0.192 0.143 0.218 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 3.62e-01 -0.123 0.135 0.218 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0155 0.102 0.218 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 4.10e-01 0.111 0.134 0.218 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 2.90e-01 0.149 0.141 0.218 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0965 0.131 0.218 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0705 0.134 0.218 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 9.25e-01 0.0124 0.131 0.218 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 1.63e-01 -0.168 0.12 0.218 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 3.68e-01 0.1 0.111 0.213 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 3.15e-02 -0.218 0.1 0.213 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 1.13e-01 -0.189 0.119 0.213 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 3.35e-01 0.108 0.111 0.213 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0845 0.115 0.213 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 1.72e-01 -0.152 0.111 0.213 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 5.61e-01 0.0568 0.0976 0.213 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 6.23e-02 -0.209 0.111 0.213 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 1.52e-04 -0.386 0.1 0.213 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 5.15e-01 0.081 0.124 0.213 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 4.43e-01 0.0834 0.108 0.213 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 1.51e-01 0.15 0.104 0.213 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 7.07e-02 -0.181 0.0996 0.213 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 2.86e-01 0.0998 0.0932 0.213 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 7.44e-01 0.0443 0.135 0.24 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 3.29e-02 -0.25 0.116 0.24 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 1.82e-03 0.384 0.121 0.24 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 5.14e-01 0.0812 0.124 0.24 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0575 0.131 0.24 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 1.45e-01 -0.166 0.113 0.24 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0249 0.0881 0.24 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0981 0.117 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0287 0.0556 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 1.21e-01 -0.173 0.111 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 1.49e-02 -0.142 0.058 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 5.58e-01 0.0542 0.0923 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 1.59e-01 0.134 0.0947 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0576 0.108 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 5.98e-02 -0.151 0.0797 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 4.15e-01 0.0785 0.0961 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 189739 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0719 0.111 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 5.13e-01 0.0761 0.116 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0645 0.115 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -552533 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0397 0.0636 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 9.34e-01 0.00859 0.104 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 1.92e-03 -0.158 0.0503 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 7.11e-01 0.0273 0.0736 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 6.98e-02 -0.163 0.0895 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 2.91e-01 0.109 0.103 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0898 0.0768 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 4.83e-01 0.0566 0.0807 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 189739 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0114 0.117 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000964 0.119 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -268374 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0658 0.108 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 2.50e-01 0.108 0.0941 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 7.47e-03 -0.203 0.075 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 8.69e-01 0.0162 0.0982 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 4.72e-01 0.0836 0.116 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 1.86e-02 0.232 0.098 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 4.98e-02 -0.169 0.0856 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 1.21e-01 0.11 0.0705 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0811 0.108 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 1.89e-05 -0.395 0.0901 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 3.40e-01 -0.109 0.114 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 4.51e-01 0.0827 0.11 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 3.88e-01 0.094 0.109 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 1.05e-02 -0.24 0.0931 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 6.75e-01 0.0342 0.0815 0.216 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -190909 sc-eQTL 9.91e-02 0.166 0.1 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 232264 sc-eQTL 3.76e-07 -0.485 0.0924 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 98252 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0369 0.0672 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 649106 sc-eQTL 7.71e-01 0.0301 0.103 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 521439 sc-eQTL 3.60e-01 0.0877 0.0956 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 sc-eQTL 4.42e-02 -0.156 0.0768 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 51631 sc-eQTL 7.46e-01 0.0338 0.104 0.216 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -190974 sc-eQTL 9.78e-01 0.00336 0.123 0.216 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 232264 eQTL 1.89e-23 -0.28 0.0273 0.0 0.0 0.228
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 eQTL 0.034 -0.0301 0.0142 0.0 0.0 0.228
ENSG00000185480 PARPBP -190974 eQTL 0.0251 0.0583 0.026 0.0 0.0 0.228
ENSG00000258230 AC063950.1 155456 eQTL 0.0295 -0.0682 0.0313 0.0 0.0 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 232264 1.49e-06 2.19e-06 2.53e-07 1.57e-06 3.85e-07 6.48e-07 1.23e-06 3.93e-07 1.72e-06 6.9e-07 1.95e-06 1.15e-06 2.64e-06 8.7e-07 4.07e-07 9.67e-07 1.14e-06 1.08e-06 5.65e-07 8.15e-07 6.12e-07 1.92e-06 1.34e-06 6.22e-07 2.34e-06 7.43e-07 1.01e-06 1.05e-06 1.7e-06 1.26e-06 7.57e-07 2.8e-07 3.55e-07 5.82e-07 8.35e-07 5.22e-07 6.55e-07 3.63e-07 5.35e-07 2.42e-07 2.69e-07 2.12e-06 5.93e-07 1.74e-07 3.15e-07 3.26e-07 2.27e-07 2.23e-07 2.83e-07
ENSG00000120860 WASHC3 -132938 4.24e-06 4.79e-06 6.9e-07 2.79e-06 7.58e-07 1.03e-06 3.02e-06 9.78e-07 4.09e-06 1.92e-06 4.33e-06 3.3e-06 7.02e-06 2.33e-06 1.25e-06 2.03e-06 2.02e-06 2.38e-06 1.42e-06 9.64e-07 1.92e-06 4.25e-06 3.45e-06 1.88e-06 4.89e-06 1.28e-06 1.9e-06 1.81e-06 3.92e-06 3.38e-06 2.53e-06 4.51e-07 7.1e-07 1.49e-06 2.07e-06 9.19e-07 9.07e-07 4.49e-07 1.25e-06 3.46e-07 2.25e-07 4.93e-06 3.47e-07 1.77e-07 3.45e-07 3.22e-07 8.67e-07 2.41e-07 2.87e-07
ENSG00000257202 \N 4492 2.55e-05 2.7e-05 5.65e-06 1.36e-05 4.62e-06 1.19e-05 3.74e-05 4.07e-06 2.57e-05 1.37e-05 3.3e-05 1.42e-05 4.07e-05 1.14e-05 6.21e-06 1.49e-05 1.35e-05 2.16e-05 6.74e-06 6.02e-06 1.26e-05 2.79e-05 2.61e-05 7.87e-06 3.73e-05 6.84e-06 1.11e-05 1.1e-05 2.8e-05 2.19e-05 1.73e-05 1.54e-06 2.24e-06 6.43e-06 1.04e-05 4.67e-06 2.72e-06 2.98e-06 4e-06 3.17e-06 1.72e-06 3.22e-05 2.95e-06 2.96e-07 2.12e-06 3.29e-06 3.77e-06 1.44e-06 1.55e-06