logo

Genes within 1Mb (chr12:101921748:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00379 0.0472 0.205 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 8.90e-01 0.0113 0.0821 0.205 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 1.34e-03 -0.158 0.0487 0.205 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 9.23e-01 0.00698 0.0722 0.205 B L1
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0217 0.0821 0.205 B L1
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00125 0.0706 0.205 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 7.46e-02 -0.1 0.0561 0.205 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 5.92e-01 0.0344 0.064 0.205 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 182276 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0241 0.102 0.205 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 9.57e-01 0.00526 0.0975 0.205 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 8.17e-01 -0.021 0.0909 0.205 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0891 0.0763 0.205 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 5.42e-08 -0.543 0.0963 0.205 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 3.08e-02 0.154 0.0708 0.205 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 5.42e-01 0.0483 0.0791 0.205 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 8.93e-01 0.0104 0.0774 0.205 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 3.06e-02 -0.117 0.0536 0.205 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 2.10e-01 -0.118 0.0939 0.205 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 2.45e-06 -0.469 0.0969 0.205 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 1.04e-02 0.171 0.066 0.205 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 4.25e-01 0.0676 0.0845 0.205 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0282 0.0933 0.205 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0299 0.0663 0.205 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 2.10e-01 0.119 0.0947 0.205 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0651 0.105 0.207 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 2.02e-02 -0.222 0.0946 0.207 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 2.73e-01 0.116 0.105 0.207 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0996 0.113 0.207 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 3.70e-01 0.105 0.117 0.207 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 2.78e-01 -0.109 0.1 0.207 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 2.40e-01 0.0977 0.0829 0.207 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0563 0.11 0.207 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 1.50e-01 0.127 0.0876 0.205 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 4.54e-05 -0.299 0.0717 0.205 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0206 0.0935 0.205 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 3.71e-01 0.0933 0.104 0.205 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 4.42e-02 0.192 0.095 0.205 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 1.31e-02 -0.208 0.0832 0.205 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 5.56e-01 0.0405 0.0688 0.205 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 6.35e-03 0.261 0.0947 0.204 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 4.65e-06 -0.4 0.0851 0.204 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0311 0.0648 0.204 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 7.39e-01 0.0348 0.104 0.204 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 8.37e-01 0.0198 0.0959 0.204 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 1.46e-01 -0.105 0.072 0.204 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0362 0.103 0.204 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 2.63e-01 0.135 0.12 0.204 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 8.49e-01 -0.00704 0.037 0.205 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 5.59e-01 0.0413 0.0705 0.205 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 5.62e-05 -0.408 0.0991 0.205 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 7.91e-01 0.0197 0.0743 0.205 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 2.02e-01 0.148 0.116 0.205 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0838 0.0845 0.205 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0414 0.0752 0.205 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 8.60e-01 0.016 0.0902 0.205 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 1.62e-01 -0.105 0.0748 0.205 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 2.60e-02 -0.194 0.0864 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 9.83e-01 0.000495 0.023 0.214 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0397 0.119 0.214 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 1.76e-02 -0.208 0.0866 0.214 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 6.15e-01 0.063 0.125 0.214 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0342 0.121 0.214 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 9.09e-01 0.0144 0.125 0.214 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 3.70e-01 0.107 0.119 0.214 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 4.62e-01 0.0879 0.119 0.214 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 182276 sc-eQTL 9.69e-01 0.00387 0.0982 0.214 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0629 0.0987 0.214 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0949 0.0926 0.214 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0101 0.0473 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 7.76e-02 -0.207 0.117 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0667 0.063 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0149 0.0934 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00729 0.104 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 8.75e-01 0.0183 0.117 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 8.14e-02 -0.168 0.0958 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 4.46e-01 0.079 0.103 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 182276 sc-eQTL 2.46e-02 -0.244 0.108 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 1.16e-01 0.179 0.114 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 2.69e-01 -0.121 0.109 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 6.64e-01 0.0191 0.0439 0.205 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 9.92e-01 0.00122 0.116 0.205 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 2.81e-03 -0.224 0.0742 0.205 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 4.18e-01 0.084 0.104 0.205 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 3.36e-02 0.241 0.113 0.205 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 7.72e-01 0.0329 0.113 0.205 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0463 0.101 0.205 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0343 0.106 0.205 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 182276 sc-eQTL 3.71e-01 0.0978 0.109 0.205 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 3.69e-01 0.101 0.112 0.205 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 7.87e-01 0.0276 0.102 0.205 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0454 0.0597 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 3.92e-01 0.0927 0.108 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 1.16e-02 -0.141 0.0554 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 4.33e-01 0.0624 0.0795 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 1.04e-01 -0.153 0.0939 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0804 0.105 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0423 0.0798 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 4.89e-01 0.0599 0.0864 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 182276 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00531 0.118 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0966 0.114 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 3.37e-01 -0.103 0.107 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0498 0.0526 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0421 0.108 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 5.29e-02 -0.111 0.0573 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 4.99e-01 0.0606 0.0894 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0133 0.104 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 1.36e-02 0.279 0.112 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0514 0.0992 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 3.19e-01 -0.098 0.0981 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 182276 sc-eQTL 4.87e-01 -0.072 0.103 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 1.53e-01 0.17 0.119 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0512 0.103 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 6.39e-01 0.0548 0.117 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 1.93e-02 -0.272 0.115 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0856 0.102 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 3.09e-01 0.114 0.112 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0513 0.119 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 4.84e-01 0.0801 0.114 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 1.00e-01 -0.145 0.088 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 1.46e-07 -0.521 0.0957 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 2.81e-03 0.233 0.0771 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0404 0.0857 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 9.39e-01 0.00709 0.093 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 8.02e-02 -0.113 0.0645 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0169 0.0923 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 1.80e-07 -0.539 0.0998 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 9.62e-01 0.0039 0.0824 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 6.51e-01 0.0468 0.103 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0588 0.0965 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0532 0.0632 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 7.97e-01 0.0279 0.108 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 1.02e-04 -0.397 0.1 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 2.71e-02 0.22 0.099 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 8.04e-01 0.027 0.108 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 6.69e-02 0.187 0.102 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0949 0.0914 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0721 0.101 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 1.39e-05 -0.44 0.0989 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0471 0.0826 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 9.72e-01 0.004 0.112 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 2.83e-01 0.119 0.11 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 3.46e-01 -0.089 0.0942 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 1.23e-02 0.292 0.116 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 1.05e-01 -0.171 0.105 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 2.16e-04 -0.383 0.102 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 3.46e-02 0.199 0.0935 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 2.96e-01 0.105 0.1 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 2.14e-01 -0.135 0.109 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 1.41e-01 0.106 0.0715 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 5.07e-01 0.0737 0.111 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 2.03e-01 0.149 0.116 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 2.61e-05 -0.431 0.1 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 1.47e-01 0.157 0.108 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 3.46e-01 0.111 0.118 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 4.25e-01 0.0928 0.116 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 1.36e-01 -0.155 0.103 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 7.52e-01 0.0359 0.113 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 6.77e-01 -0.049 0.117 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 5.99e-03 -0.303 0.109 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 4.76e-01 0.0849 0.119 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0562 0.128 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00193 0.122 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 8.71e-01 0.0174 0.107 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 2.41e-01 -0.138 0.117 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 5.61e-01 -0.023 0.0396 0.208 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 4.59e-01 0.0824 0.111 0.208 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 3.31e-08 -0.578 0.101 0.208 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 1.92e-01 0.125 0.0956 0.208 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 1.59e-01 0.162 0.115 0.208 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0118 0.117 0.208 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00974 0.0976 0.208 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 9.57e-01 0.00603 0.111 0.208 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 2.37e-02 0.244 0.107 0.208 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 4.62e-03 -0.27 0.0942 0.208 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 2.34e-01 0.148 0.124 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 9.20e-03 -0.232 0.0883 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 5.12e-01 0.0681 0.104 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 6.51e-02 0.223 0.12 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 4.13e-01 -0.097 0.118 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 3.19e-02 0.229 0.106 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 1.91e-01 -0.147 0.112 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 1.52e-01 0.17 0.118 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 2.42e-01 0.125 0.107 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 2.06e-05 -0.436 0.1 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0627 0.0789 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 4.77e-01 0.078 0.11 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 9.66e-02 0.176 0.105 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 1.01e-01 -0.149 0.0904 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 5.90e-01 0.0596 0.11 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 4.86e-01 0.0866 0.124 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00716 0.113 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 1.10e-02 -0.294 0.115 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00861 0.0936 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 2.26e-01 -0.148 0.122 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 1.81e-01 -0.167 0.124 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0716 0.116 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0635 0.119 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000554 0.117 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 1.18e-01 0.168 0.107 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 3.19e-03 -0.295 0.0988 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0584 0.0765 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 5.62e-01 -0.062 0.107 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 2.98e-01 -0.112 0.107 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 9.90e-01 0.0011 0.0847 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0841 0.11 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0928 0.119 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 3.87e-01 0.0742 0.0855 0.2 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 8.60e-02 0.197 0.114 0.2 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 8.37e-02 -0.154 0.0884 0.2 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 5.68e-01 0.0736 0.129 0.2 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 9.88e-02 0.243 0.146 0.2 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 9.62e-01 0.00429 0.0909 0.2 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0407 0.105 0.2 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 1.83e-01 0.142 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 182276 sc-eQTL 7.23e-01 0.0438 0.124 0.2 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0447 0.113 0.2 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 1.80e-01 0.14 0.104 0.2 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0162 0.0408 0.204 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0311 0.0823 0.204 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 8.13e-03 -0.287 0.107 0.204 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 5.98e-01 0.0425 0.0806 0.204 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 3.63e-01 0.105 0.115 0.204 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0463 0.0871 0.204 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 1.46e-01 -0.138 0.0942 0.204 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 2.34e-01 0.0966 0.0809 0.204 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0722 0.0751 0.204 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0506 0.0823 0.204 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 8.66e-02 -0.191 0.111 0.205 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 5.53e-08 -0.612 0.109 0.205 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 9.88e-01 0.00147 0.102 0.205 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 4.88e-01 0.0769 0.111 0.205 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 4.62e-01 0.0843 0.114 0.205 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 2.47e-01 -0.108 0.0928 0.205 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 8.93e-01 0.0139 0.103 0.212 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 3.11e-01 -0.102 0.1 0.212 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 7.65e-01 0.0388 0.13 0.212 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 3.20e-01 -0.117 0.117 0.212 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 2.30e-01 0.146 0.121 0.212 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0942 0.114 0.212 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 8.21e-01 0.0202 0.0891 0.212 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0799 0.101 0.212 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 8.22e-01 0.0227 0.101 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 2.78e-04 -0.272 0.0736 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 1.00e+00 5.67e-05 0.101 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 5.97e-01 0.0599 0.113 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 4.61e-01 0.0749 0.101 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0846 0.0873 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 4.60e-01 0.0552 0.0745 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 1.03e-02 0.278 0.107 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 2.59e-02 -0.185 0.0827 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 5.59e-01 0.0595 0.102 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 2.28e-01 0.144 0.119 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 2.27e-01 0.135 0.112 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 2.40e-02 -0.233 0.102 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 9.01e-01 0.01 0.0807 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 3.43e-01 0.134 0.141 0.209 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 2.21e-01 -0.163 0.132 0.209 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0831 0.0998 0.209 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 7.56e-01 0.0412 0.132 0.209 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 4.03e-01 0.116 0.138 0.209 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 4.09e-01 -0.107 0.129 0.209 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 2.19e-01 -0.161 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 8.68e-01 0.0216 0.129 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 3.50e-01 -0.11 0.118 0.209 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 5.51e-01 0.0656 0.11 0.202 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 2.05e-02 -0.232 0.0992 0.202 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 1.05e-01 -0.191 0.117 0.202 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 5.29e-01 0.0696 0.11 0.202 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 7.67e-01 -0.034 0.114 0.202 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0612 0.111 0.202 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 5.24e-01 0.0617 0.0966 0.202 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 1.55e-01 -0.16 0.112 0.201 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 7.63e-04 -0.345 0.101 0.201 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0167 0.124 0.201 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0289 0.109 0.201 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 1.60e-01 0.147 0.104 0.201 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 1.03e-01 -0.163 0.0998 0.201 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 9.34e-01 0.00774 0.0935 0.201 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00574 0.134 0.226 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 1.41e-01 -0.172 0.116 0.226 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 1.18e-02 0.308 0.121 0.226 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 5.23e-01 0.0785 0.123 0.226 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 2.57e-01 -0.147 0.129 0.226 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0768 0.113 0.226 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 5.25e-01 0.0555 0.0871 0.226 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 2.72e-01 -0.127 0.115 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0222 0.055 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 3.39e-01 -0.106 0.11 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 3.55e-03 -0.168 0.057 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 8.02e-01 0.023 0.0914 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 1.64e-01 0.131 0.0937 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 9.96e-01 0.00055 0.106 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 1.30e-01 -0.12 0.079 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 4.34e-01 0.0744 0.095 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 182276 sc-eQTL 2.16e-01 -0.136 0.109 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 4.64e-01 0.0841 0.115 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0414 0.114 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -559996 sc-eQTL 3.28e-01 -0.062 0.0633 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 6.00e-01 0.0544 0.104 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 4.96e-03 -0.143 0.0503 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 7.74e-01 0.0211 0.0734 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 1.01e-01 -0.147 0.0892 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 5.19e-01 0.0661 0.102 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0551 0.0766 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 8.39e-01 0.0163 0.0804 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 182276 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0178 0.116 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 9.66e-01 0.00511 0.118 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -275837 sc-eQTL 3.22e-01 -0.107 0.107 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 1.13e-01 0.146 0.092 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 3.95e-04 -0.262 0.0726 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 7.90e-01 0.0257 0.0963 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 3.66e-01 0.103 0.114 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 1.67e-01 0.135 0.0969 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 6.74e-02 -0.155 0.0841 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 4.66e-01 0.0507 0.0694 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 6.89e-01 -0.043 0.107 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 4.47e-05 -0.376 0.0901 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 1.83e-01 -0.151 0.113 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 9.59e-01 0.00558 0.109 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 3.36e-01 0.104 0.108 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 9.63e-02 -0.156 0.0935 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0117 0.0812 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -198372 sc-eQTL 2.05e-02 0.235 0.1 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 224801 sc-eQTL 1.27e-05 -0.424 0.0949 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 90789 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0428 0.068 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 641643 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000896 0.104 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 513976 sc-eQTL 5.49e-01 0.0581 0.0968 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -140401 sc-eQTL 8.42e-02 -0.135 0.0779 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 44168 sc-eQTL 9.99e-01 0.00014 0.105 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -198437 sc-eQTL 6.98e-01 0.0481 0.124 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 224801 eQTL 3.86e-24 -0.282 0.0271 0.0 0.0 0.227
ENSG00000139351 SYCP3 182279 eQTL 0.0438 -0.0817 0.0405 0.0 0.0 0.227
ENSG00000258230 AC063950.1 147993 eQTL 0.0255 -0.0695 0.0311 0.0 0.0 0.227

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 224801 1.15e-05 5.11e-06 4.62e-07 3.88e-06 4.49e-07 1.71e-06 4.29e-06 6.43e-07 4.99e-06 1.23e-06 5.38e-06 1.39e-06 7.69e-06 1.98e-06 1.33e-06 2.1e-06 2.06e-06 3.18e-06 1.32e-06 9.17e-07 1.67e-06 3.5e-06 3.48e-06 1.2e-06 4.89e-06 1.06e-06 1.84e-06 1.43e-06 4.26e-06 4.13e-06 2.62e-06 3.97e-07 7.75e-07 1.22e-06 2.05e-06 9.25e-07 8.74e-07 4.68e-07 9.13e-07 3.28e-07 2.59e-07 6.52e-06 4.23e-07 5.7e-08 3.14e-07 3.96e-07 3.02e-07 1.95e-07 3.24e-07
ENSG00000257202 \N -2971 4.16e-05 3.47e-05 6.41e-06 1.6e-05 6.21e-06 1.52e-05 4.83e-05 4.92e-06 3.52e-05 1.69e-05 4.22e-05 1.91e-05 5.27e-05 1.52e-05 7.47e-06 2.12e-05 1.92e-05 2.83e-05 8.46e-06 7.09e-06 1.72e-05 3.73e-05 3.46e-05 9.6e-06 4.81e-05 8.74e-06 1.6e-05 1.41e-05 3.51e-05 2.64e-05 2.2e-05 1.63e-06 2.78e-06 7.58e-06 1.21e-05 5.98e-06 3.19e-06 3.21e-06 5.03e-06 3.36e-06 1.74e-06 4.09e-05 3.99e-06 3.63e-07 2.67e-06 4.34e-06 4.3e-06 1.69e-06 1.52e-06
ENSG00000258230 AC063950.1 147993 2.47e-05 9.28e-06 7.1e-07 6.53e-06 9.66e-07 4.24e-06 9.3e-06 9.79e-07 6.04e-06 2.81e-06 9.01e-06 3.27e-06 1.12e-05 3.87e-06 1.55e-06 4.09e-06 3.63e-06 3.86e-06 1.65e-06 1.58e-06 2.82e-06 6.58e-06 4.69e-06 1.94e-06 9.06e-06 1.81e-06 3.1e-06 1.75e-06 6.66e-06 7.09e-06 4.75e-06 4.34e-07 8.87e-07 1.54e-06 3.58e-06 1.6e-06 1.02e-06 5.58e-07 1.57e-06 4.27e-07 2.54e-07 9.28e-06 4e-07 1.49e-07 3.69e-07 1.18e-06 8.16e-07 6.45e-07 5.97e-07