logo

Genes within 1Mb (chr12:101917357:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00379 0.0472 0.205 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 8.90e-01 0.0113 0.0821 0.205 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 1.34e-03 -0.158 0.0487 0.205 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 9.23e-01 0.00698 0.0722 0.205 B L1
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0217 0.0821 0.205 B L1
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00125 0.0706 0.205 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 7.46e-02 -0.1 0.0561 0.205 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 5.92e-01 0.0344 0.064 0.205 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 177885 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0241 0.102 0.205 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 9.57e-01 0.00526 0.0975 0.205 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 8.17e-01 -0.021 0.0909 0.205 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0891 0.0763 0.205 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 5.42e-08 -0.543 0.0963 0.205 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 3.08e-02 0.154 0.0708 0.205 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 5.42e-01 0.0483 0.0791 0.205 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 8.93e-01 0.0104 0.0774 0.205 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 3.06e-02 -0.117 0.0536 0.205 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 2.10e-01 -0.118 0.0939 0.205 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 2.45e-06 -0.469 0.0969 0.205 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 1.04e-02 0.171 0.066 0.205 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 4.25e-01 0.0676 0.0845 0.205 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0282 0.0933 0.205 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0299 0.0663 0.205 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 2.10e-01 0.119 0.0947 0.205 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0651 0.105 0.207 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 2.02e-02 -0.222 0.0946 0.207 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 2.73e-01 0.116 0.105 0.207 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0996 0.113 0.207 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 3.70e-01 0.105 0.117 0.207 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 2.78e-01 -0.109 0.1 0.207 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 2.40e-01 0.0977 0.0829 0.207 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0563 0.11 0.207 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 1.50e-01 0.127 0.0876 0.205 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 4.54e-05 -0.299 0.0717 0.205 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0206 0.0935 0.205 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 3.71e-01 0.0933 0.104 0.205 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 4.42e-02 0.192 0.095 0.205 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 1.31e-02 -0.208 0.0832 0.205 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 5.56e-01 0.0405 0.0688 0.205 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 6.35e-03 0.261 0.0947 0.204 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 4.65e-06 -0.4 0.0851 0.204 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0311 0.0648 0.204 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 7.39e-01 0.0348 0.104 0.204 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 8.37e-01 0.0198 0.0959 0.204 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 1.46e-01 -0.105 0.072 0.204 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0362 0.103 0.204 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 2.63e-01 0.135 0.12 0.204 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 8.49e-01 -0.00704 0.037 0.205 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 5.59e-01 0.0413 0.0705 0.205 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 5.62e-05 -0.408 0.0991 0.205 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 7.91e-01 0.0197 0.0743 0.205 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 2.02e-01 0.148 0.116 0.205 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0838 0.0845 0.205 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0414 0.0752 0.205 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 8.60e-01 0.016 0.0902 0.205 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 1.62e-01 -0.105 0.0748 0.205 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 2.60e-02 -0.194 0.0864 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 9.83e-01 0.000495 0.023 0.214 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0397 0.119 0.214 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 1.76e-02 -0.208 0.0866 0.214 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 6.15e-01 0.063 0.125 0.214 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0342 0.121 0.214 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 9.09e-01 0.0144 0.125 0.214 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 3.70e-01 0.107 0.119 0.214 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 4.62e-01 0.0879 0.119 0.214 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 177885 sc-eQTL 9.69e-01 0.00387 0.0982 0.214 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0629 0.0987 0.214 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0949 0.0926 0.214 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0101 0.0473 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 7.76e-02 -0.207 0.117 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0667 0.063 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0149 0.0934 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00729 0.104 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 8.75e-01 0.0183 0.117 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 8.14e-02 -0.168 0.0958 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 4.46e-01 0.079 0.103 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 177885 sc-eQTL 2.46e-02 -0.244 0.108 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 1.16e-01 0.179 0.114 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 2.69e-01 -0.121 0.109 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 6.64e-01 0.0191 0.0439 0.205 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 9.92e-01 0.00122 0.116 0.205 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 2.81e-03 -0.224 0.0742 0.205 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 4.18e-01 0.084 0.104 0.205 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 3.36e-02 0.241 0.113 0.205 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 7.72e-01 0.0329 0.113 0.205 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0463 0.101 0.205 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0343 0.106 0.205 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 177885 sc-eQTL 3.71e-01 0.0978 0.109 0.205 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 3.69e-01 0.101 0.112 0.205 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 7.87e-01 0.0276 0.102 0.205 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0454 0.0597 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 3.92e-01 0.0927 0.108 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 1.16e-02 -0.141 0.0554 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 4.33e-01 0.0624 0.0795 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 1.04e-01 -0.153 0.0939 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0804 0.105 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0423 0.0798 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 4.89e-01 0.0599 0.0864 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 177885 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00531 0.118 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0966 0.114 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 3.37e-01 -0.103 0.107 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0498 0.0526 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0421 0.108 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 5.29e-02 -0.111 0.0573 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 4.99e-01 0.0606 0.0894 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0133 0.104 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 1.36e-02 0.279 0.112 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0514 0.0992 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 3.19e-01 -0.098 0.0981 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 177885 sc-eQTL 4.87e-01 -0.072 0.103 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 1.53e-01 0.17 0.119 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0512 0.103 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 6.39e-01 0.0548 0.117 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 1.93e-02 -0.272 0.115 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0856 0.102 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 3.09e-01 0.114 0.112 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0513 0.119 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 4.84e-01 0.0801 0.114 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 1.00e-01 -0.145 0.088 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 1.46e-07 -0.521 0.0957 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 2.81e-03 0.233 0.0771 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0404 0.0857 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 9.39e-01 0.00709 0.093 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 8.02e-02 -0.113 0.0645 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0169 0.0923 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 1.80e-07 -0.539 0.0998 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 9.62e-01 0.0039 0.0824 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 6.51e-01 0.0468 0.103 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0588 0.0965 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0532 0.0632 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 7.97e-01 0.0279 0.108 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 1.02e-04 -0.397 0.1 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 2.71e-02 0.22 0.099 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 8.04e-01 0.027 0.108 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 6.69e-02 0.187 0.102 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0949 0.0914 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0721 0.101 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 1.39e-05 -0.44 0.0989 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0471 0.0826 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 9.72e-01 0.004 0.112 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 2.83e-01 0.119 0.11 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 3.46e-01 -0.089 0.0942 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 1.23e-02 0.292 0.116 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 1.05e-01 -0.171 0.105 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 2.16e-04 -0.383 0.102 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 3.46e-02 0.199 0.0935 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 2.96e-01 0.105 0.1 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 2.14e-01 -0.135 0.109 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 1.41e-01 0.106 0.0715 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 5.07e-01 0.0737 0.111 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 2.03e-01 0.149 0.116 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 2.61e-05 -0.431 0.1 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 1.47e-01 0.157 0.108 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 3.46e-01 0.111 0.118 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 4.25e-01 0.0928 0.116 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 1.36e-01 -0.155 0.103 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 7.52e-01 0.0359 0.113 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 6.77e-01 -0.049 0.117 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 5.99e-03 -0.303 0.109 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 4.76e-01 0.0849 0.119 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0562 0.128 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00193 0.122 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 8.71e-01 0.0174 0.107 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 2.41e-01 -0.138 0.117 0.199 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 5.61e-01 -0.023 0.0396 0.208 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 4.59e-01 0.0824 0.111 0.208 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 3.31e-08 -0.578 0.101 0.208 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 1.92e-01 0.125 0.0956 0.208 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 1.59e-01 0.162 0.115 0.208 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0118 0.117 0.208 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00974 0.0976 0.208 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 9.57e-01 0.00603 0.111 0.208 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 2.37e-02 0.244 0.107 0.208 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 4.62e-03 -0.27 0.0942 0.208 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 2.34e-01 0.148 0.124 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 9.20e-03 -0.232 0.0883 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 5.12e-01 0.0681 0.104 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 6.51e-02 0.223 0.12 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 4.13e-01 -0.097 0.118 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 3.19e-02 0.229 0.106 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 1.91e-01 -0.147 0.112 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 1.52e-01 0.17 0.118 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 2.42e-01 0.125 0.107 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 2.06e-05 -0.436 0.1 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0627 0.0789 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 4.77e-01 0.078 0.11 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 9.66e-02 0.176 0.105 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 1.01e-01 -0.149 0.0904 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 5.90e-01 0.0596 0.11 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 4.86e-01 0.0866 0.124 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00716 0.113 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 1.10e-02 -0.294 0.115 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00861 0.0936 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 2.26e-01 -0.148 0.122 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 1.81e-01 -0.167 0.124 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0716 0.116 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0635 0.119 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000554 0.117 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 1.18e-01 0.168 0.107 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 3.19e-03 -0.295 0.0988 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0584 0.0765 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 5.62e-01 -0.062 0.107 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 2.98e-01 -0.112 0.107 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 9.90e-01 0.0011 0.0847 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0841 0.11 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0928 0.119 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 3.87e-01 0.0742 0.0855 0.2 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 8.60e-02 0.197 0.114 0.2 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 8.37e-02 -0.154 0.0884 0.2 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 5.68e-01 0.0736 0.129 0.2 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 9.88e-02 0.243 0.146 0.2 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 9.62e-01 0.00429 0.0909 0.2 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0407 0.105 0.2 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 1.83e-01 0.142 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 177885 sc-eQTL 7.23e-01 0.0438 0.124 0.2 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0447 0.113 0.2 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 1.80e-01 0.14 0.104 0.2 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0162 0.0408 0.204 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0311 0.0823 0.204 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 8.13e-03 -0.287 0.107 0.204 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 5.98e-01 0.0425 0.0806 0.204 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 3.63e-01 0.105 0.115 0.204 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0463 0.0871 0.204 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 1.46e-01 -0.138 0.0942 0.204 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 2.34e-01 0.0966 0.0809 0.204 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0722 0.0751 0.204 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0506 0.0823 0.204 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 8.66e-02 -0.191 0.111 0.205 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 5.53e-08 -0.612 0.109 0.205 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 9.88e-01 0.00147 0.102 0.205 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 4.88e-01 0.0769 0.111 0.205 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 4.62e-01 0.0843 0.114 0.205 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 2.47e-01 -0.108 0.0928 0.205 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 8.93e-01 0.0139 0.103 0.212 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 3.11e-01 -0.102 0.1 0.212 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 7.65e-01 0.0388 0.13 0.212 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 3.20e-01 -0.117 0.117 0.212 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 2.30e-01 0.146 0.121 0.212 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0942 0.114 0.212 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 8.21e-01 0.0202 0.0891 0.212 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0799 0.101 0.212 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 8.22e-01 0.0227 0.101 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 2.78e-04 -0.272 0.0736 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 1.00e+00 5.67e-05 0.101 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 5.97e-01 0.0599 0.113 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 4.61e-01 0.0749 0.101 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0846 0.0873 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 4.60e-01 0.0552 0.0745 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 1.03e-02 0.278 0.107 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 2.59e-02 -0.185 0.0827 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 5.59e-01 0.0595 0.102 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 2.28e-01 0.144 0.119 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 2.27e-01 0.135 0.112 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 2.40e-02 -0.233 0.102 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 9.01e-01 0.01 0.0807 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 3.43e-01 0.134 0.141 0.209 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 2.21e-01 -0.163 0.132 0.209 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0831 0.0998 0.209 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 7.56e-01 0.0412 0.132 0.209 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 4.03e-01 0.116 0.138 0.209 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 4.09e-01 -0.107 0.129 0.209 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 2.19e-01 -0.161 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 8.68e-01 0.0216 0.129 0.209 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 3.50e-01 -0.11 0.118 0.209 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 5.51e-01 0.0656 0.11 0.202 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 2.05e-02 -0.232 0.0992 0.202 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 1.05e-01 -0.191 0.117 0.202 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 5.29e-01 0.0696 0.11 0.202 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 7.67e-01 -0.034 0.114 0.202 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0612 0.111 0.202 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 5.24e-01 0.0617 0.0966 0.202 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 1.55e-01 -0.16 0.112 0.201 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 7.63e-04 -0.345 0.101 0.201 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0167 0.124 0.201 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0289 0.109 0.201 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 1.60e-01 0.147 0.104 0.201 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 1.03e-01 -0.163 0.0998 0.201 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 9.34e-01 0.00774 0.0935 0.201 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00574 0.134 0.226 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 1.41e-01 -0.172 0.116 0.226 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 1.18e-02 0.308 0.121 0.226 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 5.23e-01 0.0785 0.123 0.226 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 2.57e-01 -0.147 0.129 0.226 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0768 0.113 0.226 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 5.25e-01 0.0555 0.0871 0.226 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 2.72e-01 -0.127 0.115 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0222 0.055 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 3.39e-01 -0.106 0.11 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 3.55e-03 -0.168 0.057 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 8.02e-01 0.023 0.0914 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 1.64e-01 0.131 0.0937 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 9.96e-01 0.00055 0.106 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 1.30e-01 -0.12 0.079 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 4.34e-01 0.0744 0.095 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 177885 sc-eQTL 2.16e-01 -0.136 0.109 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 4.64e-01 0.0841 0.115 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0414 0.114 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -564387 sc-eQTL 3.28e-01 -0.062 0.0633 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 6.00e-01 0.0544 0.104 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 4.96e-03 -0.143 0.0503 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 7.74e-01 0.0211 0.0734 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 1.01e-01 -0.147 0.0892 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 5.19e-01 0.0661 0.102 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0551 0.0766 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 8.39e-01 0.0163 0.0804 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 177885 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0178 0.116 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 9.66e-01 0.00511 0.118 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -280228 sc-eQTL 3.22e-01 -0.107 0.107 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 1.13e-01 0.146 0.092 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 3.95e-04 -0.262 0.0726 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 7.90e-01 0.0257 0.0963 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 3.66e-01 0.103 0.114 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 1.67e-01 0.135 0.0969 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 6.74e-02 -0.155 0.0841 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 4.66e-01 0.0507 0.0694 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 6.89e-01 -0.043 0.107 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 4.47e-05 -0.376 0.0901 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 1.83e-01 -0.151 0.113 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 9.59e-01 0.00558 0.109 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 3.36e-01 0.104 0.108 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 9.63e-02 -0.156 0.0935 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0117 0.0812 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -202763 sc-eQTL 2.05e-02 0.235 0.1 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 220410 sc-eQTL 1.27e-05 -0.424 0.0949 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 86398 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0428 0.068 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 637252 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000896 0.104 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 509585 sc-eQTL 5.49e-01 0.0581 0.0968 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -144792 sc-eQTL 8.42e-02 -0.135 0.0779 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 39777 sc-eQTL 9.99e-01 0.00014 0.105 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -202828 sc-eQTL 6.98e-01 0.0481 0.124 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 220410 eQTL 4.80e-25 -0.288 0.0271 0.0 0.0 0.229
ENSG00000139351 SYCP3 177888 eQTL 0.045 -0.0814 0.0406 0.0 0.0 0.229
ENSG00000258230 AC063950.1 143602 eQTL 0.0153 -0.0757 0.0311 0.0 0.0 0.229

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 220410 2.02e-06 4.65e-06 7.11e-07 2.02e-06 4.71e-07 8.16e-07 2.08e-06 8.94e-07 3.03e-06 1.41e-06 3.25e-06 1.84e-06 3.66e-06 2.3e-06 1.02e-06 2.68e-06 2.02e-06 2.38e-06 1.53e-06 1.19e-06 1.67e-06 3.5e-06 2.61e-06 9.56e-07 4.54e-06 1.19e-06 1.59e-06 1.48e-06 2.57e-06 1.9e-06 1.98e-06 3.22e-07 4.47e-07 8.37e-07 1.67e-06 8.66e-07 8.92e-07 4.03e-07 8.73e-07 3.33e-07 2.83e-07 3.71e-06 4.8e-07 1.56e-07 3.13e-07 3.65e-07 8.12e-07 2.32e-07 2.97e-07
ENSG00000257202 \N -7362 5.81e-05 4.67e-05 8.86e-06 2.07e-05 8.66e-06 2.03e-05 6.15e-05 7.24e-06 4.93e-05 2.61e-05 6.22e-05 2.53e-05 7.16e-05 2.04e-05 1.06e-05 3.42e-05 2.82e-05 3.86e-05 1.21e-05 9.36e-06 2.58e-05 5.87e-05 4.5e-05 1.33e-05 6.47e-05 1.36e-05 2.2e-05 2.04e-05 4.7e-05 3.34e-05 3.09e-05 2.81e-06 5.36e-06 9.22e-06 1.69e-05 7.98e-06 4.62e-06 5.28e-06 6.98e-06 4.37e-06 1.96e-06 5.11e-05 5.45e-06 5.07e-07 3.62e-06 5.91e-06 6.32e-06 2.8e-06 2.05e-06
ENSG00000258230 AC063950.1 143602 5.07e-06 9.42e-06 1.35e-06 4.3e-06 1.75e-06 1.54e-06 8.46e-06 1.44e-06 6.53e-06 3.57e-06 8.95e-06 3.55e-06 1.01e-05 3.88e-06 1.63e-06 6.63e-06 3.7e-06 4.31e-06 2.15e-06 1.58e-06 3.45e-06 7.66e-06 4.9e-06 1.99e-06 1.15e-05 2.38e-06 3.82e-06 3.16e-06 6.27e-06 4.99e-06 4.17e-06 5.84e-07 7.68e-07 1.65e-06 2.91e-06 1.29e-06 1.31e-06 5.45e-07 8.77e-07 6.24e-07 2.39e-07 8.32e-06 1.19e-06 2.66e-07 7.85e-07 7.62e-07 1.04e-06 7.1e-07 5.14e-07