logo

Genes within 1Mb (chr12:101876248:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0205 0.0513 0.156 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0557 0.0891 0.156 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 4.32e-01 0.0426 0.0541 0.156 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0223 0.0784 0.156 B L1
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 8.14e-01 0.0211 0.0892 0.156 B L1
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 4.85e-01 0.0536 0.0766 0.156 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 4.35e-01 0.0479 0.0613 0.156 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 7.07e-02 -0.125 0.0691 0.156 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 136776 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00911 0.111 0.156 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 1.10e-01 0.169 0.105 0.156 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 3.86e-01 0.0857 0.0986 0.156 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 6.82e-01 0.0335 0.0815 0.156 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 2.70e-03 0.327 0.108 0.156 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0869 0.0761 0.156 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 2.28e-01 0.102 0.0841 0.156 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 5.91e-02 -0.155 0.0819 0.156 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 9.15e-01 0.0062 0.0578 0.156 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 3.24e-01 0.1 0.102 0.156 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 3.08e-03 0.323 0.108 0.156 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0748 0.0722 0.156 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0099 0.0913 0.156 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00732 0.101 0.156 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0498 0.0715 0.156 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0268 0.103 0.156 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 2.28e-01 0.136 0.113 0.164 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 1.26e-01 0.158 0.103 0.164 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 4.48e-02 -0.227 0.113 0.164 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 8.90e-01 0.0169 0.122 0.164 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 9.71e-01 0.00461 0.126 0.164 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0185 0.109 0.164 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 1.12e-01 0.142 0.0891 0.164 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 6.40e-01 0.0553 0.118 0.164 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 2.89e-01 -0.1 0.0945 0.156 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 6.51e-02 0.148 0.0796 0.156 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0995 0.1 0.156 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 8.53e-02 -0.193 0.111 0.156 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0373 0.103 0.156 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00808 0.0908 0.156 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 1.15e-01 -0.117 0.0736 0.156 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 8.07e-01 0.0249 0.102 0.157 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 1.83e-01 0.126 0.094 0.157 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0216 0.0684 0.157 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 8.77e-01 0.017 0.11 0.157 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 4.23e-02 -0.205 0.1 0.157 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 6.12e-01 0.0387 0.0762 0.157 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0713 0.108 0.157 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0505 0.127 0.157 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0366 0.0393 0.156 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 5.02e-01 0.0504 0.0749 0.156 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 5.24e-03 0.303 0.108 0.156 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 3.41e-02 -0.167 0.0782 0.156 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 2.72e-02 0.271 0.122 0.156 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0872 0.0898 0.156 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0729 0.0798 0.156 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 6.91e-02 -0.174 0.0952 0.156 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 2.75e-02 0.175 0.079 0.156 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 4.97e-01 0.0632 0.0928 0.156 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0252 0.0253 0.145 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0937 0.132 0.145 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0566 0.0973 0.145 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0246 0.138 0.145 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 7.80e-01 0.0374 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 5.73e-03 0.378 0.135 0.145 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 1.53e-01 -0.188 0.131 0.145 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 3.77e-01 -0.117 0.132 0.145 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 136776 sc-eQTL 7.70e-01 0.0319 0.109 0.145 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00316 0.109 0.145 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 3.41e-01 0.0979 0.102 0.145 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0278 0.0512 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 6.67e-01 0.0549 0.128 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 8.48e-01 0.0131 0.0685 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0864 0.101 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 4.74e-01 0.0807 0.112 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 8.19e-01 0.029 0.127 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 5.62e-01 0.0607 0.105 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0375 0.112 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 136776 sc-eQTL 4.35e-01 0.0922 0.118 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 5.99e-01 0.0653 0.124 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0349 0.119 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 9.30e-01 0.00413 0.0471 0.157 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 6.88e-01 0.05 0.124 0.157 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 7.91e-02 0.142 0.0807 0.157 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 6.27e-01 0.0541 0.111 0.157 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 1.80e-01 -0.164 0.122 0.157 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 1.88e-01 -0.16 0.121 0.157 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 6.27e-01 0.0528 0.109 0.157 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 1.96e-01 -0.147 0.113 0.157 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 136776 sc-eQTL 2.22e-01 -0.143 0.117 0.157 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 5.24e-01 0.0765 0.12 0.157 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0497 0.109 0.157 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 3.45e-02 0.137 0.0644 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 2.21e-01 -0.144 0.117 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 7.42e-01 0.0202 0.0612 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 5.72e-01 -0.049 0.0866 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 5.99e-01 0.0542 0.103 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 8.48e-02 0.197 0.114 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0152 0.0869 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 3.23e-01 -0.093 0.094 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 136776 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0391 0.128 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 2.51e-01 0.143 0.124 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 4.87e-01 0.081 0.116 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 4.08e-01 0.0471 0.0568 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 7.05e-01 0.0442 0.117 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 4.38e-01 0.0485 0.0624 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0128 0.0968 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 3.35e-01 0.108 0.112 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 4.11e-01 0.101 0.123 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 1.28e-01 0.163 0.107 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0407 0.106 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 136776 sc-eQTL 9.88e-01 0.00171 0.112 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0256 0.129 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 5.32e-01 0.0695 0.111 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0839 0.124 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 5.96e-02 0.233 0.123 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0798 0.108 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 4.81e-02 0.235 0.118 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0459 0.126 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 2.03e-02 -0.28 0.12 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 9.26e-01 0.00874 0.0939 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 3.14e-03 0.317 0.106 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0998 0.0832 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 4.14e-01 0.0742 0.0908 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 1.46e-01 -0.143 0.0981 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 9.58e-01 0.00364 0.0689 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 6.20e-01 0.0486 0.098 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 6.49e-03 0.306 0.111 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 3.52e-01 0.0816 0.0874 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 1.88e-01 0.144 0.109 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0491 0.102 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 7.70e-01 0.0197 0.0673 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 2.42e-01 0.136 0.116 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 3.16e-03 0.328 0.11 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 1.75e-01 -0.147 0.108 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 9.43e-01 0.00839 0.117 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0797 0.11 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 7.75e-01 0.0284 0.099 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0432 0.107 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 8.44e-03 0.287 0.108 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 3.37e-01 0.0843 0.0876 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 5.91e-01 0.064 0.119 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 1.63e-01 -0.164 0.117 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 4.87e-01 0.0698 0.1 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 8.02e-01 0.0312 0.125 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 4.02e-01 0.0953 0.114 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 5.85e-02 0.213 0.112 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 1.23e-01 -0.156 0.101 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 9.40e-01 0.00817 0.108 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0995 0.117 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 1.63e-01 -0.108 0.0768 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0872 0.119 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 2.56e-01 -0.138 0.121 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 1.03e-01 0.178 0.108 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 9.65e-01 0.005 0.113 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 3.88e-01 0.106 0.123 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 6.40e-01 0.0566 0.121 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 1.97e-01 0.139 0.108 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0317 0.118 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 7.15e-01 0.0439 0.12 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 8.17e-02 0.197 0.113 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0485 0.121 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 9.82e-01 0.00298 0.13 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 2.14e-01 0.155 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 4.14e-02 0.221 0.108 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 3.97e-01 0.102 0.12 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00143 0.0425 0.156 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 2.25e-01 0.144 0.119 0.156 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 4.78e-02 0.229 0.115 0.156 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 2.78e-01 -0.112 0.103 0.156 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 5.73e-02 0.234 0.122 0.156 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 2.91e-01 -0.133 0.126 0.156 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 4.71e-01 0.0754 0.104 0.156 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 3.51e-02 -0.249 0.117 0.156 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 4.29e-01 0.0921 0.116 0.156 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 9.86e-02 0.17 0.102 0.156 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00239 0.129 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 2.71e-01 0.102 0.0928 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00761 0.108 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 4.97e-02 -0.246 0.124 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 1.24e-01 -0.188 0.122 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 3.42e-02 -0.234 0.11 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 7.24e-01 0.0413 0.117 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0258 0.123 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 7.62e-01 0.0339 0.112 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 2.79e-01 0.118 0.109 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0096 0.0827 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 2.10e-01 0.144 0.114 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 6.79e-01 0.0461 0.111 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 7.85e-01 -0.026 0.0952 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 5.85e-01 0.0632 0.116 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0931 0.13 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 8.40e-02 0.205 0.118 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 3.00e-01 0.127 0.122 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00208 0.0983 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0016 0.129 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 2.41e-01 -0.154 0.131 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 2.24e-01 0.148 0.121 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 7.88e-01 0.0337 0.125 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0741 0.123 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0032 0.114 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 6.80e-01 0.0439 0.106 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0292 0.0808 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0312 0.113 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0673 0.113 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 7.69e-02 0.158 0.0887 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 6.65e-02 -0.213 0.115 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 9.06e-01 0.0149 0.126 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 2.20e-01 -0.12 0.0972 0.152 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0967 0.131 0.152 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 1.21e-01 0.158 0.101 0.152 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0295 0.147 0.152 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 3.17e-01 -0.169 0.168 0.152 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 6.43e-01 0.0481 0.104 0.152 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 9.85e-01 0.0022 0.12 0.152 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0545 0.121 0.152 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 136776 sc-eQTL 5.21e-03 0.388 0.136 0.152 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 1.08e-02 0.325 0.125 0.152 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 3.27e-01 0.117 0.119 0.152 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0414 0.0432 0.159 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 8.39e-01 0.0178 0.0874 0.159 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 1.34e-02 0.285 0.114 0.159 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 3.22e-02 -0.183 0.0847 0.159 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 4.41e-01 0.0944 0.122 0.159 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 8.55e-01 0.0169 0.0925 0.159 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 1.41e-01 -0.148 0.1 0.159 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0529 0.0862 0.159 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 9.77e-01 0.00226 0.0799 0.159 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 5.90e-01 0.0472 0.0874 0.159 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 4.95e-01 0.082 0.12 0.156 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 5.14e-03 0.346 0.123 0.156 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 5.30e-01 0.0686 0.109 0.156 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0155 0.119 0.156 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 3.06e-01 -0.126 0.122 0.156 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 3.13e-01 0.101 0.0995 0.156 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 5.18e-01 0.0709 0.109 0.166 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 2.16e-01 0.132 0.106 0.166 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 2.32e-01 -0.165 0.137 0.166 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 1.53e-01 0.178 0.124 0.166 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 5.75e-01 0.0728 0.129 0.166 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 7.69e-01 0.0358 0.122 0.166 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 7.88e-01 0.0256 0.0948 0.166 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 7.18e-01 0.0392 0.108 0.166 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 1.58e-01 -0.152 0.107 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 1.87e-01 0.107 0.0809 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 7.55e-02 -0.191 0.107 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 2.88e-01 -0.129 0.121 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 8.70e-01 0.0178 0.109 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 7.11e-01 0.0347 0.0936 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 1.68e-01 -0.11 0.0795 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 6.87e-01 0.047 0.117 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 2.12e-01 0.111 0.0891 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0237 0.109 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0445 0.127 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 9.56e-01 0.00666 0.12 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0437 0.111 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 1.49e-01 -0.124 0.0859 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 9.87e-01 0.00231 0.146 0.158 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 1.67e-01 0.189 0.136 0.158 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0709 0.103 0.158 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 9.39e-01 0.0105 0.136 0.158 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 1.03e-01 -0.232 0.142 0.158 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00269 0.133 0.158 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 8.66e-01 0.0229 0.135 0.158 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 2.38e-01 -0.157 0.132 0.158 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 7.88e-01 0.0327 0.122 0.158 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 3.68e-01 -0.105 0.117 0.16 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 5.86e-01 0.0584 0.107 0.16 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 3.13e-01 0.127 0.126 0.16 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 6.05e-01 -0.061 0.118 0.16 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 6.55e-01 0.0545 0.122 0.16 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 1.76e-01 -0.159 0.117 0.16 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0108 0.103 0.16 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 6.28e-01 -0.057 0.118 0.163 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 4.41e-01 0.0839 0.109 0.163 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0319 0.13 0.163 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0998 0.114 0.163 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00676 0.109 0.163 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0875 0.105 0.163 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 3.31e-02 -0.208 0.0969 0.163 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 3.49e-02 0.289 0.136 0.161 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 1.90e-01 0.157 0.119 0.161 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0816 0.127 0.161 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 3.36e-01 -0.122 0.126 0.161 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 2.03e-01 0.169 0.132 0.161 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0324 0.116 0.161 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 8.35e-02 0.155 0.0889 0.161 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 1.77e-01 0.161 0.118 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0265 0.0595 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 6.83e-01 0.0488 0.12 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 4.36e-01 0.0491 0.0628 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0337 0.0988 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 9.94e-01 0.000758 0.102 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00307 0.115 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 6.91e-01 0.0342 0.086 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 7.14e-02 -0.185 0.102 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 136776 sc-eQTL 9.85e-01 0.00216 0.119 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 4.96e-01 0.0846 0.124 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0698 0.123 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -605496 sc-eQTL 1.05e-01 0.112 0.0685 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0886 0.113 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 5.07e-01 0.037 0.0557 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0508 0.0797 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 2.98e-01 0.102 0.0974 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 4.80e-02 0.219 0.11 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 6.01e-01 0.0436 0.0834 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0798 0.0873 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 136776 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0411 0.126 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 2.82e-01 0.138 0.128 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -321337 sc-eQTL 4.88e-01 0.0812 0.117 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0734 0.099 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 1.65e-01 0.111 0.0798 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 1.70e-01 -0.141 0.103 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 2.59e-01 -0.138 0.122 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00347 0.104 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 7.72e-01 0.0264 0.0908 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 3.08e-02 -0.16 0.0737 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 1.39e-01 -0.168 0.113 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 1.51e-01 0.143 0.099 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 6.12e-01 0.0612 0.12 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 2.11e-01 -0.145 0.115 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 7.29e-01 -0.04 0.115 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 2.07e-01 -0.126 0.0995 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 1.69e-01 -0.118 0.0858 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -243872 sc-eQTL 7.81e-01 0.0298 0.107 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 179301 sc-eQTL 2.80e-01 0.113 0.104 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 45289 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000338 0.0717 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 596143 sc-eQTL 4.79e-01 0.0779 0.11 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 468476 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0977 0.102 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -185901 sc-eQTL 2.01e-01 0.106 0.0823 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0865 0.111 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -243937 sc-eQTL 3.84e-01 -0.114 0.13 0.157 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 179301 eQTL 4.79e-11 0.209 0.0314 0.0 0.0 0.168
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 eQTL 2.98e-05 0.0751 0.0179 0.0 0.0 0.168
ENSG00000196091 MYBPC1 307895 pQTL 0.00538 -0.0644 0.0231 0.00325 0.00113 0.164
ENSG00000258230 AC063950.1 102493 eQTL 0.0134 0.0866 0.035 0.0 0.0 0.168

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 179301 1.9e-06 9.28e-07 2.52e-07 5.65e-07 1.04e-07 4.81e-07 1.18e-06 3.34e-07 1.12e-06 2.77e-07 1.36e-06 5.69e-07 1.82e-06 2.68e-07 4.95e-07 5.75e-07 7.74e-07 5.45e-07 3.77e-07 4.38e-07 2.82e-07 1.17e-06 8.03e-07 3.27e-07 2.23e-06 3.59e-07 6.21e-07 4.75e-07 9.39e-07 9.49e-07 5.47e-07 8.32e-08 1.37e-07 2.87e-07 4.66e-07 2.58e-07 2.57e-07 1.06e-07 8.26e-08 2.77e-08 4.67e-08 1.65e-06 2.33e-07 1.1e-08 1.93e-07 7.36e-08 1.41e-07 2.31e-08 5.61e-08
ENSG00000136048 DRAM1 -1332 6.68e-05 4.36e-05 6.99e-06 1.6e-05 6.55e-06 1.86e-05 5.64e-05 4.49e-06 3.69e-05 1.53e-05 4.74e-05 2.05e-05 5.93e-05 1.75e-05 7.75e-06 2.32e-05 2.22e-05 3.05e-05 9e-06 6.93e-06 1.9e-05 4.03e-05 4.15e-05 9.54e-06 5.06e-05 9.17e-06 1.63e-05 1.34e-05 4.25e-05 3.19e-05 2.44e-05 1.58e-06 2.42e-06 6.95e-06 1.3e-05 5.85e-06 2.93e-06 3.14e-06 4.35e-06 3.19e-06 1.72e-06 5.41e-05 4.94e-06 2.85e-07 2.86e-06 4.25e-06 4.23e-06 1.48e-06 1.5e-06
ENSG00000258230 AC063950.1 102493 4.91e-06 3.63e-06 2.46e-07 2.03e-06 4.65e-07 8.39e-07 2.18e-06 6.05e-07 2.28e-06 8.55e-07 3.13e-06 1.3e-06 3.99e-06 1.36e-06 8.99e-07 1.5e-06 1.48e-06 2.35e-06 6.74e-07 1.09e-06 9e-07 3.15e-06 2.44e-06 9.14e-07 4.27e-06 1.09e-06 1.33e-06 1.39e-06 1.91e-06 1.88e-06 2.07e-06 2.09e-07 4e-07 6.91e-07 1.43e-06 6.4e-07 6.81e-07 3.15e-07 5.34e-07 3.21e-07 2.78e-07 4.88e-06 4.34e-07 8.98e-08 3.3e-07 3.46e-07 3.68e-07 8.19e-08 1.69e-07