logo

Genes within 1Mb (chr12:101841533:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0408 0.0642 0.094 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0814 0.112 0.094 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 5.11e-02 0.132 0.0673 0.094 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 2.49e-01 -0.113 0.098 0.094 B L1
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 4.16e-01 0.091 0.112 0.094 B L1
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 2.77e-01 -0.104 0.0957 0.094 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 1.96e-01 0.0994 0.0766 0.094 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 3.84e-03 -0.25 0.0855 0.094 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 102061 sc-eQTL 2.36e-01 0.164 0.138 0.094 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 2.43e-01 0.155 0.132 0.094 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 7.90e-01 0.0329 0.124 0.094 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 4.04e-02 -0.212 0.103 0.094 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 1.44e-07 0.714 0.131 0.094 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 5.44e-05 -0.385 0.0934 0.094 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 5.08e-02 0.209 0.106 0.094 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 5.18e-01 -0.068 0.105 0.094 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 3.26e-01 0.0723 0.0734 0.094 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0989 0.125 0.094 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.38e-06 0.626 0.129 0.094 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 1.74e-02 -0.211 0.0881 0.094 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0358 0.113 0.094 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 8.47e-01 -0.024 0.124 0.094 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00512 0.0883 0.094 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00242 0.127 0.094 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 4.98e-01 0.0961 0.141 0.099 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 1.23e-02 0.322 0.127 0.099 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 1.12e-01 -0.226 0.142 0.099 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 8.96e-01 -0.02 0.153 0.099 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0768 0.158 0.099 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00306 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 4.50e-02 0.224 0.111 0.099 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 4.25e-01 -0.118 0.148 0.099 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 1.62e-01 -0.165 0.118 0.094 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 9.54e-04 0.327 0.0976 0.094 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 1.90e-01 0.164 0.125 0.094 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 1.78e-02 -0.33 0.138 0.094 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 3.44e-01 -0.122 0.129 0.094 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 8.40e-01 0.0229 0.113 0.094 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 9.35e-03 -0.239 0.0909 0.094 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 2.97e-01 -0.133 0.128 0.094 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.82e-03 0.352 0.116 0.094 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0629 0.0861 0.094 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 6.72e-01 0.0587 0.139 0.094 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 2.27e-01 -0.154 0.127 0.094 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 7.04e-01 0.0366 0.0961 0.094 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0663 0.137 0.094 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0172 0.16 0.094 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00653 0.0482 0.094 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0162 0.0919 0.094 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 5.23e-05 0.533 0.129 0.094 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 2.25e-04 -0.352 0.0938 0.094 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 1.62e-02 0.362 0.149 0.094 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 2.23e-01 -0.134 0.11 0.094 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 8.46e-01 -0.019 0.098 0.094 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 4.56e-03 -0.331 0.115 0.094 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 1.62e-02 0.234 0.0966 0.094 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 9.30e-01 -0.01 0.114 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0102 0.0318 0.087 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0879 0.165 0.087 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00473 0.122 0.087 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 2.26e-01 -0.21 0.173 0.087 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0586 0.168 0.087 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 1.43e-01 0.253 0.172 0.087 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 2.58e-01 -0.187 0.164 0.087 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 2.78e-01 -0.18 0.165 0.087 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 102061 sc-eQTL 6.85e-01 0.0554 0.136 0.087 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0106 0.137 0.087 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 5.35e-01 0.0799 0.129 0.087 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0678 0.0636 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 2.73e-01 0.174 0.158 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 4.77e-01 0.0606 0.0851 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 3.10e-01 -0.128 0.126 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 5.17e-01 0.0907 0.14 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 8.64e-01 -0.027 0.157 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 7.33e-01 0.0444 0.13 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 1.51e-01 -0.2 0.139 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 102061 sc-eQTL 4.34e-01 0.115 0.147 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0662 0.154 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 7.17e-01 0.0537 0.148 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 4.69e-01 0.0426 0.0587 0.095 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0804 0.155 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.15e-02 0.232 0.1 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 6.12e-01 0.0704 0.139 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 6.55e-01 -0.068 0.152 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 3.67e-01 -0.137 0.151 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 9.12e-01 0.015 0.135 0.095 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 3.71e-01 -0.127 0.142 0.095 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 102061 sc-eQTL 3.23e-01 -0.144 0.146 0.095 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0831 0.149 0.095 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 1.12e-01 -0.216 0.135 0.095 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 5.85e-02 0.153 0.0804 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0962 0.147 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 1.52e-01 0.109 0.0759 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0589 0.108 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 3.52e-01 0.119 0.128 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 9.83e-01 0.00307 0.143 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0276 0.108 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0862 0.117 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 102061 sc-eQTL 4.19e-01 0.129 0.159 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 8.68e-01 0.0257 0.155 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 2.73e-01 0.159 0.145 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 7.15e-01 0.026 0.0711 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0907 0.146 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 1.13e-01 0.123 0.0775 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 8.11e-02 -0.21 0.12 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 1.54e-01 0.199 0.139 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0595 0.154 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 8.45e-02 0.231 0.133 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 1.89e-01 -0.174 0.132 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 102061 sc-eQTL 3.57e-01 0.129 0.139 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 3.31e-01 0.157 0.161 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0252 0.139 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0901 0.157 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.29e-02 0.356 0.155 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 3.84e-01 -0.12 0.137 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 1.63e-02 0.361 0.149 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00505 0.16 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 1.19e-01 -0.239 0.153 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 1.80e-01 -0.159 0.118 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.81e-07 0.682 0.129 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 4.10e-05 -0.425 0.101 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 1.20e-01 0.178 0.114 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0839 0.124 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 3.15e-01 0.0875 0.0868 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 2.20e-01 -0.151 0.123 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.53e-06 0.653 0.135 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 4.32e-02 -0.222 0.109 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 2.21e-01 0.168 0.137 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 3.54e-01 -0.12 0.129 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 4.03e-01 0.0709 0.0845 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 4.38e-01 -0.117 0.151 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 1.68e-07 0.738 0.136 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 6.47e-03 -0.379 0.138 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 8.71e-01 0.0247 0.152 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 4.83e-01 0.101 0.143 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0668 0.128 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 3.88e-01 -0.116 0.134 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.44e-05 0.57 0.132 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 3.43e-01 -0.104 0.11 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 3.78e-01 0.131 0.149 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 1.82e-01 -0.196 0.147 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 8.92e-01 0.017 0.126 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0482 0.156 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 3.87e-01 -0.123 0.142 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 9.91e-05 0.542 0.137 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 4.98e-03 -0.354 0.125 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 2.06e-01 -0.171 0.135 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 4.83e-01 -0.103 0.147 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0762 0.0966 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 2.81e-01 0.161 0.149 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 3.81e-01 -0.134 0.153 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 5.22e-03 0.38 0.135 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 2.15e-01 -0.176 0.142 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 7.06e-01 0.0587 0.155 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 5.30e-01 0.0957 0.152 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 3.17e-02 0.292 0.135 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 7.03e-01 0.0568 0.149 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 3.95e-01 -0.127 0.149 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 1.19e-02 0.354 0.139 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 3.89e-01 -0.131 0.151 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 6.16e-01 0.0817 0.163 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 8.49e-01 0.0296 0.156 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 2.16e-01 0.168 0.135 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 4.11e-01 0.123 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 3.12e-01 -0.053 0.0523 0.095 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 7.52e-01 0.0465 0.147 0.095 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 5.16e-03 0.398 0.141 0.095 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 4.27e-02 -0.257 0.126 0.095 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 3.44e-03 0.442 0.149 0.095 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 4.25e-01 -0.124 0.155 0.095 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 2.57e-01 0.147 0.129 0.095 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 1.21e-02 -0.366 0.144 0.095 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 6.59e-01 0.0635 0.144 0.095 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 6.29e-01 0.0616 0.127 0.095 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 3.69e-01 -0.146 0.162 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 6.28e-02 0.219 0.117 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 9.65e-01 -0.006 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 2.25e-02 -0.361 0.157 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 8.55e-01 0.0283 0.155 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 3.58e-01 -0.129 0.14 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 6.00e-01 0.0775 0.148 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 5.50e-01 0.0933 0.156 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00587 0.141 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 6.48e-03 0.372 0.135 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0469 0.104 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 9.32e-02 0.242 0.144 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 6.62e-01 0.0612 0.14 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0597 0.12 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 9.12e-01 0.0161 0.146 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0876 0.164 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 6.10e-01 0.0757 0.148 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 5.55e-02 0.29 0.151 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 6.88e-01 0.0491 0.122 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 5.34e-01 0.0995 0.16 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 4.24e-01 -0.13 0.163 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 4.35e-01 0.118 0.151 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 8.61e-01 0.0273 0.156 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 8.96e-01 0.0201 0.153 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0829 0.144 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.68e-02 0.298 0.134 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 2.46e-01 -0.119 0.102 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0212 0.143 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 4.74e-01 -0.103 0.144 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 3.98e-01 0.0959 0.113 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 2.81e-01 -0.159 0.147 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00778 0.16 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 5.18e-01 -0.081 0.125 0.093 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 5.32e-01 -0.106 0.168 0.093 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.80e-01 0.141 0.13 0.093 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 3.68e-01 -0.169 0.187 0.093 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 3.97e-02 -0.441 0.212 0.093 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 4.96e-01 0.0904 0.132 0.093 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0777 0.153 0.093 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0859 0.155 0.093 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 102061 sc-eQTL 1.31e-02 0.443 0.176 0.093 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 9.43e-02 0.276 0.163 0.093 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 4.96e-01 0.104 0.153 0.093 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0123 0.0526 0.096 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 5.81e-01 0.0586 0.106 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 8.95e-02 0.238 0.14 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 9.59e-03 -0.268 0.102 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 5.54e-01 -0.088 0.149 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0301 0.112 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 8.15e-02 -0.212 0.121 0.096 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0242 0.105 0.096 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0118 0.0971 0.096 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0599 0.106 0.096 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0162 0.15 0.094 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 1.59e-05 0.659 0.149 0.094 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0536 0.136 0.094 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 8.15e-01 0.0348 0.148 0.094 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0954 0.153 0.094 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 1.34e-01 0.186 0.124 0.094 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 7.56e-01 0.0442 0.142 0.098 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.26e-02 0.314 0.137 0.098 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0201 0.179 0.098 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 1.15e-01 0.255 0.161 0.098 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 4.27e-01 0.134 0.168 0.098 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 8.39e-01 0.032 0.158 0.098 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 9.95e-01 0.000769 0.123 0.098 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0113 0.14 0.098 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 1.33e-01 -0.202 0.134 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.01e-02 0.234 0.1 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 7.07e-01 0.0505 0.134 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 8.62e-02 -0.259 0.15 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0749 0.135 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 4.41e-01 0.09 0.117 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 2.13e-02 -0.228 0.0984 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 4.33e-01 0.114 0.146 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 1.45e-03 0.352 0.109 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 6.78e-01 0.0565 0.136 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 8.49e-01 0.0304 0.159 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 2.20e-01 -0.183 0.149 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 5.64e-01 0.08 0.138 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 5.20e-02 -0.209 0.107 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 5.55e-01 -0.111 0.187 0.1 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.33e-01 0.21 0.175 0.1 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 4.11e-01 -0.109 0.132 0.1 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 6.06e-01 0.0903 0.175 0.1 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 1.16e-01 -0.287 0.182 0.1 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 5.08e-01 0.113 0.171 0.1 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 3.16e-01 -0.174 0.173 0.1 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 3.35e-01 -0.165 0.17 0.1 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 2.42e-01 -0.183 0.156 0.1 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 2.65e-01 -0.163 0.146 0.096 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 6.11e-02 0.25 0.133 0.096 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 7.29e-03 0.419 0.155 0.096 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 4.82e-01 -0.104 0.147 0.096 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 6.87e-01 0.0615 0.152 0.096 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0859 0.147 0.096 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 1.80e-01 -0.172 0.128 0.096 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 2.18e-01 -0.183 0.148 0.097 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.65e-01 0.153 0.137 0.097 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 7.81e-01 0.0457 0.164 0.097 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 4.27e-03 -0.407 0.141 0.097 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 6.60e-01 0.0609 0.138 0.097 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0971 0.133 0.097 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 1.72e-02 -0.293 0.122 0.097 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 3.38e-01 0.169 0.176 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 1.32e-01 0.231 0.152 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 1.45e-01 -0.236 0.161 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 5.24e-01 -0.103 0.162 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0344 0.17 0.09 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 8.24e-01 -0.033 0.148 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 6.16e-02 0.214 0.114 0.09 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 5.60e-01 0.0889 0.152 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0478 0.0742 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 7.85e-01 0.0408 0.149 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 2.90e-01 0.0831 0.0783 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0987 0.123 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 8.94e-01 0.017 0.127 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 6.36e-01 -0.068 0.144 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 5.40e-01 0.0658 0.107 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 9.97e-03 -0.329 0.126 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 102061 sc-eQTL 6.29e-01 0.0716 0.148 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0407 0.155 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 4.49e-01 -0.116 0.153 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -640211 sc-eQTL 1.37e-01 0.128 0.0857 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0713 0.141 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 6.22e-02 0.129 0.069 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 8.65e-02 -0.17 0.0989 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 1.06e-01 0.197 0.121 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 8.09e-01 0.0336 0.139 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 4.98e-01 0.0706 0.104 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 1.94e-01 -0.142 0.109 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 102061 sc-eQTL 4.76e-01 0.112 0.157 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 3.74e-01 0.143 0.16 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -356052 sc-eQTL 6.94e-01 0.0576 0.146 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 5.62e-01 -0.072 0.124 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 3.44e-03 0.29 0.0982 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 5.49e-01 0.0773 0.129 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 2.15e-01 -0.189 0.152 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 2.93e-01 -0.137 0.13 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 3.22e-01 0.112 0.113 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 2.13e-03 -0.283 0.091 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 3.52e-02 -0.299 0.141 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 8.47e-03 0.326 0.122 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 3.51e-02 0.316 0.149 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 6.62e-03 -0.391 0.142 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0199 0.144 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0851 0.125 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 2.25e-02 -0.245 0.107 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -278587 sc-eQTL 3.92e-01 -0.116 0.135 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 144586 sc-eQTL 4.27e-03 0.373 0.129 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB 10574 sc-eQTL 5.43e-01 -0.055 0.0902 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 561428 sc-eQTL 3.18e-01 0.138 0.138 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 433761 sc-eQTL 3.98e-01 -0.109 0.128 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -220616 sc-eQTL 3.92e-01 0.0891 0.104 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0878 0.14 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -278652 sc-eQTL 4.16e-01 -0.134 0.164 0.095 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 144586 eQTL 2.29e-19 0.333 0.0362 0.0 0.0 0.111
ENSG00000136048 DRAM1 -36047 eQTL 0.000421 0.0747 0.0211 0.0 0.0 0.111
ENSG00000183395 PMCH -356300 pQTL 0.0198 -0.107 0.0458 0.00154 0.0 0.108
ENSG00000196091 MYBPC1 273180 pQTL 0.00257 -0.0831 0.0275 0.00508 0.00198 0.108
ENSG00000258230 AC063950.1 67778 eQTL 0.0214 0.0948 0.0411 0.0 0.0 0.111

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 144586 5.53e-06 2.75e-06 6.03e-07 1.71e-06 4.74e-07 1.09e-06 2.54e-06 4.95e-07 1.97e-06 1.17e-06 2.48e-06 1.34e-06 3.49e-06 1.41e-06 9.26e-07 1.98e-06 1.24e-06 2.09e-06 1.42e-06 1.32e-06 1.28e-06 3.37e-06 2.7e-06 1e-06 4.06e-06 1.26e-06 1.52e-06 1.68e-06 2.64e-06 1.87e-06 1.84e-06 2.7e-07 5.87e-07 1.14e-06 1e-06 5.32e-07 7.26e-07 3.59e-07 4.85e-07 2.08e-07 3.03e-07 3.38e-06 3.82e-07 8.04e-08 3.69e-07 2.98e-07 8.08e-07 2.65e-07 2.07e-07
ENSG00000258230 AC063950.1 67778 1.73e-05 9.44e-06 1.35e-06 4.02e-06 1.9e-06 5.12e-06 1.03e-05 1.29e-06 7.72e-06 4.46e-06 1.06e-05 4.77e-06 1.2e-05 3.95e-06 2.12e-06 6.63e-06 3.78e-06 7.27e-06 2.56e-06 2.23e-06 4.68e-06 9.34e-06 6.92e-06 2.82e-06 1.21e-05 2.97e-06 4.46e-06 3.19e-06 8.33e-06 7.75e-06 4.6e-06 5.87e-07 8.87e-07 2.75e-06 2.59e-06 1.09e-06 1.1e-06 5e-07 9.34e-07 7.17e-07 7.52e-07 1.14e-05 1.64e-06 1.74e-07 6.84e-07 9.83e-07 1.08e-06 7.08e-07 5.13e-07