logo

Genes within 1Mb (chr12:101827647:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0241 0.0483 0.171 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 8.20e-02 -0.146 0.0834 0.171 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.85e-04 0.188 0.0494 0.171 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 6.78e-02 -0.135 0.0733 0.171 B L1
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 8.27e-01 0.0183 0.084 0.171 B L1
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 8.30e-02 -0.125 0.0717 0.171 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 3.14e-02 0.124 0.0572 0.171 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 2.36e-02 -0.148 0.0648 0.171 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 88175 sc-eQTL 1.34e-02 0.256 0.103 0.171 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00533 0.0997 0.171 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0116 0.093 0.171 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0909 0.0766 0.171 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 2.60e-13 0.714 0.0914 0.171 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 1.04e-11 -0.464 0.0645 0.171 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00606 0.0796 0.171 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 4.66e-01 0.0568 0.0777 0.171 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 8.88e-02 0.0925 0.0541 0.171 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 6.09e-01 0.0486 0.0948 0.171 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 4.98e-11 0.643 0.0928 0.171 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 1.79e-03 -0.209 0.0659 0.171 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0337 0.0851 0.171 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0639 0.0938 0.171 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 7.18e-01 0.0242 0.0667 0.171 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 4.73e-01 0.0686 0.0955 0.171 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 2.88e-01 0.114 0.107 0.178 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 5.03e-03 0.272 0.0959 0.178 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 8.25e-02 -0.186 0.107 0.178 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 1.35e-01 -0.172 0.115 0.178 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 2.20e-01 -0.146 0.119 0.178 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0377 0.103 0.178 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 1.52e-01 0.121 0.0844 0.178 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 2.21e-01 -0.137 0.111 0.178 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0333 0.0896 0.171 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 7.56e-05 0.295 0.0731 0.171 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 3.25e-01 0.0936 0.0949 0.171 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 1.57e-01 -0.15 0.106 0.171 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0515 0.0976 0.171 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 4.50e-01 0.065 0.0858 0.171 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 1.13e-01 -0.111 0.0696 0.171 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0891 0.0963 0.172 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 9.52e-08 0.463 0.0837 0.172 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0374 0.0649 0.172 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 3.99e-01 0.0881 0.104 0.172 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 4.89e-02 -0.189 0.0952 0.172 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 1.82e-01 0.0965 0.0721 0.172 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 4.77e-01 0.0733 0.103 0.172 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 7.37e-01 0.0407 0.121 0.172 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 8.33e-01 -0.00771 0.0365 0.171 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 8.55e-01 0.0128 0.0696 0.171 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 4.85e-07 0.497 0.0957 0.171 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 5.35e-05 -0.291 0.0706 0.171 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 2.08e-01 0.144 0.114 0.171 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 6.75e-01 -0.035 0.0835 0.171 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00341 0.0743 0.171 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 4.71e-02 -0.176 0.0882 0.171 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 9.76e-03 0.19 0.073 0.171 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 1.40e-01 0.127 0.0858 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 7.40e-01 0.00771 0.0232 0.163 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 3.36e-01 -0.116 0.12 0.163 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 6.75e-02 0.162 0.088 0.163 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 3.52e-02 -0.265 0.125 0.163 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 4.66e-01 0.089 0.122 0.163 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 6.19e-01 0.0629 0.126 0.163 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0285 0.12 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 1.23e-01 -0.186 0.12 0.163 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 88175 sc-eQTL 2.86e-01 0.106 0.0988 0.163 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 6.59e-01 -0.044 0.0997 0.163 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 6.68e-01 0.0403 0.0937 0.163 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 4.02e-01 -0.04 0.0477 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 8.04e-01 0.0295 0.119 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.04e-02 0.163 0.0629 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 6.65e-01 -0.041 0.0944 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 8.51e-01 0.0197 0.105 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 8.51e-02 -0.203 0.117 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0125 0.0976 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 1.91e-01 -0.137 0.104 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 88175 sc-eQTL 4.37e-01 0.0856 0.11 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 2.30e-01 -0.139 0.115 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00265 0.111 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 2.64e-01 0.0488 0.0436 0.172 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0877 0.115 0.172 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.03e-05 0.325 0.0719 0.172 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 6.59e-01 0.0456 0.103 0.172 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 3.36e-01 -0.109 0.113 0.172 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 4.24e-01 -0.09 0.112 0.172 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 8.14e-01 0.0237 0.101 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 1.84e-01 -0.14 0.105 0.172 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 88175 sc-eQTL 9.06e-01 0.0128 0.109 0.172 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 1.37e-01 -0.165 0.111 0.172 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 8.02e-01 0.0255 0.101 0.172 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 2.14e-01 0.0754 0.0604 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 3.24e-01 -0.108 0.109 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 4.42e-03 0.161 0.056 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 1.32e-01 -0.121 0.0803 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 9.49e-01 0.00619 0.0958 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 2.80e-01 -0.115 0.107 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 7.68e-01 0.0238 0.0809 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 9.48e-01 0.00568 0.0877 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 88175 sc-eQTL 2.10e-02 0.274 0.118 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 8.37e-01 0.0238 0.116 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 4.17e-01 0.0881 0.108 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 8.55e-01 -0.00979 0.0536 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 1.88e-01 -0.144 0.109 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 4.66e-02 0.117 0.0582 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 9.00e-02 -0.154 0.0905 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 3.10e-01 0.107 0.105 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 8.56e-01 0.0211 0.116 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 8.73e-02 0.172 0.1 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 7.50e-02 -0.178 0.0993 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 88175 sc-eQTL 4.14e-01 0.086 0.105 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0152 0.121 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0591 0.105 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 2.59e-01 -0.132 0.116 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 4.03e-04 0.408 0.113 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 3.44e-02 -0.215 0.101 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 5.85e-01 0.0615 0.112 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 9.01e-01 0.0148 0.119 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 3.00e-01 -0.118 0.114 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0381 0.0882 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.94e-12 0.677 0.0905 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 6.39e-12 -0.511 0.0702 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0094 0.0855 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 6.62e-01 0.0406 0.0926 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 7.49e-02 0.115 0.0642 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 1.94e-01 -0.12 0.0918 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.17e-13 0.741 0.0933 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 1.46e-04 -0.308 0.0796 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 9.29e-01 0.00921 0.103 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 9.56e-01 0.00528 0.0964 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 2.80e-01 0.0684 0.0631 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0649 0.112 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 3.67e-11 0.682 0.0976 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 1.48e-02 -0.253 0.103 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0177 0.113 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 6.87e-01 0.0429 0.107 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 6.70e-01 0.0407 0.0954 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0119 0.1 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 6.57e-10 0.608 0.0939 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0804 0.082 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 2.44e-02 0.249 0.11 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 2.57e-01 -0.125 0.11 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0511 0.0937 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 8.36e-01 0.0242 0.117 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 8.79e-01 0.0163 0.107 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 5.85e-10 0.63 0.097 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 1.01e-06 -0.454 0.0902 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 9.73e-03 -0.261 0.0999 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00129 0.11 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0501 0.0725 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 5.63e-01 0.0648 0.112 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 8.23e-01 0.0258 0.115 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 2.23e-04 0.374 0.0995 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 1.85e-01 -0.141 0.106 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00553 0.116 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 5.26e-02 -0.221 0.113 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 1.04e-01 0.166 0.102 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 2.84e-01 -0.119 0.111 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 7.36e-01 -0.038 0.113 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.56e-03 0.333 0.104 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0845 0.114 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 3.90e-01 0.105 0.122 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 4.69e-01 0.0848 0.117 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 5.25e-01 0.065 0.102 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 8.93e-01 0.0151 0.113 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0481 0.0396 0.173 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 6.36e-01 0.0528 0.111 0.173 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.31e-04 0.409 0.105 0.173 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 1.36e-01 -0.144 0.0959 0.173 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 5.67e-02 0.219 0.115 0.173 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 5.79e-01 0.0654 0.118 0.173 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 7.13e-01 0.0361 0.0979 0.173 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 2.18e-01 -0.137 0.111 0.173 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 9.14e-01 0.0118 0.109 0.173 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 2.81e-01 0.104 0.0961 0.173 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 4.62e-01 -0.09 0.122 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.86e-02 0.207 0.0872 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 4.91e-01 0.0704 0.102 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 3.87e-01 -0.103 0.119 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 9.92e-01 0.00112 0.117 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 2.19e-01 0.13 0.105 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 7.57e-01 0.0344 0.111 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 3.56e-01 0.108 0.117 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 4.84e-01 0.0747 0.106 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.74e-06 0.485 0.0986 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0913 0.0785 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 5.68e-01 0.0625 0.109 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0552 0.106 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 8.59e-01 0.0161 0.0906 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.11 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0879 0.124 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 2.25e-01 -0.133 0.109 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 3.78e-03 0.322 0.11 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 5.83e-01 0.0496 0.09 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 6.04e-02 0.221 0.117 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0199 0.12 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0404 0.112 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0719 0.115 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 4.60e-01 0.0835 0.113 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0239 0.108 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.04e-05 0.436 0.0964 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0836 0.0765 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000781 0.107 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 9.07e-02 -0.182 0.107 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 1.76e-01 0.115 0.0844 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0274 0.11 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 7.91e-01 0.0316 0.119 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00477 0.0925 0.163 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 6.15e-02 -0.232 0.123 0.163 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 8.00e-02 0.168 0.0952 0.163 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0707 0.139 0.163 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 2.13e-01 -0.198 0.158 0.163 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 7.12e-01 0.0363 0.0979 0.163 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 8.58e-01 0.0202 0.113 0.163 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 3.40e-01 -0.11 0.114 0.163 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 88175 sc-eQTL 2.32e-01 0.159 0.132 0.163 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 2.35e-01 0.145 0.121 0.163 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 2.74e-01 0.124 0.112 0.163 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0104 0.0397 0.17 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 9.83e-01 0.00175 0.0801 0.17 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 7.09e-03 0.284 0.104 0.17 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 2.08e-02 -0.181 0.0776 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 2.09e-01 -0.141 0.112 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 3.21e-02 -0.181 0.0839 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0922 0.092 0.17 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 1.34e-01 -0.118 0.0787 0.17 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 9.75e-02 0.121 0.0728 0.17 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0132 0.0802 0.17 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 9.77e-01 0.0032 0.113 0.171 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 6.47e-09 0.657 0.109 0.171 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 2.11e-01 -0.129 0.102 0.171 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0436 0.112 0.171 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 7.06e-01 0.0437 0.116 0.171 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 9.14e-01 0.0102 0.094 0.171 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 6.40e-01 0.0498 0.106 0.178 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 3.37e-02 0.219 0.103 0.178 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 9.02e-01 0.0165 0.134 0.178 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 9.67e-01 0.00509 0.121 0.178 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0138 0.126 0.178 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 1.65e-01 0.164 0.118 0.178 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00231 0.0921 0.178 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0935 0.105 0.178 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 8.83e-01 0.0153 0.103 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.65e-03 0.242 0.076 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 5.62e-01 0.06 0.103 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0902 0.116 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0181 0.104 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 6.19e-01 0.0446 0.0897 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 1.01e-01 -0.125 0.076 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 5.04e-01 0.0743 0.111 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 8.84e-04 0.28 0.083 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 9.81e-01 0.00244 0.104 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0624 0.121 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 1.25e-01 -0.174 0.113 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 6.50e-01 0.0479 0.105 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 1.06e-01 -0.132 0.0817 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 8.35e-01 0.0293 0.14 0.185 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 6.74e-02 0.24 0.13 0.185 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00407 0.0991 0.185 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 2.78e-01 0.142 0.13 0.185 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 6.77e-01 0.0573 0.137 0.185 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 3.19e-02 0.273 0.126 0.185 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 4.34e-01 -0.102 0.13 0.185 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 1.88e-01 -0.168 0.127 0.185 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 3.06e-01 0.12 0.117 0.185 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0187 0.111 0.173 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 9.39e-03 0.262 0.1 0.173 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 5.95e-02 0.224 0.118 0.173 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0351 0.112 0.173 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00181 0.116 0.173 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 5.87e-01 0.0608 0.112 0.173 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0197 0.0977 0.173 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 1.38e-01 -0.164 0.11 0.174 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 3.45e-02 0.216 0.101 0.174 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 2.10e-01 -0.154 0.122 0.174 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 1.50e-02 -0.259 0.106 0.174 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 4.20e-01 0.0831 0.103 0.174 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 2.78e-01 0.108 0.0988 0.174 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0971 0.092 0.174 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 1.75e-01 0.176 0.129 0.175 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 3.69e-02 0.234 0.111 0.175 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 5.80e-03 -0.326 0.117 0.175 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 2.03e-01 -0.151 0.118 0.175 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 1.19e-01 -0.195 0.124 0.175 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 4.58e-02 -0.217 0.108 0.175 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 2.53e-02 0.188 0.0831 0.175 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00276 0.112 0.175 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0285 0.0555 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0731 0.111 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 9.55e-04 0.192 0.0572 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0474 0.0922 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0373 0.095 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 2.25e-01 -0.13 0.107 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 6.00e-01 0.0421 0.0802 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 4.68e-03 -0.27 0.0943 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 88175 sc-eQTL 5.52e-01 0.0659 0.111 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 1.02e-01 -0.189 0.115 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00861 0.115 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -654097 sc-eQTL 3.04e-01 0.0662 0.0642 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 1.93e-01 -0.137 0.105 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 2.50e-03 0.156 0.0509 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 5.29e-02 -0.144 0.0738 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 3.83e-01 0.0795 0.091 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0494 0.104 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 2.05e-01 0.0986 0.0776 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0563 0.0816 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 88175 sc-eQTL 3.11e-02 0.253 0.117 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 8.09e-01 0.0291 0.12 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -369938 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00882 0.109 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 5.78e-01 0.0529 0.0949 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 4.22e-04 0.267 0.0746 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 5.38e-01 0.0609 0.0988 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0918 0.117 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0943 0.0997 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 3.68e-01 0.0782 0.0868 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 2.78e-02 -0.156 0.0705 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 1.47e-01 -0.155 0.107 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 6.61e-04 0.315 0.0912 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 3.68e-01 0.102 0.113 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 4.79e-02 -0.215 0.108 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0436 0.108 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 1.02e-01 0.154 0.0936 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0224 0.0812 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -292473 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0699 0.102 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 130700 sc-eQTL 1.09e-07 0.512 0.093 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -3312 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0407 0.0681 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 547542 sc-eQTL 3.13e-01 0.106 0.104 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 419875 sc-eQTL 9.29e-02 -0.163 0.0964 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 sc-eQTL 2.44e-01 0.0915 0.0783 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 sc-eQTL 8.71e-01 0.0171 0.106 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -292538 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0388 0.124 0.172 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 130700 eQTL 6.15e-33 0.347 0.0279 0.0 0.0 0.19
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 eQTL 0.0317 0.032 0.0149 0.0 0.0 0.19
ENSG00000136048 DRAM1 -49933 eQTL 0.0028 0.0504 0.0168 0.0 0.0 0.19
ENSG00000139351 SYCP3 88178 eQTL 0.0187 0.1 0.0426 0.0 0.0 0.19
ENSG00000196091 MYBPC1 259294 pQTL 0.00727 -0.0581 0.0216 0.00259 0.0 0.188
ENSG00000258230 AC063950.1 53892 eQTL 0.034 0.0695 0.0328 0.0 0.0 0.19

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 130700 4.02e-06 4.7e-06 5.59e-07 2.14e-06 8e-07 8.45e-07 2.4e-06 8.73e-07 2.78e-06 1.45e-06 3.62e-06 1.84e-06 5.69e-06 1.36e-06 9.71e-07 2e-06 1.59e-06 2.12e-06 1.44e-06 1.28e-06 1.81e-06 3.73e-06 3.17e-06 1.68e-06 4.97e-06 1.21e-06 1.84e-06 1.78e-06 3.22e-06 3.06e-06 2.05e-06 4.17e-07 5.97e-07 1.34e-06 1.79e-06 9.75e-07 9.22e-07 4.71e-07 1.26e-06 4.35e-07 2.54e-07 4.81e-06 5.42e-07 1.68e-07 3.52e-07 3.88e-07 8.85e-07 2.32e-07 1.54e-07
ENSG00000120860 WASHC3 -234502 1.24e-06 1.22e-06 3.3e-07 1.25e-06 3.57e-07 5.92e-07 1.61e-06 3.31e-07 1.46e-06 4.52e-07 1.81e-06 6.57e-07 2.25e-06 2.89e-07 5.65e-07 8.19e-07 9.14e-07 6.56e-07 8.18e-07 6.82e-07 6.66e-07 1.72e-06 8.66e-07 6.4e-07 2.25e-06 4.28e-07 9.01e-07 7.59e-07 1.29e-06 1.26e-06 7.05e-07 1.92e-07 2.19e-07 7.11e-07 5.23e-07 4.67e-07 5.19e-07 2.73e-07 4.04e-07 1.92e-07 2.68e-07 1.64e-06 9.55e-08 1.31e-07 1.74e-07 1.22e-07 2.33e-07 8.73e-08 1.07e-07