logo

Genes within 1Mb (chr12:101683151:T:TG):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 7.98e-01 -0.017 0.0661 0.094 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 4.12e-01 0.0943 0.115 0.094 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 4.68e-01 0.0507 0.0698 0.094 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 6.65e-01 0.0438 0.101 0.094 B L1
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 3.83e-01 0.1 0.115 0.094 B L1
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 5.42e-03 -0.273 0.097 0.094 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 8.52e-02 -0.136 0.0785 0.094 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0131 0.0897 0.094 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -56321 sc-eQTL 6.95e-01 -0.056 0.142 0.094 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 7.19e-01 0.0491 0.136 0.094 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 7.70e-01 0.0372 0.127 0.094 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 2.20e-01 -0.127 0.103 0.094 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 4.63e-02 -0.277 0.138 0.094 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 3.49e-01 0.0907 0.0966 0.094 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 9.17e-01 0.0112 0.107 0.094 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 2.54e-01 -0.119 0.104 0.094 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 2.93e-01 -0.077 0.0731 0.094 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 2.51e-02 0.288 0.128 0.094 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 7.68e-02 -0.247 0.139 0.094 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 9.24e-01 0.00884 0.092 0.094 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0155 0.116 0.094 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 4.24e-01 -0.102 0.128 0.094 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0575 0.0909 0.094 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 7.61e-01 0.0398 0.13 0.094 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 6.96e-01 0.0565 0.144 0.095 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 3.57e-01 -0.121 0.132 0.095 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 8.41e-03 0.379 0.143 0.095 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 1.07e-01 0.25 0.154 0.095 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 5.25e-01 0.102 0.161 0.095 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 3.88e-01 -0.12 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0778 0.114 0.095 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 1.92e-01 -0.196 0.15 0.095 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 7.63e-01 0.0368 0.122 0.094 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 3.79e-01 0.0906 0.103 0.094 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 7.55e-01 0.0403 0.129 0.094 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 2.62e-01 0.161 0.144 0.094 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 6.28e-01 0.0642 0.132 0.094 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 5.02e-01 0.0783 0.116 0.094 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 2.38e-01 0.112 0.0947 0.094 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0828 0.134 0.092 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 6.70e-02 -0.227 0.123 0.092 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 1.42e-01 -0.132 0.0898 0.092 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0545 0.145 0.092 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0789 0.133 0.092 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0154 0.101 0.092 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 2.00e-01 0.183 0.143 0.092 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 2.05e-01 -0.213 0.167 0.092 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 9.15e-01 0.00525 0.0493 0.094 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 2.27e-01 -0.113 0.0936 0.094 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 6.10e-01 0.07 0.137 0.094 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 7.05e-01 0.0376 0.099 0.094 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 6.93e-01 0.0611 0.155 0.094 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 2.56e-01 -0.128 0.112 0.094 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 4.37e-01 0.0779 0.1 0.094 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 2.86e-01 0.128 0.12 0.094 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 1.34e-01 0.15 0.0996 0.094 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 2.75e-01 0.127 0.116 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0112 0.0313 0.097 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 3.86e-01 0.141 0.162 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 1.10e-02 0.303 0.118 0.097 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 3.90e-01 -0.147 0.17 0.097 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 6.04e-02 -0.309 0.163 0.097 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 1.46e-01 -0.247 0.169 0.097 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 2.64e-01 -0.181 0.162 0.097 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 3.00e-01 -0.169 0.163 0.097 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -56321 sc-eQTL 5.83e-01 0.0737 0.134 0.097 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 3.04e-02 -0.29 0.133 0.097 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 7.79e-01 0.0356 0.127 0.097 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 2.69e-01 0.0725 0.0654 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 9.64e-02 0.271 0.162 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 2.73e-01 0.0962 0.0875 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00476 0.13 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 1.21e-01 -0.223 0.143 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 2.59e-01 -0.183 0.162 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 5.51e-01 0.0799 0.134 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 2.28e-01 0.173 0.143 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -56321 sc-eQTL 3.08e-01 -0.154 0.151 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 4.99e-01 -0.107 0.158 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 4.64e-01 0.111 0.152 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0721 0.0605 0.095 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 9.71e-01 0.00584 0.16 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 2.87e-01 -0.112 0.104 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 4.49e-01 -0.108 0.143 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 1.11e-01 0.251 0.156 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 9.32e-01 0.0133 0.156 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 2.01e-01 -0.179 0.139 0.095 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0829 0.147 0.095 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -56321 sc-eQTL 4.04e-01 -0.126 0.151 0.095 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 4.30e-01 -0.122 0.154 0.095 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 9.65e-02 -0.233 0.14 0.095 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 3.22e-01 0.0817 0.0823 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 3.60e-01 0.137 0.149 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 1.48e-01 0.112 0.0772 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 5.66e-01 -0.063 0.11 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 1.42e-01 0.191 0.13 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 4.09e-01 -0.12 0.145 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0877 0.11 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 1.29e-01 -0.181 0.119 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -56321 sc-eQTL 7.10e-01 0.0602 0.162 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 1.15e-01 0.248 0.157 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0476 0.148 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 3.48e-01 0.0682 0.0725 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 9.36e-01 0.0121 0.149 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 4.60e-01 0.059 0.0796 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 2.19e-01 0.152 0.123 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 4.65e-01 0.105 0.143 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 1.17e-01 -0.246 0.156 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0674 0.137 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 4.83e-01 0.0953 0.135 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -56321 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0234 0.143 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 9.12e-02 0.278 0.164 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 6.87e-01 0.0572 0.142 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 1.93e-01 -0.206 0.158 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 4.30e-01 -0.125 0.158 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 6.16e-03 0.377 0.136 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 3.75e-02 -0.316 0.151 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 1.52e-01 -0.231 0.161 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 4.93e-01 -0.106 0.155 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0968 0.119 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 3.97e-02 -0.283 0.137 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 9.26e-01 0.00994 0.106 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0399 0.116 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0694 0.125 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0322 0.0877 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 8.77e-01 0.0195 0.125 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 8.34e-02 -0.25 0.144 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 1.87e-01 -0.147 0.111 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 5.63e-01 0.0811 0.14 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 2.00e-01 -0.168 0.131 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0669 0.0859 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0153 0.15 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 9.58e-03 -0.372 0.142 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 7.37e-01 0.0468 0.139 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 8.02e-02 0.263 0.15 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0865 0.142 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 7.19e-01 0.0459 0.128 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 5.59e-02 0.265 0.138 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0873 0.143 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0774 0.114 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 3.04e-01 -0.158 0.154 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 4.30e-01 -0.12 0.152 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0739 0.13 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 4.07e-01 -0.134 0.162 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 2.22e-02 0.328 0.142 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 1.99e-01 -0.184 0.142 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 8.20e-01 0.0293 0.128 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 4.75e-01 0.0976 0.136 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 3.43e-01 -0.141 0.148 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0402 0.0977 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 2.03e-01 0.192 0.15 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 2.41e-01 -0.185 0.157 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 9.24e-02 -0.237 0.14 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 5.64e-01 0.0844 0.146 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 3.84e-01 -0.139 0.159 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 1.78e-01 0.211 0.156 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 3.99e-01 0.119 0.14 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0311 0.153 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 3.06e-01 0.161 0.157 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 8.33e-02 -0.257 0.148 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 6.22e-01 0.0787 0.159 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 5.45e-01 -0.104 0.171 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 2.16e-02 -0.374 0.161 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0668 0.143 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0295 0.158 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 6.64e-01 0.0233 0.0537 0.095 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0906 0.151 0.095 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 2.76e-01 0.16 0.146 0.095 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 9.28e-01 0.0118 0.13 0.095 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 4.36e-01 -0.121 0.156 0.095 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0421 0.159 0.095 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 1.29e-01 0.201 0.132 0.095 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 2.58e-01 0.17 0.15 0.095 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 5.58e-01 0.0861 0.147 0.095 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0115 0.13 0.095 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 4.34e-01 0.135 0.172 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0564 0.125 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 4.04e-02 -0.294 0.143 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 4.43e-01 -0.129 0.168 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 7.69e-01 0.0483 0.164 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 9.86e-01 0.00256 0.149 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 8.23e-01 0.035 0.156 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 2.72e-01 -0.181 0.165 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 2.99e-01 0.154 0.148 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 9.08e-02 -0.245 0.144 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 3.03e-01 -0.113 0.109 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 2.63e-01 -0.17 0.152 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 1.49e-01 -0.213 0.147 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0615 0.126 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0339 0.153 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 2.19e-01 -0.212 0.172 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0867 0.161 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 3.52e-01 -0.154 0.165 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 6.07e-01 0.0686 0.133 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0535 0.174 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0514 0.178 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 4.58e-01 0.123 0.165 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 4.56e-01 0.127 0.17 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 8.89e-02 -0.283 0.166 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 6.65e-02 -0.277 0.15 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 1.32e-01 -0.213 0.141 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 1.00e+00 -2.25e-05 0.108 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0457 0.15 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 8.61e-01 0.0264 0.151 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0717 0.119 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 4.21e-02 0.313 0.153 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 6.38e-01 0.0788 0.167 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 8.67e-01 0.0219 0.131 0.078 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 2.54e-01 0.2 0.175 0.078 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 1.58e-01 0.192 0.135 0.078 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 1.80e-01 0.262 0.194 0.078 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 4.63e-01 0.166 0.225 0.078 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0425 0.138 0.078 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 7.61e-01 0.0486 0.16 0.078 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 1.38e-01 0.24 0.16 0.078 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -56321 sc-eQTL 7.50e-01 0.0601 0.188 0.078 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0831 0.172 0.078 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 6.63e-01 0.0697 0.159 0.078 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 9.08e-01 0.00618 0.0536 0.096 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 7.24e-02 -0.194 0.107 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 6.47e-01 0.0657 0.143 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 2.54e-01 0.121 0.106 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 2.54e-01 0.172 0.151 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0214 0.114 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0286 0.124 0.096 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 3.27e-01 0.105 0.106 0.096 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0233 0.0988 0.096 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 8.53e-01 0.0201 0.108 0.096 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 2.77e-01 -0.167 0.153 0.094 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 2.93e-01 -0.168 0.159 0.094 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0671 0.139 0.094 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0766 0.152 0.094 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 4.39e-01 -0.122 0.157 0.094 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0228 0.128 0.094 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0924 0.145 0.095 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 3.44e-01 -0.134 0.141 0.095 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 2.04e-02 0.421 0.18 0.095 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 9.95e-01 -0.001 0.165 0.095 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 7.45e-01 0.0558 0.171 0.095 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 1.53e-01 -0.23 0.16 0.095 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 9.32e-01 0.0107 0.125 0.095 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 3.03e-01 -0.147 0.143 0.095 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0524 0.139 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 5.04e-01 0.0702 0.105 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 8.56e-01 0.0254 0.139 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 8.16e-01 0.0365 0.157 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 6.98e-01 0.0545 0.14 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 7.04e-01 -0.046 0.121 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0152 0.103 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 4.80e-01 0.106 0.149 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 7.59e-02 0.203 0.114 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 8.82e-01 0.0206 0.139 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 2.18e-01 0.201 0.163 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 6.65e-01 0.0663 0.153 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 1.58e-01 0.2 0.141 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 8.22e-01 0.0249 0.11 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0157 0.197 0.097 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0889 0.185 0.097 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 1.44e-01 0.203 0.138 0.097 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 4.96e-02 -0.359 0.181 0.097 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 2.36e-01 -0.228 0.192 0.097 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 2.81e-01 -0.194 0.179 0.097 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 9.79e-01 0.00492 0.183 0.097 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 5.21e-02 0.347 0.177 0.097 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 1.06e-01 0.265 0.163 0.097 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 9.31e-01 0.0136 0.156 0.091 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0934 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0582 0.168 0.091 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 3.26e-01 0.154 0.157 0.091 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 6.89e-01 0.0651 0.163 0.091 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0527 0.157 0.091 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0248 0.137 0.091 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 1.14e-01 0.242 0.152 0.09 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0544 0.141 0.09 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 2.76e-01 0.184 0.169 0.09 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 3.10e-02 0.318 0.146 0.09 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 8.54e-01 0.0261 0.142 0.09 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 3.40e-01 0.131 0.136 0.09 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 1.45e-01 0.185 0.127 0.09 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0779 0.187 0.088 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 3.48e-01 -0.153 0.163 0.088 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00479 0.173 0.088 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 1.21e-01 0.266 0.171 0.088 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 5.70e-01 0.103 0.181 0.088 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 2.26e-01 0.191 0.157 0.088 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0558 0.122 0.088 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 3.81e-01 -0.142 0.162 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0311 0.076 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 1.67e-01 0.211 0.152 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 8.23e-01 0.018 0.0804 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0397 0.126 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 4.19e-01 -0.105 0.13 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0765 0.147 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0141 0.11 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 7.01e-01 0.0506 0.132 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -56321 sc-eQTL 1.06e-01 -0.245 0.151 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 1.77e-01 -0.214 0.158 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0728 0.157 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -798593 sc-eQTL 3.51e-01 0.0814 0.0871 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 5.48e-01 0.0859 0.143 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 2.55e-01 0.0803 0.0703 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 6.99e-01 0.0391 0.101 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 1.28e-01 0.188 0.123 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 9.20e-02 -0.237 0.14 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 2.05e-01 -0.134 0.105 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0696 0.111 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -56321 sc-eQTL 6.81e-01 0.0657 0.16 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 6.30e-02 0.302 0.161 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -514434 sc-eQTL 8.21e-01 0.0335 0.148 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 8.74e-01 0.0202 0.127 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 3.29e-01 0.101 0.103 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 9.97e-01 0.00055 0.133 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 7.60e-01 0.0479 0.157 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 5.32e-01 0.0839 0.134 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 5.72e-01 0.0661 0.117 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 6.32e-01 0.0459 0.0957 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 2.42e-01 0.174 0.148 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00879 0.13 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 4.65e-01 0.115 0.157 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 1.57e-02 0.364 0.149 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 8.79e-01 0.0229 0.15 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 6.82e-01 0.0535 0.131 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 2.51e-01 0.129 0.112 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -436969 sc-eQTL 2.89e-01 -0.15 0.141 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -13796 sc-eQTL 4.58e-02 -0.275 0.137 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -147808 sc-eQTL 1.79e-01 -0.127 0.0942 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 403046 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0665 0.145 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 275379 sc-eQTL 4.81e-01 -0.095 0.134 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -378998 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0594 0.109 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 sc-eQTL 1.58e-01 0.206 0.146 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -437034 sc-eQTL 4.38e-01 -0.134 0.172 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 eQTL 0.000464 0.0874 0.0249 0.0 0.0 0.0829

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -436969 3.91e-06 3.17e-06 5.1e-07 2.07e-06 4.79e-07 1.19e-06 2.91e-06 3.54e-07 1.74e-06 6.9e-07 2.12e-06 1.34e-06 3.83e-06 1.31e-06 5.32e-07 9.51e-07 8.06e-07 1.34e-06 1.61e-06 6.44e-07 9.23e-07 2.02e-06 3.4e-06 6.51e-07 2.55e-06 1.19e-06 1.03e-06 8.57e-07 2.99e-06 1.66e-06 1.65e-06 5.46e-08 2.29e-07 1.52e-06 9.17e-07 8.93e-07 9.21e-07 4.57e-07 5.01e-07 2.29e-07 2.73e-07 4.14e-06 4.37e-07 2.2e-07 7.89e-08 3.67e-07 1.76e-07 3.13e-08 1.14e-07
ENSG00000111666 \N -13796 8.53e-05 6.76e-05 7.58e-06 2.31e-05 7.6e-06 2.55e-05 9.6e-05 7.11e-06 5.94e-05 2.29e-05 8e-05 2.57e-05 9.58e-05 2.34e-05 7.62e-06 3.44e-05 3.03e-05 3.86e-05 1.06e-05 9.02e-06 2.29e-05 6.25e-05 6.59e-05 1.15e-05 6.25e-05 1.29e-05 2.36e-05 1.84e-05 5.97e-05 3.24e-05 3.18e-05 1.86e-06 4.66e-06 8.63e-06 1.76e-05 8.12e-06 5.7e-06 4.91e-06 7.19e-06 4.67e-06 1.97e-06 7.27e-05 6.91e-06 5.07e-07 2.88e-06 5.22e-06 5.21e-06 2.25e-06 1.78e-06
ENSG00000136048 DRAM1 -194429 8.18e-06 7.92e-06 1.29e-06 4.47e-06 1.5e-06 3.26e-06 1.03e-05 8.06e-07 4.82e-06 1.98e-06 7.56e-06 3.17e-06 9.46e-06 2.09e-06 1.37e-06 2.56e-06 1.82e-06 3.57e-06 1.56e-06 1.51e-06 2.77e-06 4.88e-06 7.15e-06 1.39e-06 6.37e-06 2.01e-06 1.88e-06 1.75e-06 6.94e-06 4.17e-06 2.87e-06 2.09e-07 7.94e-07 3.43e-06 2.12e-06 2.04e-06 1.78e-06 5e-07 1.3e-06 3.47e-07 6.55e-07 1.28e-05 2.25e-06 4.28e-07 2.74e-07 8.79e-07 5.32e-07 2.3e-07 1.58e-07