logo

Genes within 1Mb (chr1:70380838:TAAAA:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 2.81e-01 -0.109 0.101 0.16 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 4.08e-02 0.16 0.0778 0.16 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 9.45e-01 0.00627 0.0916 0.16 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 4.25e-01 0.0616 0.077 0.16 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.66e-03 -0.314 0.0987 0.16 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0965 0.0848 0.16 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 4.34e-02 0.135 0.0662 0.16 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 7.73e-01 0.0196 0.0678 0.16 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0601 0.0619 0.16 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 9.99e-01 -9.36e-05 0.0733 0.16 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.84e-08 -0.467 0.0799 0.16 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 1.01e-01 -0.157 0.0953 0.16 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 1.23e-01 0.123 0.0795 0.16 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 1.42e-01 -0.115 0.0778 0.16 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 1.77e-01 -0.102 0.0752 0.16 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 2.32e-01 -0.105 0.0875 0.16 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.28e-09 -0.521 0.0821 0.16 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 3.52e-01 0.114 0.123 0.158 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 2.65e-01 0.0915 0.0819 0.158 DC L1
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 4.56e-01 0.0791 0.106 0.158 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 3.25e-01 -0.11 0.112 0.158 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00804 0.098 0.158 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 4.29e-03 -0.314 0.109 0.158 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 5.76e-01 0.0622 0.111 0.16 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 9.12e-02 0.108 0.0639 0.16 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 7.86e-02 -0.155 0.0875 0.16 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 9.25e-01 0.00978 0.104 0.16 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 6.16e-02 0.169 0.0897 0.16 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 7.27e-01 0.0335 0.0958 0.159 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 1.20e-01 0.131 0.0841 0.159 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 9.39e-01 0.00652 0.0849 0.159 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 6.33e-01 0.0419 0.0874 0.159 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 3.08e-05 -0.436 0.102 0.159 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 4.18e-02 0.227 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 6.93e-01 0.0348 0.088 0.16 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 9.52e-01 0.00602 0.1 0.16 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 5.99e-01 0.0558 0.106 0.16 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 6.36e-01 -0.047 0.0991 0.16 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 8.31e-02 -0.194 0.112 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 8.95e-02 0.211 0.124 0.156 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 3.44e-01 -0.125 0.132 0.156 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 6.76e-01 0.0557 0.133 0.156 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 3.88e-01 0.116 0.134 0.156 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0923 0.111 0.156 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 6.84e-01 0.048 0.118 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 8.85e-02 0.17 0.0995 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 2.79e-01 -0.124 0.114 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 5.49e-03 0.312 0.111 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 8.96e-03 -0.31 0.118 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 7.32e-01 0.0422 0.123 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 1.86e-01 0.144 0.109 0.162 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 3.12e-01 -0.102 0.101 0.162 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 2.84e-01 -0.126 0.117 0.162 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 5.45e-02 -0.222 0.115 0.162 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 7.06e-02 -0.207 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 2.54e-01 0.104 0.0909 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 6.47e-01 0.0445 0.0972 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 6.78e-01 0.0409 0.0982 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 2.85e-02 -0.243 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0829 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 5.24e-02 0.203 0.104 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 7.49e-01 0.0396 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0406 0.0957 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.96e-01 -0.146 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 1.09e-01 -0.186 0.115 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 2.73e-01 -0.132 0.12 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 5.13e-01 0.0662 0.101 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0493 0.111 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 9.12e-01 0.0133 0.121 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.26e-01 0.172 0.112 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0673 0.0962 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 2.80e-02 0.153 0.069 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 2.71e-01 0.0815 0.0738 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0434 0.0736 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 9.60e-01 0.00399 0.0795 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 5.90e-07 -0.448 0.0869 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 5.11e-01 0.0756 0.115 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 3.63e-01 0.0771 0.0846 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00844 0.0929 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 5.83e-01 0.0484 0.088 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 5.76e-01 0.0533 0.0952 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.76e-02 -0.272 0.114 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 1.49e-01 -0.165 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 9.54e-01 0.00581 0.1 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 8.43e-01 0.0203 0.102 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0523 0.101 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0502 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 2.28e-01 -0.138 0.115 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0643 0.107 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 1.58e-01 0.143 0.101 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 1.32e-01 -0.148 0.0981 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 2.90e-02 -0.251 0.114 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 2.28e-01 -0.133 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 7.77e-05 -0.448 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 1.73e-01 -0.16 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 2.27e-01 0.105 0.087 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 2.48e-01 -0.105 0.0909 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 9.10e-01 0.00968 0.0854 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0749 0.0908 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 2.42e-06 -0.449 0.0927 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 2.34e-01 -0.144 0.121 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 4.50e-01 0.0845 0.112 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0857 0.111 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 3.88e-01 -0.101 0.116 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0668 0.119 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 2.37e-02 -0.266 0.117 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 1.04e-01 -0.197 0.12 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 4.67e-01 0.0824 0.113 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 1.54e-01 0.155 0.108 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 1.34e-01 -0.188 0.125 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 5.87e-01 0.0706 0.13 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 9.51e-01 0.00733 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 1.58e-02 0.28 0.115 0.162 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 1.59e-01 0.161 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 2.50e-01 -0.111 0.0965 0.162 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 6.70e-01 0.0458 0.107 0.162 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 4.60e-01 -0.086 0.116 0.162 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 3.12e-01 -0.105 0.104 0.162 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 3.67e-01 0.114 0.126 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 6.45e-01 0.0513 0.111 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 1.28e-01 -0.19 0.124 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 8.40e-01 0.0229 0.113 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.81e-01 -0.161 0.12 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0357 0.101 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 4.23e-01 0.0791 0.0985 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 1.31e-01 0.149 0.0984 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0199 0.0971 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 2.87e-02 -0.254 0.115 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0281 0.122 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 1.22e-01 0.17 0.11 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0579 0.125 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 9.02e-01 -0.015 0.121 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 4.70e-04 -0.422 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 3.20e-01 0.115 0.116 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 2.05e-01 0.126 0.0988 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0737 0.111 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 7.72e-01 0.0299 0.103 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.52e-02 -0.261 0.107 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0538 0.15 0.156 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 3.64e-01 0.123 0.135 0.156 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 9.77e-01 0.00436 0.152 0.156 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 1.66e-01 -0.148 0.106 0.156 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0276 0.144 0.156 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 2.17e-01 0.144 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0389 0.101 0.163 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 6.68e-01 0.0394 0.0917 0.163 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0847 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0596 0.114 0.163 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.47e-01 -0.169 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 5.36e-01 -0.075 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 5.93e-01 0.0542 0.101 0.16 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 1.31e-01 -0.122 0.0806 0.16 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 7.09e-01 0.0398 0.106 0.16 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0125 0.11 0.16 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.25e-01 -0.18 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 6.75e-01 0.0489 0.116 0.159 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 7.48e-01 0.0281 0.0871 0.159 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 3.93e-01 0.0902 0.105 0.159 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 2.01e-01 -0.158 0.123 0.159 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 4.07e-01 -0.101 0.121 0.159 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 2.43e-03 -0.338 0.11 0.159 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 2.00e-01 0.145 0.113 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 5.04e-01 0.05 0.0747 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 4.45e-01 -0.071 0.0928 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 1.93e-01 0.143 0.11 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 5.01e-02 0.193 0.0981 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 8.39e-01 0.0249 0.122 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 1.95e-01 0.113 0.0869 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 1.67e-01 -0.146 0.105 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 3.60e-01 -0.114 0.124 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 5.24e-01 0.0675 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0202 0.154 0.176 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 4.94e-01 -0.101 0.146 0.176 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 4.31e-01 0.111 0.141 0.176 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 4.60e-01 -0.113 0.152 0.176 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 1.31e-01 -0.224 0.148 0.176 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.89e-01 -0.188 0.142 0.176 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 4.56e-01 0.0863 0.115 0.16 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 7.41e-02 0.18 0.1 0.16 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0817 0.0901 0.16 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 5.98e-01 0.062 0.117 0.16 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0664 0.118 0.16 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 2.75e-01 -0.13 0.119 0.154 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 7.20e-03 0.246 0.0904 0.154 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 2.08e-01 -0.116 0.0916 0.154 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0356 0.104 0.154 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 3.22e-01 0.109 0.109 0.154 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 5.68e-01 0.0741 0.129 0.164 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.164 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 5.37e-01 0.0616 0.0996 0.164 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0393 0.132 0.164 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 1.10e-01 0.174 0.109 0.164 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 3.38e-01 -0.111 0.115 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 6.16e-01 0.0566 0.113 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 5.92e-02 0.186 0.098 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 9.07e-02 -0.18 0.106 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 1.42e-01 0.158 0.107 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 5.44e-03 -0.322 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 1.49e-01 -0.16 0.11 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 1.26e-01 0.144 0.0936 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 1.34e-01 0.142 0.0946 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 7.26e-01 -0.031 0.0885 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.36e-02 -0.262 0.105 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 2.41e-01 0.133 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 4.71e-01 0.049 0.0679 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 1.32e-01 -0.135 0.0889 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 5.91e-01 0.0612 0.114 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 1.26e-01 0.141 0.0915 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0291 0.114 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 3.41e-03 0.256 0.0864 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -30380 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0841 0.0859 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 4.94e-01 0.073 0.107 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 6.05e-01 0.0528 0.102 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 175259 sc-eQTL 6.69e-01 0.0431 0.101 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 175156 sc-eQTL 9.87e-02 0.144 0.087 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 26104 sc-eQTL 3.96e-01 0.0754 0.0887 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -700451 sc-eQTL 7.05e-01 0.0342 0.0903 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 26033 sc-eQTL 1.79e-05 -0.455 0.104 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116761 CTH -30380 eQTL 0.445 -0.0352 0.0461 0.0108 0.0111 0.126
ENSG00000197568 HHLA3 26033 eQTL 2.53e-16 -0.308 0.0369 0.0611 0.058 0.126

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000050628 \N -666970 2.77e-07 1.16e-07 5.03e-08 2.01e-07 9.02e-08 8.21e-08 2.74e-07 5.21e-08 1.41e-07 4.57e-08 1.62e-07 8.03e-08 1.41e-07 6.21e-08 4.89e-08 7.5e-08 4.01e-08 1.56e-07 5.39e-08 4.78e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.45e-07 4.53e-08 1.5e-07 1.22e-07 1.07e-07 9.36e-08 1.22e-07 1.81e-07 9.64e-08 3.72e-08 2.92e-08 8.25e-08 5.41e-08 3.93e-08 5.45e-08 8.76e-08 8.3e-08 3.12e-08 3.43e-08 1.36e-07 5.12e-08 2e-08 9.88e-08 1.72e-08 1.18e-07 4.7e-09 4.61e-08
ENSG00000066557 \N 175259 6.01e-06 5.78e-06 1.28e-06 3.67e-06 1.71e-06 3.88e-06 9.53e-06 9.52e-07 4.94e-06 2.44e-06 6.04e-06 3.18e-06 6.97e-06 1.16e-06 9.1e-07 3.77e-06 2.01e-06 3.86e-06 1.44e-06 2.83e-06 4.38e-06 4.86e-06 5.2e-06 1.4e-06 5.31e-06 3.36e-06 2.25e-06 1.76e-06 7.09e-06 6.39e-06 2.62e-06 5.93e-07 1.2e-06 1.57e-06 1.95e-06 1.14e-06 1.63e-06 2.02e-06 1.34e-06 3.63e-07 6.18e-07 6.09e-06 1.64e-06 3.63e-07 6.07e-07 1.1e-06 9.05e-07 4.43e-07 1.58e-07
ENSG00000197568 HHLA3 26033 0.000129 0.000104 1.35e-05 3.07e-05 1.33e-05 3.8e-05 0.000105 1.02e-05 9.2e-05 3.98e-05 0.000111 4.48e-05 0.00014 3.82e-05 1.73e-05 6.09e-05 4.89e-05 6.97e-05 2.03e-05 1.89e-05 3.68e-05 0.000102 9.51e-05 2.18e-05 0.000104 2.63e-05 4.13e-05 3.62e-05 8.62e-05 5.68e-05 5.54e-05 4.24e-06 6.68e-06 2.03e-05 1.84e-05 1.24e-05 5.86e-06 6.91e-06 1.09e-05 4.63e-06 2.04e-06 9.8e-05 1.2e-05 5.83e-07 6.58e-06 1.11e-05 9.97e-06 4.46e-06 3.13e-06