logo

Genes within 1Mb (chr1:70322270:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 4.15e-01 0.112 0.137 0.079 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 6.02e-01 0.0553 0.106 0.079 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 2.73e-01 -0.135 0.123 0.079 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0807 0.104 0.079 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 9.36e-03 -0.352 0.134 0.079 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 5.57e-04 -0.394 0.112 0.079 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0915 0.0907 0.079 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00939 0.0922 0.079 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0438 0.0843 0.079 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0483 0.0997 0.079 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 2.75e-01 -0.128 0.117 0.079 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 7.40e-01 0.0427 0.128 0.079 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 4.52e-01 0.0806 0.107 0.079 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 8.10e-01 0.0253 0.105 0.079 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 9.81e-01 0.00244 0.101 0.079 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0327 0.118 0.079 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 7.09e-03 -0.321 0.118 0.079 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0399 0.161 0.083 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 8.13e-01 0.0254 0.107 0.083 DC L1
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 9.74e-01 0.00454 0.138 0.083 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0866 0.146 0.083 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0549 0.128 0.083 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0951 0.145 0.083 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 9.41e-01 0.0111 0.15 0.079 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 3.20e-01 0.0862 0.0864 0.079 Mono L1
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0748 0.119 0.079 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 6.15e-05 -0.553 0.135 0.079 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0621 0.122 0.079 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 3.55e-01 0.12 0.129 0.079 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0416 0.114 0.079 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 2.86e-03 -0.339 0.112 0.079 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 1.02e-01 -0.193 0.117 0.079 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 2.26e-01 -0.174 0.143 0.079 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 8.98e-01 0.0197 0.154 0.079 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0382 0.121 0.079 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 1.86e-01 0.181 0.137 0.079 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 9.58e-01 0.00766 0.146 0.079 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00334 0.136 0.079 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 8.28e-01 0.0336 0.154 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 1.56e-01 -0.241 0.169 0.077 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0217 0.18 0.077 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 1.15e-01 -0.286 0.18 0.077 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 8.53e-01 0.0341 0.183 0.077 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 8.67e-01 0.0256 0.152 0.077 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0652 0.16 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 8.85e-01 0.0198 0.137 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 8.07e-02 -0.271 0.154 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 5.17e-01 -0.1 0.154 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 1.42e-02 -0.397 0.161 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 6.65e-01 0.0733 0.169 0.08 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 7.94e-01 0.0392 0.15 0.08 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 1.94e-01 -0.18 0.138 0.08 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 4.41e-01 -0.124 0.161 0.08 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0284 0.159 0.08 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 2.27e-01 0.186 0.154 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0577 0.122 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0153 0.131 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0794 0.132 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 3.99e-01 -0.126 0.149 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 9.11e-01 0.0183 0.163 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0709 0.144 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0836 0.169 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0435 0.131 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 2.37e-01 -0.183 0.154 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 5.26e-02 -0.31 0.159 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 4.58e-04 -0.575 0.161 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 4.78e-01 0.099 0.139 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 1.79e-01 -0.206 0.153 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 9.73e-01 -0.0057 0.166 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 1.25e-01 0.238 0.155 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 2.47e-03 -0.392 0.128 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0293 0.0949 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 7.51e-01 0.0319 0.101 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0645 0.1 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0493 0.108 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 2.62e-01 -0.14 0.125 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 2.04e-02 -0.352 0.15 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 3.55e-01 -0.104 0.112 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 3.44e-01 -0.117 0.123 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 7.79e-01 0.0328 0.117 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 2.30e-01 -0.152 0.126 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 8.77e-01 0.0237 0.153 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 7.13e-01 0.0569 0.155 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 5.03e-02 -0.263 0.134 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0342 0.137 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 2.70e-01 -0.15 0.136 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 1.63e-01 -0.21 0.15 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0312 0.155 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000247 0.149 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0137 0.141 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0857 0.137 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 2.51e-01 -0.185 0.16 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 7.01e-02 -0.277 0.152 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 3.34e-01 -0.155 0.16 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 7.51e-01 -0.051 0.16 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 4.41e-01 0.092 0.119 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 4.51e-01 0.0941 0.125 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 6.54e-01 0.0524 0.117 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0633 0.124 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 7.65e-02 -0.236 0.133 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0952 0.168 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 4.55e-01 0.116 0.155 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 8.35e-01 0.0322 0.155 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0769 0.162 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0469 0.165 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 3.75e-02 -0.34 0.162 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0242 0.177 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0418 0.165 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 6.81e-01 0.0655 0.159 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 9.39e-01 -0.014 0.183 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 5.50e-01 0.113 0.189 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 4.08e-01 -0.144 0.174 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 3.95e-01 -0.134 0.157 0.08 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 3.11e-01 -0.156 0.154 0.08 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 7.42e-01 0.043 0.131 0.08 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 4.55e-01 0.108 0.145 0.08 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 2.87e-01 -0.167 0.156 0.08 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0261 0.14 0.08 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 7.53e-01 0.051 0.162 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 3.57e-01 -0.131 0.142 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 3.27e-01 -0.157 0.16 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 3.73e-01 -0.13 0.145 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0175 0.154 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 4.23e-01 0.11 0.137 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 4.50e-01 0.1 0.133 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 4.49e-01 -0.101 0.133 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 2.70e-02 -0.288 0.129 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 4.87e-01 -0.109 0.157 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0298 0.167 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0963 0.151 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 5.94e-02 -0.321 0.17 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0922 0.166 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 5.33e-01 -0.105 0.167 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 7.84e-01 0.0429 0.156 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 1.81e-01 -0.179 0.133 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 1.09e-01 -0.24 0.149 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00054 0.139 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 2.12e-01 -0.182 0.145 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 1.24e-01 0.274 0.177 0.096 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 4.07e-01 0.134 0.16 0.096 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 5.11e-01 0.119 0.181 0.096 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 8.69e-03 -0.331 0.124 0.096 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0406 0.172 0.096 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 3.37e-01 0.152 0.158 0.078 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00583 0.137 0.078 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 5.08e-01 0.0825 0.125 0.078 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0141 0.16 0.078 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 8.97e-01 0.0201 0.154 0.078 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 7.67e-01 0.047 0.158 0.078 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0644 0.162 0.079 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 2.36e-01 0.16 0.135 0.079 Treg L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 3.33e-01 -0.105 0.108 0.079 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 8.11e-01 -0.034 0.142 0.079 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 9.82e-01 0.00338 0.147 0.079 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0492 0.157 0.079 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 9.92e-01 0.00156 0.163 0.078 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0458 0.122 0.078 cDC L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 6.56e-01 0.0659 0.148 0.078 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 6.07e-01 -0.089 0.173 0.078 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 9.31e-01 0.0148 0.17 0.078 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 9.17e-01 0.0166 0.158 0.078 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 4.23e-01 0.122 0.152 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 2.68e-01 0.112 0.101 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 8.80e-01 -0.019 0.125 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 7.51e-02 -0.264 0.147 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0766 0.134 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 9.72e-01 0.00567 0.164 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 1.56e-01 0.166 0.117 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 2.87e-01 -0.151 0.142 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 2.64e-02 -0.369 0.165 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 1.97e-01 -0.183 0.142 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 5.64e-01 0.118 0.204 0.076 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 2.56e-01 -0.221 0.193 0.076 gdT L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 2.88e-01 0.199 0.187 0.076 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 4.21e-01 0.163 0.202 0.076 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 1.37e-02 -0.482 0.193 0.076 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 8.84e-01 0.0276 0.189 0.076 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 6.12e-01 -0.08 0.158 0.08 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0547 0.138 0.08 intMono L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0767 0.123 0.08 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 3.64e-01 -0.145 0.16 0.08 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0453 0.161 0.08 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0757 0.158 0.081 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 3.71e-01 -0.109 0.122 0.081 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0512 0.122 0.081 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 5.05e-02 -0.268 0.136 0.081 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 6.97e-02 0.262 0.144 0.081 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 2.49e-01 0.209 0.18 0.088 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0983 0.153 0.088 pDC L2
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 9.88e-01 0.00212 0.139 0.088 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0632 0.184 0.088 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 7.24e-01 -0.054 0.153 0.088 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 2.82e-01 -0.174 0.161 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 2.55e-01 -0.175 0.153 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0344 0.135 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 2.27e-03 -0.438 0.142 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 2.20e-01 -0.18 0.146 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 6.02e-02 -0.298 0.158 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 2.25e-01 0.179 0.147 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 3.27e-01 -0.123 0.125 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 3.59e-01 -0.116 0.127 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0557 0.118 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 2.22e-01 -0.174 0.142 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 5.54e-01 0.0905 0.153 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 2.03e-01 0.117 0.0914 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0267 0.121 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 6.85e-03 -0.412 0.151 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 2.26e-01 -0.151 0.124 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 4.58e-01 -0.114 0.153 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0692 0.118 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH -88948 sc-eQTL 3.10e-01 -0.117 0.115 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 2.81e-02 -0.313 0.141 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 7.12e-02 0.246 0.136 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 116691 sc-eQTL 3.21e-01 0.134 0.135 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 116588 sc-eQTL 9.86e-01 0.00201 0.118 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 sc-eQTL 1.84e-02 -0.28 0.118 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -759019 sc-eQTL 1.08e-01 -0.195 0.121 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 sc-eQTL 1.57e-01 -0.206 0.145 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000066557 LRRC40 116691 eQTL 0.0094 -0.075 0.0288 0.0 0.0 0.0702
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 eQTL 4.16e-13 -0.165 0.0224 0.118 0.116 0.0702
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 eQTL 1.5e-06 -0.232 0.0479 0.0 0.0 0.0702

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000066557 LRRC40 116691 4.62e-06 4.79e-06 7.5e-07 3.02e-06 1.63e-06 1.74e-06 4.27e-06 1.14e-06 5.08e-06 2.44e-06 4.99e-06 3.43e-06 7.03e-06 2.33e-06 1.35e-06 3.85e-06 1.78e-06 3.53e-06 1.55e-06 1.17e-06 3.04e-06 4.87e-06 4.62e-06 1.72e-06 6.54e-06 1.99e-06 2.39e-06 1.73e-06 4.3e-06 4.31e-06 2.7e-06 4.16e-07 4.63e-07 2.14e-06 2.09e-06 1.18e-06 1.07e-06 4.21e-07 9.07e-07 5.62e-07 8.36e-07 5.76e-06 4.37e-07 1.56e-07 7.49e-07 1.32e-06 1.13e-06 6.9e-07 4.83e-07
ENSG00000118454 ANKRD13C -32464 1.1e-05 1.26e-05 2.5e-06 7.89e-06 2.57e-06 6.19e-06 1.64e-05 2.44e-06 1.18e-05 6.24e-06 1.59e-05 6.6e-06 2.16e-05 4.67e-06 4.13e-06 8.56e-06 7.11e-06 1.12e-05 3.87e-06 3.59e-06 6.93e-06 1.2e-05 1.23e-05 4.8e-06 2.18e-05 5.01e-06 7.27e-06 5.28e-06 1.47e-05 1.4e-05 7.81e-06 1.12e-06 1.44e-06 4.8e-06 5.89e-06 3.77e-06 1.97e-06 2.38e-06 3.09e-06 2e-06 1.67e-06 1.57e-05 2.14e-06 3.33e-07 1.85e-06 2.36e-06 2.32e-06 1.23e-06 9.21e-07
ENSG00000197568 HHLA3 -32535 1.1e-05 1.26e-05 2.5e-06 7.89e-06 2.57e-06 6.16e-06 1.61e-05 2.44e-06 1.18e-05 6.11e-06 1.59e-05 6.6e-06 2.16e-05 4.67e-06 4.13e-06 8.42e-06 7.11e-06 1.12e-05 3.87e-06 3.59e-06 6.93e-06 1.2e-05 1.23e-05 4.8e-06 2.18e-05 5.01e-06 7.29e-06 5.28e-06 1.46e-05 1.4e-05 7.72e-06 1.11e-06 1.4e-06 4.8e-06 5.89e-06 3.77e-06 1.97e-06 2.38e-06 3.01e-06 2e-06 1.67e-06 1.57e-05 2.14e-06 3.33e-07 1.84e-06 2.36e-06 2.32e-06 1.26e-06 9.21e-07