logo

Genes within 1Mb (chr1:64320721:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 7.32e-02 -0.159 0.088 0.271 B L1
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 1.14e-01 0.145 0.0914 0.271 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0201 0.102 0.271 B L1
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 9.30e-01 0.0055 0.0626 0.271 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00745 0.104 0.271 B L1
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 1.51e-01 -0.11 0.0765 0.271 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 8.91e-01 0.0117 0.0848 0.271 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0454 0.0983 0.271 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -149408 sc-eQTL 3.78e-01 0.0518 0.0586 0.271 CD4T L1
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 2.72e-01 0.0675 0.0614 0.271 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 4.68e-01 0.0641 0.0882 0.271 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 4.80e-03 -0.237 0.0833 0.271 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0587 0.0934 0.271 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 8.26e-01 0.0221 0.101 0.271 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -149408 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0528 0.0508 0.271 CD8T L1
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 1.14e-01 0.126 0.0798 0.271 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 4.55e-01 0.0749 0.1 0.271 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 7.00e-01 0.0366 0.0948 0.266 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0384 0.0979 0.266 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 2.92e-01 -0.116 0.109 0.266 DC L1
ENSG00000162433 AK4 -826828 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0521 0.0869 0.266 DC L1
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 4.58e-01 0.0537 0.0722 0.266 DC L1
ENSG00000162437 RAVER2 -424374 sc-eQTL 5.36e-01 0.0573 0.0926 0.266 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 1.28e-01 -0.145 0.095 0.266 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 9.34e-01 0.00774 0.0927 0.271 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 1.86e-01 0.128 0.0964 0.271 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 1.21e-01 -0.155 0.0994 0.271 Mono L1
ENSG00000162433 AK4 -826828 sc-eQTL 8.57e-01 0.0169 0.0943 0.271 Mono L1
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0147 0.0672 0.271 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 2.38e-02 -0.178 0.0781 0.27 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 4.63e-01 -0.068 0.0926 0.27 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 2.83e-01 0.109 0.102 0.27 NK L1
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 9.95e-01 0.000304 0.0475 0.27 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 6.44e-01 0.0512 0.111 0.27 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 1.46e-01 0.131 0.0896 0.271 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 1.02e-01 -0.148 0.0899 0.271 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 1.52e-01 0.101 0.0706 0.271 Other_T L1
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0042 0.0687 0.271 Other_T L1
ENSG00000162437 RAVER2 -424374 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0449 0.0998 0.271 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0306 0.109 0.271 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 2.65e-02 -0.266 0.119 0.268 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 2.53e-01 0.132 0.115 0.268 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 7.59e-01 0.034 0.111 0.268 B_Activated L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 8.05e-01 0.0272 0.11 0.268 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0576 0.105 0.268 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 2.92e-01 -0.113 0.107 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0257 0.109 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0123 0.105 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 9.84e-01 0.0018 0.0907 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0311 0.104 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 1.38e-01 -0.155 0.104 0.272 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 7.45e-01 0.0347 0.106 0.272 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 2.48e-01 -0.125 0.108 0.272 B_Memory L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 1.63e-01 -0.125 0.0897 0.272 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 9.04e-01 0.013 0.108 0.272 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 2.54e-01 -0.123 0.107 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 9.46e-02 0.18 0.107 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 6.46e-01 0.0487 0.106 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 2.80e-01 0.0885 0.0817 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 9.96e-01 0.000524 0.113 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0943 0.105 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 7.92e-01 0.029 0.11 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 9.16e-01 0.0117 0.11 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 5.98e-01 0.0451 0.0855 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 5.34e-01 0.0684 0.11 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0204 0.107 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 6.51e-01 0.0513 0.113 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 9.81e-01 0.00265 0.11 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149408 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0226 0.0398 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0394 0.0982 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 4.27e-02 0.21 0.103 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 8.31e-02 -0.149 0.0859 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0818 0.0938 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 8.62e-01 0.0174 0.0997 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149408 sc-eQTL 5.93e-01 0.0316 0.059 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 9.67e-01 0.00247 0.0603 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 4.30e-01 0.0782 0.0989 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0764 0.0891 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 4.52e-01 0.0779 0.104 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 3.05e-01 -0.108 0.105 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149408 sc-eQTL 1.77e-01 0.113 0.0832 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 8.97e-02 0.116 0.0679 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0296 0.102 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 4.50e-01 -0.08 0.106 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 4.32e-01 0.0836 0.106 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 9.69e-01 -0.004 0.104 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149408 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0462 0.0642 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 2.42e-01 0.107 0.0912 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 7.40e-01 0.0358 0.108 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 1.30e-01 -0.145 0.0954 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 1.84e-01 -0.135 0.102 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0169 0.107 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149408 sc-eQTL 4.47e-01 0.0345 0.0453 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 3.62e-01 0.0773 0.0846 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 2.62e-01 0.123 0.109 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 1.67e-02 -0.232 0.0963 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 9.46e-02 -0.169 0.1 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 9.61e-01 0.005 0.102 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149408 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0392 0.0704 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0264 0.0847 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0687 0.0957 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0133 0.107 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0494 0.108 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 5.09e-01 0.0693 0.105 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149408 sc-eQTL 7.20e-01 0.0198 0.0551 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0246 0.0886 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 9.01e-01 0.0133 0.107 0.275 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 3.20e-01 -0.11 0.111 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0335 0.112 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 9.00e-02 -0.19 0.112 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149408 sc-eQTL 3.08e-01 0.0233 0.0229 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 3.31e-01 0.105 0.108 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 5.10e-01 0.072 0.109 0.269 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 5.76e-01 0.0577 0.103 0.268 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00855 0.102 0.268 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 1.18e-01 0.161 0.103 0.268 MAIT L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 5.44e-01 0.0568 0.0933 0.268 MAIT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -424374 sc-eQTL 2.74e-01 -0.109 0.0992 0.268 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 4.70e-01 0.0769 0.106 0.268 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 9.24e-01 0.00985 0.104 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 8.72e-02 -0.181 0.106 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0223 0.107 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 9.10e-01 0.00767 0.0675 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 3.82e-01 0.0923 0.105 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 2.35e-02 -0.187 0.0818 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 4.58e-01 0.0779 0.105 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 2.89e-01 0.112 0.105 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 8.13e-01 0.0132 0.0558 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 2.95e-01 -0.12 0.114 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 5.46e-01 -0.066 0.109 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 8.37e-01 0.0233 0.113 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 2.20e-01 0.13 0.105 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000171 0.0708 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0182 0.101 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 6.86e-02 -0.161 0.0877 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0936 0.0997 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 7.88e-01 0.0264 0.098 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0337 0.0583 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 4.34e-01 0.0818 0.104 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00347 0.129 0.27 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 6.61e-01 0.0597 0.136 0.27 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 1.90e-01 0.165 0.125 0.27 PB L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 9.85e-01 0.00179 0.0954 0.27 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0134 0.139 0.27 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 1.28e-01 0.148 0.0971 0.276 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0549 0.0993 0.276 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0199 0.0876 0.276 Pro_T L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 7.16e-01 0.0252 0.069 0.276 Pro_T L2
ENSG00000162437 RAVER2 -424374 sc-eQTL 2.77e-01 -0.099 0.0909 0.276 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 1.51e-01 -0.146 0.101 0.276 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0405 0.101 0.271 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 8.60e-01 0.019 0.108 0.271 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 7.00e-02 -0.192 0.105 0.271 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -149408 sc-eQTL 4.21e-03 0.227 0.0786 0.271 Treg L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 3.01e-01 0.0883 0.0852 0.271 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 8.16e-01 0.0236 0.101 0.271 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 9.76e-01 0.00309 0.103 0.271 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 5.55e-01 0.0615 0.104 0.271 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 1.25e-01 -0.172 0.112 0.271 cDC L2
ENSG00000162433 AK4 -826828 sc-eQTL 8.45e-02 -0.161 0.0931 0.271 cDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 9.11e-01 0.00979 0.0876 0.271 cDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -424374 sc-eQTL 7.24e-01 0.0341 0.0962 0.271 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0799 0.0901 0.271 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0179 0.0972 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 6.32e-01 0.0466 0.0973 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0648 0.102 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000162433 AK4 -826828 sc-eQTL 2.83e-01 0.103 0.0959 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0534 0.0874 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0355 0.107 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 5.28e-02 0.21 0.108 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 4.33e-02 -0.198 0.0974 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000162433 AK4 -826828 sc-eQTL 8.96e-01 0.0127 0.0971 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 7.46e-01 -0.029 0.0896 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 4.48e-01 0.0906 0.119 0.279 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 6.88e-01 0.0512 0.127 0.279 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0669 0.127 0.279 gdT L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00632 0.127 0.279 gdT L2
ENSG00000162437 RAVER2 -424374 sc-eQTL 1.77e-01 0.151 0.111 0.279 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 1.07e-01 -0.2 0.123 0.279 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0736 0.108 0.271 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 7.58e-01 0.031 0.1 0.271 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0415 0.108 0.271 intMono L2
ENSG00000162433 AK4 -826828 sc-eQTL 5.15e-01 -0.062 0.095 0.271 intMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 2.96e-01 0.0919 0.0877 0.271 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0248 0.0967 0.276 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0458 0.106 0.276 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0643 0.102 0.276 ncMono L2
ENSG00000162433 AK4 -826828 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0718 0.089 0.276 ncMono L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 5.91e-02 0.136 0.0714 0.276 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 3.02e-01 0.12 0.116 0.271 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 1.62e-01 -0.158 0.112 0.271 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 8.31e-01 0.0249 0.116 0.271 pDC L2
ENSG00000162433 AK4 -826828 sc-eQTL 9.59e-01 0.00365 0.0702 0.271 pDC L2
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 4.43e-01 0.0719 0.0935 0.271 pDC L2
ENSG00000162437 RAVER2 -424374 sc-eQTL 6.71e-01 0.0449 0.106 0.271 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 1.28e-01 -0.156 0.102 0.271 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 9.01e-02 -0.167 0.0981 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 9.68e-01 0.00443 0.109 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0775 0.101 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0973 0.0792 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 9.32e-01 0.00893 0.105 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 1.16e-01 -0.164 0.104 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 1.79e-01 0.145 0.107 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 6.03e-01 0.0564 0.108 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 2.67e-01 0.0874 0.0785 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 6.95e-01 0.0428 0.109 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 8.60e-01 0.0174 0.0987 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 2.09e-01 0.12 0.0952 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 8.24e-02 -0.171 0.0978 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -826828 sc-eQTL 7.51e-01 0.0309 0.0973 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0558 0.0813 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0379 0.0939 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0493 0.107 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0325 0.104 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162433 AK4 -826828 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0622 0.0924 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 3.67e-02 0.13 0.0616 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 727310 sc-eQTL 2.05e-02 -0.186 0.0796 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 953146 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0146 0.0968 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP 727000 sc-eQTL 1.57e-01 0.145 0.102 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162434 JAK1 -747033 sc-eQTL 7.82e-01 0.0135 0.0487 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 797349 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00732 0.113 0.272 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116652 DLEU2L 773639 eQTL 0.0192 0.0628 0.0268 0.00139 0.0 0.333
ENSG00000162433 AK4 -826828 eQTL 0.0249 0.0512 0.0228 0.0 0.0 0.333
ENSG00000162434 JAK1 -645828 eQTL 0.00762 0.0405 0.0152 0.00155 0.0 0.333
ENSG00000185483 ROR1 546704 pQTL 0.000439 -0.0501 0.0142 0.0 0.0 0.319

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162433 AK4 -826828 8.85e-07 6.78e-07 1.2e-07 4.27e-07 1.06e-07 2.12e-07 5.9e-07 5.89e-08 2.66e-07 1.37e-07 3.66e-07 2.04e-07 9.57e-07 1.07e-07 3.56e-07 1.76e-07 1.69e-07 3.12e-07 1.62e-07 8.25e-08 1.48e-07 3.8e-07 2.81e-07 7.22e-08 6.59e-07 2.13e-07 2.56e-07 1.67e-07 2.57e-07 4.3e-07 1.71e-07 4.4e-08 4.87e-08 1.38e-07 2.58e-07 5.32e-08 7.74e-08 7.51e-08 7.54e-08 8.59e-09 3.24e-08 6.15e-07 4.41e-08 1.86e-08 4.06e-08 2.68e-08 9.26e-08 2.16e-09 4.8e-08
ENSG00000231485 \N -747016 1.24e-06 9.07e-07 1.87e-07 3.81e-07 1.07e-07 3.15e-07 6.87e-07 7.12e-08 3.66e-07 1.78e-07 5.73e-07 3.11e-07 1.22e-06 1.52e-07 4.6e-07 2.45e-07 3.35e-07 3.82e-07 2.25e-07 1.32e-07 1.8e-07 5.18e-07 3.7e-07 1.23e-07 9.71e-07 2.39e-07 4e-07 2.18e-07 3.83e-07 6.27e-07 2.11e-07 4.29e-08 5.75e-08 1.67e-07 3.4e-07 6.18e-08 1.14e-07 5.71e-08 7.63e-08 1.98e-08 4.49e-08 8.03e-07 6.3e-08 1.05e-08 7.26e-08 6.01e-08 9.52e-08 0.0 4.91e-08