logo

Genes within 1Mb (chr1:63539596:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 8.66e-08 -0.478 0.0861 0.239 B L1
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 5.62e-01 0.0555 0.0954 0.239 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 6.42e-01 0.0444 0.0954 0.239 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 2.34e-01 0.079 0.0662 0.239 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 7.13e-04 -0.353 0.103 0.239 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 9.55e-01 0.00615 0.108 0.239 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 9.92e-03 -0.205 0.0786 0.239 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 6.61e-02 0.162 0.0875 0.239 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 6.24e-01 0.0438 0.0892 0.239 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0159 0.0721 0.239 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 4.86e-02 -0.201 0.101 0.239 CD4T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -930533 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0323 0.061 0.239 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 9.59e-01 0.0047 0.0918 0.239 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 8.70e-02 -0.149 0.0869 0.239 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 8.69e-01 0.016 0.0964 0.239 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0227 0.0977 0.239 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 5.91e-01 0.05 0.0927 0.239 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 1.75e-01 -0.141 0.103 0.239 CD8T L1
ENSG00000158966 CACHD1 -930533 sc-eQTL 2.28e-01 0.0633 0.0523 0.239 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 1.28e-01 0.157 0.103 0.239 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0566 0.0962 0.245 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 3.68e-01 0.0895 0.0992 0.245 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 8.22e-01 -0.023 0.102 0.245 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0776 0.0795 0.245 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 3.81e-03 -0.319 0.109 0.245 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 5.21e-02 -0.188 0.096 0.245 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0133 0.0946 0.239 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 3.54e-02 0.207 0.0977 0.239 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 3.95e-01 0.0812 0.0954 0.239 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00761 0.0645 0.239 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0938 0.102 0.239 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 1.86e-01 -0.108 0.0811 0.24 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0306 0.0954 0.24 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0961 0.0783 0.24 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00513 0.0844 0.24 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 6.27e-01 -0.051 0.105 0.24 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 1.49e-01 0.164 0.113 0.24 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 6.38e-01 0.0432 0.0916 0.239 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 2.39e-01 0.108 0.0918 0.239 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 4.70e-01 -0.068 0.0939 0.239 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 5.48e-01 -0.049 0.0813 0.239 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 2.74e-01 0.0789 0.072 0.239 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 7.30e-01 0.0385 0.111 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 5.57e-02 -0.231 0.12 0.253 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 2.69e-02 -0.256 0.115 0.253 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0571 0.108 0.253 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 9.99e-01 0.000154 0.114 0.253 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0513 0.111 0.253 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 6.07e-02 0.197 0.104 0.253 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 1.39e-01 -0.162 0.109 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 1.06e-01 0.18 0.111 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 9.30e-01 0.00931 0.107 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 1.99e-01 -0.116 0.0898 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 1.30e-01 -0.162 0.107 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 5.24e-01 0.0679 0.106 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 2.45e-02 -0.24 0.106 0.237 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 3.19e-01 -0.109 0.109 0.237 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0413 0.102 0.237 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 2.63e-01 0.109 0.0968 0.237 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 1.15e-01 -0.175 0.11 0.237 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 8.95e-01 0.0145 0.11 0.237 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 1.18e-05 -0.474 0.105 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 8.01e-01 0.0279 0.111 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 7.13e-01 0.039 0.106 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 4.06e-01 -0.068 0.0817 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 6.52e-03 -0.293 0.107 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 1.60e-01 -0.162 0.115 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 1.72e-03 -0.334 0.105 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 5.51e-01 -0.067 0.112 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 8.28e-01 0.0235 0.108 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 2.14e-02 0.238 0.103 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 1.88e-02 -0.263 0.111 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 7.68e-01 0.0331 0.112 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 4.84e-01 0.0761 0.109 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 9.52e-01 0.00695 0.115 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0941 0.1 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0839 0.104 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0754 0.111 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -930533 sc-eQTL 4.68e-01 0.0293 0.0403 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0558 0.106 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 1.12e-01 -0.142 0.0888 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 3.94e-02 0.199 0.096 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 4.17e-01 0.0773 0.0952 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00301 0.0843 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 1.13e-01 -0.163 0.102 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -930533 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00817 0.061 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 5.60e-01 0.0597 0.102 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 4.05e-02 -0.189 0.0919 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0226 0.108 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 2.49e-01 0.11 0.0952 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 9.45e-01 0.00643 0.093 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 1.36e-01 -0.163 0.109 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -930533 sc-eQTL 5.91e-01 0.0467 0.0868 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0791 0.106 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 1.48e-02 -0.263 0.107 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 6.27e-01 0.0532 0.109 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 6.06e-01 0.0549 0.106 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0738 0.103 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 5.68e-01 -0.061 0.107 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -930533 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0367 0.066 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 7.67e-01 0.0328 0.111 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 7.38e-01 0.0334 0.0996 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 1.07e-01 0.171 0.105 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 7.52e-01 0.0318 0.1 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0928 0.107 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0844 0.111 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000158966 CACHD1 -930533 sc-eQTL 8.31e-04 0.156 0.0459 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 1.24e-01 0.175 0.113 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 6.96e-03 -0.268 0.0983 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 5.43e-01 0.063 0.103 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 6.72e-01 0.0453 0.107 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 5.51e-01 0.0613 0.103 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0687 0.104 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000158966 CACHD1 -930533 sc-eQTL 6.17e-02 0.134 0.0715 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0467 0.098 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 1.37e-01 -0.165 0.11 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 1.38e-01 -0.167 0.112 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 8.25e-01 0.0243 0.11 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 8.28e-01 0.0245 0.112 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 2.38e-02 -0.245 0.108 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -930533 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00697 0.0573 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 5.55e-01 0.0658 0.111 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 5.34e-01 0.0692 0.111 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0794 0.112 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00854 0.108 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0435 0.104 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 2.10e-01 -0.141 0.112 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000158966 CACHD1 -930533 sc-eQTL 7.25e-01 0.00808 0.023 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 1.76e-01 0.148 0.109 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 3.37e-01 0.102 0.106 0.24 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 6.78e-01 0.0439 0.106 0.24 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 9.95e-01 0.000683 0.101 0.24 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0411 0.107 0.24 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0222 0.107 0.24 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0755 0.11 0.24 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0434 0.105 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00723 0.108 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0884 0.0931 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0307 0.104 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 1.09e-01 -0.174 0.108 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0212 0.107 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0524 0.0846 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0053 0.107 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0798 0.0934 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 2.60e-01 0.107 0.0947 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 3.45e-01 -0.102 0.108 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 1.58e-01 0.165 0.116 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0814 0.115 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0181 0.12 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 4.48e-01 0.0696 0.0915 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0162 0.107 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0359 0.112 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0287 0.107 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0167 0.0927 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00759 0.105 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0128 0.0971 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 2.75e-01 -0.108 0.099 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0034 0.103 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 1.42e-01 0.161 0.109 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0513 0.135 0.241 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 4.69e-01 0.103 0.142 0.241 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 3.17e-02 0.324 0.149 0.241 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0604 0.133 0.241 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 2.84e-01 -0.142 0.132 0.241 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 1.74e-01 -0.197 0.144 0.241 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0381 0.101 0.239 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 2.96e-01 0.107 0.102 0.239 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0941 0.103 0.239 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0845 0.0898 0.239 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 1.20e-02 0.225 0.0889 0.239 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 3.55e-01 0.097 0.105 0.239 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0661 0.105 0.239 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0612 0.113 0.239 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0643 0.103 0.239 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 9.42e-02 0.177 0.105 0.239 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 4.37e-02 -0.223 0.11 0.239 Treg L2
ENSG00000158966 CACHD1 -930533 sc-eQTL 9.59e-01 0.00433 0.0837 0.239 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 2.36e-01 -0.126 0.106 0.239 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0904 0.105 0.254 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 1.01e-01 0.174 0.106 0.254 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0677 0.104 0.254 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 1.71e-01 -0.124 0.0901 0.254 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 8.51e-04 -0.378 0.111 0.254 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00299 0.0922 0.254 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 3.41e-01 0.0941 0.0985 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 2.88e-01 0.105 0.0986 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 3.10e-01 0.106 0.104 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 9.73e-01 0.0025 0.0733 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0672 0.104 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0987 0.109 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 1.83e-02 0.261 0.11 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 6.80e-01 0.0426 0.103 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0675 0.0891 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 7.58e-02 -0.178 0.0999 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0832 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 9.88e-01 0.00185 0.126 0.239 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 9.82e-02 -0.204 0.123 0.239 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 7.63e-01 0.0357 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 3.16e-01 0.126 0.125 0.239 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 3.24e-01 -0.122 0.123 0.239 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0834 0.111 0.244 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0664 0.103 0.244 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 9.23e-01 0.0103 0.106 0.244 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0699 0.101 0.244 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0624 0.111 0.244 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 2.91e-01 -0.105 0.0988 0.242 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 4.29e-02 0.22 0.108 0.242 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00718 0.107 0.242 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 2.44e-01 0.116 0.0997 0.242 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 1.94e-01 0.136 0.104 0.242 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 8.79e-01 0.0176 0.116 0.249 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 5.06e-01 0.0749 0.112 0.249 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 1.86e-01 0.152 0.114 0.249 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 1.98e-01 0.133 0.103 0.249 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 3.10e-01 -0.117 0.115 0.249 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 3.27e-02 -0.218 0.101 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 3.36e-03 -0.297 0.1 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 4.72e-01 0.0813 0.113 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 7.37e-01 0.0329 0.0979 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0579 0.0791 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 1.65e-02 -0.248 0.103 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 1.75e-01 0.147 0.108 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 8.59e-08 -0.555 0.1 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 7.75e-01 0.0316 0.11 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 9.35e-01 0.00841 0.103 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 2.99e-01 0.0815 0.0783 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 3.28e-04 -0.393 0.108 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 2.30e-01 -0.134 0.111 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 7.66e-01 0.0301 0.101 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 2.52e-02 0.218 0.0968 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 3.15e-01 0.0991 0.0984 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0266 0.0682 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 1.44e-01 -0.147 0.1 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 1.72e-01 -0.131 0.0956 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 3.42e-01 0.104 0.109 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 4.41e-01 0.0831 0.108 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 5.89e-01 0.0498 0.0919 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.106 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -53815 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0828 0.0827 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 172021 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0196 0.0995 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 851210 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0768 0.089 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 755464 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0155 0.089 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 sc-eQTL 7.26e-01 -0.037 0.105 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 16224 sc-eQTL 1.87e-01 0.154 0.116 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -53815 eQTL 3.83e-18 -0.177 0.02 0.00795 0.00846 0.223
ENSG00000088035 ALG6 172021 eQTL 0.0325 0.033 0.0154 0.0 0.0 0.223
ENSG00000116641 DOCK7 851228 eQTL 0.00271 0.0771 0.0256 0.00321 0.0 0.223
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 eQTL 3.3999999999999996e-42 -0.443 0.0309 0.00303 0.00379 0.223
ENSG00000185483 ROR1 -234421 pQTL 0.0422 -0.0321 0.0158 0.0 0.0 0.225

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -53815 9.54e-06 1.23e-05 1.98e-06 7.03e-06 2.39e-06 5.06e-06 1.31e-05 2.2e-06 1.07e-05 6.14e-06 1.45e-05 6.44e-06 1.93e-05 4.19e-06 3.67e-06 7.34e-06 5.73e-06 9.07e-06 3.31e-06 3.13e-06 6.71e-06 1.1e-05 1.05e-05 3.7e-06 2e-05 4.47e-06 7.18e-06 5.2e-06 1.31e-05 1e-05 7.59e-06 1.09e-06 1.23e-06 3.63e-06 4.96e-06 2.85e-06 1.74e-06 2.03e-06 2.22e-06 1.18e-06 1.14e-06 1.51e-05 1.58e-06 2.62e-07 9.9e-07 1.95e-06 1.99e-06 7.04e-07 5.67e-07
ENSG00000088035 ALG6 172021 2.66e-06 3.03e-06 4.5e-07 2.04e-06 7.59e-07 7.88e-07 2.37e-06 8.51e-07 2.37e-06 1.28e-06 2.88e-06 1.72e-06 4.11e-06 1.44e-06 9e-07 2.06e-06 1.61e-06 2.27e-06 1.5e-06 1.17e-06 1.4e-06 3.2e-06 2.69e-06 1.44e-06 4.08e-06 1.09e-06 1.53e-06 1.73e-06 2.76e-06 2.2e-06 2.08e-06 4.53e-07 6.63e-07 1.22e-06 1.29e-06 9.73e-07 9.23e-07 4.23e-07 1.24e-06 4.16e-07 2.37e-07 4.18e-06 5.58e-07 1.77e-07 3.46e-07 4.03e-07 9e-07 1.98e-07 1.58e-07
ENSG00000125703 \N 755464 2.8e-07 1.42e-07 5.82e-08 2.05e-07 1.03e-07 9.05e-08 1.9e-07 5.43e-08 1.44e-07 6.4e-08 1.59e-07 1.2e-07 1.87e-07 7.95e-08 5.69e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.51e-07 7.18e-08 5.46e-08 1.27e-07 1.31e-07 1.58e-07 2.68e-08 1.72e-07 1.23e-07 1.17e-07 1.12e-07 1.31e-07 1e-07 1.07e-07 3.9e-08 3.13e-08 8.89e-08 3.46e-08 2.68e-08 5.35e-08 8.37e-08 6.5e-08 4.24e-08 4.47e-08 1.5e-07 5.27e-08 1.43e-08 3.36e-08 1.8e-08 9.96e-08 1.96e-09 4.82e-08
ENSG00000142856 ITGB3BP -54125 9.43e-06 1.22e-05 1.98e-06 6.97e-06 2.34e-06 5e-06 1.28e-05 2.18e-06 1.07e-05 6.2e-06 1.44e-05 6.27e-06 1.91e-05 4.17e-06 3.67e-06 7.31e-06 5.67e-06 8.89e-06 3.33e-06 3.14e-06 6.79e-06 1.1e-05 1.04e-05 3.67e-06 1.98e-05 4.33e-06 7.15e-06 5.13e-06 1.31e-05 9.92e-06 7.4e-06 1.06e-06 1.23e-06 3.64e-06 4.96e-06 2.82e-06 1.75e-06 2.06e-06 2.25e-06 1.15e-06 1.14e-06 1.51e-05 1.54e-06 2.62e-07 9.9e-07 1.96e-06 1.98e-06 7.18e-07 5.68e-07
ENSG00000203965 \N 16224 2.69e-05 3.1e-05 6.39e-06 1.6e-05 6.21e-06 1.5e-05 4.33e-05 5.19e-06 3.08e-05 1.61e-05 3.78e-05 1.79e-05 5.21e-05 1.41e-05 7.12e-06 2.04e-05 1.65e-05 2.44e-05 9e-06 7.8e-06 1.76e-05 3.22e-05 3.09e-05 9.9e-06 4.78e-05 8.55e-06 1.67e-05 1.36e-05 3.39e-05 2.71e-05 2.07e-05 1.71e-06 3.49e-06 8.04e-06 1.21e-05 6.78e-06 3.82e-06 3.47e-06 5.9e-06 3.71e-06 1.82e-06 3.71e-05 3.38e-06 4.16e-07 2.75e-06 4.96e-06 4.55e-06 1.71e-06 1.56e-06