logo

Genes within 1Mb (chr1:63433221:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 8.66e-08 -0.478 0.0861 0.239 B L1
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 5.62e-01 0.0555 0.0954 0.239 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 6.42e-01 0.0444 0.0954 0.239 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 2.34e-01 0.079 0.0662 0.239 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 7.13e-04 -0.353 0.103 0.239 B L1
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 9.89e-02 -0.151 0.0911 0.239 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 9.55e-01 0.00615 0.108 0.239 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 9.92e-03 -0.205 0.0786 0.239 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 6.61e-02 0.162 0.0875 0.239 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 6.24e-01 0.0438 0.0892 0.239 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0159 0.0721 0.239 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 4.86e-02 -0.201 0.101 0.239 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0232 0.0699 0.239 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 9.59e-01 0.0047 0.0918 0.239 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 8.70e-02 -0.149 0.0869 0.239 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 8.69e-01 0.016 0.0964 0.239 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0227 0.0977 0.239 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 5.91e-01 0.05 0.0927 0.239 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 1.75e-01 -0.141 0.103 0.239 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 9.69e-01 0.00319 0.0808 0.239 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 1.28e-01 0.157 0.103 0.239 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0566 0.0962 0.245 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 3.68e-01 0.0895 0.0992 0.245 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 8.22e-01 -0.023 0.102 0.245 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0776 0.0795 0.245 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 3.81e-03 -0.319 0.109 0.245 DC L1
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0962 0.097 0.245 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 5.21e-02 -0.188 0.096 0.245 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0133 0.0946 0.239 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 3.54e-02 0.207 0.0977 0.239 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 3.95e-01 0.0812 0.0954 0.239 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00761 0.0645 0.239 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0938 0.102 0.239 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0363 0.0837 0.239 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 1.86e-01 -0.108 0.0811 0.24 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0306 0.0954 0.24 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0961 0.0783 0.24 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00513 0.0844 0.24 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 6.27e-01 -0.051 0.105 0.24 NK L1
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0677 0.0937 0.24 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 1.49e-01 0.164 0.113 0.24 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 6.38e-01 0.0432 0.0916 0.239 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 2.39e-01 0.108 0.0918 0.239 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 4.70e-01 -0.068 0.0939 0.239 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 5.48e-01 -0.049 0.0813 0.239 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 2.74e-01 0.0789 0.072 0.239 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 4.50e-01 0.0473 0.0625 0.239 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 7.30e-01 0.0385 0.111 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 5.57e-02 -0.231 0.12 0.253 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 2.69e-02 -0.256 0.115 0.253 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0571 0.108 0.253 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 9.99e-01 0.000154 0.114 0.253 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0513 0.111 0.253 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 1.71e-01 0.165 0.12 0.253 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 6.07e-02 0.197 0.104 0.253 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 1.39e-01 -0.162 0.109 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 1.06e-01 0.18 0.111 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 9.30e-01 0.00931 0.107 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 1.99e-01 -0.116 0.0898 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 1.30e-01 -0.162 0.107 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0399 0.107 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 5.24e-01 0.0679 0.106 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 2.45e-02 -0.24 0.106 0.237 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 3.19e-01 -0.109 0.109 0.237 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0413 0.102 0.237 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 2.63e-01 0.109 0.0968 0.237 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 1.15e-01 -0.175 0.11 0.237 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 8.39e-01 0.0228 0.112 0.237 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 8.95e-01 0.0145 0.11 0.237 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 1.18e-05 -0.474 0.105 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 8.01e-01 0.0279 0.111 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 7.13e-01 0.039 0.106 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 4.06e-01 -0.068 0.0817 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 6.52e-03 -0.293 0.107 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 1.92e-01 -0.124 0.095 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 1.60e-01 -0.162 0.115 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 1.72e-03 -0.334 0.105 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 5.51e-01 -0.067 0.112 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 8.28e-01 0.0235 0.108 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 2.14e-02 0.238 0.103 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 1.88e-02 -0.263 0.111 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0727 0.107 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 7.68e-01 0.0331 0.112 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 4.84e-01 0.0761 0.109 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 9.52e-01 0.00695 0.115 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0941 0.1 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0839 0.104 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0754 0.111 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 3.27e-01 -0.104 0.106 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0558 0.106 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 1.12e-01 -0.142 0.0888 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 3.94e-02 0.199 0.096 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 4.17e-01 0.0773 0.0952 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00301 0.0843 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 1.13e-01 -0.163 0.102 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0513 0.0786 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 5.60e-01 0.0597 0.102 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 4.05e-02 -0.189 0.0919 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0226 0.108 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 2.49e-01 0.11 0.0952 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 9.45e-01 0.00643 0.093 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 1.36e-01 -0.163 0.109 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 5.19e-01 0.0579 0.0898 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0791 0.106 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 1.48e-02 -0.263 0.107 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 6.27e-01 0.0532 0.109 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 6.06e-01 0.0549 0.106 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0738 0.103 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 5.68e-01 -0.061 0.107 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 7.75e-01 0.0289 0.101 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 7.67e-01 0.0328 0.111 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 7.38e-01 0.0334 0.0996 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 1.07e-01 0.171 0.105 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 7.52e-01 0.0318 0.1 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0928 0.107 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0844 0.111 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0114 0.0996 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 1.24e-01 0.175 0.113 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 6.96e-03 -0.268 0.0983 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 5.43e-01 0.063 0.103 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 6.72e-01 0.0453 0.107 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 5.51e-01 0.0613 0.103 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0687 0.104 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 4.74e-01 0.063 0.0879 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0467 0.098 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 1.37e-01 -0.165 0.11 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 1.38e-01 -0.167 0.112 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 8.25e-01 0.0243 0.11 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 8.28e-01 0.0245 0.112 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 2.38e-02 -0.245 0.108 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 1.22e-01 0.162 0.104 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 5.55e-01 0.0658 0.111 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 5.34e-01 0.0692 0.111 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0794 0.112 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00854 0.108 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0435 0.104 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 2.10e-01 -0.141 0.112 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0498 0.107 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 1.76e-01 0.148 0.109 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 3.37e-01 0.102 0.106 0.24 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 6.78e-01 0.0439 0.106 0.24 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 9.95e-01 0.000683 0.101 0.24 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0411 0.107 0.24 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0222 0.107 0.24 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0306 0.106 0.24 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0755 0.11 0.24 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0434 0.105 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00723 0.108 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0884 0.0931 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0307 0.104 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 1.09e-01 -0.174 0.108 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0194 0.112 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0212 0.107 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0524 0.0846 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0053 0.107 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0798 0.0934 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 2.60e-01 0.107 0.0947 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 3.45e-01 -0.102 0.108 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 5.67e-01 -0.06 0.105 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 1.58e-01 0.165 0.116 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0814 0.115 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0181 0.12 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 4.48e-01 0.0696 0.0915 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0162 0.107 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0359 0.112 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 7.26e-01 0.041 0.117 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0287 0.107 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0167 0.0927 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00759 0.105 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0128 0.0971 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 2.75e-01 -0.108 0.099 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0034 0.103 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 1.10e-01 -0.172 0.107 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 1.42e-01 0.161 0.109 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0513 0.135 0.241 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 4.69e-01 0.103 0.142 0.241 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 3.17e-02 0.324 0.149 0.241 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0604 0.133 0.241 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 2.84e-01 -0.142 0.132 0.241 PB L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 2.47e-01 0.153 0.131 0.241 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 1.74e-01 -0.197 0.144 0.241 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0381 0.101 0.239 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 2.96e-01 0.107 0.102 0.239 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0941 0.103 0.239 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0845 0.0898 0.239 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 1.20e-02 0.225 0.0889 0.239 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 7.96e-01 0.016 0.062 0.239 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 3.55e-01 0.097 0.105 0.239 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0661 0.105 0.239 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0612 0.113 0.239 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0643 0.103 0.239 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 9.42e-02 0.177 0.105 0.239 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 4.37e-02 -0.223 0.11 0.239 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 1.82e-01 -0.143 0.107 0.239 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 2.36e-01 -0.126 0.106 0.239 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0904 0.105 0.254 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 1.01e-01 0.174 0.106 0.254 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0677 0.104 0.254 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 1.71e-01 -0.124 0.0901 0.254 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 8.51e-04 -0.378 0.111 0.254 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 8.19e-01 0.0234 0.102 0.254 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00299 0.0922 0.254 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 3.41e-01 0.0941 0.0985 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 2.88e-01 0.105 0.0986 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 3.10e-01 0.106 0.104 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 9.73e-01 0.0025 0.0733 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0672 0.104 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0135 0.0916 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0987 0.109 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 1.83e-02 0.261 0.11 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 6.80e-01 0.0426 0.103 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0675 0.0891 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 7.58e-02 -0.178 0.0999 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 9.73e-01 0.00347 0.104 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0832 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 9.88e-01 0.00185 0.126 0.239 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 9.82e-02 -0.204 0.123 0.239 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 7.63e-01 0.0357 0.118 0.239 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 3.16e-01 0.126 0.125 0.239 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 5.49e-01 0.0713 0.119 0.239 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 3.24e-01 -0.122 0.123 0.239 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0834 0.111 0.244 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0664 0.103 0.244 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 9.23e-01 0.0103 0.106 0.244 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0699 0.101 0.244 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0624 0.111 0.244 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0639 0.113 0.244 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 2.91e-01 -0.105 0.0988 0.242 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 4.29e-02 0.22 0.108 0.242 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00718 0.107 0.242 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 2.44e-01 0.116 0.0997 0.242 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 1.94e-01 0.136 0.104 0.242 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 3.28e-01 -0.105 0.107 0.242 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 8.79e-01 0.0176 0.116 0.249 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 5.06e-01 0.0749 0.112 0.249 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 1.86e-01 0.152 0.114 0.249 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 1.98e-01 0.133 0.103 0.249 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 3.10e-01 -0.117 0.115 0.249 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0667 0.118 0.249 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 3.27e-02 -0.218 0.101 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 3.36e-03 -0.297 0.1 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 4.72e-01 0.0813 0.113 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 7.37e-01 0.0329 0.0979 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0579 0.0791 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 1.65e-02 -0.248 0.103 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0703 0.101 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 1.75e-01 0.147 0.108 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 8.59e-08 -0.555 0.1 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 7.75e-01 0.0316 0.11 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 9.35e-01 0.00841 0.103 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 2.99e-01 0.0815 0.0783 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 3.28e-04 -0.393 0.108 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 1.74e-01 -0.13 0.095 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 2.30e-01 -0.134 0.111 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 7.66e-01 0.0301 0.101 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 2.52e-02 0.218 0.0968 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 3.15e-01 0.0991 0.0984 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0266 0.0682 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 1.44e-01 -0.147 0.1 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 9.89e-01 0.00118 0.0862 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 1.72e-01 -0.131 0.0956 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 3.42e-01 0.104 0.109 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 4.41e-01 0.0831 0.108 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 5.89e-01 0.0498 0.0919 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.106 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0578 0.1 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -160190 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0828 0.0827 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 65646 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0196 0.0995 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 744835 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0768 0.089 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 649089 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0155 0.089 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 sc-eQTL 7.26e-01 -0.037 0.105 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 996924 sc-eQTL 2.15e-01 -0.119 0.0954 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -90151 sc-eQTL 1.87e-01 0.154 0.116 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079739 PGM1 -160190 eQTL 1.54e-17 -0.175 0.0202 0.00262 0.00251 0.224
ENSG00000088035 ALG6 65646 eQTL 0.0239 0.0351 0.0155 0.0 0.0 0.224
ENSG00000116641 DOCK7 744853 eQTL 0.00271 0.0777 0.0258 0.00343 0.0 0.224
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 eQTL 7.83e-43 -0.449 0.0311 0.0133 0.0163 0.224
ENSG00000185483 ROR1 -340796 pQTL 0.0464 -0.0317 0.0159 0.0 0.0 0.227

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 PGM1 -160190 3.06e-06 3.08e-06 5.55e-07 2.02e-06 8.57e-07 7.86e-07 2.18e-06 9.82e-07 2.37e-06 1.42e-06 2.77e-06 1.67e-06 3.68e-06 1.47e-06 9.24e-07 1.98e-06 1.56e-06 2.15e-06 1.6e-06 1.25e-06 1.5e-06 3.41e-06 2.77e-06 1.6e-06 4.02e-06 1.28e-06 1.53e-06 1.69e-06 2.83e-06 2.53e-06 1.99e-06 4.69e-07 5.68e-07 1.32e-06 1.62e-06 9.09e-07 8.88e-07 4.67e-07 1.35e-06 3.46e-07 2.66e-07 3.41e-06 6.51e-07 1.68e-07 3.51e-07 3.52e-07 8.3e-07 2.38e-07 2.69e-07
ENSG00000088035 ALG6 65646 7.08e-06 9.1e-06 1.31e-06 4.16e-06 2.4e-06 3.52e-06 9.61e-06 1.86e-06 6.77e-06 4.46e-06 1.05e-05 4.74e-06 1.15e-05 3.87e-06 2.21e-06 5.78e-06 3.8e-06 5.52e-06 2.53e-06 2.68e-06 4.51e-06 7.96e-06 6.91e-06 3.15e-06 1.18e-05 3.19e-06 4.38e-06 3.3e-06 8.25e-06 7.84e-06 4.33e-06 8.1e-07 1.23e-06 2.98e-06 3.56e-06 2.21e-06 1.65e-06 1.84e-06 1.61e-06 1.01e-06 9.98e-07 8.98e-06 1.16e-06 1.92e-07 7.68e-07 1.68e-06 1.26e-06 7.96e-07 4.14e-07
ENSG00000125703 \N 649089 3.14e-07 1.51e-07 6.42e-08 2.22e-07 1.1e-07 7.75e-08 2.1e-07 5.89e-08 1.71e-07 1.03e-07 1.66e-07 1.31e-07 2.13e-07 8.07e-08 5.97e-08 9.01e-08 4.63e-08 1.91e-07 7.29e-08 6.16e-08 1.24e-07 1.7e-07 1.64e-07 3.59e-08 2.02e-07 1.43e-07 1.23e-07 1.26e-07 1.32e-07 1.33e-07 1.21e-07 4.93e-08 4.23e-08 9.08e-08 5.16e-08 2.74e-08 3.91e-08 6.11e-08 6.49e-08 5.96e-08 6.28e-08 1.52e-07 3.02e-08 7.18e-09 3.61e-08 9.65e-09 7.13e-08 0.0 4.68e-08
ENSG00000142856 ITGB3BP -160500 3.06e-06 2.98e-06 5.55e-07 2.02e-06 8.74e-07 7.86e-07 2.16e-06 1e-06 2.38e-06 1.42e-06 2.77e-06 1.67e-06 3.69e-06 1.43e-06 9.24e-07 1.98e-06 1.56e-06 2.15e-06 1.61e-06 1.25e-06 1.43e-06 3.41e-06 2.77e-06 1.64e-06 4.02e-06 1.28e-06 1.53e-06 1.69e-06 2.82e-06 2.52e-06 2.01e-06 4.69e-07 5.68e-07 1.33e-06 1.63e-06 9.62e-07 8.88e-07 4.67e-07 1.33e-06 3.46e-07 2.66e-07 3.49e-06 6.51e-07 1.68e-07 3.35e-07 3.52e-07 8.3e-07 2.38e-07 2.69e-07
ENSG00000203965 \N -90151 4.89e-06 5.79e-06 6.31e-07 3.5e-06 1.82e-06 1.59e-06 7.39e-06 1.26e-06 4.66e-06 3.16e-06 7.6e-06 2.82e-06 9.33e-06 2.02e-06 9.95e-07 3.88e-06 2.73e-06 3.71e-06 1.65e-06 1.6e-06 2.77e-06 6.37e-06 4.66e-06 1.99e-06 8.88e-06 2.29e-06 2.89e-06 1.83e-06 5.98e-06 6.42e-06 2.73e-06 5.03e-07 7.23e-07 2.43e-06 2.04e-06 1.53e-06 1.04e-06 6.94e-07 1.08e-06 7.31e-07 8.78e-07 7.11e-06 6.63e-07 1.58e-07 7.96e-07 8.05e-07 1.05e-06 6.26e-07 6.17e-07