logo

Genes within 1Mb (chr1:63367779:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 3.96e-02 0.201 0.097 0.199 B L1
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0674 0.101 0.199 B L1
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0573 0.101 0.199 B L1
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0406 0.0705 0.199 B L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 5.70e-14 0.791 0.0982 0.199 B L1
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 5.54e-01 0.0577 0.0973 0.199 B L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 1.03e-01 0.187 0.114 0.199 B L1
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 3.66e-01 0.0754 0.0832 0.199 CD4T L1
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 1.84e-01 -0.122 0.0916 0.199 CD4T L1
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 7.63e-01 0.0281 0.0931 0.199 CD4T L1
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0312 0.0752 0.199 CD4T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.30e-14 0.769 0.0927 0.199 CD4T L1
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 1.87e-02 0.171 0.072 0.199 CD4T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 9.34e-03 0.247 0.0943 0.199 CD4T L1
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 8.34e-01 0.0194 0.0921 0.199 CD8T L1
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 1.04e-01 0.165 0.101 0.199 CD8T L1
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 6.00e-02 -0.193 0.102 0.199 CD8T L1
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 9.50e-01 0.00614 0.0977 0.199 CD8T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 5.86e-10 0.648 0.0997 0.199 CD8T L1
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 7.58e-01 0.0262 0.0851 0.199 CD8T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 1.29e-02 0.269 0.107 0.199 CD8T L1
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0733 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 2.67e-01 -0.119 0.107 0.198 DC L1
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0346 0.11 0.198 DC L1
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 3.63e-01 0.0781 0.0857 0.198 DC L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.08e-02 0.304 0.118 0.198 DC L1
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 6.50e-01 0.0477 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 4.00e-04 0.365 0.101 0.198 DC L1
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 8.82e-01 0.0151 0.101 0.199 Mono L1
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 2.63e-04 -0.38 0.102 0.199 Mono L1
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 4.57e-01 0.0761 0.102 0.199 Mono L1
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 7.36e-01 0.0233 0.069 0.199 Mono L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.82e-08 0.592 0.101 0.199 Mono L1
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 4.42e-01 0.0689 0.0894 0.199 Mono L1
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0153 0.0857 0.2 NK L1
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0902 0.1 0.2 NK L1
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0568 0.0827 0.2 NK L1
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 4.94e-01 0.0608 0.0888 0.2 NK L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 6.77e-06 0.486 0.105 0.2 NK L1
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 6.74e-01 0.0415 0.0987 0.2 NK L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0582 0.12 0.2 NK L1
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0109 0.0967 0.199 Other_T L1
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 6.67e-01 0.0419 0.0972 0.199 Other_T L1
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 2.32e-01 -0.119 0.0989 0.199 Other_T L1
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 1.85e-01 -0.114 0.0856 0.199 Other_T L1
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 2.32e-01 0.091 0.0759 0.199 Other_T L1
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0506 0.0659 0.199 Other_T L1
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 2.20e-01 0.144 0.117 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 7.34e-01 0.045 0.132 0.191 B_Activated L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 3.65e-01 -0.114 0.126 0.191 B_Activated L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0232 0.118 0.191 B_Activated L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0404 0.124 0.191 B_Activated L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 4.68e-04 0.416 0.117 0.191 B_Activated L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0838 0.131 0.191 B_Activated L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 6.72e-01 0.0485 0.114 0.191 B_Activated L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 9.06e-01 0.0138 0.116 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 2.33e-01 0.141 0.118 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0658 0.113 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0875 0.0952 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.05e-02 0.289 0.112 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 9.12e-01 0.0125 0.113 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 3.77e-02 0.233 0.111 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 2.85e-01 0.121 0.113 0.2 B_Memory L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 4.01e-01 0.0967 0.115 0.2 B_Memory L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 4.69e-01 0.0782 0.108 0.2 B_Memory L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 8.67e-01 0.0172 0.103 0.2 B_Memory L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 5.45e-03 0.324 0.115 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0574 0.118 0.2 B_Memory L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 9.89e-02 0.192 0.116 0.2 B_Memory L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 2.38e-01 0.138 0.117 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 4.82e-01 0.0825 0.117 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 3.62e-01 -0.103 0.112 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 6.87e-01 0.0349 0.0866 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.79e-09 0.664 0.105 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 8.31e-01 0.0215 0.101 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 4.45e-02 0.246 0.121 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 7.67e-02 0.202 0.114 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 1.84e-02 -0.28 0.118 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 7.52e-01 0.0364 0.115 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0464 0.11 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 5.00e-10 0.713 0.109 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 5.46e-01 0.069 0.114 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 9.03e-03 -0.309 0.117 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 2.11e-01 -0.145 0.115 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0082 0.122 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0729 0.107 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 4.70e-01 -0.08 0.11 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.41e-01 0.174 0.118 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 6.75e-01 0.0472 0.112 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 3.54e-01 0.104 0.112 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 6.87e-01 0.0377 0.0935 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 1.38e-01 -0.15 0.101 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 9.51e-01 0.00609 0.0998 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000437 0.0883 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 4.51e-12 0.707 0.0963 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 1.95e-01 0.107 0.0821 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 2.06e-01 0.135 0.107 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 1.16e-01 0.153 0.0968 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 9.88e-01 0.00175 0.113 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 7.43e-01 0.0328 0.1 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 3.30e-01 0.095 0.0973 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 2.83e-07 0.573 0.108 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 4.56e-02 0.188 0.0934 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 1.52e-03 0.349 0.109 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00449 0.114 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0752 0.115 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 3.65e-01 0.101 0.112 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 1.67e-01 -0.15 0.108 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.93e-04 0.412 0.108 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 1.70e-02 0.252 0.105 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 6.99e-01 0.0449 0.116 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0502 0.105 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 2.62e-01 0.125 0.112 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 1.22e-01 -0.164 0.106 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 2.02e-01 -0.144 0.113 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.07e-02 0.298 0.116 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 8.52e-01 0.0196 0.105 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 2.64e-01 0.134 0.12 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 8.35e-01 0.0222 0.106 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0536 0.11 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 5.99e-01 -0.06 0.114 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 5.89e-01 0.0592 0.109 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 4.53e-09 0.625 0.102 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 2.52e-01 0.107 0.0934 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 9.58e-02 0.174 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 6.24e-01 0.0565 0.115 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 9.46e-02 0.195 0.116 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 8.31e-01 0.0243 0.114 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 4.14e-01 0.0952 0.116 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 2.49e-03 0.339 0.11 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 9.24e-01 0.0104 0.109 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 1.11e-01 0.183 0.115 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 1.56e-01 0.167 0.117 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 9.81e-01 0.00281 0.118 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 2.85e-01 -0.123 0.114 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0171 0.11 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 5.85e-02 0.225 0.118 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 1.88e-01 -0.15 0.113 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 9.27e-01 0.0107 0.116 0.205 CD8_TEM L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 8.56e-01 0.0206 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 5.43e-01 0.0683 0.112 0.201 MAIT L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 2.43e-01 -0.125 0.107 0.201 MAIT L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0833 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 2.11e-03 0.345 0.111 0.201 MAIT L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0238 0.113 0.201 MAIT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 8.79e-01 0.0178 0.117 0.201 MAIT L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 6.62e-01 0.05 0.114 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 5.80e-02 -0.222 0.116 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0914 0.101 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 7.71e-01 0.033 0.113 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.35e-02 0.29 0.116 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0295 0.122 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 4.38e-01 0.0905 0.116 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 8.61e-02 -0.154 0.089 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 5.12e-01 0.0747 0.114 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0357 0.0989 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 1.07e-01 0.162 0.0999 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 3.97e-02 0.234 0.113 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 7.15e-01 0.0405 0.111 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0657 0.123 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 3.28e-02 0.26 0.121 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 3.52e-01 -0.118 0.127 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0942 0.0968 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0916 0.113 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 5.23e-03 0.328 0.116 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0321 0.124 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 9.98e-01 0.000344 0.113 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0434 0.098 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 4.11e-01 -0.091 0.111 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 2.82e-01 -0.11 0.102 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0641 0.105 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 6.61e-05 0.426 0.105 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 9.21e-01 0.0114 0.114 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 1.90e-01 -0.152 0.115 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 4.72e-02 0.281 0.14 0.189 PB L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 1.52e-01 -0.214 0.148 0.189 PB L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 7.32e-01 -0.055 0.16 0.189 PB L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 9.39e-02 -0.233 0.138 0.189 PB L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 4.39e-03 0.391 0.134 0.189 PB L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 4.64e-01 -0.102 0.138 0.189 PB L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 1.17e-01 0.239 0.151 0.189 PB L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 3.14e-01 0.105 0.104 0.2 Pro_T L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 1.41e-01 -0.156 0.106 0.2 Pro_T L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 2.13e-02 0.244 0.105 0.2 Pro_T L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 7.26e-02 0.167 0.0926 0.2 Pro_T L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 8.56e-03 -0.244 0.0921 0.2 Pro_T L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 9.18e-01 0.00659 0.0644 0.2 Pro_T L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0502 0.109 0.2 Pro_T L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0296 0.111 0.199 Treg L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 9.59e-01 0.00609 0.118 0.199 Treg L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 7.20e-01 -0.039 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 1.19e-01 -0.173 0.11 0.199 Treg L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 5.54e-02 0.222 0.115 0.199 Treg L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 7.57e-01 0.0348 0.112 0.199 Treg L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 7.06e-02 0.2 0.11 0.199 Treg L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 9.55e-01 0.00626 0.111 0.193 cDC L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 7.91e-01 0.03 0.113 0.193 cDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0045 0.111 0.193 cDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 7.54e-01 0.0303 0.0963 0.193 cDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.99e-01 0.157 0.122 0.193 cDC L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 1.53e-01 0.155 0.108 0.193 cDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 3.90e-02 0.202 0.097 0.193 cDC L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 7.23e-01 0.0371 0.105 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 1.20e-01 -0.162 0.104 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 8.17e-01 0.0256 0.11 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 5.76e-01 0.0435 0.0776 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.52e-05 0.466 0.105 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 4.65e-01 0.071 0.0969 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0706 0.117 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 2.92e-03 -0.349 0.116 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 8.42e-01 0.022 0.11 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00159 0.0951 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 2.00e-04 0.393 0.104 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 8.31e-01 0.0236 0.11 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 4.12e-01 -0.108 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 2.29e-01 0.169 0.14 0.191 gdT L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 2.56e-01 -0.156 0.137 0.191 gdT L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0691 0.132 0.191 gdT L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 8.77e-01 0.0216 0.14 0.191 gdT L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 5.40e-01 0.0812 0.132 0.191 gdT L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 8.94e-01 0.0183 0.138 0.191 gdT L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0914 0.12 0.193 intMono L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 6.20e-01 0.0554 0.111 0.193 intMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0547 0.114 0.193 intMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00514 0.109 0.193 intMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 7.73e-03 0.317 0.118 0.193 intMono L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 3.20e-01 0.121 0.122 0.193 intMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 4.16e-01 0.0877 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 2.72e-01 -0.13 0.118 0.195 ncMono L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 5.26e-01 0.074 0.116 0.195 ncMono L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0159 0.109 0.195 ncMono L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.06e-01 0.184 0.113 0.195 ncMono L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 7.23e-01 0.0413 0.116 0.195 ncMono L2
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0799 0.128 0.203 pDC L2
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 3.14e-01 -0.126 0.124 0.203 pDC L2
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0648 0.127 0.203 pDC L2
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0717 0.114 0.203 pDC L2
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 2.72e-01 0.141 0.128 0.203 pDC L2
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 9.91e-02 -0.215 0.13 0.203 pDC L2
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 1.38e-01 0.168 0.113 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 3.84e-01 0.0942 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 3.40e-01 0.114 0.119 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00928 0.104 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00964 0.0838 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 2.00e-05 0.461 0.106 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00711 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 8.30e-03 0.301 0.113 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 1.93e-02 0.265 0.112 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 3.57e-01 -0.108 0.117 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0498 0.109 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 7.26e-01 0.0293 0.0834 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 3.06e-13 0.81 0.104 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 9.27e-01 0.0093 0.101 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 7.25e-01 0.0417 0.119 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0223 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 2.82e-03 -0.307 0.102 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 6.49e-01 0.0475 0.104 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 5.05e-01 0.0481 0.0721 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 1.55e-07 0.543 0.1 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 3.20e-01 0.0908 0.091 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 9.11e-01 0.0117 0.104 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 2.30e-01 -0.142 0.118 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 9.49e-01 0.00747 0.117 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0344 0.0997 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 9.40e-03 0.299 0.114 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 4.29e-01 0.086 0.109 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079739 PGM1 -225632 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0359 0.0874 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000088035 ALG6 204 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0281 0.105 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116641 DOCK7 679393 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0633 0.094 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000125703 ATG4C 583647 sc-eQTL 3.84e-01 0.0817 0.0937 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 sc-eQTL 2.57e-05 0.459 0.107 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162607 USP1 931482 sc-eQTL 4.66e-01 0.0737 0.101 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0804 0.123 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000088035 ALG6 204 eQTL 5.51e-13 -0.118 0.0161 0.0488 0.082 0.198
ENSG00000125703 ATG4C 583647 eQTL 0.0333 -0.0447 0.021 0.0 0.0 0.198
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 eQTL 1.2200000000000001e-21 0.342 0.0349 0.0 0.0 0.198
ENSG00000203965 EFCAB7 -155593 eQTL 4.14e-03 0.0859 0.0299 0.0 0.0 0.198
ENSG00000230798 FOXD3-AS1 43338 eQTL 0.0119 -0.0819 0.0325 0.0 0.0 0.198

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079739 \N -225632 9.83e-07 1.01e-06 3.05e-07 1.41e-06 1.16e-07 4.73e-07 1.48e-06 1.48e-07 1.49e-06 3.24e-07 1.79e-06 5.93e-07 2.01e-06 2.67e-07 3.58e-07 2.55e-07 9.26e-07 5.66e-07 3.51e-07 1.65e-07 6.61e-07 6.2e-07 6.63e-07 2.92e-07 1.88e-06 2.44e-07 3.68e-07 3.24e-07 9.15e-07 1.31e-06 7.8e-07 4.4e-08 5.42e-08 6.38e-07 4.66e-07 2.58e-07 6.69e-07 2.97e-07 1.41e-07 2.32e-07 4.68e-08 2.73e-06 2.91e-07 1.57e-06 1.69e-07 1.26e-07 1.21e-07 2.2e-09 5.61e-08
ENSG00000088035 ALG6 204 0.000371 0.000428 5.69e-05 0.000125 8.18e-05 0.000142 0.000394 7.01e-05 0.000355 0.000175 0.000433 0.000194 0.000492 0.000173 8.32e-05 0.000248 0.00017 0.00026 9.56e-05 7.8e-05 0.000199 0.000381 0.000339 9.56e-05 0.000428 0.000133 0.000186 0.000153 0.00033 0.000185 0.000231 2.82e-05 3.34e-05 7.11e-05 8.62e-05 5.65e-05 3.07e-05 3.42e-05 5.2e-05 2.99e-05 2.19e-05 0.000449 5.19e-05 4.48e-06 4.56e-05 5.77e-05 5.46e-05 2.68e-05 2.24e-05
ENSG00000142856 ITGB3BP -225942 9.83e-07 1.01e-06 3.05e-07 1.41e-06 1.16e-07 4.7e-07 1.48e-06 1.48e-07 1.46e-06 3.24e-07 1.79e-06 5.97e-07 2.01e-06 2.67e-07 3.58e-07 2.55e-07 9.33e-07 5.66e-07 3.51e-07 1.63e-07 6.56e-07 6.2e-07 6.63e-07 2.92e-07 1.94e-06 2.44e-07 3.68e-07 3.24e-07 9.15e-07 1.32e-06 7.64e-07 4.4e-08 5.42e-08 6.35e-07 4.66e-07 2.56e-07 6.69e-07 3.09e-07 1.41e-07 2.32e-07 4.68e-08 2.73e-06 2.9e-07 1.57e-06 1.69e-07 1.26e-07 1.21e-07 2.2e-09 5.52e-08